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Identification of potentially self-reactive T cell receptors and their candidate epitopes in a mouse model of rheumatoid arthritis

研究課題

研究課題/領域番号 20K16286
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分49070:免疫学関連
研究機関国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所 (2021-2022)
大阪大学 (2020)

研究代表者

LlamasCovarrubias MaraAnais  国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, 医薬基盤研究所 ワクチン・アジュバント研究センター, 研究員 (00867715)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2022年度: 390千円 (直接経費: 300千円、間接経費: 90千円)
2021年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2020年度: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
キーワードAutoimmunity / T cell receptor / single cell sequencing / Rheumatoid arthritis / T Cell Receptor / Rheumatoid Arthritis / epitope
研究開始時の研究の概要

The activating peptides and the receptor molecules responsible for the development of autoimmune diseases are largely unknown. We aim to identify candidate self-reactive receptor-peptide pairs in a mouse model of Rheumatoid Arthritis, by single cell sequencing and machine learning.

研究成果の概要

自己免疫疾患の原因となるT細胞受容体(TCR)分子は、集中的な研究にもかかわらず、ほとんど知られていません。本研究では関節リウマチモデルマウスの組織において、いくつかの自己反応性T細胞グループとそのTCRを同定した。我々は3つの自己反応性細胞群を発見した。そのうちの2つは非常に類似したTCRを持つ。もう一つは、遺伝子プログラムもTCRもユニークで、関節にのみ発生する。自己反応性Tconv TCRと正常なTregおよびTconv TCRの結果の類似性の比較は、自己免疫におけるTregからTconvへのレパートリーシフトという仮説を支持する。

研究成果の学術的意義や社会的意義

We provided a novel description of the gene programs and TCRs involved in autoimmunity and showed evidence of a Treg/Tconv repertoire shift. These results, increase our current understanding of the pathogenesis of autoimmune diseases and generate new hypothesis that can be tested in future research.

報告書

(4件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて 2023 2022 2020

すべて 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 2件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (1件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Construction of a T cell receptor signaling range for spontaneous development of autoimmune disease2022

    • 著者名/発表者名
      Tanaka Atsushi、Maeda Shinji、Nomura Takashi、Llamas-Covarrubias Mara Anais、Tanaka Satoshi、Jin Lin、Lim Ee Lyn、Morikawa Hiromasa、Kitagawa Yohko、Akizuki Shuji、Ito Yoshinaga、Fujimori Chihiro、Hirota Keiji、et al、Sakaguchi Shimon
    • 雑誌名

      Journal of Experimental Medicine

      巻: 220 号: 2 ページ: 1-5

    • DOI

      10.1084/jem.20220386

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Methods for sequence and structural analysis of B and T cell receptor repertoires2020

    • 著者名/発表者名
      Teraguchi Shunsuke、Saputri Dianita S.、Llamas-Covarrubias Mara Anais、Davila Ana、Diez Diego、Nazlica Sedat Aybars、Rozewicki John、Ismanto Hendra S.、Wilamowski Jan、Xie Jiaqi、Xu Zichang、Loza-Lopez Martin de Jesus、van Eerden Floris J.、Li Songling、Standley Daron M.
    • 雑誌名

      Computational and Structural Biotechnology Journal

      巻: 18 ページ: 2000-2011

    • DOI

      10.1016/j.csbj.2020.07.008

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Single cell sequencing reveals a Tconv tissue adaptation process influenced by the TCR in a mouse model of rheumatoid arthritis2023

    • 著者名/発表者名
      Mara Llamas-Covarrubias, Atsushi Tanaka, Martin Loza-Lopez, Diego Diez, Shimon Sakaguchi, Daron Standley
    • 学会等名
      18th International Congress of Immunology
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2025-03-27  

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