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ストマチン様タンパク質とイオンチャネルタンパク質の相互作用機構の研究

研究課題

研究課題/領域番号 20K15732
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分43020:構造生物化学関連
研究機関大阪大学

研究代表者

竹川 宜宏  大阪大学, 大学院理学研究科, 助教 (50791810)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2022年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2021年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2020年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワードストマチン / チャネル / 細菌 / べん毛 / 蛋白質間相互作用 / 線虫 / トランスポーター / イオンチャネル / 神経 / 構造解析
研究開始時の研究の概要

本研究では、ストマチン様タンパク質(以下slipin)とチャネルタンパク質の複合体構造の決定を行う。構造を元にslipinとチャネルタンパク質の相互作用様式を原子レベルで明らかにする。slipinはほとんど全ての生物に保存されており、slipinによって様々なチャネル/トランスポータータンパク質がどのような分子メカニズムによって制御されているのかを明らかにすることは、生命現象の根幹に関わる重要な課題である。チャネルやトランスポーターは細胞、ひいては生物の活動に必須であり、slipinは病理学的にも重要なターゲットである。本研究の達成は病理学的な原因追求や感染症に対する新規薬剤の探索にも繋がる。

研究成果の概要

本研究では、ストマチン様タンパク質(slipin)と制御するチャネルタンパク質の相互作用機構を明らかにすることを目的とした。線虫と細菌をモデルとして、異なるslipinと対応するチャネルタンパク質の複合体を分子構造の知見から考察した。全長蛋白質やフラグメントの発現系を確立し、安定的に精製可能なフラグメントの同定に成功した。多量体構造を作りやすい性質を持つタンパク質についても再現よく確認された。MEC-2とMEC-4の弱い相互作用も検出された。低温電子顕微鏡により、MotA/Bホモログの構造が明らかになった。また、MotBホモログがNa+と結合することで構造変化するメカニズムも明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

ほとんど全ての生物に保存されているslipinは、多様な機能を持つチャネル/トランスポータータンパク質を制御する。しかし、異なる構造を持つチャネルタンパク質をどのように制御するのか、また、同じ構造モチーフを持つslipinがどのように機能的な多様性を生み出すのかが興味深い。さらに、チャネルやトランスポーターは生物活動に必須であり、slipinは病理学的にも重要なターゲットである。本研究は、病理学的な原因追求や新規薬剤の探索に繋がる可能性がある。同一ファミリーのタンパク質がここまで多様な相互作用パートナーを持つ例はほとんどなく、今後も生命現象の根幹に関わる重要な課題である。

報告書

(4件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (20件)

すべて 2023 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (14件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Structure of MotA, a flagellar stator protein, from hyperthermophile2023

    • 著者名/発表者名
      Tatsuro Nishikino, Norihiro Takekawa, Duy Phuoc Tran, Jun-ichi Kishikawa, Mika Hirose, Sakura Onoe, Seiji Kojima, Michio Homma, Akio Kitao, Takayuki Kato and Katsumi Imada
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 631 ページ: 78-85

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2022.09.072

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Two distinct conformations in 34 FliF subunits generate three different symmetries within the flagellar MS-ring2021

    • 著者名/発表者名
      Takekawa N, Kawamoto A, Sakuma M, Kato T, Kojima S, Kinoshita M, Minamino T, Namba K, Homma M, Imada K.
    • 雑誌名

      mBio

      巻: 12 号: 2

    • DOI

      10.1128/mbio.03199-20

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書 2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The FlhA linker mediates flagellar protein export switching during flagellar assembly2021

    • 著者名/発表者名
      Inoue Yumi、Kinoshita Miki、Kida Mamoru、Takekawa Norihiro、Namba Keiichi、Imada Katsumi、Minamino Tohru
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 4 号: 1 ページ: 646-646

    • DOI

      10.1038/s42003-021-02177-z

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A slight bending of an α-helix in FliM creates a counterclockwise-locked structure of the flagellar motor in <i>Vibrio</i>2021

    • 著者名/発表者名
      Takekawa Norihiro、Nishikino Tatsuro、Yamashita Toshiki、Hori Kiyoshiro、Onoue Yasuhiro、Ihara Kunio、Kojima Seiji、Homma Michio、Imada Katsumi
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: 170 号: 4 ページ: 531-538

    • DOI

      10.1093/jb/mvab074

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] ZomB is essential for chemotaxis of Vibrio alginolyticus by the rotational direction control of the polar flagellar motor2021

    • 著者名/発表者名
      Takekawa N, Nishikino T, Hori K, Kojima S, Imada K, Homma M.
    • 雑誌名

      Genes Cells.

      巻: 26(11) 号: 11 ページ: 927-937

    • DOI

      10.1111/gtc.12895

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structure and Energy-Conversion Mechanism of the Bacterial Na+-Driven Flagellar Motor2020

    • 著者名/発表者名
      Takekawa Norihiro、Imada Katsumi、Homma Michio
    • 雑誌名

      Trends in Microbiology

      巻: 28 号: 9 ページ: 719-731

    • DOI

      10.1016/j.tim.2020.03.010

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ビブリオ菌固定子PomAPomBの単粒子解析によるイオン結合部位の解析2023

    • 著者名/発表者名
      錦野達郎、竹川宜宏、岸川淳一、廣瀬未果、小嶋誠司、本間道夫、加藤貴之、今田勝巳
    • 学会等名
      2022年度べん毛研究交流会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] イオン透過に関わるMotAとMotBの相対運動2023

    • 著者名/発表者名
      チャンフズイ、錦野達郎、竹川宜宏、小島誠司、今田勝巳、本間道夫、北尾彰朗
    • 学会等名
      2022年度べん毛研究交流会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 固定子の回転計測実験系の構築2023

    • 著者名/発表者名
      上堀まりあ、山下俊貴、竹川宜宏、上野博史、野地博行、今田勝巳
    • 学会等名
      2022年度べん毛研究交流会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Cryo-EM structure analysis of the PomAB complex, a bacterial flagellar stator of sodium-driven motor in Vibrio alginolyticus2022

    • 著者名/発表者名
      錦野達郎、竹川宜宏、岸川淳一、廣瀬未果、小嶋誠司、本間道夫、加藤貴之、今田勝巳
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Vibrioべん毛モーター固定子複合体のCryo-EMによる単粒子解析2022

    • 著者名/発表者名
      錦野達郎、竹川宜宏、岸川淳一、廣瀬未果、小嶋誠司、本間道夫、加藤貴之、今田勝巳
    • 学会等名
      第54回ビブリオシンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Atomic structure of Na+ conducting flagellar energy convertor, the PomAB complex from Vibrio alginolyticus, by Cryo-EM2022

    • 著者名/発表者名
      錦野達郎、竹川宜宏、岸川淳一、廣瀬未果、小嶋誠司、本間道夫、加藤貴之、今田勝巳
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] クライオ電子顕微鏡単粒子解析による海洋性ビブリオ菌べん毛モーター固定子PomAPomBのイオン透過経路の解明2022

    • 著者名/発表者名
      錦野達郎、竹川宜宏、岸川淳一、廣瀬未果、小嶋誠司、本間道夫、加藤貴之、今田勝巳
    • 学会等名
      日本生体エネルギー研究会第48回討論会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 枯草菌べん毛モーター固定子のナトリウム依存的構造変化メカニズム2022

    • 著者名/発表者名
      竹川宜宏、上堀まりあ、山口綾香、南野徹、今田勝巳
    • 学会等名
      生体運動研究合同班会議2022
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] べん毛が時計回りに回転するFliM変異体の構造機能解析2022

    • 著者名/発表者名
      竹川宜宏、錦野達郎、山下俊貴、堀清志郎、尾上靖宏、 井原邦夫、小嶋誠司、本間道夫、今田勝巳
    • 学会等名
      2021年度 べん毛研究交流会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 細菌べん毛モーターの力学応答に寄与する小さなリング2022

    • 著者名/発表者名
      竹川宜宏
    • 学会等名
      第95回 日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Structure of the hook-filament junction with the filament cap in the bacterial flagellum2021

    • 著者名/発表者名
      竹川宜宏、池田篤志、宮田知子、牧野文信、難波啓一、今田勝巳
    • 学会等名
      第59回 日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 枯草菌べん毛モーター固定子のNa+依存的構造変化は短いhelixの形成により誘起される2021

    • 著者名/発表者名
      竹川宜宏、上堀まりあ、山口綾香、南野徹、今田勝巳
    • 学会等名
      日本生体エネルギー研究会 第47回討論会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] The structural and biochemical analyses of MEC-2 and its partner channel proteins in C. elegans2020

    • 著者名/発表者名
      Norihiro Takekawa, Maria Uehori, Shunji Nakano, Ikue Mori, Michio Homma, Katsumi Imada
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] FliMのわずかな構造変化により,べん毛モーターが反時計回りに固定される2020

    • 著者名/発表者名
      竹川宜宏、錦野達郎、山下俊貴、堀清志郎、小嶋誠司、本間道夫、今田勝巳
    • 学会等名
      日本生体エネルギー研究会 第46回討論会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-01-30  

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