長鎖非翻訳ＲＮＡを介したクロマチン／染色体機能の制御

• 研究課題/領域番号: 21241046
• 研究種目: 基盤研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 基礎ゲノム科学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 太田 邦史 東京大学, 総合文化研究科, 教授 (90211789)
• 研究分担者: 山田 貴富 (山田 高富) 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 助教 (30451850)
• 連携研究者: 久郷 和人 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 特任助教 (60554425) ; 廣田 耕志 首都大学, 東京理工学研究科, 教授 (00342840)
• 研究期間 (年度): 2009-04-01 – 2014-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 45,630千円 (直接経費: 35,100千円、間接経費: 10,530千円); 2013年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円); 2012年度: 8,190千円 (直接経費: 6,300千円、間接経費: 1,890千円); 2011年度: 9,620千円 (直接経費: 7,400千円、間接経費: 2,220千円); 2010年度: 10,920千円 (直接経費: 8,400千円、間接経費: 2,520千円); 2009年度: 11,830千円 (直接経費: 9,100千円、間接経費: 2,730千円)
• キーワード: ノンコーディングRNA / クロマチン / ヒストン修飾 / 転写制御 / ゲノム発現 / 翻訳制御 / エピゲノム / 転写 / ストレス応答 / グルコース代謝 / エビゲノム / ヒストン

研究概要

分裂酵母fbp1遺伝子の上流域から合成され、クロマチン弛緩を通じてfbp1遺伝子の大規模な活性化に関わるlncRNA(mlonRNA)について以下の成果を得た。１）mlonRNAを介したクロマチン修飾・再編成に関わる因子を特定。２）mlonRNA転写に必要な転写因子Atf1のクロマチン結合がmlonRNA転写により促進される正のフィードバック制御の発見。３）mlonRNAの細胞質ポリソームへの結合とuORFによる翻訳抑制の発見。４）RNA SeqによるmlonRNA候補42個の同定。５）相反的に転写されるアンチセンスlncRNAの発見。６）マウス細胞でのmlonRNA様lncRNAの確認。

研究成果

• [雑誌論文] Meiotic recombination cold spots in chromosomal cohesion sites (2014)
  • 著者名/発表者名: Ito M., Kugou K., Fawcett J. A., Mura S., Ikeda S., Innan H. and Ohta K
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 19 ページ: 359-378
  • 査読あり
• [雑誌論文] Prdm9 Polymorphism Unveils Mouse Evolutionary Tracks (2014)
  • 著者名/発表者名: Kono H, Tamura M, Osada N, Suzuki H, Abe K, Moriwaki K, Ohta K, Shiroishi T
  • 雑誌名: DNA Research 巻: - 号: 3 ページ: 315-326
  • DOI: 10.1093/dnares/dst059
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Meiotic recombination cold spots in chromosomal cohesion sites (2014)
  • 著者名/発表者名: Masaru Ito, Kazuto Kugou, Jeffrey A. Fawcett, Sachiko Mura, Sho Ikeda, Hideki Innan, Kunihiro Ohta
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: (Published online) 号: 5 ページ: 359-378
  • DOI: 10.1111/gtc.12138
  • 査読あり
• [雑誌論文] Initiation of meiotic recombination in chromatin structure (2013)
  • 著者名/発表者名: Yamada T., Ohta K
  • 雑誌名: J.Biochem 巻: 154 ページ: 107-114
  • NAID: 40019731054
  • 査読あり
• [雑誌論文] Spatiotemporal regulation of meiotic recombination by Liaisonin (2013)
  • 著者名/発表者名: Miyoshi T., Ito M., Ohta K
  • 雑誌名: Bioarchitecture 巻: 3 ページ: 20-24
  • 査読あり
• [雑誌論文] 長鎖ノンコーディングRNA による遺伝子発現・クロマチン修飾制御 (2013)
  • 著者名/発表者名: 竹俣 直道, 三木 敦子, 太田 邦史
  • 雑誌名: 実験医学 巻: 31 ページ: 1183-1188
• [雑誌論文] Acetylated Histone H3K9 is associated with meiotic recombination hotspots, and plays a role in recombination redundantly with other factors including the H3K4 methylase Set1 in fission yeast (2013)
  • 著者名/発表者名: Yamada S., Ohta K, Yamada T
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 41 ページ: 3504-3517
  • 査読あり
• [雑誌論文] Stress-induced lncRNAs evade nuclear degradation and enter the translational machinery (2013)
  • 著者名/発表者名: Galipon J., Miki A., Oda A., Inada T., and Ohta K
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 18 ページ: 353-368
  • 査読あり
• [雑誌論文] Initiation of meiotic recombination in chromatin structure (2013)
  • 著者名/発表者名: 山田貴富、太田邦史
  • 雑誌名: J. Biochem. 巻: 154 号: 2 ページ: 107-114
  • DOI: 10.1093/jb/mvt054
  • NAID: 40019731054
  • 査読あり
• [雑誌論文] patiotemporal regulation of meiotic recombination by Liaisonin. (2013)
  • 著者名/発表者名: 三好知一郎ら
  • 雑誌名: Bioarchitecture 巻: 3 号: 1 ページ: 20-24
  • DOI: 10.4161/bioa.23966
  • 査読あり
• [雑誌論文] 長鎖ノンコーディングRNAによる遺伝子発現・クロマチン修飾制御 (2013)
  • 著者名/発表者名: 竹俣直道、三木敦子、太田邦史
  • 雑誌名: 実験医学 巻: 31 ページ: 1183-1188
• [雑誌論文] Stress-induced lncRNAs evade nuclear degradation and enter the translational machinery (2013)
  • 著者名/発表者名: Galipon, Josephine ; Miki, Atsuko ; Oda, Arisa ; Inada, Toshifumi ; Ohta, Kunihiro
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 18 号: 5 ページ: 353-368
  • DOI: 10.1111/gtc.12042
  • 査読あり
• [雑誌論文] Acetylated Histone H3K9 is associated with meiotic recombination hotspots, and plays a role in recombination redundantly with other factors including the H3K4 methylase Setl in fission yeast. (2013)
  • 著者名/発表者名: 山田真太郎
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 41 号: 6 ページ: 3504-3517
  • DOI: 10.1093/nar/gkt049
  • 査読あり
• [雑誌論文] A central coupler for recombination initiation linking chromosome architecture to S-phase checkpoint (2012)
  • 著者名/発表者名: Miyoshi T., Ito M., Kugou K., Yamada S., Furuichi M., Oda A., Yamada T., Hirota K., Masai M., and Ohta K
  • 雑誌名: Mol. Cell 巻: 47 ページ: 1-12
  • 査読あり
• [雑誌論文] 次世代シークエンサーによる非コードDNA配列解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 太田 邦史, 久郷 和人, 山田 真太郎, 小田 有沙
  • 雑誌名: 実験医学 巻: 30 ページ: 2209-2214
• [雑誌論文] A central coupler for recombination initiation linking chromosome architecture to S phase checkpoint. (2012)
  • 著者名/発表者名: 三好知一郎
  • 雑誌名: Molecular Cell 巻: 14 号: 5 ページ: 722-733
  • DOI: 10.1016/j.molcel.2012.06.023
  • 査読あり
• [雑誌論文] 次世代シークエンサーによる非コードDNA配列解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 雑誌名: 実験医学 2012年9月号「ヒトゲノム中98%の"未踏領域"非コードDNAに挑む」 巻: 30 ページ: 2209-2214
• [雑誌論文] Fission yeast ATF/CREB family protein Atf21 plays important roles in production of normal spores (2011)
  • 著者名/発表者名: Morita T., Yamada T., Yamada S., Matsumoto K., Ohta K
  • 雑誌名: Genes Cells 巻: 16 ページ: 217-230
  • 査読あり
• [雑誌論文] 長鎖ncRNAによるクロマチン・転写活性化の制御 (2011)
  • 著者名/発表者名: 太田 邦史, 小田 有沙, Galipon J., 竹俣 直道, 三好 知一郎, 廣田 耕志
  • 雑誌名: 実験医学 巻: 29 ページ: 1722-1727
  • 査読あり
• [雑誌論文] 環境応答とエピゲノム (2011)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 雑誌名: Endocrine Disrupter News Letter 巻: 14 ページ: 6-6
• [雑誌論文] Genetic diversification by somatic gene conversion (2011)
  • 著者名/発表者名: Kurosawa K., Ohta K.
  • 雑誌名: Genes 巻: 2(掲載確定)
  • 査読あり
• [雑誌論文] The fission yeast ATF/CREB family protein Atf21 plays important roles in production of normal spores (2011)
  • 著者名/発表者名: Morita T., et al.
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 16 ページ: 217-230
  • 査読あり
• [雑誌論文] The role of stress-activated Sty1 and Gcn2 kinases and proto-oncoprotein homologue Int6/eIF3e in responses to endogenous oxidative stress during histidine starvation (2010)
  • 著者名/発表者名: Nemoto N., Udagawa T., Ohira T., Jiang L., Hirota K., Wilkinson C., Bahler J., Jones N., Ohta K., Wek R., Asano K
  • 雑誌名: J. Mol. Biol 巻: 404 ページ: 183-201
  • 査読あり
• [雑誌論文] Actin-related protein Arp6 influences H2AZ-dependent and -independent gene expression and links ribosomal protein genes to nuclear pores (2010)
  • 著者名/発表者名: Yoshida T., Shimada K., Oma Y., Kalck V., Akimura K., Taddei A., Iwahashi H., Kugou K., Ohta K., Gasser S.M. & Harata M
  • 雑誌名: PLoS Genetics 巻: 6
  • 査読あり
• [雑誌論文] Actin-related protein Arp6 influences H2AZ-dependent and -independent gene expression and links ribosomal protein genes to nuclear pores (2010)
  • 著者名/発表者名: Yoshida T., et al
  • 雑誌名: PLoS Genetics 巻: 6
  • 査読あり
• [雑誌論文] Bcell display-based one-step method to generate chimeric human IgG monoclonal antibodies (2010)
  • 著者名/発表者名: Lin W., et al.
  • 雑誌名: NucleicAcids Res. 巻: 39 ページ: 48-58
  • 査読あり
• [雑誌論文] The role of stress activated Styl and Gcn2 kinases and proto-oncoprotein homologue Int6/elF3e in responses to endogenous oxid ative stress during histidine starvation (2010)
  • 著者名/発表者名: Nemoto N., et al.
  • 雑誌名: J.Mol.Biol. 巻: 404 ページ: 183-201
  • 査読あり
• [雑誌論文] Distinct roles of HDAC l and HDAC2 in transcription and recombi-nation at the immunoglobulin loci in the chicken B cell line DT40. (2010)
  • 著者名/発表者名: Kurosawa K., et al.
  • 雑誌名: J.Biocbem. 巻: 148
  • 査読あり
• [雑誌論文] Actin-related protein Arp6 influences H2AZ-dependent and -independent gene expression and links ribosomal protein genes to nuclear pores. (2010)
  • 著者名/発表者名: Yoshida T., et al.
  • 雑誌名: PLoS Genetics (印刷中)(掲載確定)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Rec8 guides canonical Spo11 distribution along yeast meiotic chromosomes (2009)
  • 著者名/発表者名: Kugou K., Yamada S., Itoh S., Fukuda T., Sasanuma H., Mori S., Katou Y., Itoh T., Matsumoto K., Shibata T., Shirahige K., and Ohta K
  • 雑誌名: Mol. Biol. Cell 巻: 20 ページ: 3064-3076
  • 査読あり
• [雑誌論文] Rec8 guides canonical Spoll distribution along yeast meiotic chromosomes. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kugou K., et al.
  • 雑誌名: Mol.Biol.Cell 20 ページ: 3064-3076
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analysis of chromatin structure at meiotic DSB sites in yeasts (2009)
  • 著者名/発表者名: Hirota K., et al.
  • 雑誌名: Methods in Molecular Biology, Meiosis, Molecular and Genetic Method 557 ページ: 253-266
• [雑誌論文] Genome-wide high-resolution chromatin immunoprecipitation of meiotic chromosomal proteins in S. cerevisiae (2009)
  • 著者名/発表者名: Kugou K., et al.
  • 雑誌名: Methods in Molecular Biology, Meiosis, Molecular and Genetic Method 557 ページ: 285-304
• [学会発表] Transcriptional regulation by glucose starvation stress-induced lncRNAs in yeast (2014)
  • 著者名/発表者名: Oda A., Takemata N., Miyoshi T., Suzuki Y., Sugano S., Hoffman C. and Ohta K.
  • 学会等名: The Second Annual Winter q-bio Meeting in Hawaii
  • 発表場所: Waikoloa village (ハワイ, アメリカ)
• [学会発表] Transcriptional regulation by glucose starvation stress-induced lncRNAs in yeast (2014)
  • 著者名/発表者名: Arisa Oda
  • 学会等名: the Second Annual Winter q-bio Meeting in Hawaii
  • 発表場所: Waikoloa village, Hawaii,USA(ハワイ、アメリカ)
• [学会発表] 長鎖ノンコーディングRNAの転写はクロマチン制御因子の呼び込みをポジティブフィードバック的に促進する (2013)
  • 著者名/発表者名: 竹俣 直道, 廣田 耕志, 山田 貴富, Galipon J., 三好 知一郎, 太田 邦史
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸ポートピアホテル(兵庫県神戸市)
  • 年月日: 2013-12-04
• [学会発表] 長鎖ノンコーディングRNAの転写を介したヒストンアセチル化制御機構 (2013)
  • 著者名/発表者名: 竹俣 直道, 廣田 耕志, 山田 貴富, 三好 知一郎, 太田 邦史
  • 学会等名: 酵母遺伝学フォーラム 第46回研究報告会
  • 発表場所: 東北学院大学土樋キャ ンパス 押川記念ホール(宮城県仙台市)
  • 年月日: 2013-09-08
• [学会発表] lncRNA transcription drives sequential recruitment of chromatin regulator proteins during gene activation in fission yeast (2013)
  • 著者名/発表者名: 竹俣 直道, 廣田 耕志, 山田 貴富, 小田 有沙, Galipon J., 三好 知一郎, 太田 邦史
  • 学会等名: 酵母からのエピジェネティクス研究へのメッセージ
  • 発表場所: グランディア芳泉(福井県あわら市)
  • 年月日: 2013-09-03
• [学会発表] Role of lncRNAs in chromatin regulation during fission yeast gene Activation (2013)
  • 著者名/発表者名: 竹俣 直道, 廣田 耕志, 山田 貴富, 小田 有沙, Galipon J., 三好 知一郎, 太田 邦史
  • 学会等名: FASEB Science Research Conference(Epigenetics, Chromatin and Transcription)
  • 発表場所: シェラトン ナッソー ビーチリゾート&カジノ(バハマ)
  • 年月日: 2013-06-07
• [学会発表] Chromatin regulation by stress-induced lncRNAs (2013)
  • 著者名/発表者名: Ohta K., 他
  • 学会等名: 酵母からのエピジェネティクス研究へのメッセージ
  • 発表場所: グランディア芳泉(福井県あわら市)
  • 招待講演
• [学会発表] 分裂酵母のグルコース飢餓応答性long noncoding RNA の発現制御 (2013)
  • 著者名/発表者名: 小田 有沙, 竹俣 直道, 三好 知一郎, 鈴木 穣, 菅野 純夫, 太田 邦史
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
• [学会発表] Transcriptional regulation by Glucose starvation-induced lncRNAs (2013)
  • 著者名/発表者名: Oda A., Takemata N., Miyoshi T., Suzuki Y., Sugano S., Hoffman C. and Ohta K.
  • 学会等名: EMBO Conference Pombe 2013
  • 発表場所: Univ.of London (ロンドン, イギリス)
• [学会発表] Distinct stability control of metabolic stress-related sense and antisense long noncoding RNAs (2013)
  • 著者名/発表者名: Miki A., Galipon J., Oda A.,Inada T., Ohta K.
  • 学会等名: EMBO Conference Pombe 2013
  • 発表場所: Univ.of London (ロンドン, イギリス)
• [学会発表] 分裂酵母グルコース飢餓におけるfbp1+センス・アンチセンスlncRNAの分解制御 (2013)
  • 著者名/発表者名: 三木 敦子, Galipon J., 小田 有沙, 太田 邦史
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
• [学会発表] Spatio-temporal control of meiotic recombination initiation (2013)
  • 著者名/発表者名: Kunihiro Ohta
  • 学会等名: EMBO Conference on Fission Yeast: pombe 2013
  • 発表場所: University of London（ロンドン、イギリス）
  • 招待講演
• [学会発表] Chromatin regulation by stress-induced lncRNAs. (2013)
  • 著者名/発表者名: Kunihiro Ohta
  • 学会等名: 酵母からのエピジェネティクス研究へのメッセージ
  • 発表場所: グランディア芳泉(福井県あわら市）
  • 招待講演
• [学会発表] Determinants of meiotic recombination hotspots in S. pombe (2013)
  • 著者名/発表者名: Kunihiro Ohta
  • 学会等名: EMBO Conference on Meiosis
  • 発表場所: Hotel Radisson Blu, Radebeul-Dresden（ドレスデン、ドイツ）
  • 招待講演
• [学会発表] Massive genome restructuring induced by conditional multiple DNA breaks (2013)
  • 著者名/発表者名: Kunihiro Ohta
  • 学会等名: 第29回放生研・放医研国際シンポジウム
  • 発表場所: コープイン京都（京都府京都市）
  • 招待講演
• [学会発表] 分裂酵母のグルコース飢餓応答性long noncoding RNAの発現制御 (2013)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
• [学会発表] Transcriptional regulation by Glucose starvation-induced lncRNAs (2013)
  • 著者名/発表者名: Arisa Oda
  • 学会等名: EMBO Conference on Fission Yeast: Pombe 2013
  • 発表場所: University of London（ロンドン、イギリス）
• [学会発表] Distinct stability control of metabolic stress-related sense and antisense long noncoding RNAs (2013)
  • 著者名/発表者名: Atsuko Miki
  • 学会等名: EMBO Conference on Fission Yeast: pombe 2013
  • 発表場所: University of London（ロンドン、イギリス）
• [学会発表] 分裂酵母グルコース飢餓におけるfbp1+センス・アンチセンスlncRNAの分解制御 (2013)
  • 著者名/発表者名: 三木敦子
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
• [学会発表] Long non-coding RNA による転写制御の RNA-seq 解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小田 有沙, 竹俣 直道, 鈴木 穣, 菅野 純夫, 太田 邦史
  • 学会等名: 第14回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 東北大学百周年記念会館 (宮城県仙台市)
• [学会発表] The transcriptiome analysis of stress responsive long non-coding RNAs using directional RNA-seq in fission yeast (2012)
  • 著者名/発表者名: 小田 有沙, 他
  • 学会等名: The 2012 CSHL Meeting on Dynamic Organization of Nuclear Function
  • 発表場所: Cold Spring Harbor Laboratory(ニューヨーク, アメリカ)
• [学会発表] Directional RNA-seq 及びChIP-seqによるグルコース飢餓応答性長鎖ノンコーディングRNA のゲノムワイド解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小田 有沙, 竹俣 直道, 三好 知一郎, 鈴木 穣, 菅野 純夫, 太田 邦史
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場(福岡県福岡市)
• [学会発表] グルコース飢餓ストレス応答性の long noncoding RNA による分裂酵母の転写制御機構 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小田 有沙, 他
  • 学会等名: NGS現場の会 第二回研究会
  • 発表場所: ホテル阪急エキスポパーク(大阪府吹田市)
• [学会発表] 分裂酵母グルコース飢餓におけるfbp1+アンチセンスlncRNAの分解制御 (2012)
  • 著者名/発表者名: 三木 敦子, Galipon J., 小田 有沙, 太田 邦史
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場(福岡県福岡市)
• [学会発表] ヒストン修飾酵素Gcn5およびSet1はlncRNAの転写と協調してグルコース飢餓応答に働く (2012)
  • 著者名/発表者名: 竹俣 直道, 廣田 耕志, Galipon J., 小田 有沙, 三好 知一郎, 山田 貴富, 太 田 邦史
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場(福岡県福岡市)
• [学会発表] Directional RNA-seq及びChIP-seqによるグルコース飢餓応答性長鎖ノンコーディングRNAのゲノムワイド解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小田 有沙
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡（福岡）
• [学会発表] The transcriptiome analysis of stress responsive long non-coding RNAs using directional RNA-seq in fission yeast (2012)
  • 著者名/発表者名: 小田 有沙
  • 学会等名: The 2012 CSHL Meeting on Dynamic Organization of Nuclear Function
  • 発表場所: Cold Spring Harbor（アメリカ）
• [学会発表] Long non-coding RNA による転写制御の RNA-seq 解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小田 有沙
  • 学会等名: 第14回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 東北大学（仙台）
• [学会発表] グルコース飢餓ストレス応答性の long noncoding RNA による分裂酵母の転写制御機構 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小田 有沙
  • 学会等名: NGS現場の会 第二回研究会
  • 発表場所: ホテル阪急エキスポパーク（大阪）
• [学会発表] 複製チェックポイントと染色体高次構造を仲介する新規因子による遺伝的組換え開始制御 (2012)
  • 著者名/発表者名: 伊藤 将
  • 学会等名: 日本遺伝学会第84回大会
  • 発表場所: 九州大学（福岡）
• [学会発表] Conditional induction of whole genome remodeling in plants and fungi (2012)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: EMBO Genetic Stability and Change Workshop
  • 発表場所: Roscoff(フランス)
  • 招待講演
• [学会発表] Mde2 is a central coupler for meiotic recombination initiation that links chromosome architecture to S-phase checkpoint (2012)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: 1st IGAKUKEN International Symposium on ”Regulation of Chromosome Cycle”
  • 発表場所: 東京都医学総合研究所（東京）
  • 招待講演
• [学会発表] TAQingシステムを用いた酵母の大規模ゲノム改変 (2012)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: 第１８３回酵母細胞研究会例会
  • 発表場所: 東京海洋大学（東京）
  • 招待講演
• [学会発表] ADLibシステムを用いたシーズ抗体の開発 (2012)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: 第１２回日本蛋白質化学会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場（名古屋）
  • 招待講演
• [学会発表] A novel mediator for meiotic recombination initiation that links chromosome architecture to S-phase checkpoint (2012)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: The 8th 3R Symposium
  • 発表場所: 淡路夢舞台国際会議場（兵庫）
  • 招待講演
• [学会発表] A novel mediator for meiotic recombination initiation links chromosome architecture to S-phase checkpoint (2012)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: The 2012 CSHL Meeting on Dynamic Organization of Nuclear Function
  • 発表場所: Cold Spring Harbor（アメリカ）
  • 招待講演
• [学会発表] A central coupler for recombination initiation linking chromosome architecture to S-phase checkpoint (2012)
  • 著者名/発表者名: 伊藤 将
  • 学会等名: The 8th 3R Symposium
  • 発表場所: 淡路夢舞台国際会議場（兵庫）
• [学会発表] 染色体高次構造とS期チェックポイントを減数分裂期組換えの開始と連係させるリエゾン因子 (2012)
  • 著者名/発表者名: 伊藤 将
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡（福岡）
• [学会発表] 分裂酵母グルコース飢餓におけるfbp1+アンチセンスlncRNAの分解制御 (2012)
  • 著者名/発表者名: 三木 敦子
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡（福岡）
• [学会発表] ヒストン修飾酵素Gcn5およびSet1はlncRNAの転写と協調してグルコース飢餓応答に働く (2012)
  • 著者名/発表者名: 竹俣 直道
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡（福岡）
• [学会発表] 染色体高次構造と複製チェックポイントの連係を介した減数分裂組換え開始制御 (2012)
  • 著者名/発表者名: 伊藤 将
  • 学会等名: 第 30 回染色体ワークショップ・第 11 回核ダイナミクス研究会合同会議
  • 発表場所: 淡路夢舞台国際会議場（兵庫）
• [学会発表] A novel mediator for recombination initiation links chromosome architecture to S-phase checkpoint (2012)
  • 著者名/発表者名: 伊藤 将
  • 学会等名: The 2012 Meiosis Gordon Research Conference
  • 発表場所: New London（アメリカ）
• [学会発表] Gene regulation by lncRNAs in response to low glucose stress (2011)
  • 著者名/発表者名: 太田 邦史, 他
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 第34 回日本分子生物学会年会
  • 年月日: 2011-12-16
• [学会発表] Gene regulation by IncRNAs in response to low glucose stress (2011)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史, ら
  • 学会等名: 分子生物学会
  • 発表場所: 神奈川、パシフィコ横浜
  • 年月日: 2011-12-16
• [学会発表] Rec15Mer2 bridges meiotic recombination initiation sites to chromosomeaxes to facilitate the assembly of recombination initiation complexes (2011)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史, ら
  • 学会等名: EMBO workshop (Meiosis)
  • 発表場所: イタリア、Paestum
  • 年月日: 2011-09-19
• [学会発表] Role of long non-coding RNAs during glucose starvation in fission yeast (2011)
  • 著者名/発表者名: 竹俣 直道, 他
  • 学会等名: FASEB Summer Conferences (epigenetics)
  • 発表場所: Snowmass(アメリカ)
  • 年月日: 2011-08-03
• [学会発表] Role of long non-coding RNAs during glucose starvation in fission yeast (2011)
  • 著者名/発表者名: 竹俣直道, ら
  • 学会等名: FASEB Summer Conferences (epigenetics)
  • 発表場所: アメリカ、Snowmass
  • 年月日: 2011-08-03
• [学会発表] 環境応答とエピゲノム (2011)
  • 著者名/発表者名: 太田 邦史, 他
  • 学会等名: 第25回環境ホルモン学会講演会
  • 発表場所: 東大山上会館(東京都文京区)
  • 年月日: 2011-06-16
  • 招待講演
• [学会発表] 環境応答とエピゲノム (2011)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: 第5回環境ホルモン学会
  • 発表場所: 東京、東大(本郷)(招待講演)
  • 年月日: 2011-06-16
• [学会発表] 大規模ゲノム再編成ンスアム (2011)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: 第7回よこはまバイオマス研究会
  • 発表場所: 神奈川、横浜市立大(招待講演)
  • 年月日: 2011-05-31
• [学会発表] The responsible domain for functional differentiation of HDAC1 and HDAC2 is not located in the variable C terminal region in the chicken B cell line DT40 (2011)
  • 著者名/発表者名: Kurosawa K.
  • 学会等名: 2011 KEYSTONE SYMPOSIUM "Histone Code : Fact or Fiction?"
  • 発表場所: Midway, Utah, USA
  • 年月日: 2011-01-12
• [学会発表] Control of recombination initiating DNA double strand breaks by cohesin and chromosome axis proteins. (2010)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸・神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2010-12-10
• [学会発表] 染色体接着因子Rec8と遺伝的組換え開始因子Spo11の相互作用 (2010)
  • 著者名/発表者名: 伊藤将
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸・神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] グルコース飢餓時におけるmRNA 型長鎖非翻訳RNA ゲノムワイド解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 小田 有沙, 他
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] ノンコーディングRNAの転写を介したクロマチン再編成・ヒストン修飾の制御と遺伝子活性化機構 (2010)
  • 著者名/発表者名: 竹俣 直道, 他
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] 減数分裂期DNA組換え開始機構の解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 三好知一郎
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸・神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] 減数分裂期姉妹染色体接着因子と減数分裂期相同組換えの関係 (2010)
  • 著者名/発表者名: 久郷和人
  • 学会等名: 艮本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸・神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] 分裂酵母のATF/CREBタンパク質Atf1の機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 岡村美佳
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸・神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] グルコース飢餓時におけるmRNA型長鎖非翻訳RNAゲノムワイド解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸・神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] ノンコーディングRNAの転写を介したクロマチン再編成・ピストン修飾の制御と遺伝子活性化機構 (2010)
  • 著者名/発表者名: 竹俣直道
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸・神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] The variable C terminal region between HDAC1 and HDAC2 is not responsible for their distinct functions at immunoglobulin gene locus in the chicken B cell line DT40 (2010)
  • 著者名/発表者名: Kurosawa K.
  • 学会等名: 7th 3R meeting
  • 発表場所: 富山・富山国際会議場
  • 年月日: 2010-10-29
• [学会発表] Molecular assembly of meiotic recombination-initiating proteins in fission yeast (2010)
  • 著者名/発表者名: Ohta K.
  • 学会等名: 7th 3R meeting
  • 発表場所: 富山・富山国際会議場(Invited talk)
  • 年月日: 2010-10-27
• [学会発表] 大規模ゲノム再編誘発系による出芽酵母ゲノムの改変 (2010)
  • 著者名/発表者名: 米田詩織
  • 学会等名: 日本遺伝学会
  • 発表場所: 札幌・北海道大学高等教育機能開発総合センター
  • 年月日: 2010-09-22
• [学会発表] 抗体遺伝子領域のエンジニアリングによる抗体デザイン (2010)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: 日本遺伝学会
  • 発表場所: 札幌・北海道大学高等教育機能開発総合センター
  • 年月日: 2010-09-22
• [学会発表] 減数分裂期相同組換え開始因子と姉妹染色体接着因子Rec8の関係 (2010)
  • 著者名/発表者名: 久郷和人
  • 学会等名: 日本遺伝学会
  • 発表場所: 札幌・北海道大学高等教育機能開発総合センター
  • 年月日: 2010-09-21
• [学会発表] ニワトリB細胞由来DT40細胞におけるヒストン脱アセチル化酵素HDAC1とHDAC2による異なる抗体遺伝子制御機構 (2010)
  • 著者名/発表者名: 黒澤恒平
  • 学会等名: 日本遺伝学会
  • 発表場所: 札幌・北海道大学高等教育機能開発総合センター
  • 年月日: 2010-09-21
• [学会発表] Adlib system for in vitro based rapid antibody design (2010)
  • 著者名/発表者名: Ohta K.
  • 学会等名: BioKorea 2010
  • 発表場所: Seoul, Korea(Invited talk)
  • 年月日: 2010-09-02
• [学会発表] Ahistone modification pattern around ATF/CREB-dependent meiotic recombination hotspots in fission yeast (2010)
  • 著者名/発表者名: Yamada T.
  • 学会等名: 2010FASEB Summer Research Conferences Yeast Chromosome Structure, Replication and Segregation
  • 発表場所: Carefree, Arizona, USA
  • 年月日: 2010-08-11
• [学会発表] Conservation and diversification of yeast Spoll accessory proteins (2010)
  • 著者名/発表者名: Ohta K.
  • 学会等名: Gordon conference on"Meiosis"
  • 発表場所: Colby-Sawyer College, NH, USA(Invited talk)
  • 年月日: 2010-06-13
• [学会発表] Chromatin modification coupled with cascade transcription of long non-protein-coding RNA in glucose starvation (2010)
  • 著者名/発表者名: Ohta K., 他
  • 学会等名: The 19th CDB meeting RNA Sciences in Cell and Developmental Biology
  • 発表場所: 理化学研究所発生・再生科学総合研究センター(兵庫県神戸市)
  • 年月日: 2010-05-11
  • 招待講演
• [学会発表] Chromatin modification coupled with cascade transcription of long non-protein-coding RNA in glucose starvation(Invited talk) (2010)
  • 著者名/発表者名: Ohta K.
  • 学会等名: The 19th CDB meeting RNA Sciences in Cell and Developmental Biology
  • 発表場所: 神戸・独立行政法人理化学研究所発生・再生科学総合研究センター(CDB)
  • 年月日: 2010-05-11
• [学会発表] Glucose starvation and chromatin regulation in fission yeast (2009)
  • 著者名/発表者名: Ohta K., 他
  • 学会等名: The 4th International Workshop on Cell Regulations in Division and Arrest
  • 発表場所: OIST (沖縄県国頭郡)
  • 年月日: 2009-12-01
• [学会発表] Glucose starvation and chromatin regulation in fission yeast (2009)
  • 著者名/発表者名: Ohta K., et al.
  • 学会等名: The 4th International Workshop onCell Regulations in Division and Arrest
  • 発表場所: 沖縄
  • 年月日: 2009-12-01
• [学会発表] Chromatin modification coupled with cascade transcription of non-coding RNA during glucose derepression of fbp1 (2009)
  • 著者名/発表者名: Ohta K., 他
  • 学会等名: The Fifth International Fission Yeast Meeting
  • 発表場所: 国立オリンピック記念青少年センター (東京都渋谷区)
  • 年月日: 2009-10-27
• [学会発表] Chromatin modification coupled with cascade transcription of non-coding RNA during glucose derepression of fbp1 (2009)
  • 著者名/発表者名: Ohta K., et al.
  • 学会等名: The Fifth International Fission Yeast Meeting
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2009-10-27
• [学会発表] 長鎖ノンコーディングRNAとクロマチン再編成 (2009)
  • 著者名/発表者名: 太田 邦史, 他
  • 学会等名: 第82回日本生化学会シンポジウム
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
  • 年月日: 2009-10-23
• [学会発表] 長鎖ノンコーディングRNAとクロマチン再編成 (2009)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: 日本生化学会シンポジウム
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2009-10-23
• [学会発表] Control of meiotic recombination initiation by Cdc7-Dbf4 (2009)
  • 著者名/発表者名: Ohta K., et al.
  • 学会等名: The EMBO conference on Meiosis
  • 発表場所: Isle sur la Sorgue, France
  • 年月日: 2009-09-19
• [学会発表] Chromatin regulation of CRE-regulated recombination and transcription (2009)
  • 著者名/発表者名: Ohta K., 他
  • 学会等名: FASEB Summer conference
  • 発表場所: Snowmass(アメリカ)
  • 年月日: 2009-08-03
• [学会発表] Chromatin regulation of CRE-regulated recombination and transcription (2009)
  • 著者名/発表者名: Ohta K.
  • 学会等名: FASEB Sammer conference on genetic rearrangements
  • 発表場所: Snowmass, USA
  • 年月日: 2009-08-03
• [学会発表] Chromatin regulation by long non-coding RNA (2009)
  • 著者名/発表者名: Ohta K., 他
  • 学会等名: Switzerland-Japan Joint meeting 2009
  • 発表場所: Villars sur Ollon, (スイス)
  • 年月日: 2009-05-16
• [学会発表] Chromatin regulation by long non-coding RNA (2009)
  • 著者名/発表者名: Ohta K.
  • 学会等名: Switzerland-Japan Joint meeting 2009
  • 発表場所: Villars sur Ollon, Swiss
  • 年月日: 2009-05-16
• [学会発表] Role of lncRNAs in chromatin regulation during fission yeast gene activation
  • 著者名/発表者名: Naomichi Takemata
  • 学会等名: FASEB Science Research Conference(Epigenetics, Chromatin and Transcription)
  • 発表場所: シェラトン ナッソー ビーチリゾート&カジノ（ナッソー、バハマ）
• [学会発表] lncRNA transcription drives sequential recruitment of chromatin regulator proteins during gene activation in fission yeast
  • 著者名/発表者名: 竹俣直道
  • 学会等名: 酵母からのエピジェネティクス研究へのメッセージ
  • 発表場所: グランディア芳泉（福井県あわら市）
• [学会発表] 長鎖ノンコーディングRNAの転写を介したヒストンアセチル化制御機構
  • 著者名/発表者名: 竹俣直道
  • 学会等名: 酵母遺伝学フォーラム 第46回研究報告会
  • 発表場所: 東北学院大学土樋キャンパス 押川記念ホール（宮城県仙台市）
• [学会発表] 長鎖ノンコーディングRNAの転写はクロマチン制御因子の呼び込みをポジティブフィードバック的に促進する
  • 著者名/発表者名: 竹俣直道
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
• [図書] エピゲノムと生命 (2013)
  • 著者名/発表者名: 太田 邦史
  • 総ページ数: 230
  • 出版者: エピゲノムと生命
• [図書] エピゲノムと生命 (2013)
  • 著者名/発表者名: 太田 邦史
  • 総ページ数: 230
  • 出版者: 講談社
• [図書] “Chimeric antibodies” In “Human Monoclonal Antibodies: Methods and Protocols” (2013)
  • 著者名/発表者名: 黒澤恒平ら
  • 出版者: Springer
• [図書] 自己変革するDNA (2011)
  • 著者名/発表者名: 太田 邦史
  • 総ページ数: 234
  • 出版者: みすず書房
• [図書] 自己変革するDNA (2011)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 総ページ数: 234
  • 出版者: みすず書房
• [備考] 研究室のホームページ
  • URL: http://www.ohta-lab.c.u-tokyo.ac.jp/index.html
• [備考] 東京大学大学院総合文化研究科太田研究室
  • URL: http://www.ohta-lab.c.u-tokyo.ac.jp/index.html
• [備考] 太田邦史教授（総合文化研究科広域科学専攻）親から子への遺伝子継承で中心的な役割を果たす遺伝子を発見
  • URL: http://www.c.u-tokyo.ac.jp/info/news/topics/20120727095047.html
• [備考] 染色体の高次構造とS期チェックポイントを減数分裂期の組換えの開始と連係させるリエゾンタンパク質
  • URL: http://first.lifesciencedb.jp/archives/5476
• [備考]
  • URL: http://www.ohta-lab.c.u-tokyo.ac.jp/
• [備考]
  • URL: http://www.ohta-Iab.c.u-tokyo.ac.jp/
• [備考]
  • URL: http://www.ohta-lab.c.u-tokyo.ac.jp/
• [産業財産権] 植物バイオマスの増産方法 (2013)
  • 発明者名: 村本伸彦ら
  • 権利者名: 豊田中央研究所、東京大学
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2013-049689
  • 出願年月日: 2013-03-12
• [産業財産権] 非誘導体型LPAに対して作製された抗LPA抗体 (2012)
  • 発明者名: 太田 邦史ら
  • 権利者名: 東京大学
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2012-284612
  • 出願年月日: 2012-12-28
• [産業財産権] タンパク質の迅速改良法 (2012)
  • 発明者名: 黒澤恒平、太田邦史、瀬尾秀宗
  • 権利者名: 東京大学、カイオム・バイオサイエンス
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2012-138293
  • 出願年月日: 2012-06-20
• [産業財産権] 変異体植物、その製造方法及び遺伝学的組換え頻度を上昇させる方法 (2011)
  • 発明者名: 太田邦史, ら
  • 権利者名: 豊田中央研究所、理研、トヨタ自動車
  • 産業財産権番号: 2011-004805
  • 出願年月日: 2011-01-13
  • 外国
• [産業財産権] 体細胞相同組換えの促進方法及び特異的抗体の作製方法 (2010)
  • 発明者名: 太田邦史, ら
  • 権利者名: 理研、JST
  • 取得年月日: 2010-08-17
  • 外国
• [産業財産権] 体細胞相同組換えの促進方法及び特異的抗体の作製方法 (2010)
  • 発明者名: 太田邦史, ら
  • 権利者名: 理研、JST
  • 取得年月日: 2010-12-01
  • 外国
• [産業財産権] 変異体植物、その製造方法及び遺伝学的組換え頻度を上昇させる方法 (2010)
  • 発明者名: 太田邦史, ら
  • 権利者名: 理化学研究所・トヨタ自動車・豊田中研
  • 産業財産権番号: 2010-007220
  • 出願年月日: 2010-01-15
• [産業財産権] キメラ抗体の一段階作製方法 (2009)
  • 発明者名: 太田邦史, ら
  • 権利者名: 理化学研究所・東京大学
  • 産業財産権番号: 2009-240270
  • 出願年月日: 2009-10-19
• [産業財産権] 光反応性化合物を有する磁気ビーズへの化合物の固定法 (2009)
  • 発明者名: 太田邦史, ら
  • 権利者名: 理化学研究所・東京大学
  • 産業財産権番号: 2009-116325
  • 出願年月日: 2009-05-13