• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

サンゴが雲を作り気候を変化させているのか?遺伝子解析技術を用いた検証

研究課題

研究課題/領域番号 20K21860
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分64:環境保全対策およびその関連分野
研究機関東京大学

研究代表者

新里 宙也  東京大学, 大気海洋研究所, 准教授 (70524726)

研究分担者 山下 洋  国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水産技術研究所(長崎), 主任研究員 (00583147)
鈴木 豪  国立研究開発法人水産研究・教育機構, 水産技術研究所(長崎), 主任研究員 (30533319)
亀山 宗彦  北海道大学, 地球環境科学研究院, 准教授 (70510543)
研究期間 (年度) 2020-07-30 – 2024-03-31
研究課題ステータス 完了 (2023年度)
配分額 *注記
6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
2022年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2021年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2020年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
キーワードサンゴ / DMSP / DMS / 遺伝子
研究開始時の研究の概要

海岸を歩いていると感じる「磯の香り」硫化ジメチル(DMS)は、植物プランクトンの浸透圧調節物質であるDMSPから、DMSPリアーゼという酵素により生成される。DMSは大気中で水蒸気の凝結核となって雲を形成し、太陽光を遮ることで、地球冷却効果に重要な役割を果たすと考えられている。我々は18種の造礁サンゴの全ゲノムの比較解析から、通常動物に存在しないはずのDMSPリアーゼ酵素遺伝子が、サンゴ礁に優先しているミドリイシ属サンゴで、爆発的に増加していることを発見した。ミドリイシ属サンゴは、DMSを産出しているのだろうか?その可能性を遺伝子解析を中心に検証する。

研究成果の概要

植物プランクトンが浸透圧調節物質であるジメチルスルホニオプロピオン酸(DMSP)は、主に細菌や植物プランクトンが持つDMSPリアーゼという酵素によって硫化ジメチル(DMS)へと転換される。DMSは大気中で水蒸気の凝結核となることにより、地球冷却効果の役割を果たしていると考えられている。通常動物はDMSPリアーゼを持たないが、特定のサンゴ(ミドリイシ属)においてDMSPリアーゼに似た遺伝子、DMSPリアーゼ様遺伝子の数が、ゲノム上で大きく増加していた。本研究は、サンゴ及び真核生物におけるDMSPリアーゼ様遺伝子の進化的背景の解明と、サンゴにおける役割の推定を行った。

研究成果の学術的意義や社会的意義

DMSPリアーゼ様遺伝子はサンゴの共生藻からも確認されたので、当初はサンゴのDMSPリアーゼ様遺伝子は共生藻からの遺伝子水平伝播が疑われた。現在利用可能な遺伝子データベースを網羅的に解析したところ、共生藻からの水平伝播ではなく、刺胞動物の共通祖先でDMSPリアーゼ様遺伝子を獲得したことが示唆された。その他に、刺胞動物以外の動物からは確認されない、動物のDMSPリアーゼ様遺伝子は他の真核生物のDMSPリアーゼ様遺伝子や原核生物のDMSPリアーゼとは起源が異なる、ことも明らかにした。DMSPリアーゼ様遺伝子がサンゴにおいてどのような役割を果たしているのか、その詳細の解明が今後期待される。

報告書

(5件)
  • 2023 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (23件)

すべて 2024 2023 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 (10件) (うち国際共著 2件、 査読あり 10件、 オープンアクセス 10件) 学会発表 (13件) (うち国際学会 2件、 招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Genomic Data Reveal Diverse Biological Characteristics of Scleractinian Corals and Promote Effective Coral Reef Conservation2024

    • 著者名/発表者名
      Shinzato Chuya、Yoshioka Yuki
    • 雑誌名

      Genome Biology and Evolution

      巻: 16 号: 2 ページ: 1-8

    • DOI

      10.1093/gbe/evae014

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Genes possibly related to symbiosis in early life stages of Acropora tenuis inoculated with Symbiodinium microadriaticum2023

    • 著者名/発表者名
      Yoshioka Yuki、Chiu Yi-Ling、Uchida Taiga、Yamashita Hiroshi、Suzuki Go、Shinzato Chuya
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 6 号: 1 ページ: 1-11

    • DOI

      10.1038/s42003-023-05350-8

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Genomic and transcriptomic analyses illuminate the molecular basis of the unique lifestyle of a tubeworm, <i>Lamellibrachia satsuma</i>2023

    • 著者名/発表者名
      Uchida Taiga、Yoshioka Yuki、Yoshida Yu、Fujie Manabu、Yamaki Ayuta、Sasaki Akira、Inoue Koji、Shinzato Chuya
    • 雑誌名

      DNA Research

      巻: 30 号: 4

    • DOI

      10.1093/dnares/dsad014

    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Evolutionary History of DMSP Lyase-Like Genes in Animals and Their Possible Involvement in Evolution of the Scleractinian Coral Genus, Acropora2022

    • 著者名/発表者名
      Chiu Yi-Ling、Shinzato Chuya
    • 雑誌名

      Frontiers in Marine Science

      巻: 9

    • DOI

      10.3389/fmars.2022.889866

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Comparative genomics highlight the importance of lineage-specific gene families in evolutionary divergence of the coral genus, Montipora2022

    • 著者名/発表者名
      Yoshioka Yuki、Suzuki Go、Zayasu Yuna、Yamashita Hiroshi、Shinzato Chuya
    • 雑誌名

      BMC Ecology and Evolution

      巻: 22 号: 1 ページ: 71-71

    • DOI

      10.1186/s12862-022-02023-8

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Genomic analysis of a reef‐building coral, <i>Acropora digitifera</i> , reveals complex population structure and a migration network in the Nansei Islands, Japan2022

    • 著者名/発表者名
      Tsuchiya Kojin、Zayasu Yuna、Nakajima Yuichi、Arakaki Nana、Suzuki Go、Satoh Noriyuki、Shinzato Chuya
    • 雑誌名

      Molecular Ecology

      巻: 31 号: 20 ページ: 5270-5284

    • DOI

      10.1111/mec.16665

    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Novel Mitochondrial DNA Markers for Scleractinian Corals and Generic-Level Environmental DNA Metabarcoding2021

    • 著者名/発表者名
      Shinzato Chuya、Narisoko Haruhi、Nishitsuji Koki、Nagata Tomofumi、Satoh Noriyuki、Inoue Jun
    • 雑誌名

      Frontiers in Marine Science

      巻: 8 ページ: 1-9

    • DOI

      10.3389/fmars.2021.758207

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Whole-Genome Sequencing Highlights Conservative Genomic Strategies of a Stress-Tolerant, Long-Lived Scleractinian Coral, Porites australiensis Vaughan, 19182021

    • 著者名/発表者名
      Chuya Shinzato, Takeshi Takeuchi, Yuki Yoshioka, Ipputa Tada, Miyuki Kanda, Cedric Broussard, Akira Iguchi, Makoto Kusakabe, Frederic Marin, Noriyuki Satoh, Mayuri Inoue
    • 雑誌名

      Genome Biology and Evolution

      巻: 13 号: 12 ページ: 1-16

    • DOI

      10.1093/gbe/evab270

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Can Acropora tenuis larvae attract native Symbiodiniaceae cells by green fluorescence at the initial establishment of symbiosis?2021

    • 著者名/発表者名
      Yamashita H, Koike K, Shinzato C, Jimbo M, Suzuki G
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 16 号: 6 ページ: e0252514-e0252514

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0252514

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Eighteen Coral Genomes Reveal the Evolutionary Origin of Acropora Strategies to Accommodate Environmental Changes2020

    • 著者名/発表者名
      Shinzato Chuya、Khalturin Konstantin、Inoue Jun、Zayasu Yuna、Kanda Miyuki、Kawamitsu Mayumi、Yoshioka Yuki、Yamashita Hiroshi、Suzuki Go、Satoh Noriyuki
    • 雑誌名

      Molecular Biology and Evolution

      巻: 38 号: 1 ページ: 16-30

    • DOI

      10.1093/molbev/msaa216

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] シャコガイのゲノム解読と網羅的遺伝子発現解析による共生関連遺伝子の探索2024

    • 著者名/発表者名
      内田大賀, 島田剛,山下洋, 藤江学, 將口栄一, 新里宙也
    • 学会等名
      日本水産学会春季大会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] ウスエダミドリイシの初期生活期における共生関連遺伝子2023

    • 著者名/発表者名
      善岡祐輝、Yi-Ling Chiu、内田大賀 、山下洋、鈴木豪、新里宙也
    • 学会等名
      サンゴ礁学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Evolutionary strategy of the coral Montipora2023

    • 著者名/発表者名
      善岡祐輝、新里宙也
    • 学会等名
      第25回日本進化学会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] 共生開始時におけるウスエダミドリイシの異なる褐虫藻株に対する遺伝子発現応答の網羅的比較2022

    • 著者名/発表者名
      善岡 祐輝,山下 洋,鈴木 豪,新里 宙也
    • 学会等名
      日本サンゴ礁学会25回大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Attempts to identify the possible heat-tolerance individuals of Acropora tenuis using SNP markers.2022

    • 著者名/発表者名
      Yi-Ling Chiu, Azusa Kinjo, Ryota Nakamura, Atsushi Shuto, Chuya Shinzato
    • 学会等名
      日本サンゴ礁学会25回大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] ナガレハナサンゴにおける蛍光タンパク質遺伝子の独自進化2022

    • 著者名/発表者名
      内田 大賀,識名 信也,新里 宙也
    • 学会等名
      日本サンゴ礁学会25回大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 南西諸島におけるコユビミドリイシ集団の複雑な分散ネットワークと歴史的変遷2022

    • 著者名/発表者名
      土屋 考人,座安 佑奈,中島 祐一,鈴木 豪,佐藤 矩行, 新里 宙也
    • 学会等名
      日本サンゴ礁学会25回大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] サンゴ-褐虫藻共生系の分子機構:異なる褐虫藻に対する宿主の遺伝子応答から探る2022

    • 著者名/発表者名
      善岡祐輝, 新里宙也
    • 学会等名
      第81回日本寄生虫学会東日本支部大会・日本共生生物学会第6回大会 合同大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] サツマハオリムシのゲノム解析と組織別トランスクリプトーム解析による共生関連遺伝子の探索2022

    • 著者名/発表者名
      内田大賀, 善岡祐輝, 新里宙也
    • 学会等名
      第81回日本寄生虫学会東日本支部大会・日本共生生物学会第6回大会 合同大会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] Marine Invertebrate Adaptations to Different Stressors: Genomic level2022

    • 著者名/発表者名
      Chuya Shinzato
    • 学会等名
      ICGEB-USM-CREPSUM Course "Application of Advanced Genomic Tools for Conservation of Marine Biodiversity"
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ハマサンゴ,その「コンサバ」なゲノム戦略2021

    • 著者名/発表者名
      新里宙也,竹内猛,善岡祐輝,多田一風太,神田美幸,井口亮,日下部誠,佐藤矩行,井上麻夕里
    • 学会等名
      日本サンゴ礁学会24回大会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] Using genomics to reveal novel insights into coral biology2021

    • 著者名/発表者名
      Chuya Shinzato
    • 学会等名
      Genome Concept Centennial Conference
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 18種のミドリイシ科サンゴの全ゲノム解読が明らかにする,ミドリイシ属の環境適応戦略2020

    • 著者名/発表者名
      新里宙也、Konstantin Khalturin 、井上潤、座安佑奈、神田美幸、川満真由美、善岡祐輝、山下洋、鈴木豪、佐藤矩行
    • 学会等名
      日本サンゴ礁学会第23回大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2020-08-03   更新日: 2025-01-30  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi