研究課題/領域番号 |
20K09061
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
審査区分 |
小区分55020:消化器外科学関連
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研究機関 | 福島県立医科大学 |
研究代表者 |
早瀬 傑 福島県立医科大学, 医学部, 博士研究員 (00583387)
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研究分担者 |
岡山 洋和 福島県立医科大学, 医学部, 講師 (20583397)
坂本 渉 福島県立医科大学, 医学部, 講師 (40622337)
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研究期間 (年度) |
2020-04-01 – 2024-03-31
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研究課題ステータス |
交付 (2022年度)
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配分額 *注記 |
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2022年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2021年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2020年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
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キーワード | 大腸癌 / 染色体不安定性 / CIN / MSS |
研究開始時の研究の概要 |
大腸癌の多段階発癌に伴い、染色体不安定性(chromosomal instability: CIN)は増強し、またCINは癌進展を促進する。本課題は、CINを示す約85%の大腸癌(MSS/CIN)を対象に、腺腫形成・癌化・進展・転移過程で生じる染色体の欠失に着目する。CINを制御する遺伝子の不活化がCINのdriverとなると考えており、その同定と機能的検証、臨床的意義の解明を目的とする。bioinformaticsを用いた網羅的な遺伝子変異/コピー数 (増幅/欠失) /発現など多層データの統合解析と機能的検証を軸としており、癌進展の中心機構であるCINの理解と応用に知見をもたらすと考える。
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研究実績の概要 |
大腸癌の多段階発癌に伴い、染色体不安定性(chromosomal instability: CIN)は増強し、一方でCINは癌進展を促進するとされる。大腸癌の約15%がマイクロサテライト不安定性(microsatellite instability: MSI)を示すのに対し、残りの約85%はマイクロサテライト安定(microsatellite stable: MSS)であり典型的にはCINを示す。本課題は、CINあるいはMSSを示す約85%の大腸癌を対象として、腺腫形成・癌化・進展・転移過程で生じる染色体の欠失に着目する。CINを制御する遺伝子の不活化それ自体がCINのdriverとなり得るとも考えており、その同定と機能的検証、臨床的意義の解明を目的とするものである。
網羅的な遺伝子変異、コピー数 (増幅/欠失)、発現などオミクスデータの統合的な解析を行い、CINの過程で主として欠失によって機能喪失する遺伝子(群)の同定を試みている。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
4: 遅れている
理由
これまでの解析により、候補となる遺伝子群の抽出や検討を進めているものの、いずれも予備的段階にとどまっており、breakthroughを見いだせていない状況である。
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今後の研究の推進方策 |
データ解析の継続とともに、文献やパスウェイ解析からの遺伝子候補の絞り込みと遺伝子機能の推定、さらにin vitroでの実験系を拡大する。
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