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Reactivation of Tumor-suppressor MicroRNAs in Cancer Cells by Epigenome Editing

研究課題

研究課題/領域番号 20K07604
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分50010:腫瘍生物学関連
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

Gailhouste Luc  国立研究開発法人理化学研究所, 開拓研究本部, 研究員 (40848537)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 交付 (2021年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2022年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2021年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2020年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワードmicroRNA / Epigenome editing / Tumor-suppressor / DNA methylation / dCas9-Tet1 / MicroRNAs / epigenome editing / tumor-suppressor / cancer
研究開始時の研究の概要

1. Apr. to Dec. 2020: in silico analysis and design of the gRNAs. Challenge of targeted epigenome editing and demethylation of the candidate tumor-suppressor miRNAs in cancer cells.
2. Jan. to June 2021: assessment of the recovery of tumor-suppressor activities mediated by the reactivation of the miRNAs.
3. July 2021 to June 2022: tumor growth models (in vivo).
4. July 2022 to March 2023: compilation of the data, analyses, manuscript writing, submission, and potential revision

研究実績の概要

The objective of this project was to develop a reliable system for targeted demethylation and reactivation of specific cancer-related microRNAs (miRNAs). By adapting the CRISPR-Cas9 system and establishing an innovative editing technology, we have been able to accurately manipulate the epigenome of tumor-suppressor miRNAs for functional analyses and potential therapeutic applications. Thus far, the following aims have been achieved:
1. Targeted demethylation of the tumor-suppressor miR-122 using the dCas9-TET1 epigenome editing system
2. Identification of miR-122 targets using miRNA epigenome editing
3. miR-122 editing negatively impacts hepatic cancer cell growth through SLC2A3 targeting

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

This work is currently in progress as expected. Tumor-suppressor miRNA epigenome editing using animal experimental models will be achieved this year.

今後の研究の推進方策

We are currently applying targeted demethylation of miRNAs to other types of tumor cells, especially pancreatic ductal adenocarcinoma cells. Importantly, reactivation of tumor-suppressor miRNAs other than miR-122 is in progress to demonstrate the versatility of our miRNA epigenome editing system. Further functional analyses will help to clarify interactions between the edited miRNAs and their potential targets. Last, mouse tumor growth models will be used to validate the therapeutic potential of miRNA epigenome editing.

報告書

(2件)
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2021

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 3件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Establishment of a Rapid Detection System for ISG20-Dependent SARS-CoV-2 Subreplicon RNA Degradation Induced by Interferon-α2021

    • 著者名/発表者名
      Furutani Yutaka、Toguchi Mariko、Higuchi Shoko、Yanaka Kaori、Gailhouste Luc、Qin Xian-Yang、Masaki Takahiro、Ochi Sae、Matsuura Tomokazu
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 22 号: 21 ページ: 11641-11641

    • DOI

      10.3390/ijms222111641

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Epigenetic reprogramming promotes the antiviral action of IFNα in HBV-infected cells2021

    • 著者名/発表者名
      Gailhouste Luc、Sudoh Masayuki、Qin Xian-Yang、Watashi Koichi、Wakita Takaji、Ochiya Takahiro、Matsuura Tomokazu、Kojima Soichi、Furutani Yutaka
    • 雑誌名

      Cell Death Discovery

      巻: 7 号: 1 ページ: 130-130

    • DOI

      10.1038/s41420-021-00515-y

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Non-Genomic Control of Dynamic MYCN Gene Expression in Liver Cancer2021

    • 著者名/発表者名
      Qin Xian-Yang、Gailhouste Luc
    • 雑誌名

      Frontiers in Oncology

      巻: 10 ページ: 618515-618515

    • DOI

      10.3389/fonc.2020.618515

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Epigenome editing technology for the targeted demethylation and reactivation of tumor-suppressor microRNAs2021

    • 著者名/発表者名
      Luc Gailhouste
    • 学会等名
      RIKEN 24th Interdisciplinary Exchange Evening
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] A robust cell culture system for anti-hepatitis B virus drug study via epigenetic reprogramming2021

    • 著者名/発表者名
      Luc Gailhouste
    • 学会等名
      Asian Pacific Association for the Study of the Liver (APASL), Single Topic Conference
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2022-12-28  

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