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エピゲノム解析を用いた各種肺癌の分化プログラムの探索

研究課題

研究課題/領域番号 20K17192
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分53030:呼吸器内科学関連
研究機関慶應義塾大学

研究代表者

佐藤 崇  慶應義塾大学, 医学部, 共同研究員 (20464836)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2022年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2021年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2020年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワードエピゲノム / 肺癌 / super-enhancer / 肺大細胞神経内分泌癌 / 細胞系統因子 / 転写プログラム / 肺がん / 分化プログラム / 不均一性 / 肺大細胞神経内分泌がん / 可塑性
研究開始時の研究の概要

近年の抗癌治療の進歩にも関わらず、肺癌は依然本邦の癌死因第一位の予後不良な疾患である。肺癌患者に対する新たな治療戦略開発の礎となる、病態の理解に向けた革新的な研究戦略が求められている。これまでの研究により、癌の発生する臓器に特徴的なDNA結合因子が癌細胞の状態を制御し、その癌の振る舞いを規定することが示唆されている。研究代表者らは、最新のエピゲノム解析により肺扁平上皮癌において新規サブタイプを同定した。本研究では、これまで解析が困難であったホルマリン固定検体やオルガノイド検体を用いた解析を計画する。各種肺癌における個々の違いや治療耐性のメカニズムを検討し、個別化治療をを向上させることを目指す。

研究成果の概要

肺癌の中でも高悪性度神経内分泌腫瘍はとりわけ予後不良である。本研究で我々はエピゲノムプロファイリングを用いて各種肺癌の多様性、特に神経内分泌要素を有する肺癌の神経内分泌分化の多様性を明らかにすることを目的とした。その結果、我々は神経内分泌要素を有する肺癌の異なる分化サブタイプを同定し、これらはこれまで報告された細胞系統転写因子の発現に基づいた分類と異なる可能性が考えられた。ASCL1とNKX2-1の高発現によって規定されるクラシカルな神経内分泌サブタイプは他のサブタイプと比較してより神経内分泌の特徴を有していた。

研究成果の学術的意義や社会的意義

大規模な肺癌ゲノム研究によりシグナル伝達分子に数々の体性遺伝子異常が発見されてきたものの、主に肺腺癌に見つかる遺伝子変化を除けば標的治療の開発に結びついていない。一方、肺癌ゲノム研究を通じて癌細胞が細胞系統転写因子の規定する分化プログラムに依存していることも示されてきた。しかし、大多数の肺癌における分化プログラムを規定する分子機構は未だ見つかっておらず、特に肺癌の中でも予後不良である高悪性度神経内分泌腫瘍の分類と特徴付けは確立していなかった。本研究では肺癌における神経内分泌分化の多様性が既知の報告と異なるパターンであることが示唆され、今後肺癌細胞の可塑性と脆弱性の解明につながる可能性がある。

報告書

(4件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 2件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 3件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] 小細胞肺がん・肺神経内分泌がんにおける分子サブタイプの検討2022

    • 著者名/発表者名
      Sato Takashi、Naoki Katsuhiko
    • 雑誌名

      肺癌

      巻: 62 号: 4 ページ: 286-291

    • DOI

      10.2482/haigan.62.286

    • ISSN
      0386-9628, 1348-9992
    • 年月日
      2022-08-20
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Transcriptional Circuitry of NKX2-1 and SOX1 Defines an Unrecognized Lineage Subtype of Small-Cell Lung Cancer2022

    • 著者名/発表者名
      Kong Ranran、Patel Ayushi S.、Sato Takashi、Jiang Feng、Yoo Seungyeul、Bao Li、Sinha Abhilasha、Tian Yang、Fridrikh Maya、Liu Shuhui、Feng Jie、He Xijing、Jiang Jiantao、Ma Yuefeng、Grullon Karina、Yang Dawei、Powell Charles A.、Beasley Mary Beth、Zhu Jun、Snyder Eric L.、Li Shaomin、Watanabe Hideo
    • 雑誌名

      American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine

      巻: 206 号: 12 ページ: 1480-1494

    • DOI

      10.1164/rccm.202110-2358oc

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Integrative network analysis of early-stage lung adenocarcinoma identifies aurora kinase inhibition as interceptor of invasion and progression2022

    • 著者名/発表者名
      Yoo Seungyeul、Sinha Abhilasha、Yang Dawei、Altorki Nasser K.、Tandon Radhika、Wang Wenhui、Chavez Deebly、Lee Eunjee、Patel Ayushi S.、Sato Takashi、Kong Ranran、Ding Bisen、Schadt Eric E.、Watanabe Hideo、Massion Pierre P.、Borczuk Alain C.、Zhu Jun、Powell Charles A.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 13 号: 1

    • DOI

      10.1038/s41467-022-29230-7

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Early-Stage Lung Adenocarcinoma MDM2 Genomic Amplification Predicts Clinical Outcome and Response to Targeted Therapy2022

    • 著者名/発表者名
      Sinha Abhilasha、Zou Yong、Patel Ayushi S.、Yoo Seungyeul、Jiang Feng、Sato Takashi、Kong Ranran、Watanabe Hideo、Zhu Jun、Massion Pierre P.、Borczuk Alain C.、Powell Charles A.
    • 雑誌名

      Cancers

      巻: 14 号: 3 ページ: 708-708

    • DOI

      10.3390/cancers14030708

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Transcriptional circuitry of NKX2-1 and SOX1 defines an unrecognized lineage subtype of small cell lung cancer2022

    • 著者名/発表者名
      Ranran Kong、Ayushi S. Patel、Takashi Sato、Seungyeul Yoo、Li Bao、Abhilasha Sinha、Feng Jiang、Yang Tian、Maya Fridrikh、Shuhui Liu、Jie Feng、Xijing He、Jiantao Jiang、Yuefeng Ma 、Karina Grullon 、Dawei Yang、Charles A. Powell 、Mary Beth Beasley 、Jun Zhu 、Eric L. Snyder、Shaomin Li、Hideo Watanabe
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.1101/2022.03.06.483161

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際共著
  • [雑誌論文] Prototypical oncogene family Myc defines unappreciated distinct lineage states of small cell lung cancer2021

    • 著者名/発表者名
      Ayushi S. Patel、Seungyeul Yoo、Ranran Kong、Takashi Sato、Abhilasha Sinha、Sarah Karam、Li Bao、Maya Fridrikh、Katsura Emoto、German Nudelman、Charles A. Powell、Mary Beth Beasley、Jun Zhu、Hideo Watanabe
    • 雑誌名

      Science Advances

      巻: 7 号: 5

    • DOI

      10.1126/sciadv.abc2578

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Standard therapy-resistant small cell lung cancer showing dynamic transition of neuroendocrine fate during the cancer trajectory: A case report2021

    • 著者名/発表者名
      Fumimaro Ito、Takashi Sato 、Katsura Emoto、Nobuki Kaizuka、Kazuma Yagi、Rinako Watanabe、Mizuha Haraguchi Hashiguchi 、Hironori Ninomiya、Yuki Ikematsu、Kentaro Tanaka、Hideharu Domoto、Tetsuya Shiomi
    • 雑誌名

      Molecular and Clinical Oncology

      巻: 15 号: 6 ページ: 261-261

    • DOI

      10.3892/mco.2021.2423

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Epigenomic profiling identifies distinct neuroendocrine subtypes in lung cancer with neuroendocrine differentiation2022

    • 著者名/発表者名
      Sato T, Hamamoto J, Emoto K, Fukushima T, Sugihara K, Shirasawa M, Nakahara Y, Igawa S, Murakumo Y, Kohno T, Shiraishi K, Yasuda H, Soejima K, Watanabe H. and Naoki K
    • 学会等名
      AACR Annual Meeting 2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Transcriptional circuitry of NKX2-1 and SOX1 defines a previously unrecognized lineage subtype of small cell lung cancer2022

    • 著者名/発表者名
      Kong R, Patel AS, Sato T, Yoo S, Sinha A, Tian Y, Jiang Y, Powell CA, Snyder E, Jiang J, Li S. and Watanabe H
    • 学会等名
      AACR Annual Meeting 2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Epigenomic profiling identifies distinct neuroendocrine subtypes in lung cancer with neuroendocrine differentiation2022

    • 著者名/発表者名
      Takashi Sato, Junko Hamamoto, Katsura Emoto, Takahiro Fukushima, Kai Sugihara, Masayuki Shirasawa, Yoshiro Nakahara, Satoshi Igawa, Yoshiki Murakumo, Takashi Kohno, Kouya Shiraishi, Hiroyuki Yasuda, Kenzo Soejima, Hideo Watanabe, Katsuhiko Naoki
    • 学会等名
      AACR Annual Meeting 2022
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 学会奨励賞受賞講演 肺癌細胞における分化系統プログラムの不均一性の解明2020

    • 著者名/発表者名
      佐藤崇
    • 学会等名
      第60回日本呼吸器学会学術講演会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-01-30  

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