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ホシミドロ目藻類の受容体型キナーゼとリガンドから迫る、植物の陸上進出背景

研究課題

研究課題/領域番号 20K21451
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分45:個体レベルから集団レベルの生物学と人類学およびその関連分野
研究機関日本女子大学

研究代表者

関本 弘之  日本女子大学, 理学部, 教授 (20281652)

研究分担者 西山 智明  金沢大学, 疾患モデル総合研究センター, 助教 (50390688)
池谷 仁里  神戸大学, 理学研究科, 学術研究員 (30531579)
坂山 英俊  神戸大学, 理学研究科, 准教授 (60391108)
研究期間 (年度) 2020-07-30 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
2022年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2021年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2020年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワードアオミドロ / ヒメミカヅキモ / ミカヅキモ / 受容体型キナーゼ / ペプチドリガンド / 受容体 / RLK / ホシミドロ目
研究開始時の研究の概要

本研究では、2種のホシミドロ目藻類を用いて、細胞分化、細胞増殖に関わるリガンド・RLKペアの特定を行うことを通して、陸上植物へと進化する上で重要な役割を示した細胞間コミュニケーションの実体に迫ることを目的とする。リガンド・RLKペアの機能解析を進め、陸上植物で見られる機能分化した多細胞体制の維持と制御が、どのようなリガンドとRLKによってもたらされたのかについて、糸口を探る。

研究実績の概要

本研究は、陸上植物にもっとも近縁な接合藻類に注目し、植物の多細胞化と陸上進出に必須であった細胞間コミュニケーションの端緒を明らかにすることを目的としている。そのため、ヒメミカヅキモ、アオミドロを用いて、特にRLK遺伝子に注目した研究を進めている。
今年度は、ヒメミカヅキモ、アオミドロのゲノム情報の整備が不完全であったことを踏まえて、PacBio HiFiによるlong read dataを用いたゲノムアセンブリを中心に進めた。
糸状性のアオミドロSpirogyra parvulaについては、HiFiリードのアセンブル、Hi-C scaffoldingにより20本のscaffoldを特定した。またその合計長は、56.93 Mb, N50は2.76 Mbとなった。また、ヒメミカヅキモについては、HiFiリードのアセンブルによりNIES-67株で1549本、NIES-68株で1558本にまでcontig数が減少したが、依然としてアセンブルに難航した。用いたクローン系統株が長年の系統保存の間に変異を蓄積してしまい、おそらくすでにクローン株とは呼べない状況にまでなってしまっていることが示唆された。
アオミドロについて、遺伝子機能の解析を行うための形質転換系確立を目指しており、プロトプラスト化させた後、糸状性個体にまで再分化させる方法を検討した。その結果、プロトプラスト化には、試した4種のセルラーゼのうち、1つだけが有効であり、その後、適切な回復条件にて、糸状性個体の再分化が起こることを見出した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

アオミドロについてはゲノム解読も進み、形質転換系確立のハードルとなるプロトプラストからの再分化系に目処が立ち、想定以上に順調である。ヒメミカヅキモについては、ゲノム解読がなかなか改善せず、遺伝子機能の解析を行うための基盤整備の上で、なお一層の注力が必要である。総合して、概ね順調に進展していると判断した。

今後の研究の推進方策

アオミドロについては、プロトプラストにしたのち、外来遺伝子を導入する形質転換方法を検討する。また、ヒメミカヅキモについては、系統株のクローン化からやり直し、十分に繋がったゲノム情報をまず得る。さらに、アオミドロおよびヒメミカヅキモのゲノム中に含まれるRLK遺伝子の比較を行い、ヒメミカヅキモにおいて機能喪失もしくは欠落している遺伝子を特定し、機能解析に取り組む。

報告書

(4件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (31件)

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 2件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (22件) (うち国際学会 3件、 招待講演 3件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] University of Wageningen(オランダ)

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Expanded male sex-determining region conserved during the evolution of homothallism in the green alga Volvox2023

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto, K., Matsuzaki, R., Mahakham, W., Heman, W., Sekimoto, H., Kawachi, M., Minakuchi, Y., Toyoda, A., Nozaki, H.
    • 雑誌名

      iScience

      巻: 26 号: 6 ページ: 106893-106893

    • DOI

      10.1016/j.isci.2023.106893

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Extensive copy number variation explains genome size variation in the unicellular zygnematophycean alga, Closterium peracerosum-strigosum-littorale complex2023

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi, Y., Tsuchikane, Y., Tanaka, K., Taji, T., Suzuki, Y., Toyoda, A., Ito, M., Watano, Y., Nishiyama, T., Sekimoto, H., Tsuchimatsu, T.
    • 雑誌名

      Genome Biol. Evol.

      巻: 15 号: 8

    • DOI

      10.1093/gbe/evad115

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A divergent RWP-RK transcription factor determines mating type in heterothallic Closterium2023

    • 著者名/発表者名
      Sekimoto, H., Komiya, A., Tsuyuki, N., Kawai, J., Kanda, N., Ootsuki, R., Suzuki, Y., Toyoda, A., Fujiyama, A., Kasahara, M., Abe, J., Tsuchikane, Y., Nishiyama, T.
    • 雑誌名

      New Phytologist

      巻: 237 号: 5 ページ: 1636-1651

    • DOI

      10.1111/nph.18662

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Zygnematophycean algae: Possible models for cellular and evolutionary biology2022

    • 著者名/発表者名
      Ohtaka Kinuka、Sekimoto Hiroyuki
    • 雑誌名

      Seminars in Cell & Developmental Biology

      巻: - ページ: 59-68

    • DOI

      10.1016/j.semcdb.2022.03.042

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Three sex phenotypes in a haploid algal species give insights into the evolutionary transition to a self-compatible mating system2021

    • 著者名/発表者名
      Kohei Takahashi, Hiroko Kawai-Toyooka, Ryo Ootsuki, Takashi Hamaji, Yuki Tsuchikane, Hiroyuki Sekimoto, Tetsuya Higashiyama, Hisayoshi Nozaki
    • 雑誌名

      Evolution

      巻: 75 号: 11 ページ: 2984-2993

    • DOI

      10.1111/evo.14306

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Highly efficient transformation of the model zygnematophycean alga <i>Closterium peracerosum‐strigosum‐littorale</i> complex by square‐pulse electroporation2021

    • 著者名/発表者名
      Kawai Junko、Kanazawa Manaki、Suzuki Rie、Kikuchi Nanako、Hayakawa Yasuhiko、Sekimoto Hiroyuki
    • 雑誌名

      New Phytologist

      巻: 233 号: 1 ページ: 569-578

    • DOI

      10.1111/nph.17763

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Anthoceros genomes illuminate the origin of land plants and the unique biology of hornworts2020

    • 著者名/発表者名
      Li FW, Nishiyama T, et al.
    • 雑誌名

      Nat. Plants

      巻: 6 号: 3 ページ: 259-272

    • DOI

      10.1038/s41477-020-0618-2

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] ヒメミカヅキモBELL1遺伝子の有性生殖過程における機能2024

    • 著者名/発表者名
      專田梨瑛子,加来卓也, 川井 絢子,西山 智明,関本 弘之,榊原 恵子
    • 学会等名
      日本藻類学会第48回大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] 三倍体無配生殖型ヤブソテツにおけるISSR-HRM解析を用いた遺伝的分離の検証2023

    • 著者名/発表者名
      大槻涼、関本弘之
    • 学会等名
      日本植物学会第87回大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] ヒメミカヅキモBELL1遺伝子の有性生殖過程における発現解析と接合型における役割2023

    • 著者名/発表者名
      專田梨瑛子,川井 絢子,西山 智明,関本 弘之,榊原 恵子
    • 学会等名
      日本植物学会第87回大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] ヒメミカヅキモの新規RWP-RK遺伝子の逆遺伝学的解析2023

    • 著者名/発表者名
      吉村美南、西山智明、関本弘之
    • 学会等名
      日本植物学会第87回大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] ヒメミカヅキモのゲノム解読と緑色植物特異的転写因子RWP-RKの機能2023

    • 著者名/発表者名
      関本弘之
    • 学会等名
      日本植物学会第87回大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Transformation, whole genome, mating-type determination, and RWP-RK genes in the heterothallic Closterium peracerosum-strigosum-littorale complex, a new model streptophyte alga2023

    • 著者名/発表者名
      Sekimoto, H.
    • 学会等名
      Workshop in Streptophyte Algae
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] アオミドロ属Spirogyra parvulaのゲノム解析から探る接合藻類単細胞化と遺伝子喪失2023

    • 著者名/発表者名
      西山智明、池谷 仁里、高野 智之、坂山 英俊、関本 弘之
    • 学会等名
      植物分類学会第22回大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 多細胞接合藻アオミドロ属Spirogyra parvulaゲノムの解読と単細胞性接合藻および陸上植物との比較解析2023

    • 著者名/発表者名
      西山智明、池谷 仁里、高野 智之、坂山 英俊、関本 弘之
    • 学会等名
      日本植物生理学会第64回年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] ヒメミカヅキモにおけるコピー数変異がもたらした顕著なゲノムサイズ多型と遺伝子発現への影響2022

    • 著者名/発表者名
      川口也和子、土金勇樹、田中啓介、太治輝昭、豊田敦、西山智明、関本弘之、土松隆志
    • 学会等名
      日本進化学会第24回大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 多細胞接合藻類アオミドロのゲノム解読2022

    • 著者名/発表者名
      西山智明、池谷仁里、高野智之、坂山英俊、関本弘之
    • 学会等名
      日本植物学会第86回大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 異なる性表現タイプのボルボックス間比較ゲノム解析からホモタリック化に伴う性決定領域の進化を探る2022

    • 著者名/発表者名
      山本荷葉子、松崎令、Wuttipong Mahakham、Wirawan Heman、関本弘之、河地正伸,水口洋平,豊田 敦,野崎久義
    • 学会等名
      日本植物学会第86回大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] ヒメミカヅキモBELL1遺伝子の有性生殖過程における機能解析2022

    • 著者名/発表者名
      專田梨瑛子,加来 卓也,川井 絢子,西山 智明,関本 弘之,榊原 恵子
    • 学会等名
      日本植物学会第86回大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Male sex-determining region retained after transition from heterothallism to homothallism in a Thai strain of Volvox africanus2022

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto K., Matsuzaki, R., Mahakham, W., Heman, W., Sekimoto, H., Kawachi, M., Minakuchi, Y., Toyoda, A., Nozaki, H.
    • 学会等名
      Volvox 2022
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] A divergent RWP-RK transcription factor determines mating type in heterothallic Closterium2022

    • 著者名/発表者名
      Sekimoto, H., Tsuyuki, N., Komiya, A., Nishiyama, T.
    • 学会等名
      EMBO Workshop _An integrated view of early land plant evolution
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ヒメミカヅキモにおける顕著なゲノムサイズ多型の進化的起源と遺伝子発現パターンへの影響2022

    • 著者名/発表者名
      川口也和子、土金勇樹、田中啓介、太治輝昭、豊田敦、西山智明、関本弘之、土松隆志
    • 学会等名
      日本生態学会第69回大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] ヒメミカヅキモ種内にみられる大規模なゲノムサイズ変異の進化的起源2021

    • 著者名/発表者名
      川口也和子、土金勇樹、田中啓介、太治輝昭、豊田敦、西山智明、関本弘之、土松隆志
    • 学会等名
      日本進化学会第23回大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 蛍光タンパク質融合CenH3発現によるヒメミカヅキモの染色体解析とゲノム進化2021

    • 著者名/発表者名
      渡辺実咲、村田隆、堤元佐、大友康平、根本知己、川口也和子、土松隆志、西山智明、土金勇樹、関本弘之
    • 学会等名
      日本植物学会第85回大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] ヒメミカヅキモの有性生殖進行に機能する受容体型キナーゼ遺伝子の解析2021

    • 著者名/発表者名
      山口里帆子、西山智明、神田奈保、今詩織、関本弘之
    • 学会等名
      日本植物学会第85回大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] ヒメミカヅキモにおける蛍光標識CenH3タンパク質の発現による染色体可視化2021

    • 著者名/発表者名
      渡辺実咲, 村田隆, 堤元佐, 大友康平, 根本知己, 西山智明, 土金勇樹, 関本弘之
    • 学会等名
      日本藻類学会第45回大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 全ゲノムデータからみたヒメミカヅキモの自殖系統におけるホメオログ間組み換え2020

    • 著者名/発表者名
      川口也和子,土金勇樹,田中啓介,太治輝昭,豊田敦,西山智明,関本弘之,土松隆志
    • 学会等名
      日本植物学会第84回大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] ヒメミカヅキモのPR-IPは、性フェロモンであるが有性生殖に必須ではない2020

    • 著者名/発表者名
      山口里帆子、福島早貴、今詩織、神田奈保、関本弘之
    • 学会等名
      日本植物学会第84回大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] The mechanism of mating type determination in heterothallic strains of Closterium peracerosum-strigosum-littorale complex, a new model organism to study sexual reproduction in streptophytes2020

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Sekimoto, Natsumi Tsuyuki, Ayumi Komiya, Tomoaki Nishiyama
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [備考] 日本女子大学理学部物質生物科学科・関本研究室

    • URL

      https://mcm-www.jwu.ac.jp/~sekimoto/

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

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公開日: 2020-08-03   更新日: 2024-12-25  

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