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メタゲノム解析による陸上テトロドトキシンの生合成経路の解明

研究課題

研究課題/領域番号 20K15405
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分37020:生物分子化学関連
研究機関東北大学

研究代表者

工藤 雄大  東北大学, 学際科学フロンティア研究所, 助教 (60824662)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2021年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2020年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワードテトロドトキシン / イモリ / 生合成 / 構造解析 / メタゲノム / 質量分析 / メタゲノム解析
研究開始時の研究の概要

テトロドトキシン (TTX) は、強力な毒性、複雑な分子構造、フグやイモリなど様々な生物に分布するという特徴を持った興味深い化合物である。陸上のTTXの起源(生産者)は不明で、自然界でどのようにTTXが生産されるか(生合成経路)は長年の謎である。本研究では未知の毒生産者の遺伝子の解析と、天然に存在するTTX関連化合物の化学分析の両面からTTXの生合成経路の解明を目指す。

研究成果の概要

フグやイモリに含まれる神経毒テトロドトキシン(TTX)の生合成は未だ解明されていない。陸上におけるTTXの生合成経路解明を目指し、有毒イモリ生息地の環境メタゲノム解析および有毒イモリ由来の新規TTX関連物の探索を行った。有毒イモリ抽出物より新規TTX類縁体を得て、さらに既報成分の構造を改訂した。新規環状グアニジン化合物を複数発見し、そのうち2成分は新規三環性骨格を有することを明らかにした。得られた化合物の化学構造から、陸上におけるTTX生合成経路について知見を得た。また有毒イモリ生息地の環境メタゲノムからFosmid libraryを作成し、PCRスクリーニングと次世代シーケンサーで解析した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

最も有名な自然毒の一つで、重要な食中毒原因物質でもあるテトロドトキシン(TTX)の生合成に関する研究を行った。有毒イモリより新たなTTX類縁体を2種同定することができ、さらに既報の成分1種の構造改訂を行った。新規骨格構造を持つ化合物2種を含む新規環状グアニジノ化合物を得て、その構造を詳細に解析した。陸上におけるTTXの推定生合成およびシャント経路において多様な化合物が生成することを示し、新規化合物の構造から生合成経路への新たな知見が得られたことから、学術的・社会的な意義がある。有毒イモリ生息地の環境メタゲノムの塩基配列を解読し、今後、生合成経路の解明に貢献し得るデータが取得できた。

報告書

(3件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (40件)

すべて 2022 2021 2020 その他

すべて 国際共同研究 (3件) 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 4件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (26件) (うち国際学会 6件、 招待講演 6件) 備考 (5件)

  • [国際共同研究] ユタ州立大学/カリフォルニア大学サンディエゴ校(米国)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] University of California, San Diego/Utah State University(米国)

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [国際共同研究] University of British Columbia/Simon Fraser University(カナダ)

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [雑誌論文] First Identification of 12β-Deoxygonyautoxin 5 (12α-Gonyautoxinol 5) in the Cyanobacterium Dolichospermum circinale (TA04) and 12β-Deoxysaxitoxin (12α-Saxitoxinol) in D. circinale (TA04) and the Dinoflagellate Alexandrium pacificum (Group IV) (120518KureAC)2022

    • 著者名/発表者名
      Akamatsu Michiru、Hirozumi Ryosuke、Cho Yuko、Kudo Yuta、Konoki Keiichi、Oshima Yasukatsu、Yotsu-Yamashita Mari
    • 雑誌名

      Marine Drugs

      巻: 20 号: 3 ページ: 166-166

    • DOI

      10.3390/md20030166

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Identification of Tricyclic Guanidino Compounds from the Tetrodotoxin-Bearing Newt Taricha granulosa, .2021

    • 著者名/発表者名
      Yuta Kudo, Charles T. Hanifin, and Mari Yotsu-Yamashita.
    • 雑誌名

      Org. Lett.

      巻: 23 号: 9 ページ: 3513-3517

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.1c00916

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Phylogenetic Analysis of the Salinipostin γ-butyrolactone Gene Cluster Uncovers New Potential for Bacterial Signalling-molecule Diversity2021

    • 著者名/発表者名
      Kaitlin E. Creamer, Yuta Kudo, Bradley S. Moore, Paul R. Jensen
    • 雑誌名

      Microbial Genomics

      巻: 7 号: 5 ページ: 000568-000568

    • DOI

      10.1099/mgen.0.000568

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Two new skeletal analogues of saxitoxin found in the scallop, Patinopecten yessoensis, as possible metabolites of paralytic shellfish toxins2021

    • 著者名/発表者名
      Numano Satoshi、Kudo Yuta、Cho Yuko、Konoki Keiichi、Kaga Yoshimasa、Nagasawa Kazuo、Yotsu-Yamashita Mari
    • 雑誌名

      Chemosphere

      巻: 278 ページ: 130224-130224

    • DOI

      10.1016/j.chemosphere.2021.130224

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structures of N-Hydroxy-Type Tetrodotoxin Analogues and Bicyclic Guanidinium Compounds Found in Toxic Newts2020

    • 著者名/発表者名
      Yuta Kudo, Charles T. Hanifin, Yuichi Kotaki, Mari Yotsu-Yamashita*
    • 雑誌名

      Journal of Natural Products

      巻: 83 号: 9 ページ: 2706-2717

    • DOI

      10.1021/acs.jnatprod.0c00623

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Expansion of Gamma-Butyrolactone Signaling Molecule Biosynthesis to Phosphotriester Natural Products2020

    • 著者名/発表者名
      Kudo Yuta、Awakawa Takayoshi、Du Yi-Ling、Jordan Peter A.、Creamer Kaitlin E.、Jensen Paul R.、Linington Roger G.、Ryan Katherine S.、Moore Bradley S.
    • 雑誌名

      ACS Chemical Biology

      巻: 15 号: 12 ページ: 3253-3261

    • DOI

      10.1021/acschembio.0c00824

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] 陸上テトロドトキシンの生合成解明を目指した有毒イモリ由来の新規化合物の探索2022

    • 著者名/発表者名
      工藤 雄大, 山下 まり
    • 学会等名
      日本農芸化学会2022年度大会 大会シンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] テトロドトキシン含有イモリ由来の新規三環性骨格を持つ2種のグアニジノ化合物2022

    • 著者名/発表者名
      工藤 雄大, Charles T. Hanifin, 長 由扶子, 此木 敬一, 山下 まり
    • 学会等名
      日本農芸化学会2022年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Structures of novel analogues and possible biosynthetic intermediates/shunts of tetrodotoxin obtained from toxic newts2022

    • 著者名/発表者名
      Yuta Kudo
    • 学会等名
      Korea-Japan Joint Workshop on Biofunctional Chemistry
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] フグ毒テトロドトキシンの生合成経路の推定2022

    • 著者名/発表者名
      山下 まり, 工藤 雄大, 上山 望, Charles T. Hanifin, 沼野 聡, 長 由扶子, 此木 敬一
    • 学会等名
      令和4年度日本水産学会春季大会ミニシンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 12β-deoxysaxitoxinの藍藻Dolichospermum circinale (TA04) および渦鞭毛藻Alexandrium pacificum (Group IV)からの同定2022

    • 著者名/発表者名
      山下 まり, 赤松 みちる, 長 由扶子, 此木 敬一, 工藤 雄大, 大島 泰克
    • 学会等名
      令和4年度日本水産学会春季大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 抗テトロドトキシンモノクローナル抗体の 主要テトロドトキシン類縁体に対する交差反応性評価2022

    • 著者名/発表者名
      八巻 慶汰, 佐藤 恭佳, 工藤 雄大, 川津 健太郎, 荒川 修, 高谷 智裕, 長 由扶子, 此木 敬一, 山下 まり
    • 学会等名
      日本農芸化学会2022年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 異種発現環化酵素を用いた新規カイニン酸類縁体の調製2022

    • 著者名/発表者名
      山田 基生, 前野 優香理, 小瀧 裕一, 寺田 竜太, 工藤 雄大, 長 由扶子, 此木 敬一, 山下 まり
    • 学会等名
      日本農芸化学会2022年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] サキシトキシンの推定生合成中間体の合成と有毒淡水産藍藻における同定2022

    • 著者名/発表者名
      袴田 真有, 東海林 千容, 長 由扶子, 安達 栞菜, 石塚 颯, 工藤 雄大, 此木 敬一, 大島 泰克, 長澤 和夫, 山下 まり
    • 学会等名
      日本農芸化学会2022年度大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Identification of new analogues and possible biosynthetic shunt products of terrestrial tetrodotoxin aimed at elucidating its biosynthesis2021

    • 著者名/発表者名
      Yuta Kudo, Charles Hanifin, Mari Yotsu-Yamashita
    • 学会等名
      The 2021 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 二次元NMR long range-HSQMBCを用いた構造解析の有用性の検証2021

    • 著者名/発表者名
      工藤 雄大, 海原 大輔, Charles T. Hanifin, 長 由扶子, 此木 敬一, 山下 まり
    • 学会等名
      第156回 農芸化学会東北支部大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] テトロドトキシン含有サメハダイモリより得られた新規三環性骨格を有するグアニジノ化合物の構造解析2021

    • 著者名/発表者名
      工藤 雄大, Charles T. Hanifin, 長 由扶子, 此木 敬一, 山下 まり
    • 学会等名
      第63回 天然有機化合物討論会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Identification of New Analogues and Putative Biosynthetic Intermediates/Shunts of Tetrodotoxin from Toxic Newts2021

    • 著者名/発表者名
      Yuta Kudo, Charles T. Hanifin, Yuko Cho, Keiichi Konoki, Mari Yotsu-Yamshita
    • 学会等名
      ACS Publications Symposium: The Power of Chemical Transformations
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 新規三環性骨格を有するグアニジノ化合物の構造解析2021

    • 著者名/発表者名
      工藤 雄大, Charles T. Hanifin, 山下 まり
    • 学会等名
      第32 回万有仙台シンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Possible mode of action of polycavernosides, and Nav blocking activities of highly purified tetrodotoxin analogues2021

    • 著者名/発表者名
      Mari Yotsu-Yamashita, Yuka Doi, Kotaro, Iwasaki, Satori Sasaki, Yuki Kawashima, Noriko Shimada, Osamu Chiba, Kyoka Sato, Yuta Kudo, Yuko Cho, Keiichi Konoki, Makoto Sasaki
    • 学会等名
      The 2021 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Prediction of biosynthetic pathway towards tetrodotoxin based on the structures of its natural analogues2021

    • 著者名/発表者名
      Mari Yotsu-Yamashita, Yuta Kudo, Yuji Yaegashi, Satoshi Numano, Nozomi Ueyama, Charles Hanifin, Yuko Cho, Keiichi Konoki
    • 学会等名
      The 2021 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Hemiaminal type saxitoxin analogues found in the scallop, Patinopecten yessoensis2021

    • 著者名/発表者名
      Mari Yotsu-Yamashita, Satoshi Numano, Yuta Kudo, Yuko Cho, Keiichi Konoki, Yoshimasa Kaga, Kazuo Nagasawa
    • 学会等名
      9th International Conference on Harmful Algae
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] アメリカ産テトロドトキシン含有イモリより得られた新規環状グアニジノ化合物2021

    • 著者名/発表者名
      工藤 雄大, Charles T. Hanifin, 山下 まり
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] ホタテガイ (Patinopecten yessoensis) 中における麻痺性貝毒代謝物の探索2021

    • 著者名/発表者名
      沼野 聡, 工藤 雄大, 長 由扶子, 此木 敬一, 山下 まり
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 「天狗の麦飯」から分離されたクテドノバクテリア(Dictyobacter alpinus Uno16)からの抗菌化合物の探索2021

    • 著者名/発表者名
      齋藤 彩菜, 白石 太郎, 葛山 智久, 新谷 尚弘, 工藤 雄大, 山下 まり, 阿部 敬悦, 横田 明, 矢部 修平
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] フグ由来の新規テトロドトキシン関連化合物2021

    • 著者名/発表者名
      八重樫 優士, 上山 望, 工藤 雄大, 長 由扶子, 此木 敬一, 山下 まり
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] テトロドトキシン-タンパク質複合体作製のモデル反応と主生成物の構造決定2021

    • 著者名/発表者名
      善 瑞穂, 工藤 雄大, 長 由扶子, 此木 敬一, 山下 まり
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] テトロドトキシン類縁体のマウス毒性の再確認およびテトロドトキシンのアルカリ初期分解物の単離と構造2021

    • 著者名/発表者名
      山下 まり, 八重樫 優士, 佐藤 恭佳, 杉本 亜津子, 長 由扶子, 此木 敬一, 工藤 雄大
    • 学会等名
      令和3年度日本水産学会春季大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 有毒イモリより得られた新規テトロドトキシン類縁体および環状グアニジノ化合物2020

    • 著者名/発表者名
      工藤 雄大, Charles T. Hanifin, 山下 まり
    • 学会等名
      第62回 天然有機化合物討論会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 有毒イモリより得られた新規テトロドトキシン類縁体と推定生合成関連化合物の構造2020

    • 著者名/発表者名
      工藤 雄大, Charles T. Hanifin, 山下 まり
    • 学会等名
      第31 回万有仙台シンポジウム
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] ヒト虫歯菌が生産するテトラミン酸系抗生物質2020

    • 著者名/発表者名
      工藤 雄大, Xiaoyu Tang, Jonathon, L. Baker, Anna Edlund, Bradley S. Moore
    • 学会等名
      第155回 農芸化学会東北支部大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] ホタテガイ中腸腺由来オカダ酸アシル基転移酵素の可溶化条件の検討2020

    • 著者名/発表者名
      駒崎 有紀, 寺内 将斗, 工藤 雄大, 長 由扶子, 山下 まり, 此木 敬一
    • 学会等名
      第155回 農芸化学会東北支部大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [備考] 工藤雄大助教『Organic Letters』誌に論文掲載

    • URL

      http://www.fris.tohoku.ac.jp/feature/topics/detail---id-911.html

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] 天然物生命化学分野ホームページ

    • URL

      https://www.agri.tohoku.ac.jp/bukka/index-j.html

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] FRISHP, 工藤雄大 助教 論文掲載およびEditor's Choiceに選出

    • URL

      http://www.fris.tohoku.ac.jp/feature/topics/detail---id-806.html

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [備考] FRISHP, 工藤雄大 助教『ACS Chemical Biology』に論文掲載

    • URL

      http://www.fris.tohoku.ac.jp/feature/topics/detail---id-844.html

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [備考] 東北大学天然物生命化学分野HP

    • URL

      https://www.agri.tohoku.ac.jp/bukka/index-j.html

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2023-01-30  

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