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好気性微生物を用いたハイスループット解析によるアーキア工学ツールの作製

研究課題

研究課題/領域番号 20K15442
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分38020:応用微生物学関連
研究機関国立研究開発法人産業技術総合研究所

研究代表者

古林 真衣子  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 主任研究員 (90849895)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2021年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2020年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
キーワードgenetic engineering / haloarchaea / carotenoids / ハロアーキア / 遺伝子工学 / カロテノイド / アーキア / 好熱性細菌 / 合成生物学
研究開始時の研究の概要

アーキアが細菌・真核生物に並んで生命の第3のドメインだと発見されてから40年余、生命起源への進化的興味から多様な生物機能の工学応用まで、アーキアを対象とした研究はますます注目を浴びている。しかしアーキアの生物工学ツールの開発は遅れている:真核生物と細菌は、合成生物学や蛋白質工学技術が急速に進んでいるのに対し、アーキアで使える合成生物学ツールは報告が少ないのが現状である。本研究では、好気性ハロアーキアおよび好気性好熱性細菌を利用して、アーキア・とくにEuryarchaeotaで広く使えうる合成生物学ツールをハイスループットに作製・整備することを目指す。

研究成果の概要

アーキアは多様で複雑な生物機能を持つことで知られ、遺伝子工学をより自在に行うことができれば、より魅力的な生物機能を生み出せるため期待が高まっている。しかしながらアーキア工学をするための遺伝子パーツ・ツールは、いまだに極めて少ない。本研究では、培養の簡単な好気性ハロアーキアおよび好気性好熱性細菌を利用して、アーキア発現制御パーツを作製することを目指した。まず多検体ディープウェルプレートを用いて1-2日でハロアーキアを培養する条件を確立した。さらに、シャトルベクターの作製により、プロモータ・レポーター配列を簡単に導入できるシステムを作製し、遺伝子機能をハイスループットに評価する実験系を確立した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

微生物工学の研究の中でも、アーキアに用いることができる遺伝子工学ツールはいまだに少ないのが現状である。これは、細菌・真核生物に比べても転写発現の仕組みが異なることに加え、一般にアーキアの培養は全て難しいと思われていることも大きく影響しているだろう。培養環境が嫌気・超高温など、セットアップが難しいために、生物工学者・合成生物学者の参入が少なかったのだろうと考えられる。本研究では、比較的培養が簡単である中温性・好気性のハロアーキアに注目し、そのハイスループットな培養条件検討と遺伝子工学ツールの機能評価を目指した。この戦略を応用することでさらなるアーキア工学の発展に繋がると考えられる。

報告書

(5件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (2件)

すべて 2024 2023

すべて 学会発表 (2件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)

  • [学会発表] 希少/非天然カロテノイド・アポカロテノイドの生合成工学2024

    • 著者名/発表者名
      古林真衣子
    • 学会等名
      日本農芸化学会2024年度大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Engineering Novel Retinal-Related Compounds through Carotenoid Pathway Engineering and Enzyme Mutagenesis2023

    • 著者名/発表者名
      Maiko Furubayashi
    • 学会等名
      The 19th International Symposium on Carotenoids (ISC2023)
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2025-01-30  

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