• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

液液相分離内のタンパク質の構造および分子間相互作用のラベルフリー直接計測

研究課題

研究課題/領域番号 20K21468
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分47:薬学およびその関連分野
研究機関東北大学

研究代表者

中林 孝和  東北大学, 薬学研究科, 教授 (30311195)

研究期間 (年度) 2020-07-30 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
2022年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2021年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2020年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワード液液相分離 / ラマンイメージング / 紫外共鳴ラマン散乱 / タンパク質 / 水 / 核酸 / 神経変性疾患 / 濃度定量 / 定量 / ペプチド / 四重らせん / FUS / ラマン分光 / 紫外ラマン
研究開始時の研究の概要

本研究では、液液相分離(LLPS)内のタンパク質の状態を調べる手法を提案する。LLPSは、細胞内においてタンパク質の濃度が非常に濃い状態(液滴)と薄い状態の二相の液体状態が生じる現象であり、神経変性疾患の発症と関係づけられている。本研究では、分子の振動を直接観測するラマン分光を用いれば、液滴内でのタンパク質の構造をその場で解析できること、液滴内の目的タンパク質以外の成分を同定できることを提案する。さらに、紫外光を励起光としてラマンスペクトルを測定し、芳香環を持つアミノ酸残基を選択的に観測することで、LLPSの形成に寄与するタンパク質間の分子間相互作用の直接検出を目指す。

研究成果の概要

LLPSは生体高分子が高濃度で存在する液滴が生じる現象であり、様々な生理反応に関係することが指摘されている。しかし、液滴を単一液滴の状態でラベルフリー測定する適切な手法がなく、LLPSと生理現象との関係の詳細は不明であった。本研究では、ラベルフリーで分子の情報を得るラマン顕微鏡および紫外共鳴ラマン散乱が、LLPS研究の有力な手法になることを提案することができた。単一液滴内の生体高分子の濃度を高精度に定量できることを示し、周囲の環境変化に伴う濃度変化を検出することができた。また、紫外共鳴ラマン散乱から芳香族アミノ酸残基のラマンバンドを選択的に検出し、LLPSに伴うタンパク質の状態変化を検討した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

LLPSは神経変性疾患の発症と関係することが指摘されており、LLPSによって生じた液滴から発症を誘起するタンパク質の凝集物へ変化することが示されている。本研究では、液滴から凝集物への変化について、どのような濃度変化、構造変化を経て、タンパク質の凝集物が生成するのかをラベルフリーで検討できる手法を提案する。液滴は生体高分子間の弱い分子間相互作用によって生成しているために、蛍光分子でラベル化すると分子間相互作用が変化してしまい、液滴を適切に評価できなかった。本研究ではラベルフリーかつ単一液滴の状態で化学情報が得られる有力な手法となり、凝集物変化の詳細を明らかにできる可能性がある。

報告書

(4件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (18件) (うち国際学会 3件、 招待講演 12件)

  • [雑誌論文] ラマンイメージングを用いた細胞内の水・夾雑環境の理解2022

    • 著者名/発表者名
      中林孝和, 梶本真司
    • 雑誌名

      生物工学会誌

      巻: 100 号: 7 ページ: 367-370

    • DOI

      10.34565/seibutsukogaku.100.7_367

    • ISSN
      0919-3758, 2435-8630
    • 年月日
      2022-07-25
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] ラマン顕微鏡によるラベルフリーなタンパク質液滴定量法2022

    • 著者名/発表者名
      中林孝和, 黒井邦巧, 梶本真司
    • 雑誌名

      生化学

      巻: 94 号: 3 ページ: 444-448

    • DOI

      10.14952/SEIKAGAKU.2022.940444

    • ISSN
      0037-1017
    • 年月日
      2022-06-25
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] Concentration Quantification of the Low-Complexity Domain of Fused in Sarcoma inside a Single Droplet and Effects of Solution Parameters2022

    • 著者名/発表者名
      Yokosawa Kohei、Kajimoto Shinji、Shibata Daiki、Kuroi Kunisato、Konno Tomohiro、Nakabayashi Takakazu
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry Letters

      巻: 13 号: 24 ページ: 5692-5697

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.2c00962

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 単一液滴内のラベルフリー濃度測定からみた液液相分離と分子夾雑環境2023

    • 著者名/発表者名
      中林孝和
    • 学会等名
      第二回相分離生物物理学研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 分子夾雑環境の一つとしての液液相分離:ラマン顕微鏡によるラベルフリー濃度測定2023

    • 著者名/発表者名
      中林孝和
    • 学会等名
      日本化学会コロイド先端技術講座2022ソフトマターの「液液」相分離
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ラマンイメージングを用いた細胞内の水計測とその場定量への応用2023

    • 著者名/発表者名
      中林孝和
    • 学会等名
      電子情報通信学会2023年総合大会シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Investigation of chemical properties of a single protein droplet formed by liquid-liquid phase separation2022

    • 著者名/発表者名
      Takakazu Nakabayashi
    • 学会等名
      15h International Symposium on Nanomedicine
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Water in a living cell probed by a Raman microscopy2022

    • 著者名/発表者名
      Takakazu Nakabayashi
    • 学会等名
      EMLG/JMLG 2022 Annual Meeting
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 細胞・タンパク質のラベルフリーイメージングでわかったこと・これからの課題2022

    • 著者名/発表者名
      中林孝和
    • 学会等名
      第31回日本バイオイメージング学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Dynamics and structural changes associated with liquid-liquid phase separation in neurodegenerative disease-related proteins2022

    • 著者名/発表者名
      Takakazu Nakabayashi
    • 学会等名
      The 7th Japan-Taiwan Joint Symposium for Pharmaceutical Sciences
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 水のラマンイメージングからみた細胞内環境・細胞内温度・液-液相分離2022

    • 著者名/発表者名
      中林孝和
    • 学会等名
      日本分光学会関西支部 2022年度第1回講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ラマンイメージングを用いた液液相分離・分子夾雑環境の定量2022

    • 著者名/発表者名
      中林孝和
    • 学会等名
      第22回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ラマン分光を用いた水素結合性液体および細胞内にある水の状態解析2022

    • 著者名/発表者名
      中林孝和
    • 学会等名
      理研シンポジウム 「量子ビームで創る新しい生命科学:X線からテラヘルツまで」
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 顕微ラマン分光によるラベルフリー細胞生物研2022

    • 著者名/発表者名
      中林孝和
    • 学会等名
      第35回日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ラマンイメージングを用いたALS関連タンパク質FUS LCの単一液滴内での濃度変化の定量2022

    • 著者名/発表者名
      横澤 公平, 柴田 大輝, 梶本 真司, 中林 孝和
    • 学会等名
      2021年度生物物理学会北海道支部-東北支部合同例会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 細胞内の水の測定から細胞内夾雑環境・液-液相分離を探る2021

    • 著者名/発表者名
      中林孝和
    • 学会等名
      第30回日本バイオイメージング学会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Label-free quantification for a single droplet using Raman spectroscopy: Application to ALS associated protein FUS LC2021

    • 著者名/発表者名
      横澤 公平, 柴田 大輝, 梶本 真司, 中林 孝和
    • 学会等名
      第21回日本蛋白質科学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] ラマンイメージングを用いたALS関連タンパク質FUS LCの液-液相分離の定量解析2021

    • 著者名/発表者名
      横澤 公平, 柴田 大輝, 梶本 真司, 中林 孝和
    • 学会等名
      第15回分子科学討論会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] Labal-free observation of protein concentration change in a droplet formed by liquid-liquid phase separation using Raman spectroscopy2021

    • 著者名/発表者名
      横澤 公平, 柴田 大輝, 梶本 真司, 中林 孝和
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] Liquid-liquid phase separation of disease-associated protein and its quantification using Raman spectroscopy2021

    • 著者名/発表者名
      村上一輝, 梶本 真司, 柴田 大輝, 黒井 邦巧, 中林 孝和
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] 顕微ラマン分光法を用いたALS関連タンパク質FUS LC単一液滴のラベルフリー濃度定量2021

    • 著者名/発表者名
      横澤 公平、柴田 大輝、梶本 真司、黒井 邦巧、中林 孝和
    • 学会等名
      日本薬学会第141年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2020-08-03   更新日: 2024-01-30  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi