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遺伝子発現マッピングとメタボロミクスマッピング統合による膵癌組織微小環境の解明

研究課題

研究課題/領域番号 20K17622
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分55020:消化器外科学関連
研究機関九州大学

研究代表者

寅田 信博  九州大学, 大学病院, 臨床検査技師 (00398075)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2021年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2020年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワード遺伝子発現マッピング / メタボロミクスマッピング
研究開始時の研究の概要

手術切除標本を用いた研究が行われているが、組織微小環境での位置情報は失われていることが多い。がん細胞だけでなく、免疫細胞やその他の間質細胞の不均一性が、腫瘍の特性や治療抵抗性に関連することが注目されており、局在データの必要性が高まっている。本研究では、RNAをスライドガラス上で捕捉し、組織中の位置情報を持った遺伝子発現解析を実現する10XGENOMICS社のSpatial Transcriptomics技術を用いて、遺伝子発現マッピングを行い、メタボロミクスマッピングと組み合わせることによって、多面的な膵癌組織微小環境の解明し、その制御による新規治療法の開発を目指す。

研究成果の概要

組織微小環境の解明のため、コンポーネントの1つである癌関連線維芽細胞量と膵癌分化度の関連を調べたところ、ヒト膵癌オルガノイドを用いた実験で、腫瘍分化度が高いほど周囲のCAFが多いことを確認し、微小環境因子を介した癌の増殖に寄与している可能性を示唆する結果を得た。網羅的遺伝子発現解析で、分化度が高いほどmevalonate経路を中心としたcholesterol synthesis関連遺伝子の発現が増加していた。 分化度が異なる膵癌オルガノイドにHMG-CoA還元酵素阻害剤であるsimvastatinを投与すると, 高分化膵癌オルガノイドにおいて低分化より有意に増殖能が抑制することを確認した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

膵癌は癌の中でもっとも予後不良な癌の一つで、その特徴の一つにdesmoplasiaと呼ばれる豊富な間質増生があり、治療抵抗性や、薬剤送達率低下への関与が明らかにされている。本研究成果は、細胞の相互作用を再現したヒト膵癌オルガノイドを用い、腫瘍微小環境における、腫瘍分化度と癌間質量の関連性を明らかにするだけでなく、cholesterol synthesis関連遺伝子の発現が増加していることを明らかにし、治療ターゲットとしての可能性を見出した点で学術的、社会的意義が高い。

報告書

(3件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2022 2021

すべて 学会発表 (9件)

  • [学会発表] Single cell RNA sequenceを用いたpor2胃癌におけるcancer associated fibroblastのheterogeneityの解明2022

    • 著者名/発表者名
      堤親範、大内田研宙、中村祥一、奥田翔、久野恭子、大坪慶志輝、寅田信博、進藤幸治、森山大樹、水内祐介、仲田興平、中村雅史
    • 学会等名
      第94回日本胃癌学会総会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 正規表現によるパターンマッチを利用した病理レポート癌取扱い規約因子のデータベース登録2021

    • 著者名/発表者名
      寅田信博、水内祐介、大内田研宙、久保真、仲田興平、永井俊太郎、三好圭、岡部安博、小田義直、中村雅史
    • 学会等名
      第121回日本外科学会定期学術集会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] scRNA-seqを用いた食道扁平上皮癌におけるCD8+T細胞をとりまく免疫微小環境の解明2021

    • 著者名/発表者名
      奥田翔、大内田研宙、大坪慶志輝、寅田信博、進藤幸治、森山大樹、水内祐介、仲田興平、永井俊太郎、中村雅史
    • 学会等名
      第76回日本消化器外科学会総会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] scRNA-seqを用いたFAPにおけるfibroblastのheterogeneityの解明2021

    • 著者名/発表者名
      久野恭子、水内祐介、大内田研宙、奥田翔、大坪慶志輝、寅田信博、永吉絹子、仲田興平、永井俊太郎、中村雅史
    • 学会等名
      第76回日本消化器外科学会総会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] シングルセル解析による食道扁平上皮癌内腫瘍浸潤リンパ球の評価2021

    • 著者名/発表者名
      中村祥一、大内田研宙、久野恭子、持田郁己、奥田翔、大坪慶志輝、水内祐介、進藤幸治、仲田興平、森山大樹、永井俊太郎、中村雅史
    • 学会等名
      第76回日本消化器外科学会総会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 画像認識による未固定大腸癌切除標本中の病変部検出と腫瘍正常識別および深達度予測2021

    • 著者名/発表者名
      寅田信博、大内田研宙、諸岡健一、永井俊太郎、水内祐介、河田純、小田義直、中村雅史
    • 学会等名
      第29回日本消化器関連学会週間(JDDW 2021)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Single cell RNA sequenceを用いた家族性大腸腺腫症におけるmacrophageのheterogeneityの解明2021

    • 著者名/発表者名
      久野恭子、水内祐介、大内田研宙、中村祥一、奥田翔、大坪慶志輝、佐田政史、永吉絹子、寅田信博、進藤幸治、仲田興平、森山大樹、永井俊太郎、中村雅史
    • 学会等名
      第29回日本消化器関連学会週間(JDDW 2021)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Single-cell RNA-sequenceを用いた食道扁平上皮癌の免疫環境についての解析2021

    • 著者名/発表者名
      奥田翔、大内田研宙、大坪慶志輝、中村祥一、久野恭子、持田郁己、新川智彦、寅田信博、水内祐介、進藤幸治、森山大樹、仲田興平、中村雅史
    • 学会等名
      第29回日本消化器関連学会週間(JDDW 2021)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] シングルセル解析による食道癌内の腫瘍浸潤マクロファージの食作用の評価2021

    • 著者名/発表者名
      中村祥一、大内田研宙、奥田翔、大坪慶志輝、寅田信博、水内祐介、進藤幸治、仲田興平、森山大樹、中村雅史
    • 学会等名
      第29回日本消化器関連学会週間(JDDW 2021)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2023-01-30  

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