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がんゲノム解析に基づいたドライバー変異特異的な新規ネオアンチゲンワクチンの開発

研究課題

研究課題/領域番号 20K07649
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分50020:腫瘍診断および治療学関連
研究機関静岡県立静岡がんセンター(研究所)

研究代表者

秋山 靖人  静岡県立静岡がんセンター(研究所), その他部局等, 研究員 (70222552)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2022年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2021年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2020年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
キーワードネオアンチゲン / 次世代シークエンサー / がんのドライバー変異 / がん免疫療法 / MHC安定化試験 / がんドライバー遺伝子変異 / HLAタイピング / ゲノム編集 / 腫瘍内浸潤リンパ球 / ドライバー変異 / がんゲノム解析
研究開始時の研究の概要

2014年より静岡がんセンターにて実施しているがん患者の網羅的ゲノム解析研究 (Project HOPE) においてすでに5,000例を超えるがん患者が登録されている。我々は、HOPE登録患者の遺伝子解析(HLA-DNAタイピングを含む)にて同定されたドライバー変異(TP53, KRAS, EGFR, PIK3CA, BRAF)のミスセンス2850個の配列をもとにin silicoのHLA結合予測アルゴリズムを用いてネオアンチゲン候補ペプチド配列の同定を行う。HLAとのマッチングを考慮した細胞障害性T細胞アッセイを経て最終的に30-40個のネオアンチゲンぺプチドパネルを作製することを目的とする。

研究成果の概要

がんのドライバー変異由来のネオアンチゲンの同定については、まだ網羅的な解析はなされていない。我々は、ゲノム解析研究であるHOPEプロジェクトの5,143症例の変異解析データより、5つのドライバー変異(TP53, EGFR, PIC3CA, KRAS, BRAF)由来の1万種類以上のペプチド変異配列からin silico 技術を利用してHLAクラスIにマッチする138個の候補ペプチド配列を同定した。次に不死化B細胞株からゲノム編集技術を用いて樹立した単一HLAクラスI遺伝子発現クローンを利用したMHC安定化試験を実施し、最終的に27個のドライバー変異由来ネオアンチゲン候補ぺプチドを同定した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

近年免疫チェックポイント抗体を用いた標準治療が次々と確立され,進行がんの患者においても延命効果が明らかになっているが、副作用の問題も指摘されている。一方がんワクチン療法は、副作用はほとんど持たないが、単独では、奏効率が低く完全な臨床応用までには至っていない。しかし、次世代シークエンサーの普及によりがんの遺伝子解析が網羅的に施行され、がんの遺伝子変異配列に基づくネオアンチゲンが同定されるようになり、臨床応用に向けて世界的な研究が開始されている。近年これらのネオアンチゲンワクチンと免疫チェックポイント抗体の併用によりさらなる延命効果も報告されており、将来的に有望な複合的免疫療法と考えられる。

報告書

(4件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (25件)

すべて 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 (17件) (うち査読あり 17件、 オープンアクセス 6件) 学会発表 (8件)

  • [雑誌論文] Development of two 410-cancer-gene panel tests for solid tumors and liquid biopsy based on genome data of 5,143 Japanese cancer patients2022

    • 著者名/発表者名
      Shimoda Yuji, Akiyama Yasuto, et al.
    • 雑誌名

      Biomedical Research

      巻: 43 号: 4 ページ: 115-126

    • DOI

      10.2220/biomedres.43.115

    • ISSN
      0388-6107, 1880-313X
    • 年月日
      2022-08-18
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characterization of the immunological status of hypermutated solid tumors in the cancer genome analysis project HOPE2022

    • 著者名/発表者名
      Akiyama Yasuto, Yamaguchi Ken, et al.
    • 雑誌名

      Anticancer Research

      巻: 42 号: 7 ページ: 3537-3549

    • DOI

      10.21873/anticanres.15840

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Immunological and genetic characterization of patients with head and neck cancer who developed recurrence2022

    • 著者名/発表者名
      Yasui Kazuaki, Akiyama Yasuto, et al.
    • 雑誌名

      Anticancer Research

      巻: 42 号: 9 ページ: 4417-4428

    • DOI

      10.21873/anticanres.15942

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Comparison of genetic susceptibility to lung adenocarcinoma and squamous cell carcinoma in Japanese patients using a novel panel for cancer-related drug-metabolizing enzyme genes2022

    • 著者名/発表者名
      Ohnami Sumiko, Akiyama Yasuto, et al.
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 12 号: 1 ページ: 17928-17928

    • DOI

      10.1038/s41598-022-22914-6

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of novel small antitumor compounds inhibiting PD-1/PD-L1 binding2022

    • 著者名/発表者名
      Akiyama Yasuto, Yamaguchi Ken, et al.
    • 雑誌名

      Anticancer Research

      巻: 42 号: 11 ページ: 5233-5247

    • DOI

      10.21873/anticanres.16030

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of an automatic measurement method for CD8 and PD-1 positive T cells using image analysis software2022

    • 著者名/発表者名
      Miyata H, Akiyama Y, et al.
    • 雑誌名

      Anticancer Res

      巻: 42 号: 1 ページ: 419-427

    • DOI

      10.21873/anticanres.15500

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Tumor cell enrichment by tissue suspension enables detection of mutations with low variant allele frequency and estimation of germline mutations2022

    • 著者名/発表者名
      Hatakeyama K, Akiyama Y, et al.
    • 雑誌名

      Sci Rep

      巻: 12 号: 1 ページ: 2953-2953

    • DOI

      10.1038/s41598-022-06885-2

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Alternative evaluation of an ELISPOT assay using cytokine activity as a novel parameter2021

    • 著者名/発表者名
      Maeda C, Akiyama Y, et al.
    • 雑誌名

      Anticancer Res

      巻: 41 号: 8 ページ: 3825-3831

    • DOI

      10.21873/anticanres.15175

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] EMID1, a multifunctional molecule identified in a murine model for the invasion independent metastasis pathway2021

    • 著者名/発表者名
      Kawata T, Akiyama Y, et al.
    • 雑誌名

      Sci Rep

      巻: 11 号: 1 ページ: 16372-16372

    • DOI

      10.1038/s41598-021-96006-2

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] BMP4 and PHLDA1 are plausible drug-targetable candidate genes for KRAS G12A-, G12D-, and G12V-driven colorectal cancer2021

    • 著者名/発表者名
      Ohnami S, Maruyama K, et. al.
    • 雑誌名

      Molecular and Cellular Biochemistry

      巻: 476 号: 9 ページ: 3469-3482

    • DOI

      10.1007/s11010-021-04172-8

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] JCGA: the Japanese version of the cancer genome atlas and its contribution to the interpretation of gene alterations detected in clinical cancer genome sequencing2021

    • 著者名/発表者名
      Serizawa M, Akiyama Y, et al.
    • 雑誌名

      Hum Genome Var

      巻: 8 号: 1 ページ: 38-38

    • DOI

      10.1038/s41439-021-00170-w

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of tumor microenvironment-associated immunological genes as potent prognostic markers in the cancer genome analysis project HOPE2021

    • 著者名/発表者名
      Kondou R, Akiyama Y, et al.
    • 雑誌名

      Mol Clin Oncol

      巻: 15 号: 5 ページ: 232-232

    • DOI

      10.3892/mco.2021.2395

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular classification of gastric cancer predicts survival in patients undergoing radical gastrectomy based on project HOPE2021

    • 著者名/発表者名
      Furukawa Kenichiro、Hatakeyama Keiichi、Terashima Masanori、Nagashima Takeshi、Urakami Kenichi、Ohshima Keiichi、Notsu Akifumi、Sugino Takashi、Yagi Taisuke、Fujiya Keiichi、Kamiya Satoshi、Hikage Makoto、Tanizawa Yutaka、Bando Etsuro、Kanai Yae、Akiyama Yasuto、Yamaguchi Ken
    • 雑誌名

      Gastric Cancer

      巻: 25 号: 1 ページ: 138-148

    • DOI

      10.1007/s10120-021-01242-0

    • NAID

      40022799797

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] MAGEA10 expression is a predictive marker of early hepatic recurrence after curative gastrectomy for gastric and gastroesophageal junction cancer2021

    • 著者名/発表者名
      Fujiya K, Akiyama Y, et al.
    • 雑誌名

      Gastric cancer

      巻: 24 号: 2 ページ: 341-351

    • DOI

      10.1007/s10120-020-01123-y

    • NAID

      40022501528

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Analysis of single nucleotide-mutated single-cancer cells using the combined technologies of single-cell microarray chips and peptide nucleic acid-DNA probes2020

    • 著者名/発表者名
      Shigeto H, Akiyama Y et al.
    • 雑誌名

      Micromachines

      巻: 11 号: 7 ページ: 628-628

    • DOI

      10.3390/mi11070628

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Characterization of tumors with ultralow tumor mutational burden in Japanese cancer patients2020

    • 著者名/発表者名
      Hatakeyama K, Akiyama Y, et al.
    • 雑誌名

      Cancer Sci

      巻: 111 号: 10 ページ: 3893-3901

    • DOI

      10.1111/cas.14572

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Alpha-type-1 polarized dendritic cell-based vaccination in newly diagnosed high-grade glioma: A phase II clinical trial2020

    • 著者名/発表者名
      Mitsuya K, Akiyama Y, et al.
    • 雑誌名

      Anticancer Res

      巻: 40 号: 11 ページ: 6473-6484

    • DOI

      10.21873/anticanres.14669

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] HLA-ABC単一アレルノックイン、TAP2-KO-TISI株を用いたがん遺伝子変異由来標的エピトープのインビトロ検証2022

    • 著者名/発表者名
      飯塚 明、秋山 靖人、他
    • 学会等名
      第81回日本癌学会学術総会~横浜
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 肺がん細胞株における新規核酸プローブを用いた変異EGFR遺伝子の検出2022

    • 著者名/発表者名
      宮田 治男、秋山 靖人、他
    • 学会等名
      第81回日本癌学会学術総会~横浜
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Evaluation of ELISPOT assay using cytokine activity parameter2021

    • 著者名/発表者名
      Maeda C, Akiyama Y, et al.
    • 学会等名
      The 80th Annual meeting of the Japan Cancer Association, Yokohama
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] Association of immune types classification based on tumor microenvironment with patients' prognosis in project HOPE2021

    • 著者名/発表者名
      Kondou R, Akiyama Y, et al.
    • 学会等名
      The 80th Annual meeting of the Japan Cancer Association, Yokohama
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] Development of automatic measurement method for CD8 and PD-1 positive T cells using image analysis software2021

    • 著者名/発表者名
      Miyata H, Akiyama Y, et al.
    • 学会等名
      The 80th Annual meeting of the Japan Cancer Association, Hirosima
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] Development of tumor-infiltrating lymphocytes (TIL)-measuring method using image analysis software2020

    • 著者名/発表者名
      Miyata H, Akiyama Y et al.
    • 学会等名
      The 79th Annual meeting of the Japan Cancer Association, Hirosima
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Association of immune types classification based on tumor microenvironment with patients' prognosis in project HOPE2020

    • 著者名/発表者名
      Kondou R, Akiyama Y, et al.
    • 学会等名
      The 79th Annual meeting of the Japan Cancer Association, Hirosima
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Alpha-type-1 polarized dendritic cell-based vaccination in newly diagnosed high-grade glioma: A phase II clinical trial2020

    • 著者名/発表者名
      Maeda C, Akiyama Y, et al.
    • 学会等名
      The 79th Annual meeting of the Japan Cancer Association, Hirosima
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-01-30  

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