• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

Elucidating plasma effect on structural modification of antioxidant enzymes: Combined experimental and computational

研究課題

研究課題/領域番号 20K14454
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分14030:プラズマ応用科学関連
研究機関九州大学

研究代表者

Attri Pankaj  九州大学, プラズマナノ界面工学センター, 准教授 (40868361)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 中途終了 (2022年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2022年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2021年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2020年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワードProtein folding / MD Simulation / Biophysical studies / Computational study / Mdm2 / p53 / Biophysical techniques / SARS-CoV-2 / NADPH oxidase / Plasma treated liquid / MDM2-p53 complex / antioxidant enzymes / Catalase enzyme / Superoxide Dismutase
研究開始時の研究の概要

The conventional cancer therapies lack selectivity, and resistance to the treatment while plasma-mediated apoptosis induction acts selectively on tumor cells. However, the latest plasma oncology studies reveal that selectivity is not observed for all cancer cell lines. This may be due to the elevated levels of antioxidant enzymes in some cancer cells. Therefore, in this project, we will study the effect of cold atmospheric plasma on the structure and activity of antioxidant enzymes. Later, we will use this information to improve the efficiency and selectivity of the plasma treatment.

研究成果の概要

酸化ストレスによるNoxa 1の構造修飾評価では、NOX1の制御サブユニットのNoxa1 SH3タンパク質の構造のプラズマによる変化を明らかにした。Noxa1タンパク質の構造変化を実験およびMDシミュレーションによって解析した。SARS-CoV-2スパイクタンパク質のC末端ドメイン構造へのプラズマの酸化の影響について、SARS-CoV-2-CTDスパイクタンパク質のC末端ドメインの構造およびSARS-CoV-2-CTDとヒトhACE2の相互作用に対するプラズマの影響を検討した。プラズマにより酸化の可能性があるMdm2、p53およびMdm2-p53の構造変化をMDシミュレーションにより検討した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究の学術的意義はプラズマ照射へのがん細胞の応答機序解明にある。我々はプラズマ処理によるNADPHオキシダーゼ・アクチベーター・プロテインとリゾチームの構造変化はアミノ酸の酸化によると示した。続いてSARS-CoV-2-CTDタンパク質の構造がプラズマ処理により不安定化し、酸化の抑制が結合自由エネルギーの減少に寄与すること、さらにプラズマで酸化されたMdm2はp53を阻害しないことを計算から示した。つまりプラズマ処理したがん細胞内の活性酸素の増加はp53によるカタラーゼの不活性化が原因と考えられる。以上の成果は新薬やワクチン、診断薬、治療薬の開発に繋がり、人類の健康へ貢献可能と期待できる。

報告書

(3件)
  • 2022 研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (40件)

すべて 2022 2021 2020 その他

すべて 雑誌論文 (19件) (うち国際共著 19件、 査読あり 19件、 オープンアクセス 10件) 学会発表 (13件) (うち国際学会 9件、 招待講演 6件) 図書 (1件) 備考 (5件) 産業財産権 (2件)

  • [雑誌論文] Improved luminescence performance of Yb3+-Er3+-Zn2+: Y2O3 phosphor and its application to solar cells2022

    • 著者名/発表者名
      Chawarambwa Fadzai Lesley、Putri Tika Erna、Hwang Sung-Hwa、Attri Pankaj、Kamataki Kunihiro、Itagaki Naho、Koga Kazunori、Nakamura Daisuke、Shiratani Masaharu
    • 雑誌名

      Optical Materials

      巻: 123 ページ: 111928-111928

    • DOI

      10.1016/j.optmat.2021.111928

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Outcomes of Pulsed Electric Fields and Nonthermal Plasma Treatments on Seed Germination and Protein Functions2022

    • 著者名/発表者名
      Attri Pankaj、Okumura Takamasa、Koga Kazunori、Shiratani Masaharu、Wang Douyan、Takahashi Katsuyuki、Takaki Koichi
    • 雑誌名

      Agronomy

      巻: 12 号: 2 ページ: 482-482

    • DOI

      10.3390/agronomy12020482

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Transition Metal Oxides and Their Composites for Photocatalytic Dye Degradation2021

    • 著者名/発表者名
      Ahuja Preety、Ujjain Sanjeev Kumar、Kanojia Rajni、Attri Pankaj
    • 雑誌名

      Journal of Composites Science

      巻: 5 号: 3 ページ: 82-82

    • DOI

      10.3390/jcs5030082

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Changes in the physical properties of low bandgap polymer after interaction with ionic liquids2021

    • 著者名/発表者名
      Jeong Seunghyun、Yoon Joon Ho、Attri Pankaj、Kim In Tae
    • 雑誌名

      Journal of Saudi Chemical Society

      巻: 25 号: 5 ページ: 101227-101227

    • DOI

      10.1016/j.jscs.2021.101227

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Impact of atmospheric pressure plasma treated seeds on germination, morphology, gene expression and biochemical responses2021

    • 著者名/発表者名
      Attri Pankaj、Koga Kazunori、Okumura Takamasa、Shiratani Masaharu
    • 雑誌名

      Japanese Journal of Applied Physics

      巻: 60 号: 4 ページ: 040502-040502

    • DOI

      10.35848/1347-4065/abe47d

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Plasma treatment causes structural modifications in lysozyme, and increases cytotoxicity towards cancer cells2021

    • 著者名/発表者名
      Attri Pankaj、Kaushik Nagendra Kumar、Kaushik Neha、Hammerschmid Dietmar、Privat-Maldonado Angela、De Backer Joey、Shiratani Masaharu、Choi Eun Ha、Bogaerts Annemie
    • 雑誌名

      International Journal of Biological Macromolecules

      巻: 182 ページ: 1724-1736

    • DOI

      10.1016/j.ijbiomac.2021.05.146

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Effects of concentrated light on the performance and stability of a quasi-solid electrolyte in dye-sensitized solar cells2021

    • 著者名/発表者名
      Chawarambwa Fadzai Lesley、Putri Tika Erna、Attri Pankaj、Kamataki Kunihiro、Itagaki Naho、Koga Kazunori、Shiratani Masaharu
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 781 ページ: 138986-138986

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2021.138986

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Green route for ammonium nitrate synthesis: fertilizer for plant growth enhancement2021

    • 著者名/発表者名
      Attri Pankaj、Koga Kazunori、Okumura Takamasa、Takeuchi Nozomi、Shiratani Masaharu
    • 雑誌名

      RSC Advances

      巻: 11 号: 46 ページ: 28521-28529

    • DOI

      10.1039/d1ra04441a

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Impact of Reactive Oxygen and Nitrogen Species Produced by Plasma on Mdm2-p53 Complex2021

    • 著者名/発表者名
      Attri Pankaj、Kurita Hirofumi、Koga Kazunori、Shiratani Masaharu
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 22 号: 17 ページ: 9585-9585

    • DOI

      10.3390/ijms22179585

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Functional nitrogen science based on plasma processing: quantum devices, photocatalysts and activation of plant defense and immune systems2021

    • 著者名/発表者名
      Kaneko Toshiro、Kato Hiromitsu、Yamada Hideaki、Yamamoto Muneaki、Yoshida Tomoko、Attri Pankaj、Koga Kazunori、Murakami Tomoyuki、Kuchitsu Kazuyuki、Ando Sugihiro、Nishikawa Yasuhiro、Tomita Kentaro、Ono Ryo、Ito Tsuyohito、Ito Atsushi M.、Eriguchi Koji、Nozaki Tomohiro、Tsutsumi Takayoshi、Ishikawa Kenji
    • 雑誌名

      Japanese Journal of Applied Physics

      巻: 61 号: SA ページ: SA0805-SA0805

    • DOI

      10.35848/1347-4065/ac25dc

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Performance Characteristics of Bifacial Dye-Sensitized Solar Cells with a V-Shaped Low-Concentrating Light System2021

    • 著者名/発表者名
      Putri Tika E.、Chawarambwa Fadzai L.、Son Min-Kyu、Attri Pankaj、Kamataki Kunihiro、Itagaki Naho、Koga Kazunori、Shiratani Masaharu
    • 雑誌名

      ACS Applied Energy Materials

      巻: 4 号: 12 ページ: 13410-13414

    • DOI

      10.1021/acsaem.1c02774

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Possible impact of plasma oxidation on the structure of C-terminal Domain of SARS-CoV-2 spike protein: A computational study2021

    • 著者名/発表者名
      Pankaj Attri*, K. Koga, and M. Shiratani
    • 雑誌名

      Applied Physics Express

      巻: 14 号: 2 ページ: 027002-027002

    • DOI

      10.35848/1882-0786/abd717

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Impact of seed color and storage time on the radish seed germination and sprout growth in plasma agriculture2021

    • 著者名/発表者名
      Attri Pankaj、Ishikawa Kenji、Okumura Takamasa、Koga Kazunori、Shiratani Masaharu、Mildaziene Vida
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 11 号: 1 ページ: 2539-2539

    • DOI

      10.1038/s41598-021-81175-x

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Cocktail of reactive species generated by cold atmospheric plasma: oral administration induces non-small cell lung cancer cell death2021

    • 著者名/発表者名
      C.-H. Song (co-first author), Pankaj Attri (co-first author), S.-K. Ku, I. Han, A. Bogaerts and E. H. Choi
    • 雑誌名

      Journal of Physics D: Applied Physics

      巻: 54 号: 18 ページ: 185202-185202

    • DOI

      10.1088/1361-6463/abdff2

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Structural modification of NADPH oxidase activator (Noxa 1) by oxidative stress: An experimental and computational study2020

    • 著者名/発表者名
      Pankaj Attri*, J.-H. Park, J. D. Backer, M. Kim, J.-H. Yun, Y. Heo, S. Dewilde, M. Shiratani, E. H. Choi, W. Lee, A. Bogaerts
    • 雑誌名

      International Journal of Biological Macromolecules

      巻: 163 ページ: 2405-2414

    • DOI

      10.1016/j.ijbiomac.2020.09.120

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Plasma Agriculture from Laboratory to Farm: A Review2020

    • 著者名/発表者名
      Attri Pankaj、Ishikawa Kenji、Okumura Takamasa、Koga Kazunori、Shiratani Masaharu
    • 雑誌名

      Processes

      巻: 8 号: 8 ページ: 1002-1002

    • DOI

      10.3390/pr8081002

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Carbon Nanotubes (CNTs): A Potential Nanomaterial for Water Purification2020

    • 著者名/発表者名
      B. Arora and Pankaj Attri*
    • 雑誌名

      Journal of Composites Science

      巻: 4 号: 3 ページ: 135-135

    • DOI

      10.3390/jcs4030135

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Influence of osmolytes and ionic liquids on the Bacteriorhodopsin structure in the absence and presence of oxidative stress: A combined experimental and computational study2020

    • 著者名/発表者名
      Pankaj Attri*, J. Razzokov, M. Yusupov, K. Koga, M. Shiratani, A. Bogaerts
    • 雑誌名

      International Journal of Biological Macromolecules

      巻: 148 ページ: 657-657

    • DOI

      10.1016/j.ijbiomac.2020.01.179

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Influence of alkyl chain substitution of ammonium ionic liquids on the activity and stability of tobacco etch virus protease2020

    • 著者名/発表者名
      Pankaj Attri*, S. Choi, M. Kim, M. Shiratani, A. E. Cho, W. Lee
    • 雑誌名

      International Journal of Biological Macromolecules

      巻: 155 ページ: 439-439

    • DOI

      10.1016/j.ijbiomac.2020.03.175

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] Green Route for the Production of Nitrogen Fertilizer: A Step Towards Decentralization of Fertilizer Production2022

    • 著者名/発表者名
      Pankaj Attri
    • 学会等名
      14th International Symposium on Advanced Plasma Science and Its Applications for Nitrides and Nanomaterials
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Cold plasma induced modification of the paramagnetic species of the radish and barley seeds2022

    • 著者名/発表者名
      Pankaj Attri
    • 学会等名
      69th JSAP Spring Meeting 2022
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Advanced Application of Non-thermal Atmospheric Plasma in Medicine and Agriculture2021

    • 著者名/発表者名
      Pankaj Attri
    • 学会等名
      International Conference on Advanced Materials for Next Generation Applications
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Cold Plasma induced structural modification of NADPH oxidase activator (Noxa 1) by oxidative stress2021

    • 著者名/発表者名
      Pankaj Attri
    • 学会等名
      82nd JSAP Autumn Meeting
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Comparative study on the decontamination of water using non-thermal atmospheric pressure plasma and gamma irradiation2021

    • 著者名/発表者名
      Pankaj Attri
    • 学会等名
      APA Bioforum International e-Conference on Polymeric Biomaterials & Bioengineering
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Influence of Cold Atmospheric Plasma on NADPH Oxidase 1 (NOX1) Enzyme and Membrane Protein Structures: A Combined Experimental and Computational Study2021

    • 著者名/発表者名
      Pankaj Attri
    • 学会等名
      8th International Conference on Plasma Medicine
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Impact of seed coat color on germination and seedling growth in plasma agriculture2021

    • 著者名/発表者名
      Pankaj Attri
    • 学会等名
      1st International Conference on Problems and Perspectives of Modern Science
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Green route for ammonium nitrate synthesis: Fertilizer for plant growth enhancement2021

    • 著者名/発表者名
      Pankaj Attri
    • 学会等名
      MRM2021 Materials Research Meeting
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Plasma treatment causes structural modifications in proteins, result in increased cytotoxicity towards cancer cells2021

    • 著者名/発表者名
      Pankaj Attri
    • 学会等名
      31st Annual Meetings of MRS-J
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Can plasma treatment solve the germination and growth problem in older seeds?2021

    • 著者名/発表者名
      Pankaj Attri
    • 学会等名
      ISPlasma2021/IC-PLANTS2021
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Impact of plasma oxidation on the binding of MDM2-p53 and its possible effects in cancer treatment2021

    • 著者名/発表者名
      Pankaj Attri
    • 学会等名
      ISPlasma2021/IC-PLANTS2021
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Impact of Plasma Treatment on the binding of C-terminal Domain of SARS-CoV-2 Spike Protein with Human Angiotensin-Converting Enzyme 2 (hACE2)2021

    • 著者名/発表者名
      Pankaj Attri
    • 学会等名
      30th Annual Meeting of the MRS-Japan
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Role of molecular dynamic simulation to predict the plasma oxidation effect on the binding energy of SARS-COV2-CTD and Human ACE22020

    • 著者名/発表者名
      Pankaj Attri
    • 学会等名
      Future Perspectives of Research in Chemical Science and Technology (An International eSTC)
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [図書] Nanomaterials for Water Remediation2020

    • 著者名/発表者名
      R. Bhatia, S. Garg, and Pankaj Attri
    • 総ページ数
      50
    • 出版者
      De Gruyter, Germany
    • ISBN
      9783110650600
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [備考] Kyushu University

    • URL

      https://kyushu-u.pure.elsevier.com/en/persons/pankaj-attri

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2020 実施状況報告書
  • [備考] Google Scholar

    • URL

      https://scholar.google.com/citations?user=LXH5lksAAAAJ&hl=en

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] Loop

    • URL

      https://loop.frontiersin.org/people/266263/overview

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] Loop Frontier

    • URL

      https://loop.frontiersin.org/people/266263/overview

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [備考] Research Map

    • URL

      https://researchmap.jp/pankaj-attri?lang=en

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [産業財産権] CO2 conversion using ionic liquid and plasma2022

    • 発明者名
      Pankaj Attri
    • 権利者名
      Pankaj Attri
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2022
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [産業財産権] Nitrogen rich biofertilizer2020

    • 発明者名
      P. Attri, K. Koga, M. Shiratani
    • 権利者名
      P. Attri, K. Koga, M. Shiratani
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2020
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-01-30  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi