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前生命環境の超分子化学

研究課題

研究課題/領域番号 20K15400
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分37010:生体関連化学
研究機関京都大学

研究代表者

窪田 亮  京都大学, 工学研究科, 講師 (00753146)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2021年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2020年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワード超分子 / コアセルベート / 液液相分離 / ヒドロゲル / 非平衡散逸系 / 超分子化学 / 自己集合 / 相分離 / ペプチド / 非平衡 / 人工生命
研究開始時の研究の概要

本若手研究では、研究代表者が独自に開発した自己集合性小分子からなるコアセルベートを用いて前生命的環境にとって必須な超分子化学反応システムを構築する。これまでにアミノ酸やリボヌクレオチドなどの生体高分子材料の前生命的な合成は実証されているものの、それらの生体高分子への合成過程はほぼ実証されていない。本研究ではこれらの課題を解決するため、人工化学システムで未踏であった生命機能(多成分・非平衡・濃縮反応場)を完全内包した超分子システムの開発に挑戦する。

研究成果の概要

本若手研究では、人工ジペプチド誘導体の液液相分離から形成されるコアセルベートを反応場とする前生命環境でも実現しうる生体関連反応の開発を行なった。フェニルアラニン連続配列を鍵とするコアセルベート形成のためのモノマーを合成した。コアセルベート内部において、前生命環境でも生成可能と考えられているアミノ酸活性体を利用しペプチド合成を促進させることに成功した。さらにコアセルベートが持つ反応性を利用して、時間変動する刺激によって分化するシステムを開発した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

生命の起源を明らかとすることは、科学にとって重要な問題の一つである。本研究では、生命の起源研究で未解明である生体関連高分子の形成メカニズムを明らかにするためのアイデアを提供できると期待される。また時間変動する刺激に応答する人工超分子は今まで開発されていなかった。今後本研究の成果を発展させることで、生命の起源・地球上の生命とは異なる形態の化学生命の開発に寄与できると期待される。

報告書

(3件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (32件)

すべて 2022 2021 2020 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 7件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (21件) (うち国際学会 3件、 招待講演 6件) 備考 (4件)

  • [雑誌論文] Shape-selective one-step synthesis of branched gold nanoparticles on the crystal surface of redox-active Pd<sup>II</sup>-macrocycles2022

    • 著者名/発表者名
      Yamashita Yutaro、Tashiro Shohei、Ishii Yoshiki、Uchihashi Takayuki、Matsushita Nobuyuki、Kubota Ryou、Shionoya Mitsuhiko
    • 雑誌名

      Dalton Transactions

      巻: 51 号: 4 ページ: 1318-1324

    • DOI

      10.1039/d1dt03973c

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Microscopic Imaging Techniques for Molecular Assemblies: Electron, Atomic Force, and Confocal Microscopies2021

    • 著者名/発表者名
      Ryou Kubota, Wataru Tanaka, Itaru Hamachi
    • 雑誌名

      Chemical Reviews

      巻: in press 号: 22 ページ: 14281-14347

    • DOI

      10.1021/acs.chemrev.0c01334

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phototriggered Spatially Controlled Out-of-Equilibrium Patterns of Peptide Nanofibers in a Self-Sorting Double Network Hydrogel2021

    • 著者名/発表者名
      Nakamura Keisuke、Tanaka Wataru、Sada Kei、Kubota Ryou、Aoyama Takuma、Urayama Kenji、Hamachi Itaru
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society

      巻: 143 号: 46 ページ: 19532-19541

    • DOI

      10.1021/jacs.1c09172

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Face-selective adsorption of a prochiral compound on the chiral pore-surface of metal-macrocycle framework (MMF) directed towards stereoselective reactions2021

    • 著者名/発表者名
      Tashiro Shohei, Umeki Tsutomu, Kubota Ryou, Shionoya Mitsuhiko
    • 雑誌名

      Faraday Discussions

      巻: 225 ページ: 197-209

    • DOI

      10.1039/d0fd00019a

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Force generation by a propagating wave of supramolecular nanofibers2020

    • 著者名/発表者名
      Kubota Ryou、Makuta Masahiro、Suzuki Ryo、Ichikawa Masatoshi、Tanaka Motomu、Hamachi Itaru
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 号: 1 ページ: 3541-3541

    • DOI

      10.1038/s41467-020-17394-z

    • NAID

      120006870865

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Protein-responsive protein release of supramolecular/polymer hydrogel composite integrating enzyme activation systems2020

    • 著者名/発表者名
      Shigemitsu Hajime、Kubota Ryou、Nakamura Keisuke、Matsuzaki Tomonobu、Minami Saori、Aoyama Takuma、Urayama Kenji、Hamachi Itaru
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 号: 1 ページ: 3859-3859

    • DOI

      10.1038/s41467-020-17698-0

    • NAID

      120006876564

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Control of seed formation allows two distinct self-sorting patterns of supramolecular nanofibers2020

    • 著者名/発表者名
      Kubota Ryou、Nagao Kazutoshi、Tanaka Wataru、Matsumura Ryotaro、Aoyama Takuma、Urayama Kenji、Hamachi Itaru
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 号: 1 ページ: 4100-4100

    • DOI

      10.1038/s41467-020-17984-x

    • NAID

      120006879495

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 界面活性剤添加により伸長と収縮を繰り返す超分子ファイバー2022

    • 著者名/発表者名
      鳥越 祥吾、窪田 亮、長尾 和俊、浜地 格
    • 学会等名
      日本化学会 第102春季年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 液液相分離を示すジペプチド型超分子(2): 時間パターンに依存した応答挙動2022

    • 著者名/発表者名
      窪田 亮、浜地 格
    • 学会等名
      日本化学会 第102春季年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 液液相分離を示すジペプチド型超分子(1): 分子設計と特性2022

    • 著者名/発表者名
      廣井 太郎、窪田 亮、浜地 格
    • 学会等名
      日本化学会 第102春季年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Imaging and Function of Self-sorted Supramolecular Double-networkHydrogels2022

    • 著者名/発表者名
      Ryou Kubota
    • 学会等名
      The 3rd CSLT-CSJ Joint Symposium 2022
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 生命から着想した超分子化学:多成分系と非平衡散逸系2021

    • 著者名/発表者名
      窪田 亮
    • 学会等名
      第6回有機若手ワークショップ
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Self-sorting型超分子ゲルにおける光駆動非平衡パターン形成2021

    • 著者名/発表者名
      中村 圭佑、田中 航、佐田 圭、窪田 亮、浜地 格
    • 学会等名
      第15回バイオ関連化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 超分子ダブルネットワークヒドロゲルにおける光駆動非平衡パターニング2021

    • 著者名/発表者名
      窪田 亮、中村 圭佑、田中 航、佐田 圭、浜地 格
    • 学会等名
      第70回高分子討論会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 共焦点顕微鏡による超分子・高分子複合ゲルのネットワーク構造のその場観察と分類2021

    • 著者名/発表者名
      佐田 圭、中村 圭佑、 窪田 亮、浜地 格
    • 学会等名
      第70回高分子討論会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 自己集合性ペプチド担時型高分子ヒドロゲルのpH応答と共焦点顕微鏡観察2021

    • 著者名/発表者名
      浜中 佑也、鳥越 祥吾、窪田 亮、浜地 格
    • 学会等名
      第70回高分子討論会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 刺激応答性超分子ファイバーによるCell-inspired非平衡パターニング2021

    • 著者名/発表者名
      窪田 亮
    • 学会等名
      第5回ABC-InFO講演会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Force generation by a propagating wave of artificial tripeptide-based fibrous assemblies2021

    • 著者名/発表者名
      Ryou Kubota, Masahiro Makuta, Ryo Suzuki, Masatoshi Ichikawa, Motomu Tanaka, Itaru Hamachi
    • 学会等名
      International symposium of macrocyclic and supramolecular chemistry 2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Visualization and Functional Development of Cell-inspired Supramolecular Materials2021

    • 著者名/発表者名
      Ryou Kubota
    • 学会等名
      日本化学会 第101春季年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Multiscale imaging reveals four distinct hierarchical networks in supramolecular/polymer hydrogel composites2021

    • 著者名/発表者名
      Keisuke Nakamura, Ryou Kubota, Kei Sada, Takuma Aoyama, Kenji Urayama, Itaru Hamachi
    • 学会等名
      日本化学会 第101春季年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 動的共有結合を用いた超分子Self-sortingネットワークの構造制御2021

    • 著者名/発表者名
      長尾 和俊、窪田 亮、田中 航、松村 亮太朗、青山 拓磨、浦山 健治、浜地 格
    • 学会等名
      日本化学会 第101春季年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Photo-induced spatial control of out-of-equilibrium network pattern of peptide nanofibers in a supramolecular double network hydrogel2021

    • 著者名/発表者名
      Wataru Tanaka, Ryou Kybota, Itaru Hamachi
    • 学会等名
      日本化学会 第101春季年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 超分子錯体化学を基盤とした細胞機能の模倣と制御2021

    • 著者名/発表者名
      窪田 亮
    • 学会等名
      分子研研究会, "錯体化学から始まる学術展開の可能性"
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 超分子ファイバーの核形成制御によるSelf-sorting構造の作り分け2020

    • 著者名/発表者名
      長尾 和俊、窪田 亮、田中 航、青山 拓磨、浦山 健治、浜地 格
    • 学会等名
      第69回高分子討論会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 超分子・高分子複合ゲル: 共焦点観察によるネットワーク構造の分類とレオロジー特性2020

    • 著者名/発表者名
      中村 圭佑、窪田 亮、佐田 圭、青山 拓磨、浦山 健治、浜地 格
    • 学会等名
      第69回高分子討論会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] ペプチド型超分子からなるコアセルベートの形成と特性2020

    • 著者名/発表者名
      服部 善行、窪田 亮、浜地 格
    • 学会等名
      第14回バイオ関連化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 細胞から着想を得た直交性超分子ポリマーの共焦点観察と機能2020

    • 著者名/発表者名
      窪田 亮
    • 学会等名
      CEMS Topical Meeting Online 超分子ポリマーの進化形
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Adaptive Self-sorted Supramolecular Double-network Hydrogels2020

    • 著者名/発表者名
      Ryou Kubota, Hajime Shigemitsu, Wataru Tanaka, Takahiro Fujisaku, Itaru Hamachi
    • 学会等名
      Virtual Symposium Systems Chemistry
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [備考] 代表者が所属する研究室のホームページ

    • URL

      http://www.sbchem.kyoto-u.ac.jp/hamachi-lab/index.php?hamachi-lab

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] 代表者が運営するホームページ

    • URL

      https://rkubota-chem.jimdofree.com/

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] 研究代表者が所属する研究室のホームページ

    • URL

      http://www.sbchem.kyoto-u.ac.jp/hamachi-lab/index.php?hamachi-lab

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [備考] 研究代表者が運営するホームページ

    • URL

      https://rkubota-chem.jimdofree.com/

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2023-01-30  

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