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光応答性RNA結合リガンドを用いたRNA機能の制御

研究課題

研究課題/領域番号 21200042
研究種目

新学術領域研究(研究課題提案型)

配分区分補助金
研究分野 生物分子科学
生体関連化学
研究機関大阪大学

研究代表者

堂野 主税  大阪大学, 産業科学研究所, 准教授 (60420395)

連携研究者 中谷 和彦  大阪大学, 産業科学研究所, 教授 (70237303)
研究期間 (年度) 2009 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
30,810千円 (直接経費: 23,700千円、間接経費: 7,110千円)
2011年度: 10,010千円 (直接経費: 7,700千円、間接経費: 2,310千円)
2010年度: 10,010千円 (直接経費: 7,700千円、間接経費: 2,310千円)
2009年度: 10,790千円 (直接経費: 8,300千円、間接経費: 2,490千円)
キーワード分子認識 / ケミカルバイオロジー / バイオテクノロジー / RNA / DNA / ミスマッチ / 分子糊 / 光スイッチ / 生体認識・機能化学 / RNA結合リガンド
研究概要

非翻訳RNAが多様な生体反応に直接関与することが知られるようになったが、RNAの多様かつ複雑な高次構造がさまざまなRNA機能を創出している。これら広範なRNA機能を小分子結合にともなう構造変化により制御することを指向して、RNAの特異構造に選択的に結合する人工小分子リガンドを創製した。小分子結合に伴うRNA構造変化を制御機構に組み込んだ人工的なリボスイッチ型翻訳制御を実証した。

報告書

(4件)
  • 2011 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (28件)

すべて 2012 2011 2010 2009

すべて 雑誌論文 (15件) (うち査読あり 15件) 学会発表 (13件)

  • [雑誌論文] Naphthyridine tetramer with a preorganized structure for 1:1 binding to a CGG/CGG sequence2012

    • 著者名/発表者名
      Dohno, C.; Kohyama, I.; Hong, C; Nakatani, K.
    • 雑誌名

      Nucleic.Acids Res.

      巻: 40 号: 6 ページ: 2771-2781

    • DOI

      10.1093/nar/gkr1148

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Naphthyridine tetramer with a preorganized structure for 1:1 binding to a CGG/CGG sequence2011

    • 著者名/発表者名
      Dohno, C.; Kohyama, I.; Hong, C.; Nakatani, K.
    • 雑誌名

      Nucleic. Acids. Res.

      巻: 40 ページ: 2771-2781

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Control of DNA hybridization by photoswitchable molecular glue2011

    • 著者名/発表者名
      Dohno, C.; Nakatani, K.
    • 雑誌名

      Chem. Soc. Rev.

      巻: 40 ページ: 5718-5729

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular-Glue-Triggered DNA Assembly To Form a Robust and Photoresponsive Nano-Network2011

    • 著者名/発表者名
      Wang, C.; Pu, F.; Lin, Y.; Ren, J.; Dohno, C.; Nakatani K.; Qu, X.
    • 雑誌名

      Chem. Eur. J.

      巻: 17 ページ: 8189-8197

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ligand Inducible Assembly of a DNA Tetrahedron2011

    • 著者名/発表者名
      Dohno, C.; Atsumi, H.; Nakatani, K.
    • 雑誌名

      Chem. Commun.

      巻: 47 ページ: 3499-3501

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Control of DNA hybridization by photoswitchable molecular glue2011

    • 著者名/発表者名
      Dohno, C.; Nakatani, K.
    • 雑誌名

      Chem.Soc.Rev.

      巻: 40 号: 12 ページ: 5718-5729

    • DOI

      10.1039/c1cs15062f

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular-Glue-Triggered DNA Assembly to Form a Robust and Photore sponsive Nano-Network2011

    • 著者名/発表者名
      Wang, C.; Pu, F.; Lin, Y.; Ren, J.; Dohno, C.; Nakatani K.; Qu, X.
    • 雑誌名

      Chem.Eur.J.

      巻: 17 号: 29 ページ: 8189-8197

    • DOI

      10.1002/chem.201100194

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ligand Inducible Assembly of a DNA Tetrahedron2011

    • 著者名/発表者名
      Dohno, C., et al.
    • 雑誌名

      Chem.Commun.

      巻: 47 ページ: 3499-3501

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Discrimination of N6-methyl Adenine in a Specific DNA Sequence2010

    • 著者名/発表者名
      Dohno, C., et al.
    • 雑誌名

      Chem.Commun.

      巻: 46 ページ: 5530-5532

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A Light-Driven, Supramolecular Optical Switch2009

    • 著者名/発表者名
      Uno, S.; Dohno, C.; Bittermann, H.; Malinovskii, V. L.; Haner, R.; Nakatani, K.
    • 雑誌名

      Angew. Chem. Int. Ed.

      巻: 48 ページ: 7362-7365

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Photoswitchable Unsymmetrical Ligand for DNA Hetero-Mismatches2009

    • 著者名/発表者名
      Dohno, C.; Yamamoto, T.; Nakatani, K.
    • 雑誌名

      Eur. J. Org. Chem.

      ページ: 4051-4058

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Effect of Linker Length on Binding Affinity of a Photoswitchable Molecular Glue for DNA2009

    • 著者名/発表者名
      Dohno, C.; Uno, S.; Sakai, S.; Oku, M.; Nakatani, K.
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem.

      巻: 17 ページ: 2536-2543

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The effect of linker length on binding affinity of a photoswitchable molecular glue for DNA2009

    • 著者名/発表者名
      C.Dohno, et.al.
    • 雑誌名

      Bioorg.Med.Chem.

      巻: 17 ページ: 2536-2543

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Photoswitchable Unsymmetrical Ligand for DNA Hetero-Mismatches2009

    • 著者名/発表者名
      C.Dohno, et.al.
    • 雑誌名

      Eur.J.Org.Chem.

      ページ: 4051-4058

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A Light-Driven, Supramolecular Optical Switch2009

    • 著者名/発表者名
      S.Uno, et.al.
    • 雑誌名

      Angew.Chem.Int.Ed.

      巻: 48 ページ: 7362-7365

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Design and synthesis of RNA binding ligand for regulating gene expression2012

    • 著者名/発表者名
      Dohno, C. (代表)
    • 学会等名
      243rd American Chemical Society National Meeting
    • 発表場所
      サンディエゴ(米国)
    • 年月日
      2012-03-27
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Design and synthesis of RNA binding ligand for regulating gene expression2012

    • 著者名/発表者名
      Chikara Dohno, Izumi Kohyama, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      243rd American Chemical Society National Meeting
    • 発表場所
      San Diego (USA)
    • 年月日
      2012-03-27
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Naphthyridine tetramer functions as a molecular glue for DNA and RNA2011

    • 著者名/発表者名
      Dohno, C. (代表)
    • 学会等名
      第38回国際核酸化学シンポジウム
    • 発表場所
      北海道大学(札幌)
    • 年月日
      2011-11-09
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書 2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Photoswitchable molecular glue for hybridization of nucleic acids2011

    • 著者名/発表者名
      Dohno, C. (代表)
    • 学会等名
      XVth Symposium on Chemistry of Nucleic Acid Components
    • 発表場所
      チェスキークルムロフ(チェコ)
    • 年月日
      2011-06-07
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書 2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Photoswitchable molecular glue for DNA Nanotechnology2011

    • 著者名/発表者名
      Dohno, C. (代表)
    • 学会等名
      International Symposium: Advanced Science and Technology for Single Molecular Analysis of DNA and Related Molecules (ISSMA2011)
    • 発表場所
      京都国際会議場(京都)(招待講演)
    • 年月日
      2011-01-25
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Photoswitchable molecular glue for DNA Nanotechnology2011

    • 著者名/発表者名
      Chikara Dohno
    • 学会等名
      International Symposium : Advanced Science and Technology for Single Molecular Analysis of DNA and Related Molecules (ISSMA2011)
    • 発表場所
      京都国際会議場(京都)(招待講演)
    • 年月日
      2011-01-25
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Photoswitching of DNA hybridization by a small synthetic ligand2010

    • 著者名/発表者名
      Dohno, C. (代表)
    • 学会等名
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem2010)
    • 発表場所
      ホノルル(米国)
    • 年月日
      2010-12-17
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書 2010 実績報告書
  • [学会発表] Recognition of nucleic acids by tetrameric naphthyridine derivatives2010

    • 著者名/発表者名
      Kohyama, I
    • 学会等名
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem2010)
    • 発表場所
      ホノルル(米国)
    • 年月日
      2010-12-17
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書 2010 実績報告書
  • [学会発表] Binding of tetrameric naphthyridine derivatives to DNA containing a GG-mismatch2010

    • 著者名/発表者名
      Dohno, C. (代表)
    • 学会等名
      第37回国際核酸化学シンポジウム
    • 発表場所
      はまぎんホール(横浜)
    • 年月日
      2010-11-11
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] 光応答性分子糊を用いたDNA光スイッチングデバイス2010

    • 著者名/発表者名
      堂野主税(代表)
    • 学会等名
      日本化学会第90春季年会
    • 発表場所
      近畿大学(大阪府)
    • 年月日
      2010-03-27
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書 2009 実績報告書
  • [学会発表] Binding of tetrameric naphthyridine derivatives to DNA containing a GG-mismatch2010

    • 著者名/発表者名
      Izumi Kohyama
    • 学会等名
      第37回国際核酸化学シンポジウム(ISNAC2010)
    • 発表場所
      はまぎんホール(横浜)
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 核酸二次構造安定性を大きく変化させる新規光応答性小分子リガンド2009

    • 著者名/発表者名
      堂野主税(代表)
    • 学会等名
      第24回生体機能関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      九州大学(福岡県)(招待講演)
    • 年月日
      2009-09-13
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] 核酸二次構造安定性を大きく変化させる新規光応答性小分子リガンド2009

    • 著者名/発表者名
      堂野主税
    • 学会等名
      第24回生体機能関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      九州大学(福岡県)
    • 年月日
      2009-09-13
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2018-03-28  

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