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Characterization of unstudied RND-type multidrug efflux pumps from pathogenic microorganisms

研究課題

研究課題/領域番号 20K16242
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分49050:細菌学関連
研究機関大阪大学

研究代表者

ZWAMA MARTIJN  大阪大学, 産業科学研究所, 特任助教(常勤) (40827052)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2022年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2021年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2020年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワードMultidrug resistance / Pathogens / Bacteria / Transporters / Phylogenetics / Evolution / Adaptation / Antibiotics / RND / Multidrug Resistance / MDR / Efflux pumps / AcrB / Transporter
研究開始時の研究の概要

Multidrug resistance is a major threat to human health worldwide. With this research we aim to better understand drug resistance on a molecular level, by investigating RND efflux pumps from multiple previously unstudied bacteria. We will test substrate specificity patterns and inhibition efficiencies. We are also interested to see the possible coupling of the pumps with different outer membrane proteins: an area of recent interests for the development of efflux pump inhibitors.

研究成果の概要

複数のグラム陰性菌からRND型多剤排出ポンプをクローニングし、発現させ、数種のRND型多剤排出ポンプの相違点と類似点を丹念に調べた上で変異を導入してきた。その結果、RND型多剤排出ポンプの機能、その進化、保存、機能に関して、多剤耐性分野に関連し、重要な興味深い新知見を得ることができた。この研究期間中に、複数の査読付きジャーナルに研究論文(およびレビュー記事)を発表した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

We expanded our understanding of multidrug resistance and provided novel insights into the function and adaptation of RND pumps. This has social significance as it contributes to healthcare strategies in combating multidrug resistance and addresses the global health challenge of drug resistance.

報告書

(4件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 6件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 6件)

  • [雑誌論文] Spatial Characteristics of the Efflux Pump MexB Determine Inhibitor Binding2022

    • 著者名/発表者名
      Yamasaki Seiji、Koga Naoki、Zwama Martijn、Sakurai Keisuke、Nakashima Ryosuke、Yamaguchi Akihito、Nishino Kunihiko
    • 雑誌名

      Antimicrobial Agents and Chemotherapy

      巻: 66 号: 11

    • DOI

      10.1128/aac.00672-22

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Inhibitor binding pits analysis of bacterial multidrug efflux transporters for new drug development2022

    • 著者名/発表者名
      Yamasaki Seiji、Zwama Martijn、Koga Naoki、Sakurai Keisuke、Nakashima Ryosuke、Yamaguchi Akihito、Nishino Kunihiko
    • 雑誌名

      Precision Medicine

      巻: 59 ページ: 56-60

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Proximal Binding Pocket Arg717 Substitutions in Escherichia coli AcrB Cause Clinically Relevant Divergencies in Resistance Profiles2022

    • 著者名/発表者名
      Zwama Martijn、Nishino Kunihiko
    • 雑誌名

      Antimicrobial Agents and Chemotherapy

      巻: 66 号: 4

    • DOI

      10.1128/aac.02392-21

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Ever-Adapting RND Efflux Pumps in Gram-Negative Multidrug-Resistant Pathogens: A Race against Time2021

    • 著者名/発表者名
      Zwama Martijn、Nishino Kunihiko
    • 雑誌名

      Antibiotics

      巻: 10 号: 7 ページ: 774-774

    • DOI

      10.3390/antibiotics10070774

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Proximal binding pocket Arg717 substitutions in Escherichia coli AcrB cause clinically relevant divergencies in resistance profiles2021

    • 著者名/発表者名
      Zwama Martijn、Nishino Kunihiko
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: 12.16 ページ: 473095-473095

    • DOI

      10.1101/2021.12.16.473095

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Function and Inhibitory Mechanisms of Multidrug Efflux Pumps2021

    • 著者名/発表者名
      Nishino Kunihiko、Yamasaki Seiji、Nakashima Ryosuke、Zwama Martijn、Hayashi-Nishino Mitsuko
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 12 ページ: 737288-737288

    • DOI

      10.3389/fmicb.2021.737288

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Identification of Genetic Variants via Bacterial Respiration Gas Analysis2020

    • 著者名/発表者名
      Koga Naoki、Hosomi Takuro、Zwama Martijn、Jirayupat Chaiyanut、Yanagida Takeshi、Nishino Kunihiko、Yamasaki Seiji
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 11 ページ: 581571-581571

    • DOI

      10.3389/fmicb.2020.581571

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-01-30  

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