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季節性毛色変化の収斂的な進化メカニズムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 20K15862
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分45030:多様性生物学および分類学関連
研究機関国立遺伝学研究所 (2021-2022)
京都大学 (2020)

研究代表者

木下 豪太  国立遺伝学研究所, ゲノム・進化研究系, 博士研究員 (60774578)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2022年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2021年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2020年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワード季節性毛色変化 / 環境適応 / 野生哺乳類 / 収斂進化 / 全ゲノム解析 / 気候変動
研究開始時の研究の概要

本研究では北方に生息する多様な哺乳類で季節性毛色変化が収斂進化した遺伝的メカニズムを明らかにするため、全ゲノム解析によってニホンノウサギの責任遺伝子を特定し、ノウサギ属内で季節性毛色変化が収斂進化した遺伝的基盤と進化背景を解明する。そして、他属の哺乳類でも全ゲノム情報をもとに候補遺伝子を精査し、多様な哺乳類での収斂進化メカニズムを解明する。さらに、日本列島を舞台に各種がどのように毛色多型を獲得・維持してきたのかを集団史と絡め、時空間的に推定する。

研究成果の概要

本研究ではニホンノウサギの毛色二型の原因遺伝子について、遺伝子発現パターンの解析、系統解析による多型の獲得起源の解析、過去の気候変動による集団動態の推定を進めた。その結果、多型に関わるアリルで換毛期間中の発現量に差があることを検出した。また、ニホンノウサギの多型のアリルは、同一遺伝子による多型をもつ北米のオジロジャックウサギの多型のアリルは系統的に離れていることを明らかにした。また、列島内で最終氷期前後での有効集団サイズの増加と減少が推定された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

毛色や羽毛の冬季白化は積雪環境への適応形質として、温帯以北の様々な哺乳類や鳥類で収斂進化している。しかし、異なる分類群間でどのように冬季白化が収斂進化したのかは未解明な部分が大きい。本研究では、ニホンノウサギはこれまで報告されている大陸産ノウサギとは異なる遺伝的基盤により季節性毛色変化を収斂進化させたことを明らかにすることができた。同時にその起源として、祖先多型の可能性や、未解析種からの遺伝子浸透の可能性も示唆された。本研究の成果は、北方に生息する多様な哺乳類で季節適応の遺伝的基盤と、気候変動による生物の進化的応答についての重要な知見を与えるものである。

報告書

(4件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (4件)

  • [雑誌論文] 次世代シークエンス時代における哺乳類学~初学者への誘い~2020

    • 著者名/発表者名
      佐藤 淳、木下 豪太
    • 雑誌名

      哺乳類科学

      巻: 60 号: 2 ページ: 307-319

    • DOI

      10.11238/mammalianscience.60.307

    • NAID

      130007884427

    • ISSN
      0385-437X, 1881-526X
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mouse hair significantly lightened through replacement of the cysteine residue in the N-terminal domain of Mc1r using the CRISPR/Cas9 system.2020

    • 著者名/発表者名
      Suzuki H, Kinoshita G, Tsunoi T, Noju M, Araki K.
    • 雑誌名

      Journal of Heredity

      巻: 111 号: 7 ページ: 640-645

    • DOI

      10.1093/jhered/esaa054

    • NAID

      120007160279

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 全ゲノム解析を活用した多様な哺乳類研究2022

    • 著者名/発表者名
      木下豪太
    • 学会等名
      日本哺乳類学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 島嶼固有種のノウサギにおける季節性毛色変化の進化2021

    • 著者名/発表者名
      木下 豪太, 布目 三夫, 郷 康広, 牧野 能士, 辰本 将司, Alexey P KRYUKOV, Sang-Hoon HAN, Irina KARTAVTSEVA, 永野 惇,山田 文雄, 井鷺 裕司,北野潤,鈴木仁
    • 学会等名
      日本生態学会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 始めてみよう!野生哺乳類のゲノミクス2021

    • 著者名/発表者名
      木下豪太、佐藤拓真、角井建、遠藤優
    • 学会等名
      日本哺乳類学会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] ニホンノウサギが冬季に白化するか茶色のままかを決める原因遺伝子と進化史2020

    • 著者名/発表者名
      木下 豪太, 布目 三夫, 郷 康広, 牧野 能士, 辰本 将司, Alexey P KRYUKOV, Sang-Hoon HAN, Irina KARTAVTSEVA, 永野 惇,山田 文雄, 鈴木 仁, 井鷺 裕司
    • 学会等名
      日本生態学会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-01-30  

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