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前向きゲノムコホート研究の縦断解析による循環器疾患の発症リスク予測モデルの構築

研究課題

研究課題/領域番号 20K18943
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分58030:衛生学および公衆衛生学分野関連:実験系を含まない
研究機関藤田医科大学

研究代表者

藤井 亮輔  藤田医科大学, 医療科学部, 講師 (60823846)

研究期間 (年度) 2022-12-19 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2022年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2021年度: 390千円 (直接経費: 300千円、間接経費: 90千円)
2020年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
キーワードゲノム疫学 / ポリジェニックリスクスコア / 高血圧 / 遺伝統計学 / コホート研究 / GWAS
研究開始時の研究の概要

循環器疾患は、脳血管疾患と虚血性心疾患を含み我が国の主要な死因の一つであるが、死亡だけでなく、発症に伴う個人の QOL 低下や我が国の医療経済システムにも大きな影響を与える。そのリスク因子としてすでに確立されている喫煙・飲酒などの生活習慣に加え、遺伝的要因の発症への関与が最近明らかになっている。これらの情報を統合した高リスク者のより精密な層別化が循環器疾患の一次予防として重要である。そこで、本課題では、健常人を対象とした大規模ゲノムコホート研究の縦断データを使用し、「日本人特有の遺伝的なリスクスコアと生活習慣を組み合わせた循環器疾患の新規発症を予測するモデルの構築」に取り組む。

研究実績の概要

令和5年度(2023年度)は、本課題の目的である縦断解析におけるポリジェニックリスクスコア(PRS)の構築を目指して、日本多施設共同コーホート研究(J-MICC Study)のデータセットのうち、遺伝的多型の情報が測定されている9,296人の日本人集団での収縮期血圧および拡張期血圧に関するPRSを構築した。PRSの計算方法には、PRSice-2およびPRS-CSという方法を用いた。PRS構築のために参照した収縮期血圧および拡張期血圧のGWAS要約統計量は、バイオバンクジャパンが公開しているGWASデータ:Phewebからダウンロードし利用した。
収縮期血圧および拡張期血圧のPRSと血圧実測値との横断解析については、Fujii R, et al. Circ Genom Precis Med. 2022. を参照されたい。今年度の実績としては、収縮期血圧および拡張期血圧のPRSと追跡期間中の全死亡・循環器疾患死亡との関連を調べた。循環器死亡はICD-10のI00-I99とした。統計解析では、PRSを5つのグループ(0-10%、10-20%、20-80%、80-90%、90-100%)に分割し、中間群(20-80%)を対照としてそれ以外の群のハザード比(HR)をCox比例ハザードモデルで推定した。追跡期間中(中央値12.6年)に、全死亡は273例、循環器死亡は41例観察された。PRS中間群(20-80%)と比較して、PRS最上位群(90-100%)の多変量調整HR(95% CI)は、収縮期血圧のPRSでは3.57(1.68-7.58)、拡張期血圧のPRSでは3.94(1.78-8.72)であった。研究成果は、第34回日本疫学会学術総会にて報告し、英語論文は査読中である。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

本研究の到達目的である血圧PRSと追跡期間中の循環器死亡との関連も調べており、十分に研究計画は達成されていると考える。さらに、令和6年度は発展的な解析に取り組む。

今後の研究の推進方策

主要な研究目的をさらに発展させ、1)血圧PRSを超えて循環器疾患に関与する生体指標のPRSを構築し、循環器死亡との関連を探索すること、2)血圧PRSと血圧実測値の両者を活用した個別化医療(検査)に資する層別化解析を行うことを計画している。

報告書

(3件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2024 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (4件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件) 学会発表 (4件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Integration of methylation quantitative trait loci (mQTL) on dietary intake on DNA methylation levels: an example of n-3 PUFA and ABCA1 gene2023

    • 著者名/発表者名
      Fujii Ryosuke、Ando Yoshitaka、Yamada Hiroya、Tsuboi Yoshiki、Munetsuna Eiji、Yamazaki Mirai、Mizuno Genki、Maeda Keisuke、Ohashi Koji、Ishikawa Hiroaki、Watanabe Mami、Imaeda Nahomi、Goto Chiho、Wakai Kenji、Hashimoto Shuji、Suzuki Koji
    • 雑誌名

      European Journal of Clinical Nutrition

      巻: 77 号: 9 ページ: 881-887

    • DOI

      10.1038/s41430-023-01315-6

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Associations of Genome-Wide Polygenic Risk Score and Risk Factors With Hypertension in a Japanese Population2022

    • 著者名/発表者名
      Fujii R., Hishida A., Nakatochi M., Tsuboi Y., Suzuki K., Kondo T., Ikezaki H., Hara M., et. al.
    • 雑誌名

      Circulation: Genomic and Precision Medicine

      巻: 15 号: 4

    • DOI

      10.1161/circgen.121.003612

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] DNA methylation as a mediator of associations between the environment and chronic diseases: A scoping review on application of mediation analysis2021

    • 著者名/発表者名
      Fujii Ryosuke、Sato Shuntaro、Tsuboi Yoshiki、Cardenas Andres、Suzuki Koji
    • 雑誌名

      Epigenetics

      巻: 17 号: 7 ページ: 1-27

    • DOI

      10.1080/15592294.2021.1959736

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] 日本人集団における循環器疾患に関する生活習慣とゲノム情報の統合解析 -前向きゲノムコホート研究の活用-2021

    • 著者名/発表者名
      藤井亮輔
    • 雑誌名

      BioClinica

      巻: 5 ページ: 41-45

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 血圧ポリジェニックリスクスコアと循環器死亡との関連:前向きコホート研究 J-MICC Study2024

    • 著者名/発表者名
      藤井亮輔、菱田朝陽、中杤昌弘、坪井良樹、鈴木康司、若井建志、松尾恵太郎、J-MICC Study Group
    • 学会等名
      第34回日本疫学会学術総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] マルチ・ポリジェニックリスクスコアと循環器死亡との関連:前向きコホート研究 J-MICC Study2024

    • 著者名/発表者名
      藤井亮輔、永吉真子、中杤昌弘、坪井良樹、鈴木康司、若井建志、松尾恵太郎、J-MICC Study Group
    • 学会等名
      第94回日本衛生学会学術総会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] ゲノムワイドPRS と血圧指標との関連2023

    • 著者名/発表者名
      藤井亮輔
    • 学会等名
      日本多施設共同コーホート研究全体会議(一般公開)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 日本人集団におけるゲノムワイドなポリジェニックリスク・スコアと高血圧との関連2022

    • 著者名/発表者名
      藤井亮輔、菱田朝陽、中杤昌弘、坪井良樹、鈴木康司、竹内研時、若井建志、J-MICC Study group
    • 学会等名
      第32回日本疫学会学術総会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [図書] ポストGWAS時代の遺伝統計学2024

    • 著者名/発表者名
      藤井亮輔
    • 総ページ数
      232
    • 出版者
      羊土社
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2024-12-25  

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