| 研究課題/領域番号 |
20K15756
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| 研究種目 |
若手研究
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| 配分区分 | 基金 |
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| 審査区分 |
小区分43040:生物物理学関連
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| 研究機関 | 京都大学 |
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研究代表者 |
Walinda Erik 京都大学, 医学研究科, 助教 (80782391)
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| 研究期間 (年度) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2022年度)
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| 配分額 *注記 |
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2021年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2020年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
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| キーワード | ubiquitin / ubiquitin binding / NZF domain / M1 ubiquitin chains / linear ubiquitin chains / NMR spectroscopy / ITC / MD simulations / M1-linked chains / polyubiquitin / binding domains / Protein binding / Molecular competition / Linear polyubiquitin / NF-kappa B / Ubiquitin |
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| 研究開始時の研究の概要 |
[1] Binding of NEMO to linear ubiquitin in vitro, [2] Binding of A20 to linear ubiquitin in vitro
First we will conduct the binary experiments for both proteins and other similar candidates such as HOIL-1L binding to linear ubiquitin in vitro. These parameters will be necessary to dissect the competitive mechanism [3]
[3] Competitive binding to linear ubiquitin in vitro
ITC and NMR experiments coupled with atomic simulations together will provide a comprehensive picture of the competition between A20 and NEMO (and HOIL-1L) for binding to linear ubiquitin.
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| 研究成果の概要 |
タンパク質へのポリユビキチン鎖の付着は、真核生物における重要な翻訳後修飾です。HOIP、HOIL-1L、SHARPINから成る直鎖ユビキチン鎖組み立て複合体（LUBAC）は、特定の種類のポリユビキチン鎖である直鎖ユビキチン鎖を合成します。HOIL-1Lは、そのNZFドメインを介して直鎖ポリユビキチンを選択的に結合することが知られているタンパク質の一つです。HOIL-1L NZFドメインと直鎖ユビキチンの結合形態の構造は既知ですが、認識特異性のいくつかの側面は未解明です。
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
Scientific significance: understanding non-proteolytic functions of ubiquitin chains, particularly in immune signaling, survival, inflammation, immune disorders, cancer, and infectious diseases.
Social significance: potential to contribute to the development of treatments for immune disorders.
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