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炎症性腸疾患病因蛋白質NOD2の構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 20K15730
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分43020:構造生物化学関連
研究機関東京大学

研究代表者

張 志寛  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 助教 (60866937)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2021年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2020年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワード炎症性腸疾患 / 自然免疫 / NOD2 / クライオ電顕 / NLR / NOD-like receptor / クライオ電子顕微鏡
研究開始時の研究の概要

炎症性腸疾患 (IBD) は小腸や大腸の組織細胞が患者自身の免疫細胞に攻撃され、腸の粘膜に炎症反応が引き起こされる自己免疫疾患であり、世界的に年々増加する傾向を示している。日本においては、多くの炎症性腸疾患は指定難病とされている。
多数のIBD患者においてNOD2遺伝子に変異を有することが見つかり、NOD2の機能不全はIBDの原因として同定されている。しかし、NOD2の活性化機構およびNOD2の機能不全によるIBDの発症機構の分子基盤は解明されていない。本課題では、脂質膜に制御されるNOD2の構造生物学的研究を実施し、NOD2の活性化機構およびその機能破綻によるIBDの発症機構の解明を目指す。

研究成果の概要

炎症性腸疾患の病因タンパク質と言われているNOD2の活性化機構および活性制御機構は解明されておらず、炎症性腸疾患の発症の分子機構の理解およびNOD2を標的とする治療方法の開発が困難とされている。本研究ではNOD2の活性化機構の解明を目指していた。独自のPEG修飾法により、性質不安定なNOD2タンパク質を安定化させ、クライオ電顕による高分解能でのNOD2の構造解析を可能にした (Structure, 2021)。またNOD2と酸性脂質膜および新規リガンドのヘパリンとの相互作用を見出し、NOD2の活性化に必要である可能性が示唆されている。今後はこれらの相互作用相手との複合体構造解析を実施する。

研究成果の学術的意義や社会的意義

炎症性腸疾患 (IBD) は指定難病の一種であり、世界中の患者数が年々増加傾向である。IBDの病因タンパク質NOD2の活性化機能の解明はIBDの分子機構の解明に繋がり、有効な治療方法の開発に重要である。本研究で開発されたPEGylation分子修飾法のクライオ電子顕微鏡への適応はNOD2を始め、様々なタンパク質の高分解能クライオ電顕解析を可能とさせる新たなサンプル調製法を提供している。また、本研究で同定したNOD2の新規相互作用分子 (酸性脂質およびヘパリン) は、NOD2の活性制御機構の解明に向ける重要な知見を提供した。

報告書

(3件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2022 2021 2020 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 3件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Structural basis for the oligomerization-mediated regulation of NLRP3 inflammasome activation2022

    • 著者名/発表者名
      Ohto Umeharu、Kamitsukasa Yukie、Ishida Hanako、Zhang Zhikuan、Murakami Karin、Hirama Chie、Maekawa Sakiko、Shimizu Toshiyuki
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 119 号: 11

    • DOI

      10.1073/pnas.2121353119

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] アンタゴニストによるTLR7の阻害機構の構造基盤2021

    • 著者名/発表者名
      ZHANG Zhikuan
    • 雑誌名

      日本結晶学会誌

      巻: 63 号: 3 ページ: 181-182

    • DOI

      10.5940/jcrsj.63.181

    • NAID

      130008083573

    • ISSN
      0369-4585, 1884-5576
    • 年月日
      2021-08-31
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Improving particle quality in cryo-EM analysis using a PEGylation method2021

    • 著者名/発表者名
      Zhang Zhikuan、Shigematsu Hideki、Shimizu Toshiyuki、Ohto Umeharu
    • 雑誌名

      Structure

      巻: 29 号: 10 ページ: 1192-1199.e4

    • DOI

      10.1016/j.str.2021.05.004

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cryo-EM structures of Toll-like receptors in complex with UNC93B12021

    • 著者名/発表者名
      Ishida Hanako、Asami Jinta、Zhang Zhikuan、Nishizawa Tomohiro、Shigematsu Hideki、Ohto Umeharu、Shimizu Toshiyuki
    • 雑誌名

      Nature Structural & Molecular Biology

      巻: 28 号: 2 ページ: 173-180

    • DOI

      10.1038/s41594-020-00542-w

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structural analysis reveals TLR7 dynamics underlying antagonism2020

    • 著者名/発表者名
      Tojo Shingo、Zhang Zhikuan、Matsui Hiroyuki、Tahara Masahiro、Ikeguchi Mitsunori、Kochi Mami、Kamada Mami、Shigematsu Hideki、Tsutsumi Akihisa、Adachi Naruhiko、Shibata Takuma、Yamamoto Masaki、Kikkawa Masahide、Senda Toshiya、Isobe Yoshiaki、Ohto Umeharu、Shimizu Toshiyuki
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 号: 1 ページ: 1-11

    • DOI

      10.1038/s41467-020-19025-z

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [備考]

    • URL

      https://www.f.u-tokyo.ac.jp/topics.html?key=1646880551

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.f.u-tokyo.ac.jp/topics.html?page=2&key=1603192010

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2020-04-28   更新日: 2023-01-30  

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