| 研究課題/領域番号 |
21200039
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| 研究種目 |
新学術領域研究(研究課題提案型)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 研究分野 |
分子生物学
ゲノム情報科学
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| 研究機関 | 筑波大学 (2011)
大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(新領域融合研究センター、DBCLS) (2010)
独立行政法人理化学研究所 (2009) |
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研究代表者 |
清澤 秀孔 筑波大学, 体育系, 研究員 (30295422)
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| 研究分担者 |
河合 剛太 千葉工業大学, 工学部, 教授 (70211860)
牛田 千里 弘前大学, 農学生命科学部, 准教授 (50250593)
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| 研究期間 (年度) |
2009 – 2011
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| 研究課題ステータス |
完了 (2011年度)
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| 配分額 *注記 |
30,940千円 (直接経費: 23,800千円、間接経費: 7,140千円)
2011年度: 10,010千円 (直接経費: 7,700千円、間接経費: 2,310千円)
2010年度: 10,010千円 (直接経費: 7,700千円、間接経費: 2,310千円)
2009年度: 10,920千円 (直接経費: 8,400千円、間接経費: 2,520千円)
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| キーワード | RNA / アンチセンスRNA / 低分子RNA / non-coding RNA / NMR / 立体構造 / センス-アンチセンス転写産物 / SAT(センス-アンチセンス転写産物) / non-codin RNA |
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| 研究概要 |
当初アンチセンスRNAの発現が見られる遺伝子座で発現が確認されていた新規サイズ(50-100nt)の低分子RNAの網羅的解析を試み、カスタムのマイクロアレイを開発、発現のスクリーニングを行い、ノーザン解析により発現の検証を行った。低分子RNAの構造解析の為、試験管内転写法による構造スクリーニングの方法を開発した。次世代シーケンサーによる発現解析も試み、RNA配列データの構造的クラスタリングを行った。
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