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遺伝子変異検出から予後予測へつなぐ画像生検の開発

研究課題

研究課題/領域番号 20K08084
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分52040:放射線科学関連
研究機関九州大学

研究代表者

有村 秀孝  九州大学, 医学研究院, 教授 (20287353)

研究分担者 田中 謙太郎  九州大学, 大学病院, 助教 (00536849)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2022年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2021年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2020年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワード画像生検 / 穴解析 / 肺癌 / 位相幾何学 / ベッチ数マップ / 画像不変量 / 画像生検法 / ベッチ数特徴量 / 遺伝子画像バイオマーカー / EGFRサブタイプ分類 / 再発予測 / EGFR変異肺癌 / 遺伝子変異 / 特徴量 / 予後予測
研究開始時の研究の概要

医用画像から求めた特徴量に基づき遺伝子変異を検出するため、申請者は画像生検法を提案した。さらに分子標的薬治療支援を最終目的として、予後予測へつなぐ基礎研究を行ってきた。しかし、各患者や撮像装置間の画質の変動が原因で、上記検出と予後予測性能が低下することが分かった。そこで、本研究では頑強な画像特徴量を明らかにすることで、遺伝子変異肺癌の予後予測可能な非侵襲的画像生検法を開発する。

研究成果の概要

本研究で着目した理論は位相幾何学で、それは柔らかい幾何学と呼ばれ,具体的な形態を考慮せず,穴の数だけで対象物を分類できる理論である.本研究では“穴解析”と呼ぶ[有村秀孝他.医用画像情報学会雑誌 2023].EGFR 変異陽性の肺癌には空洞やバブルなどが画像に現れやすいとの報告があるため,穴解析が有効と考えた。本研究では、ベッチ数マップ特徴量を用いてEGFR変異に対応する画像不変特徴量を明らかにし、非侵襲的画像生検法を開発した。本研究で立てた仮説である「位相幾何学に基づくベッチ数マップの特徴量が肺癌のEGFR変異(Del19/L858R変異のサブタイプ分類を含む)を検出できる」ことを示した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

位相幾何学に基づくベッチ数マップ特徴量による予測モデルは、非小細胞肺癌患者におけるEGFR変異の同定において、CT装置/撮像パラメータの変動に対して従来モデルよりも高い頑健性を示した。さらに、EGFR Del19/L858R変異のサブタイプの特徴と遺伝学的関連を示した3Dベッチ数マップ特徴量は、従来特徴量と比較してサブタイプ分類に高い精度を示した。
現状の生検では、不均一な遺伝子変異を持つ腫瘍の遺伝子変異予測を過小または過大評価する可能性があるが、この問題を提案する画像生検が解決できる可能性がある。また、生検不可または拒否の患者に対して画像生検を適用できる。

報告書

(5件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (33件)

すべて 2023 2022 2021 2020 その他

すべて 国際共同研究 (4件) 雑誌論文 (13件) (うち国際共著 4件、 査読あり 11件、 オープンアクセス 8件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 8件、 招待講演 5件) 図書 (1件) 備考 (4件) 産業財産権 (2件) (うち外国 1件)

  • [国際共同研究] マラヤ大学(マレーシア)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] Sanford Burnham Prebys Medical Discovery(米国)

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [国際共同研究] マラヤ大学(マレーシア)

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [国際共同研究] マラヤ大学(マレーシア)

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [雑誌論文] CT Image-Based Biopsy to Aid Prediction of HOPX Expression Status and Prognosis for Non-Small Cell Lung Cancer Patients2023

    • 著者名/発表者名
      Jin Yu、Arimura Hidetaka、Cui YunHao、Kodama Takumi、Mizuno Shinichi、Ansai Satoshi
    • 雑誌名

      Cancers

      巻: 15 号: 8 ページ: 2220-2220

    • DOI

      10.3390/cancers15082220

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Magnetic resonance-based imaging biopsy with signatures including topological Betti number features for prediction of primary brain metastatic sites2023

    • 著者名/発表者名
      Egashira Mai、Arimura Hidetaka、Kobayashi Kazuma、Moriyama Kazutoshi、Kodama Takumi、Tokuda Tomoki、Ninomiya Kenta、Okamoto Hiroyuki、Igaki Hiroshi
    • 雑誌名

      Physical and Engineering Sciences in Medicine

      巻: 46 号: 4 ページ: 1411-1426

    • DOI

      10.1007/s13246-023-01308-6

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Combination of Clinical Factors and Radiomics Can Predict Local Recurrence and Metastasis After Stereotactic Body Radiotherapy for Non-small Cell Lung Cancer2023

    • 著者名/発表者名
      ISOYAMA-SHIRAKAWA YUKO、YOSHITAKE TADAMASA、NINOMIYA KENTA、ASAI KAORI、MATSUMOTO KEIJI、SHIOYAMA YOSHIYUKI、KODAMA TAKUMI、ISHIGAMI KOUSEI、ARIMURA HIDETAKA
    • 雑誌名

      Anticancer Research

      巻: 43 号: 11 ページ: 5003-5013

    • DOI

      10.21873/anticanres.16699

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Three-dimensional topological radiogenomics of epidermal growth factor receptor Del19 and L858R mutation subtypes on computed tomography images of lung cancer patients2023

    • 著者名/発表者名
      Ninomiya Kenta、Arimura Hidetaka、Tanaka Kentaro、Chan Wai Yee、Kabata Yutaro、Mizuno Shinichi、Gowdh Nadia Fareeda Muhammad、Yaakup Nur Adura、Liam Chong-Kin、Chai Chee-Shee、Ng Kwan Hoong
    • 雑誌名

      Computer Methods and Programs in Biomedicine

      巻: Epub ahead of print ページ: 107544-107544

    • DOI

      10.1016/j.cmpb.2023.107544

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Topology-based radiomic features for prediction of parotid gland cancer malignancy grade in magnetic resonance images2023

    • 著者名/発表者名
      Ikushima Kojiro、Arimura Hidetaka、Yasumatsu Ryuji、Kamezawa Hidemi、Ninomiya Kenta
    • 雑誌名

      Magnetic Resonance Materials in Physics, Biology and Medicine

      巻: 36 号: 5 ページ: 767

    • DOI

      10.1007/s10334-023-01084-0

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Recurrence prediction with local binary pattern-based dosiomics in patients with head and neck squamous cell carcinoma2022

    • 著者名/発表者名
      Kamezawa Hidemi、Arimura Hidetaka
    • 雑誌名

      Physical and Engineering Sciences in Medicine

      巻: 46 号: 1 ページ: 99

    • DOI

      10.1007/s13246-022-01201-8

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dual segmentation models for poorly and well-differentiated hepatocellular carcinoma using two-step transfer deep learning on dynamic contrast-enhanced CT images2022

    • 著者名/発表者名
      Nagami Noriyuki、Arimura Hidetaka、Nojiri Junichi、Yunhao Cui、Ninomiya Kenta、Ogata Manabu、Oishi Mitsutoshi、Ohira Keiichi、Kitamura Shigetoshi、Irie Hiroyuki
    • 雑誌名

      Physical and Engineering Sciences in Medicine

      巻: 46 号: 1 ページ: 83-97

    • DOI

      10.1007/s13246-022-01202-7

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Relapse predictability of topological signature on pretreatment planning <scp>CT</scp> images of stage I non‐small cell lung cancer patients before treatment with stereotactic ablative radiotherapy2022

    • 著者名/発表者名
      Kodama Takumi、Arimura Hidetaka、Shirakawa Yuko、Ninomiya Kenta、Yoshitake Tadamasa、Shioyama Yoshiyuki
    • 雑誌名

      Thoracic Cancer

      巻: 13 号: 15 ページ: 2117-2126

    • DOI

      10.1111/1759-7714.14483

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Synergistic combination of a topologically invariant imaging signature and a biomarker for the accurate prediction of symptomatic radiation pneumonitis before stereotactic ablative radiotherapy for lung cancer: A retrospective analysis2022

    • 著者名/発表者名
      K. Ninomiya, H. Arimura, T. Yoshitake, T. Hirose and Y. Shioyama
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: - 号: 1 ページ: e0263292-e0263292

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0263292

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 高精度がん治療支援のための画像生検 -レディオミクスで抽出できる情報-2022

    • 著者名/発表者名
      有村秀孝、兒玉拓巳、浦上暉允、亀澤秀美、廣瀬貴章、二宮健太
    • 雑誌名

      日本放射線技術学会雑誌

      巻: 78 ページ: 219-224

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Stratification of prostate cancer patients into low‐ and high‐grade groups using multiparametric magnetic resonance radiomics with dynamic contrast‐enhanced image joint histograms2021

    • 著者名/発表者名
      Urakami Akimasa、Arimura Hidetaka、Takayama Yukihisa、Kinoshita Fumio、Ninomiya Kenta、Imada Kenjiro、Watanabe Sumiko、Nishie Akihiro、Oda Yoshinao、Ishigami Kousei
    • 雑誌名

      The Prostate

      巻: 82 号: 3 ページ: 330-344

    • DOI

      10.1002/pros.24278

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Robust radiogenomics approach to the identification of EGFR mutations among patients with NSCLC from three different countries using topologically invariant Betti numbers2021

    • 著者名/発表者名
      Ninomiya Kenta、Arimura Hidetaka、Chan Wai Yee、Tanaka Kentaro、Mizuno Shinichi、Muhammad Gowdh Nadia Fareeda、Yaakup Nur Adura、Liam Chong-Kin、Chai Chee-Shee、Ng Kwan Hoong
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 16 号: 1 ページ: e0244354-e0244354

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0244354

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Automated approach for segmenting gross tumor volumes for lung cancer stereotactic body radiation therapy using CT-based dense V-networks2021

    • 著者名/発表者名
      Cui Yunhao、Arimura Hidetaka、Nakano Risa、Yoshitake Tadamasa、Shioyama Yoshiyuki、Yabuuchi Hidetake
    • 雑誌名

      Journal of Radiation Research

      巻: 62 号: 2 ページ: 346-355

    • DOI

      10.1093/jrr/rraa132

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Prediction Model for the Time Variant Trajectories of Lung Tumor Growths After Tyrosine Kinase Inhibitor Therapy2023

    • 著者名/発表者名
      Rintaro Furuta, Hidetaka Arimura, Kentaro Tanaka, Yutaro Kabata, Mai Egashira
    • 学会等名
      SEACOMP & PITFMB 2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Topological Radiomics of Explainable AI2023

    • 著者名/発表者名
      Hidetaka Arimura
    • 学会等名
      SEACOMP & PITFMB 2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Applications of topological radiomics (Medical imaging signatures with topology for cancer)2023

    • 著者名/発表者名
      Hidetaka Arimura
    • 学会等名
      WORKSHOP on Mathematics for Industry, Warsaw
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Topological prediction models for relapse of stage I patients with non-small cell lung cancer prior to stereotactic ablative radiotherapy2023

    • 著者名/発表者名
      Takumi Kodama, Hidetaka Arimura, Yuko Shirakawa, Kenta Ninomiya, Tadamasa Yoshitake, Yoshiyuki Shioyama
    • 学会等名
      SPIE Medical Imaging 2023, San Diego
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 癌治療におけるレディオミクスとAI(特別講演)2022

    • 著者名/発表者名
      有村秀孝
    • 学会等名
      第十七回前立腺癌密封小線源永久挿入治療研究会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Novel imaging biopsy models for characterizing tumors and its surrounding tissue2021

    • 著者名/発表者名
      Hidetaka Arimura
    • 学会等名
      19th SEACOMP, 13th TMPS and the 14th ACOMP
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Radiomics and imaging biopsy approaches for precision medicine2021

    • 著者名/発表者名
      Hidetaka Arimura
    • 学会等名
      The 9th Korea-Japan Joint Meeting on Medical Physics, KJMP2021
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Novel recognition approach of TKI-sensitizing EGFR mutations in non-small cell lung cancer patients using topologically invariant Betti numbers2021

    • 著者名/発表者名
      Kenta Ninomiya, Hidetaka Arimura, Wai Yee Chan, Kentaro Tanaka, Shinichi Mizuno, Nadia Fareeda Muhammad Gowdh, Nur Adura Yaakup, Chong-Kin Liam, Chee-Shee Chai, Kwan Hoong Ng
    • 学会等名
      International Forum on Medical Imaging in Asia (IFMIA) 2021
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Prediction of Tumor Growth Trajectories During Molecularly Targeted Therapy Based on Mathematical Models2020

    • 著者名/発表者名
      Truong Gia Huy, Hidetaka Arimura, Kentaro Tanaka, Kenta Ninomiya
    • 学会等名
      20th Asia-Oceania Congress on Medical Physics (AOCMP), 18th South-East Asian Congress of Medical Physics (SEACOMP)
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [図書] レディオミクス入門2021

    • 著者名/発表者名
      有村 秀孝、角谷 倫之
    • 総ページ数
      338
    • 出版者
      オーム社
    • ISBN
      9784274226380
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [備考] Arimura Laboratory

    • URL

      http://web.shs.kyushu-u.ac.jp/~arimura/

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [備考] http://www.shs.kyushu-u.ac.jp/~arimura/

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [備考] http://www.shs.kyushu-u.ac.jp/~arimura/

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [備考] http://www.shs.kyushu-u.ac.jp/~arimura/

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [産業財産権] 治療効果予測装置、治療効果予測方法、および治療効果予測2021

    • 発明者名
      有村秀孝
    • 権利者名
      有村秀孝
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2021-069728
    • 出願年月日
      2021
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [産業財産権] 肺がん評価装置及び肺がん評価方法2020

    • 発明者名
      有村秀孝
    • 権利者名
      有村秀孝
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2020
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 外国

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2025-01-30  

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