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クライオ電子線トモグラフィーによる脂質交換輸送ゾーンの形態・機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 20KK0159
研究種目

国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B))

配分区分基金
審査区分 中区分44:細胞レベルから個体レベルの生物学およびその関連分野
研究機関新潟大学

研究代表者

中津 史  新潟大学, 医歯学系, 准教授 (50360607)

研究分担者 河嵜 麻実  新潟大学, 医歯学系, 特任講師 (10609358)
高杉 俊之  新潟大学, 医歯学系, 特任助教 (40823224)
伊藤 泰行  新潟大学, 医歯学系, 助教 (70710573)
研究期間 (年度) 2020-10-27 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
18,720千円 (直接経費: 14,400千円、間接経費: 4,320千円)
2022年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2021年度: 7,020千円 (直接経費: 5,400千円、間接経費: 1,620千円)
2020年度: 6,110千円 (直接経費: 4,700千円、間接経費: 1,410千円)
キーワードクライオ電子線トモグラフィー / 脂質輸送交換ゾーン / 脂質交換輸送ゾーン / クライオ電子トモグラフィー / 電子顕微鏡 / メンブレンコンタクト / 脂質交換輸送
研究開始時の研究の概要

膜接触部位とは細胞膜やオルガネラ膜などの生体膜同士が近接する領域で、脂質の交換輸送の場(脂質交換輸送ゾーン)となることがわかってきた。しかし、その脂質交換輸送ゾーンの機能的情報を含んだ三次元超微細構造に関する知見は、技術的な問題から未だ十分には得られていない。そこで本研究では、ゲッティンゲン大学との共同研究によるクライオ電子トモグラフィーを用いた形態学的アプローチにより、その解明を目指す。

研究実績の概要

海外渡航規制によりクライオ電子線トモグラフィー解析を行うことができなかったため、通常の電子顕微鏡を用いた手法に切り替えて解析を行ってきた。GFP融合タンパク質として脂質輸送交換ゾーンに局在する分子を低レベルで発現させた細胞を用いて、事前に決定した固定条件でサンプル調整を行うことで再現よく脂質輸送交換ゾーンの電子顕微鏡像を捉えることに成功した。そこで、脂質輸送交換ゾーンに局在する分子GFP融合タンパク質が適度に分散し、正常な局在を示す細胞をまず共焦点顕微鏡により画像取得し、その蛍光像に重ね合わせる手法で電子顕微鏡解析を試みた。このCLEM手法により、脂質輸送交換ゾーン局在分子のGFP蛍光共焦点画像とほぼ一致する形で、小胞体と細胞膜が接する脂質輸送交換ゾーンの電子顕微鏡像を取得することに成功した。次に、さらに詳細かつ広域の微細構造を解析するために、連続切片を作成し、それらの電子顕微鏡を重ね合わせることで3次元構造情報の取得を試みた。これは、熟練した協力研究者との共同研究により行っている。扁平な領域の電子顕微鏡像を再現性良く取得するために、現在、条件検討を行っている。また、クライオ電子線トモグラフィー解析に向けて、脂質輸送交換ゾーン局在分子の安定細胞株について、野生型、ER局在変異体、細胞膜局在変異体、および脂質輸送機能欠失変異体の樹立を行った。そして、それらの細胞の固定条件の決定を行った。さらにノックダウンによる表現型解析についても並行して行った。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

通常の電子顕微鏡解析により、小胞体と細胞膜が接する脂質輸送交換ゾーンの微細構造の取得に成功した。また、CLEM手法を用いた電子顕微鏡解析にも着手し、脂質輸送交換ゾーンの微細構造取得に成功している。一方で、当該年度も海外渡航規制のために、クライオ電子線トモグラフィー解析による超微細構造の解析を行えず、次年度へ持ち越さなくてはならない状況となった。

今後の研究の推進方策

今年度は、CLEMによる微細構造の解析について、特に3次元微細構造の解析を中心に進める。また、海外での共同研究者とのクライオ電子線トモグラフィーによる超微細構造の解析が行えるよう注力して計画を遂行する。

報告書

(4件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (8件) (うち国際共著 1件、 査読あり 7件、 オープンアクセス 6件) 学会発表 (11件) (うち招待講演 7件) 図書 (1件)

  • [国際共同研究] ゲッティンゲン大学(ドイツ)

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Phosphatidylserine turns the gears of phospholipids in B cell lymphoma2024

    • 著者名/発表者名
      Nakatsu Fubito、Kawasaki Asami
    • 雑誌名

      Journal of Cell Biology

      巻: 223 号: 2

    • DOI

      10.1083/jcb.202401047

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Very-long-chain fatty acids are crucial to neuronal polarity by providing sphingolipids to lipid rafts2023

    • 著者名/発表者名
      Honda Atsuko、Nozumi Motohiro、Ito Yasuyuki、Natsume Rie、Kawasaki Asami、Nakatsu Fubito、Abe Manabu、Uchino Haruki、Matsushita Natsuki、Ikeda Kazutaka、Arita Makoto、Sakimura Kenji、Igarashi Michihiro
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 42 号: 10 ページ: 113195-113195

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2023.113195

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Chemo- and opto-genetic tools for dissecting the role of membrane contact sites in living cells: recent advances and limitations2023

    • 著者名/発表者名
      Fubito Nakatsu, Shinya Tsukiji
    • 雑誌名

      Current Opinion in Chemical Biology

      巻: 73 ページ: 102262-102262

    • DOI

      10.1016/j.cbpa.2022.102262

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 脂質交換輸送ゾーンの制御と機能2023

    • 著者名/発表者名
      中津 史
    • 雑誌名

      解剖学雑誌

      巻: 98 (2) ページ: 50-53

    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 小胞体–エンドソーム間のメンブレンコンタクトにおけるPI4P駆動型脂質交換輸送2022

    • 著者名/発表者名
      河嵜 麻実、中津 史
    • 雑誌名

      生化学

      巻: 94 号: 4 ページ: 611-615

    • DOI

      10.14952/SEIKAGAKU.2022.940611

    • ISSN
      0037-1017
    • 年月日
      2022-08-25
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [雑誌論文] PI4P/PS countertransport by ORP10 at ER–endosome membrane contact sites regulates endosome fission2022

    • 著者名/発表者名
      Kawasaki A, Sakai A, Nakanishi H, Hasegawa J, Taguchi T, Sasaki J, Arai H, Sasaki T, Igarashi M, Nakatsu F
    • 雑誌名

      J Cell Biol

      巻: 221 号: 1 ページ: 1-19

    • DOI

      10.1083/jcb.202103141

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Functions of Oxysterol-Binding Proteins at Membrane Contact Sites and Their Control by Phosphoinositide Metabolism2021

    • 著者名/発表者名
      Nakatsu Fubito、Kawasaki Asami
    • 雑誌名

      Frontiers in Cell and Developmental Biology

      巻: 9 ページ: 1-18

    • DOI

      10.3389/fcell.2021.664788

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Protein-recruiting synthetic molecules targeting the Golgi surface2020

    • 著者名/発表者名
      Sawada Shunsuke、Nakamura Akinobu、Yoshii Tatsuyuki、Kuwata Keiko、Nakatsu Fubito、Tsukiji Shinya
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 56 号: 98 ページ: 15422-15425

    • DOI

      10.1039/d0cc06908f

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] メンブレンコンタクトにおける脂質交換輸送が制御するオルガネラダイナミクス2023

    • 著者名/発表者名
      中津 史
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 脂質の代謝と交換輸送の接点としての脂質交換輸送ゾーン2023

    • 著者名/発表者名
      中津 史
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Lipid countertransport at membrane contact sites2023

    • 著者名/発表者名
      中津 史
    • 学会等名
      第75回細胞生物学会大会
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 2.脂質交換輸送ゾーンの制御と機能2023

    • 著者名/発表者名
      中津 史
    • 学会等名
      第128回日本解剖学会総会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 1.メンブレンコンタクト操作ツールを用いた脂質交換輸送の機能解明2022

    • 著者名/発表者名
      中津 史
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] 3.新規蛍光プローブによる細胞膜ホスファチジルイノシトール 4-リン酸の可視化2022

    • 著者名/発表者名
      阿喰 萌香、吉川 優、中津 史、築地 真也
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
  • [学会発表] イノシトールリン脂質・PI4Pによるメンブレンコンタクトを介した脂質交換輸送制御2021

    • 著者名/発表者名
      中津 史
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] イノシトールリン脂質・PI4Pが駆動する脂質対向輸送システム2020

    • 著者名/発表者名
      中津 史
    • 学会等名
      第62回 日本脂質生化学会プレシンポジウム
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Phosphoinositide-driven lipid countertransport at membrane contacts2020

    • 著者名/発表者名
      Fubito Nakatsu
    • 学会等名
      第72回細胞生物学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 小胞体-エンドソーム膜接触部位における脂質交換輸送の生理機能2020

    • 著者名/発表者名
      河嵜麻実、中津 史
    • 学会等名
      第93回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] イノシトールリン脂質が駆動する脂質交換輸送システム2020

    • 著者名/発表者名
      中津 史
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [図書] Plasma Membrane Shaping2022

    • 著者名/発表者名
      Nakatsu F, Kawasaki A
    • 総ページ数
      468
    • 出版者
      Academic Press
    • ISBN
      9780323899192
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2020-10-29   更新日: 2024-12-25  

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