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極低温電子顕微鏡を用いた単粒子解析による局所麻酔薬の結合阻害機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 20K09193
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
審査区分 小区分55050:麻酔科学関連
研究機関和歌山県立医科大学 (2021-2022)
名古屋大学 (2020)

研究代表者

入江 克雅  和歌山県立医科大学, 薬学部, 准教授 (20415087)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2022年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2021年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2020年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
キーワードイオンチャネル / 局所麻酔薬 / 構造生物学 / 電気生理学 / 局所麻酔剤 / 構造解析 / 電気生理 / 分子動力学計算 / ナトリウムチャネル / 構造機能相関
研究開始時の研究の概要

外科手術や疼痛除去に用いられる薬剤である局所麻酔剤と標的タンパク質であるナトリウムチャネルとの複合体構造を明らかにすることでの極巣麻酔剤の作用機構を理解し、より効率良く・より副作用の少ない局所麻酔剤の開発を可能にすることを目指す。構造解析には極低温電子顕微鏡による単粒子解析を用いて複合体の立体構造の原子分解能での決定を目指す。そして、明らかにした構造情報に基づいてナトリウムチャネル変異体の機能解析を行い局所麻酔剤の作用機序を解明する。

研究成果の概要

当初の目的である極低温電子顕微鏡による単粒子解析でのイオンチャネルの局所麻酔薬との複合体の構造決定は、分解能が不十分であったため、結合様式を決定することはできなかったが、変異体解析を行い局所麻酔剤の認識に関わる残基と相互作用する残基を同定することができた。さらに、構造解析と分子動力学計算から、その残基の役割を明らかにすることができた。 局所麻酔剤はイオンチャネルに結合し機能を発揮する際にはイオン化することが分かっており、イオン化した局所麻酔剤が如何にしてチャネル内にとどまるかについての重要な知見を得ることができた。

研究成果の学術的意義や社会的意義

局所麻酔剤は広く使われる薬剤でありながら、未だにこれによる事故が起きています。そのため、より副作用の少ない局所麻酔剤の開発が期待されています。本研究成果は局所麻酔剤の結合の対象分子であるナトリウムチャネルと麻酔剤の結合状態ついての知見を与えるものです。この結合機構が明らかになることで、既存の局所麻酔剤のどの部分を改良すればよいかの知見を得ることができます。本研究では結合に重要になるイオンチャネルのアミノ酸を明らかにし、どのように結合するかを丹念に調べることができました。
よって、今後さらなる研究を進めていくことでより安全な局所麻酔剤の開発につながることが期待されます。

報告書

(4件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2023 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (7件) (うち招待講演 4件)

  • [雑誌論文] The structural basis of the divalent cation blocking on tetrameric cation channel2023

    • 著者名/発表者名
      Irie Katsumasa、Oda Yoshinori、Sumikama Takashi、Oshima Atsunori、Fujiyoshi Yoshinori
    • 雑誌名

      Research Square

      巻: -

    • DOI

      10.21203/rs.3.rs-2252854/v1

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] Recognition Mechanism of a Novel Gabapentinoid Drug, Mirogabalin, for Recombinant Human α2δ1, a Voltage-Gated Calcium Channel Subunit2023

    • 著者名/発表者名
      Kozai Daisuke、Numoto Nobutaka、Nishikawa Kouki、Kamegawa Akiko、Kawasaki Shohei、Hiroaki Yoko、Irie Katsumasa、Oshima Atsunori、Hanzawa Hiroyuki、Shimada Kousei、Kitano Yutaka、Fujiyoshi Yoshinori
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology

      巻: 435 号: 10 ページ: 168049-168049

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2023.168049

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 細菌の祖先型イオンチャネルから探る,普遍的なカルシウム選択機構2021

    • 著者名/発表者名
      SHIMOMURA Takushi、IRIE Katsumasa
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 61 号: 4 ページ: 223-226

    • DOI

      10.2142/biophys.61.223

    • NAID

      130008068996

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The insights into calcium ion selectivity provided by ancestral prokaryotic ion channels2021

    • 著者名/発表者名
      Irie Katsumasa
    • 雑誌名

      Biophysics and Physicobiology

      巻: 18 号: 0 ページ: 274-283

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v18.033

    • NAID

      130008124789

    • ISSN
      2189-4779
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Gastric proton pump with two occluded K+ engineered with sodium pump-mimetic mutations2021

    • 著者名/発表者名
      Abe Kazuhiro、Yamamoto Kenta、Irie Katsumasa、Nishizawa Tomohiro、Oshima Atsunori
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 12 号: 1 ページ: 5709-5709

    • DOI

      10.1038/s41467-021-26024-1

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 細菌の祖先型イオンチャネルから探る、普遍的なカルシウム選択機構2021

    • 著者名/発表者名
      下村 拓史・入江 克雅
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 未定

    • NAID

      130008068996

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 結晶構造と分子動力学計算によるイオンチャネルにおける 二価カチオンの阻害機構の解析2023

    • 著者名/発表者名
      入江 克雅
    • 学会等名
      日本薬学会 第143年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 原核生物由来ナトリウムチャネルに創出された二価カチオ ンによる電流阻害の分子機構2023

    • 著者名/発表者名
      入江 克雅
    • 学会等名
      日本生理学会第100回記念大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 四量体型イオンチャネルにおける 二価カチオンによる阻害機構の 構造基盤の解析2022

    • 著者名/発表者名
      入江 克雅
    • 学会等名
      生理研研究会 ”構造情報を基盤とした膜機能分子の生理機能理解に向けて”
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 細菌のカルシウムチャネルが示すカルシウム選択的なイオン透過機構2022

    • 著者名/発表者名
      入江克雅
    • 学会等名
      第95回日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 細菌由来のイオンチャネルに見いだされたカルシウムの選択的透過と機能阻害2021

    • 著者名/発表者名
      入江克雅
    • 学会等名
      生理研研究会”構造情報を基盤とした膜機能分子の生理機能理解に向けて”
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] The generation of the divalent cation blocking on tetrameric sodium channel2021

    • 著者名/発表者名
      Katsumasa Irie, Yoshinori Oda and Atsunori Oshima
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 天然の原核生物由来カルシウムチャネルにおけるイオン透過選択性の進化とその決定残基の同定2020

    • 著者名/発表者名
      入江 克雅, 下村 拓史, 米川 佳樹, 名倉 仁, 立山 充博, 藤吉 好則
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-01-30  

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