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Ab initio法を活用した造血系腫瘍におけるlncRNAの統合的機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 20K08716
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分54010:血液および腫瘍内科学関連
研究機関福島県立医科大学

研究代表者

森 努  福島県立医科大学, 看護学部, 准教授 (60244373)

研究分担者 合山 進  東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (80431849)
研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2022年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2021年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2020年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワードbioinformatics / long non-coding RNA / hematopoietic tumors / ab initio 遺伝子軌道法 / 造血器腫瘍 / システム生物学 / ab initio遺伝子軌道法 / 薬剤標的性 / ゲノム編集
研究開始時の研究の概要

Long non-coding RNA (lncRNA)は極めて数多いが,その機能はほとんど不明である。本研究は情報物理学と血液学の異分野協力により,血液細胞でのlncRNA機能を統合的に解析する。①研究代表者の森は,独自開発したab initio遺伝子軌道法を用い,ネットワーク情報を指標にlncRNAの包括的機能計算を行う。②研究分担者の合山は,スプライス・サイトを標的としたゲノム編集技術を用い,白血病細胞におけるlncRNAの網羅的機能解析を行う。本研究は独自性の高い研究であり,その成果は今後のlncRNA研究の指標となり,lncRNAを標的とした白血病治療開発の基盤となると期待される。

研究成果の概要

lncRNAは、その多様な機能や相互作用に関してまだ未解明の部分があり、特に、造血器腫瘍との関連性を持つlncRNAについて、これまでに十分な研究がなされていない。本研究では、ab initio遺伝子軌道法を用いて、lncRNAの遺伝子ネットワーク構造および機能を解析し、造血器腫瘍に関連するlncRNAを特定した。特定されたlncRNAは、LINC00635、LINC00636、LINC01591の3つであった。これらのlncRNAは、細胞周期、DNA損傷修復、細胞移動および免疫応答に関与しており、造血器腫瘍の進行や治療において重要な役割を果たす可能性がある。

研究成果の学術的意義や社会的意義

今回の研究で、LINC00635、LINC00636、LINC01591の3つのlncRNAが造血器腫瘍との関連性が強いことが示された。これらlncRNAは、細胞周期、DNA損傷修復、細胞移動および免疫応答に関与しており、造血器腫瘍の進行や治療において重要な役割を果たす可能性がある。今後は、これらのlncRNAの機能を更に詳細に解析し、治療標的としての可能性を探るためのwet実験を進めていく予定である。この研究成果は、lncRNAの機能解析および造血器腫瘍の治療における新たな視点を提供するものであり、今後の研究に大きな貢献をすることが期待される。

報告書

(4件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2024 2023

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (5件) (うち国際学会 1件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Alterations of UHRF family Expression and was regulated by High Risk Type HPV16 in Uterine Cervical Cancer2024

    • 著者名/発表者名
      Yoshimoto Masafumi、Tokuda Aoi、Eguchi Ayami、Nozawa Yoshihiro、Mori Tsutomu、Yaginuma Yuji
    • 雑誌名

      Experimental Cell Research

      巻: 437 号: 2 ページ: 114018-114018

    • DOI

      10.1016/j.yexcr.2024.114018

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Alterations of UHRF Family Expression and UHRF1/ICBP90 Inhibits Phosphatase and Tensin Homolog Expression in Endometrial Cancer2023

    • 著者名/発表者名
      Yoshimoto Masafumi、Tokuda Aoi、Eguchi Ayami、Nozawa Yoshihiro、Mori Tsutomu、Yaginuma Yuji
    • 雑誌名

      Oncology

      巻: 101 号: 7 ページ: 457-468

    • DOI

      10.1159/000531209

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] NIRF研究会報告「情報と確率の等価性原理」2023

    • 著者名/発表者名
      森 努
    • 雑誌名

      福島県立医科大学看護学部紀要

      巻: 25 ページ: 31-41

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [学会発表] 影響力 -その定式化と応用について-2023

    • 著者名/発表者名
      森 努
    • 学会等名
      福島医学会学術研究集会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 情報と確率の等価性原理2023

    • 著者名/発表者名
      森 努
    • 学会等名
      福島医学会学術研究集会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Identification of a Novel Immune Checkpoint KYNU by the Ab Initio Genetic Orbital Method2023

    • 著者名/発表者名
      Tsutomu Mori, Takashi Kawamura, Susumu Goyama
    • 学会等名
      日本癌学会学術総会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Discovery of a Novel Immune Checkpoint KYNU by the Ab Initio Genetic Orbital Method2023

    • 著者名/発表者名
      Tsutomu Mori, Takashi Kawamura, Susumu Goyama, Tsuyoshi Shirai
    • 学会等名
      日本バイオインフォマティクス学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Ab initio遺伝子軌道法による新規免疫チェックポイントKYNUの同定2023

    • 著者名/発表者名
      森 努,合山 進
    • 学会等名
      第42回日本トリプトファン研究会学術集会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [産業財産権] 免疫チェックポイント阻害剤及びスクリーニング方法2023

    • 発明者名
      森 努
    • 権利者名
      福島県立医科大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2023-135357
    • 出願年月日
      2023
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2025-01-30  

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