| 研究課題/領域番号 |
20K15442
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| 研究種目 |
若手研究
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| 配分区分 | 基金 |
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| 審査区分 |
小区分38020:応用微生物学関連
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| 研究機関 | 国立研究開発法人産業技術総合研究所 |
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研究代表者 |
古林 真衣子 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 主任研究員 (90849895)
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| 研究期間 (年度) |
2020-04-01 – 2024-03-31
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| 研究課題ステータス |
交付 (2022年度)
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| 配分額 *注記 |
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2021年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2020年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
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| キーワード | アーキア / カロテノイド / ハロアーキア / 好熱性細菌 / 合成生物学 |
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| 研究開始時の研究の概要 |
アーキアが細菌・真核生物に並んで生命の第3のドメインだと発見されてから40年余、生命起源への進化的興味から多様な生物機能の工学応用まで、アーキアを対象とした研究はますます注目を浴びている。しかしアーキアの生物工学ツールの開発は遅れている：真核生物と細菌は、合成生物学や蛋白質工学技術が急速に進んでいるのに対し、アーキアで使える合成生物学ツールは報告が少ないのが現状である。本研究では、好気性ハロアーキアおよび好気性好熱性細菌を利用して、アーキア・とくにEuryarchaeotaで広く使えうる合成生物学ツールをハイスループットに作製・整備することを目指す。
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| 研究実績の概要 |
アーキアが細菌・真核生物に並んで生命の第3のドメインだと発見されてから40年余、生命起源への進化的興味から多様な生物機能の工学応用まで、アーキアを対象とした研究はますます注目を浴びている。しかしアーキアの生物工学ツールの開発は他の生物と比較して遅れているとも言える：真核生物と細菌は、合成生物学や蛋白質工学技術が急速に進んでいるのに対し、アーキアで使える合成生物学ツールは報告が少ないのが現状である。本研究では、好気性ハロアーキアおよび好気性好熱性細菌を利用して、アーキアで広く使えうる合成生物学ツールをハイスループットに作製・整備することを目指す。本研究で着目するHalobacterium, Thermus は共にカロテノイドを生合成して環境耐性を獲得しているが、これらの生物がもともと持っているカロテノイド経路遺伝子を応用することにより工学ツールの開発を目指す。
本年度は、昨年度に引き続き、好熱菌、好塩菌の生育条件の検討、およびツール整備を行った。ここでは、プロモータ等の遺伝子パーツのラインナップを増やし、広域ベクターに組み込んだ。ここで使用するベクターについて、生育条件の検討が必要であった。今後は当該ベクターだけでなく、他の生物由来のプラスミドベクターについても検討したい。また、複数の好熱菌を入手し、それらの細菌の生産するカロテノイドを分析した。さらに、ゲノム配列を解析し、生合成遺伝子の候補を同定した。
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
3: やや遅れている
理由
昨年に引き続き好熱菌や好塩菌の生育条件検討を行った。計画に記載したツール開発に着手したが、プラスミドを保持するための生育条件の最適化に当初の想定以上に時間がかかっている。
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| 今後の研究の推進方策 |
当初の計画で使用する予定であったプラスミドベクターやツールを用いるだけでなく、今後は他の生物由来の新規ベクターや発現制御配列を使用することも検討に入れる。
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