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Nanoscale probing and visualization of cyclic nucleotide-gated ion channels structural dynamics and function

研究課題

研究課題/領域番号 20K22626
研究種目

研究活動スタート支援

配分区分基金
審査区分 0701:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
研究機関金沢大学

研究代表者

Marchesi Arin  金沢大学, ナノ生命科学研究所, 特任助教 (80882240)

研究期間 (年度) 2020-09-11 – 2022-03-31
研究課題ステータス 中途終了 (2021年度)
配分額 *注記
2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
2021年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2020年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
キーワードion channels / gating / atomic force microscopy / membrane proteins / CNG channels / Atomic Force Microscopy / Ion channels / Purification / Gating
研究開始時の研究の概要

The proposal will advance our understanding of ion channels function by exploiting a recently developed mechanical microscope in combination to advanced optics. The combination of these techniques will allow us to study ion channels structural dynamcs and link it to their physiological function.

研究実績の概要

The SthK channel gene (UniProtKB G0GA88)was subcloned in the appropriate vector (pCGFP-BC) for overexpression in bacteria (BL21-DE3). Channel expression, purification and reconstitution in artificial bilayer was implemented successfully. The sample was characterized by means of force-spectroscopy (i.e. adsorbed to the AFM probe and unfolded from the membrane bilayer) and high-speed AFM imaging both in the presence of the endogenous ligand (cAMP) and its absence. This allowed us to define key interactions among the different protein domains and the overall mechanisms of gating (i.e. the opening of the permeation pathway). One paper, in collaboration with the ISAS-Italy (International School for Advanced Studies) is currently in revision and another is in preparation.

報告書

(2件)
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2021 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 2件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 1件)

  • [国際共同研究] SISSA/ISAS(イタリア)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] SISSA/ISAS(イタリア)

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [雑誌論文] CNG channel structure, function, and gating: a tale of conformational flexibility2021

    • 著者名/発表者名
      Napolitano Luisa Maria Rosaria、Torre Vincent、Marchesi Arin
    • 雑誌名

      Pfl?gers Archiv - European Journal of Physiology

      巻: 473 号: 9 ページ: 1423-1435

    • DOI

      10.1007/s00424-021-02610-6

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] An ultra-wide scanner for large-area high-speed atomic force microscopy with megapixel resolution2021

    • 著者名/発表者名
      Marchesi Arin、Umeda Kenichi、Komekawa Takumi、Matsubara Takeru、Flechsig Holger、Ando Toshio、Watanabe Shinji、Kodera Noriyuki、Franz Clemens M.
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 11 号: 1 ページ: 13003-13003

    • DOI

      10.1038/s41598-021-92365-y

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著

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公開日: 2020-09-29   更新日: 2022-12-28  

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