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環状タンパク質の四次構造制御による機能スイッチング

研究課題

研究課題/領域番号 20K15403
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分37010:生体関連化学
研究機関国立研究開発法人産業技術総合研究所

研究代表者

氷見山 幹基  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究員 (90828310)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2021年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2020年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワードタンパク質集合体 / 四次構造 / 化学修飾 / ペルオキシレドキシン / エックス線結晶構造解析 / タンパク質 / 分子修飾
研究開始時の研究の概要

本研究では、タンパク質分子が10個以上集まって形成するドーナツ状リングの、分散と集合のコントロールを目的とする。アミノ酸変異によって分散したタンパク質に対し、人工分子の修飾または酸化還元処理を行うことで集合させる。巨大分子であるタンパク質を、化学反応で再集合し、その機能を制御する。

研究成果の概要

四次構造は、複数のタンパク質鎖がタンパク質間相互作用により組みあがって形成する。このような複雑さと巨大さから、人工的な集合状態制御は困難だった。本研究ではアミノ酸変異と人工分子の修飾を組み合わせることで、巨大な環状タンパク質四次構造を持つペルオキシレドキシンの解離、および再集合を制御可能であることを見出した。本研究成果により、タンパク質集合体の機能制御や新しい集合体の創製など、既存の技術では困難であった課題の解決につながると期待される。

研究成果の学術的意義や社会的意義

複数のタンパク質がさらに組みあがることで、タンパク質の四次構造は形成する。分子量が数十万以上となり、構造も複雑であることから、人工的に集合状態を制御するのは困難だった。本研究ではタンパク質同士が相互作用する界面に着目し、アミノ酸変異や人工分子の修飾といった表面構造の変化を導入することで、巨大な環状タンパク質集合体の解離、および再集合を制御可能であることを見出した。タンパク質集合体のような巨大な生体超分子であっても、人工的に合成した超分子のように、局所的な構造を変えるだけで簡便に構造変化を引き起こすことが判明した。

報告書

(3件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2021 2020

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (5件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Crystal structure of acetylxylan esterase from Caldanaerobacter subterraneus subsp. tengcongensis.2021

    • 著者名/発表者名
      Kohei Sasamoto, Tomoki Himiyama, Kunihiko Moriyoshi, Takashi Ohmoto, Koichi Uegaki, Yoshiaki Nishiya, Tsutomu Nakamura
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica

      巻: F77 号: 11 ページ: 399-406

    • DOI

      10.1107/s2053230x21009675

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Increasing loop flexibility affords low-temperature adaptation of a moderate thermophilic malate dehydrogenase from Geobacillus stearothermophilus.2021

    • 著者名/発表者名
      Yuya Shimozawa, Tomoki Himiyama, Tsutomu Nakamura, Yoshiaki Nishiya
    • 雑誌名

      Protein Engineering Design and Selection

      巻: 34

    • DOI

      10.1093/protein/gzab026

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural analysis and reaction mechanism of malate dehydrogenase from Geobacillus stearothermophilus2021

    • 著者名/発表者名
      Shimozawa Yuya、Himiyama Tomoki、Nakamura Tsutomu、Nishiya Yoshiaki
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: - 号: 1 ページ: 97-105

    • DOI

      10.1093/jb/mvab027

    • NAID

      40022723378

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Artificial Metalloenzymes: From Selective Chemical Transformations to Biochemical Applications2020

    • 著者名/発表者名
      Himiyama Tomoki、Okamoto Yasunori
    • 雑誌名

      Molecules

      巻: 25 号: 13 ページ: 2989-2989

    • DOI

      10.3390/molecules25132989

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Rebuilding Ring-Type Assembly of Peroxiredoxin by Chemical Modification2020

    • 著者名/発表者名
      Himiyama Tomoki、Tsuchiya Yuko、Yonezawa Yasushige、Nakamura Tsutomu
    • 雑誌名

      Bioconjugate Chemistry

      巻: 32 号: 1 ページ: 153-160

    • DOI

      10.1021/acs.bioconjchem.0c00587

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Rebuilding and altering ring-type assembly of peroxiredoxin by chemical modification2021

    • 著者名/発表者名
      氷見山幹基、中村努
    • 学会等名
      第21回日本蛋白質科学年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 環状タンパク質多量体の構造制御2021

    • 著者名/発表者名
      氷見山幹基、中村努
    • 学会等名
      第19回 産総研・産技連LS-BT合同研究発表会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 複雑で巨大な環状タンパク質の構造制御2021

    • 著者名/発表者名
      氷見山幹基、中村努
    • 学会等名
      産業技術支援フェアin KANSAI 2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Rebuilding ring-type decameric assembly of peroxiredoxin by chemical modification2021

    • 著者名/発表者名
      氷見山幹基、中村努
    • 学会等名
      日本化学会第101春季年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Disassembly and reassembly of ring-type structure of peroxiredoxin by manipulating hydrophobic interaction2020

    • 著者名/発表者名
      氷見山幹基、中村努
    • 学会等名
      第20回蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [産業財産権] ペルオキシレドキシンに基づく人工ヘテロオリゴマータンパク質2021

    • 発明者名
      氷見山 幹基、中村努
    • 権利者名
      国立研究開発法人産業技術総合研究所
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2021-137971
    • 出願年月日
      2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2023-01-30  

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