大腸菌の全ての転写因子の調節機能とネットワーク全体像の解明

• 研究課題/領域番号: 21241047
• 研究種目: 基盤研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 基礎ゲノム科学
• 研究機関: 法政大学
• 研究代表者: 石浜 明 法政大学, 企画戦略本部, 特任教授 (80019869)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 44,980千円 (直接経費: 34,600千円、間接経費: 10,380千円); 2011年度: 15,080千円 (直接経費: 11,600千円、間接経費: 3,480千円); 2010年度: 16,380千円 (直接経費: 12,600千円、間接経費: 3,780千円); 2009年度: 13,520千円 (直接経費: 10,400千円、間接経費: 3,120千円)
• キーワード: ゲノム制御 / 転写制御 / 転写因子 / 大腸菌 / ストレス応答 / RNAポリメラーゼ / プロモーター / 制御ネットワーク / Genomic SELEX / 転写調節 / 環境応答 / 転写制御ネットワーク / RNAボリメラーゼ / Phenotype microarray / 原核生物

研究概要

ゲノム転写パターンの決定制御機構の理解を目指し、大腸菌RNAポリメラーゼの転写対象遺伝子選択能を制御する、転写因子全300種の制御機能の解明を目標とした先端研究を実施し、以下の研究成果を得た。
1) Genomic SELEX法を開発し、転写因子300種のノム上の結合部位を解析し、制御支配下遺伝子群を同定した。
2) NIP-chip法を開発し、菌体内での転写因子作動遺伝子領域を解析した。
3)転写因子遺伝子欠損系統を利用し、転写因子支配下遺伝子群の転写制御を実証した。
4)特異抗体を作製し、転写因子細胞内濃度を決定した。
5)転写因子の制御ネットワーク全体像を提案した。
6)ひとつの生物の全転写因子の制御機能を解明した,最初の成果となった。

研究成果

• [雑誌論文] Prokaryotic genome regulation : Multi-factor promoters and multi-target regulators (2012)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 雑誌名: Proc. Jpn. Acad 巻: (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Regulation targets of metal-response BasS-BasR two-component system in Escherichia coli : Modification of cell membrane (2012)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, H., Shinohara, S. and Ishihama, A.
  • 雑誌名: Microbiology 巻: 158 ページ: 1482-1492
  • 査読あり
• [雑誌論文] Induction of YdeO, a regulator for acid resistance gene, by ultraviolet irradiation in Escherichia coli (2012)
  • 著者名/発表者名: Yamanaka, Y., Ishihama, A. and Yamamoto, K.
  • 雑誌名: Biosci. Biotechnol. Biochem 巻: 76
  • NAID: 10030818581
  • 査読あり
• [雑誌論文] Increase in cell viability by polyamines through stimulation of the synthesis of ppGpp regulatory protein and protein in Escherichia coli. (2012)
  • 著者名/発表者名: Terui, Y., Akiyama, M., Sakamoto, A., Tomitori, H., Yamamoto, K., Ishihama, A., Igarashi, K. and Kashiwagi, K.
  • 雑誌名: J. Biochem. Cell Biol 巻: 44 ページ: 412-422
  • 査読あり
• [雑誌論文] Transcription factors and transcriptional apparatus in bacteria (2012)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 雑誌名: Encyclopedia of Systems Biology 巻: (In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Detection of bacterial bahits : Single planktonic cells and assembled biofilm (2012)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 雑誌名: Nanomedicine in Diagnostics 巻: (In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Regulation targets of metal-response BasS-BasR two-component system in Escherichia coli : Modification of cell membrane (2012)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, H., Shinohara, S., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Microbiology 巻: 158(In press) 号: 6 ページ: 1482-1492
  • DOI: 10.1099/mic.0.057745-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] Induction of YdeO, a regulator for acid resistance genes, by ultraviolet irradiation in Escherichia coli (2012)
  • 著者名/発表者名: Yamanaka, Y., Ishihama, A., Yamamoto, K.
  • 雑誌名: Biosci.Biotechnol.Biochem. 巻: (In press)
  • NAID: 10030818581
  • 査読あり
• [雑誌論文] 5'-UTR of mor1, an unexpected transcript repressed by ModE, affects cell growth in Escherichia coli (2012)
  • 著者名/発表者名: Hiramatsu, M., Ogasawara, Ishihama, A., Yamamoto, K.
  • 雑誌名: Biosci.Biotechnol.Biochem. 巻: (In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Single molecule analysis of transcription factor-DNA complexes using atomic force microscopy (2012)
  • 著者名/発表者名: Nakano, M., Teramoto, J., Shimada, T., Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Micro-Nano Mechatronics Human Sci. 巻: (In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Increase in cell viability by polyamines through stimulation of the synthesis of ppGpp regulatory protein and w protein in Escherichia coli (2012)
  • 著者名/発表者名: Terui, Y., Akiyama, M., Tomitori, H., Yamamoto, K., Ishihama, A., Igarashi, K., Kashiwagi, K
  • 雑誌名: Internatl.J.Biochem.Cell Biol. 巻: 44 号: 37 ページ: 412-422
  • DOI: 10.1074/jbc.m110.111195
  • 査読あり
• [雑誌論文] RodZ(YfgA), a bacterial cytoskeletal protein, regulates expression of type III secretion system in Shigella sonnei through post-transcriptional processing (2011)
  • 著者名/発表者名: Mitobe, J., Yanagihara, I., Ohnishi, K., Ishihama, A. and Watanabe, H.
  • 雑誌名: EMBO Reports 巻: 12 ページ: 911-916
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cross-regulation between biofilm formation and flagella synthesis : Role of biofilm master regulator CsgD (2011)
  • 著者名/発表者名: Ogasaawara, H., Yamamoto, K. and Ishihama, A.
  • 雑誌名: J. Bacteriol 巻: 193(10) ページ: 2587-2597
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel roles of LeuO in transcription regulation in E. coli : Antagonistic interplay with the universal silencer H-NS (2011)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T., Bridier, A., Briandet, R. and Ishihama, A.
  • 雑誌名: Mol. Microbiol 巻: 81
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel roles of cAMP receptor protein(CRP) in regulation of transport and metabolism of carbon sources (2011)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T., Fujita, N., Yamamoto, K. and Ishihama, A.
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 6(6)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel members of the Cra regulon involved in carbon metabolism in Escherichia coli (2011)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T., Yamamoto, K. and Ishihama, A.
  • 雑誌名: J. Bacteriol 巻: 193(3) ページ: 649-659
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Escherichia coli K-12 MntR mini-regulon includes dps that encodes the major stationary phase DNA-binding protein (2011)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K., Ishihama, A., Busby, S. J. W. and Brainger, D. C.
  • 雑誌名: J. Bacteriol 巻: 193(6) ページ: 1477-1480
  • 査読あり
• [雑誌論文] RodZ (YfgA), a bacterial cytoskeletal protein, regulates expression of type III secretion system in Shigella sonnei through post-transcriptional processing (2011)
  • 著者名/発表者名: Mitobe, J., Yanagihara, I., Ohnishi, K., Ishihama, A., Watanabe, H.
  • 雑誌名: EMBO Reports 巻: 12 ページ: 911-916
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cros-regulation between biofilm formationand flagella synthesis : Role of biofilm master regulator CsgD (2011)
  • 著者名/発表者名: Ogasaawara, H., Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: J.Bacteriol. 巻: 193 号: 10 ページ: 2587-2597
  • DOI: 10.1128/jb.01468-10
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel roles of LeuO in transcription regulation in E.coli : Antagonistic interplay with the universal silencer H-NS (2011)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T., Bridier, A., Briandet, R., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Mol.Microbiol. 巻: 82 号: 2 ページ: 376-397
  • DOI: 10.1111/j.1365-2958.2011.07818.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel roles of CAMP receptor protein (CRP) in regulation of transport and metabolism of carbon sources (2011)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T., Fujita, N., Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 193 号: 6 ページ: 649-659
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0020081
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel roles of cAMP receptor protein (CRP) in regulation of transport and metabolism of carbon sources (2011)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T., Fujita, N., Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 193 号: 3 ページ: 649-659
  • DOI: 10.1128/jb.01214-10
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ribosome modulation fector, an important protein for cell viability encoded by the polyamine modulon (2011)
  • 著者名/発表者名: Terui, Y., Tabei, Y., Ishihama, A., Igarashi, K., Kashiwagi, K.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 巻: 285 ページ: 28698-28707
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Escherichia coli K-12 MntR mini-regulon includes dps that encodes the major stationary phase DNA-binding protein (2011)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K., Ishihama, A., Busby, S.J.W., Brainger, D.C.
  • 雑誌名: J.Bacteriol. 巻: 139 号: 6 ページ: 1477-1480
  • DOI: 10.1128/jb.01230-10
  • 査読あり
• [雑誌論文] Induction of the Escherichia coli cysK gene by genetic and environmental factors (2011)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K., Oshima, T., Nonaka, G., Ito, H., Ishihama, A
  • 雑誌名: FEMS Microb.Lett. 巻: 323 号: 1 ページ: 88-95
  • DOI: 10.1111/j.1574-6968.2011.02364.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel members of the Cra regulon involved in carbon metabolism in Escherichia coli. (2011)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T.
  • 雑誌名: J.Bacteriol. 巻: 193(3) ページ: 649-659
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Escherichia coli K-12 MntR mini-regulon includes dps that encodes the major stationary phase DNA-binding protein. (2011)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K.
  • 雑誌名: J.Bacteriol. 巻: 193(6) ページ: 1477-1480
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cross-regulation between biofilm formationand flagella synthesis : Role of biofilm master regulator CsgD. (2011)
  • 著者名/発表者名: Ogasaawara, H.
  • 雑誌名: J.Bacteriol. 巻: 193(10)(in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel roles of cAMP receptor protein (CAP) in regulation of transport and metabolism of carbon sources. (2011)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T.
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 6(in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Prokaryotic genome regulation : Multi-factor promoters, multi-target regulators and hierarchic networks (2010)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 雑誌名: FEMS Microbial Reviews 巻: 34 ページ: 628-645
  • 査読あり
• [雑誌論文] The E. coli csgD promoter : Interplay between eight transcription factors (2010)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, H., Yamada, K., Kori, A., Yamamoto, K. and Ishihama, A.
  • 雑誌名: Microbiology 巻: 156(8) ページ: 2470-2483
  • 査読あり
• [雑誌論文] Regulatory role of MlrA in transcription activation of csgD, the master regulator of biofilm formation in Escherichia coli (2010)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, H., Yamamoto, K. and Ishihama, A.
  • 雑誌名: FEMS Microbiol. Lett 巻: 312 ページ: 160-168
  • 査読あり
• [雑誌論文] Single live-bacterial cell assay of promoter activity and regulat (2010)
  • 著者名/発表者名: Teramoto, J., Yamanishi, Y., Magdy, E-S. H., Hasegawa, A., Kori, A., Nakajima, M., Arai, F., Fukuda, T. and Ishihama, A.
  • 雑誌名: Genes Cells 巻: 15 ページ: 1111-1112
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel nucleoid protein of Escherichia coli induced under anaerobic growth conditions (2010)
  • 著者名/発表者名: Teramoto, J., Yoshimura, S. H., Takeyasu, K. and Ishihama, A.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 38(11) ページ: 3605-3618
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ribosome modulation factor, an important protein for cell viability encoded by the polymodulon modulon (2010)
  • 著者名/発表者名: Terui, Y., Tabei, Y., Akiyama, M., Tomitori, H., Yamamoto, K., Ishihama, A., Igarashi, K. and Kashiwagi, K.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem 巻: 285 ページ: 28698-28707
  • 査読あり
• [雑誌論文] Prokaryotic genome regulation : Multi-factor promoters, multi-target regulators and hierarchic networks. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 雑誌名: FEMS Microbial Reviews 巻: 34 ページ: 625-645
  • 査読あり
• [雑誌論文] The E.coll csgD promoter : Interplay between eight transcription factors. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, H.
  • 雑誌名: Microbiology 巻: 158(8) ページ: 2470-2783
  • 査読あり
• [雑誌論文] Regulatory role of MlrA in transcription activation of csgD, the master regulator of biofilm formation in Escherichia coli. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, H.
  • 雑誌名: FEMS Microbiol.Lett. 巻: 312(2) ページ: 160-168
  • 査読あり
• [雑誌論文] Single live-bacterial cell assay of promoter activity and regulation. (2010)
  • 著者名/発表者名: Teramoto, J.
  • 雑誌名: Genes Cells 巻: 15 ページ: 1111-1122
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel nucleoid protein of Escherichia coli induced under anaerobic growth conditions. (2010)
  • 著者名/発表者名: Teramoto, J.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 38(11) ページ: 3605-3618
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ribosome modulation factor, an important protein for cell viability encoded by the polymodulon modulon. (2010)
  • 著者名/発表者名: Terui, Y.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 巻: 285(37) ページ: 28698-28707
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic SELEX for the genome-wide search of regulation targets by transcription factors ; SELEX-clos and SELEX-chip procedures. (2010)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T.
  • 雑誌名: Proc.Internatl. Symp.Micro-Nano Mechatronics Human Sci. 巻: 2010 ページ: 100-103
  • 査読あり
• [雑誌論文] Prokaryotic genome regulation : Multi-factor promoters, multi-target regulators and hierarchic networks. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 雑誌名: FEMS Microb.Rev. 34(In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Promoter regulation of the E.coli csgD gene : Interplay between eight transcription factors in promoter binding. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, H., Yamada, K., Kori, A., Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Microbiology 156(In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nucleic Acids Res. (2010)
  • 著者名/発表者名: Teramoto, J., Yoshimura, S.H., Takeyasu, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: A novel nucleoid protein of Escherichia coli induced under anaerobic growth conditions. 38(In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Participation of regulator AscG of the b. glucoside utilization operon in regulation of the propionate catabolism operon (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishida, Y., Kori, A. and Ishihama, A.
  • 雑誌名: J. Bacteriol 巻: 191 ページ: 6136-6144
  • 査読あり
• [雑誌論文] Two modes of autoregulation of the murR repressor in Escherichia coli (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishii, D., Ishihama, A. and Yamamoto, K.
  • 雑誌名: Biosci. Biotechnol. Biochem 巻: 73
  • NAID: 10027548218
• [雑誌論文] Involvement of RNA-binding protein Hfq in the osmotic-response regulation of invE gene expression in Shigella sonnei (2009)
  • 著者名/発表者名: Mitobe, J., Morita-Ishihara, T., Ishihama, A. and Watanabe, H.
  • 雑誌名: BMC Microbiol 巻: 9 ページ: 110-110
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of leucine-reponse transcription factor LeuO in regulation of the genes for sulfa-drug efflux (2009)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T., Yamamoto, K. and Ishihama, A.
  • 雑誌名: J. Bacteriol 巻: 191 ページ: 4562-4571
  • 査読あり
• [雑誌論文] Enhancement of the synthesis of RpoE and StpA by polyamines at the level of translation in Escherichia coli under heat shock conditions (2009)
  • 著者名/発表者名: Terui, Y., Higashi, K., Tabei, Y., Tomitori, H., Yamamoto, K., Ishihama, A., Igarashi, K. and Kashiwagi, K.
  • 雑誌名: J. Baceriol 巻: 191 ページ: 5348-5357
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of CitA-CitB signal transduction activating genes involved in anaerobiccitrate catabolism in Escherichia coli (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K., Matsumoto, F., Minagawa, S., Oshima, T., Fujita, N., Ogasawara, N. and Ishihama, A.
  • 雑誌名: Biosci. Biotechnonl. Biochem 巻: 73 ページ: 346-350
  • 査読あり
• [雑誌論文] Participation of regulator AscG of the β-glucoside utilization operon in regulation of the propionate catabolism operon. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishida, Y., Kori, A., Ishihama, A.
  • 雑誌名: J.Bacteriol. 191 ページ: 6136-6144
  • 査読あり
• [雑誌論文] Two modes of autoregulation of the murR repressor in Escherichia coll. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishii, D., Ishihama, A., Yamamoto, K.
  • 雑誌名: Biosci. Biotechnonl. Biochem. 73
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of RNA-binding protein Hfq in the osmotic-response regulation of invE gene expression in Shigella sonnei. (2009)
  • 著者名/発表者名: Mitobe, J., Morita-Ishihara, T., Ishihama, A., Watanabe, H.:
  • 雑誌名: BMC Microbiol. 9 ページ: 110-110
  • 査読あり
• [雑誌論文] Regulation of the E.coli csgD gene encoding the master regulator of biofilm formation : Interplay between multiple transcription factors 0925023GC004 Micro-Nano Mechatronics Human Sci. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, H., Kori, A., Yamada, K., Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: 2009 ページ: 186-190
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic SELEX for the genome-wide search of regulation targets by transcription factors : SELEX-clos and SELEX-chip procedures. (2009)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T., Fujita, N., Yamamoto, Y., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Micro-Nano Mechatronics Human Sci. 2009 ページ: 175-178
  • 査読あり
• [雑誌論文] Involvement of leucine-reponse transcription factor LeuO in regulation of the genes for sulfa-drug efflux. (2009)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T., Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: J.Bacteriol. 191 ページ: 4552-4571
  • 査読あり
• [雑誌論文] Anaerobiosis-Induced novel nucleoid protein of Escherichia coli. Architectural role in genome DNA compaction. (2009)
  • 著者名/発表者名: Teramoto, J., Yamada, K., Kobayashi, N., Kori, A., Yoshimura, S.H., Takeyasu, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Micro-Nano Mechatronics Human Sci. 2009 ページ: 179-182
  • 査読あり
• [雑誌論文] Single live-bacterial cell assay of promoter activity and regulation : Escherichia coli gcl promoter. (2009)
  • 著者名/発表者名: Teramoto, J., Yamanishi, Y., Magdy, E-S.H., Hasegawa, A., Nakajima, M., Shimada, T., Arai, F., Fukuda, T., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Micro-Nano Mechatronics Human Sci. 2009 ページ: 175-178
  • 査読あり
• [雑誌論文] Enhancement of the synthesis of RpoE and StpA by polyamines at the level of translation in Escherlchia coli under heat shock conditions. (2009)
  • 著者名/発表者名: Terui, Y., Higashi, K., Tabei, Y., Tomitori, H., Yamamoto, K., Ishihama, A., Igarashi, K., Kashiwaqi, K.
  • 雑誌名: J.Bacteriol. 191 ページ: 5348-5357
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of CitA-CitB signal transduction activating genes involved in anaerobiccitrate catabolism in Escherichia coli. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K., Matsumoto, F., Minagawa, S., Oshima, T., Fujita, N., Ogasawara, N., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Biosci. Biotechnonl. Biochem. 73 ページ: 346-350
  • 査読あり
• [雑誌論文] On-chip cell immobilization and monitoring system using thermosensitive gel controlled by suspended polymeric microbridge. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamanishi, Y., Teramoto, J., Magariyama, Y., Ishihama, A., Fukuda, T., Arai, F.
  • 雑誌名: IEEE Transaction NanoBioscience 8 ページ: 312-317
  • 査読あり
• [雑誌論文] On-chip temperature control under suspended microbridge for cell immobilization and culture system. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamanishi, Y., Teramoto, J., Magariyama, Y., Ishihama, A., Fukuda, T., Arai, F.
  • 雑誌名: Proc. 13^<th> Internati.Conf. Miniaturized Systems for Chemist.Life Sci 2009
• [学会発表] Global Regulation of Prokaryotic Genome Transcription (2012)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 学会等名: JN Centre for Advanced Scientific Research(JNCASR) Seminar
  • 発表場所: Bangalore
  • 年月日: 2012-03-19
• [学会発表] Global Regulation of Prokaryotic Genome Transcription. Attempts toward Understanding the Regulatory Roles for All 300 Transcription Factors in Escherichia coli (2012)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 学会等名: JN Contre for Advanced Scientific Research (JNCASR) Seminar
  • 発表場所: JNCASR, Bangalore, India(招待講演)
  • 年月日: 2012-03-19
• [学会発表] 「細菌ゲノム転写の包括制御機構」-ひとつの生物のすべての転写因子の制御機能の理解を目指して- (2012)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 東北大学グローバルCOE, Network Medicine創生拠点、NM高等教育セミナー
  • 発表場所: 東北大学,仙台(招待講演)
  • 年月日: 2012-03-18
• [学会発表] 大腸菌転写因子LeuOのゲノム転写制御における新規役割:Universal Silencer H-NSに対する拮抗作用 (2012)
  • 著者名/発表者名: 島田友裕、Arnaud Brider、Romain Briandet、石浜明
  • 学会等名: 第6回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 立教大学,東京
  • 年月日: 2012-03-10
• [学会発表] 大腸菌機能未知転写因子YiaUの制御標的遺伝子群の同定と機能解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 村山里枝、島田友裕、小笠原寛、片山泰徳、郡彩子、石浜明
  • 学会等名: 第6回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 立教大学,東京
  • 年月日: 2012-03-10
• [学会発表] 大腸菌機能未知転写因子YegWの転写発現制御機能の解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 保科元気、島田友裕、佐藤史佳、山田佳代子、郡彩子、石浜明
  • 学会等名: 第6回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 立教大学,東京
  • 年月日: 2012-03-10
• [学会発表] 「細菌ゲノム転写の包括制御機構」ひとつの生物のすべての転写因子の制御機能の理解を目指して- (2012)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 東北大学グローバルCOE, Network Medicine創生拠点、NM高等教育セミナー
  • 発表場所: 東北大学医学部
  • 年月日: 2012-03-08
• [学会発表] 大腸菌転写因子LeuOのゲノム転写制御における新規役割:Universal Silencer H-NSに対する拮抗作用 (2011)
  • 著者名/発表者名: 島田友裕、Arnaud Brider、Romain Briandet、石浜明
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜
  • 年月日: 2011-12-13
• [学会発表] 大腸菌機能未知転写因子YbjKの制御標的遺伝子群の同定と制御機能解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 片山泰徳、河北寿一、島田友裕、郡彩子、山田佳代子、山本兼由、石浜明
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜
  • 年月日: 2011-12-13
• [学会発表] 大腸菌転写因子SdiAの新規標的遺伝子群の探索とQSシグナル感知機能の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 島田佳織、鍛代悠一、松井誠、島田友裕、五十嵐潤、菅裕明、山本兼由、石浜明
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜
  • 年月日: 2011-12-13
• [学会発表] 大腸菌機能未知転写因子YegWの遺伝子発現制御機構の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 保科元気、島田友裕、佐藤史佳、荒井明菜、山田佳代子、郡彩子、石浜明
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜
  • 年月日: 2011-12-13
• [学会発表] 大腸菌機能未知転写因子YiaUの制御標的遺伝子群の同定と機能解明 (2011)
  • 著者名/発表者名: 村山里枝, 島田友裕, 小笠原寛, 片山泰徳, 郡彩子, 山田佳代子, 石浜明
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜
  • 年月日: 2011-12-13
• [学会発表] 亜鉛による大腸菌csgDプロモーターの発現抑制機構 (2011)
  • 著者名/発表者名: 小笠原寛、山本兼由、石浜明
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜
  • 年月日: 2011-12-13
• [学会発表] Novel role of YdeO-regulon for acid resistance in Escherichia coli. Novel role of YdeO-regulon for acid resistance in Escherichia coli (2011)
  • 著者名/発表者名: Yamanaka, Y., Oshima, T., Ishihama, A., Yamamoto, K.
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜
  • 年月日: 2011-12-13
• [学会発表] カイコ体内で発現する大腸菌プロモーターの探索 (2011)
  • 著者名/発表者名: 飯島拓郎、皆川周、後藤直正、石浜明、山本兼由
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜
  • 年月日: 2011-12-13
• [学会発表] 大腸菌K-12ゲノムの新規同定ModE支配下遺伝子mor1の5'UTRによる生育抑制 (2011)
  • 著者名/発表者名: 倉田竜明、木口悠也、小笠原寛、石浜明、山本兼由
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜
  • 年月日: 2011-12-13
• [学会発表] 大腸菌プロモーターのin vitroにおける網羅的解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 鈴木香織、山中幸、島田友裕、石浜明、山本兼由
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜
  • 年月日: 2011-12-13
• [学会発表] 大腸菌K-12株の全転写因子の発現解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 渡邊宏樹、石浜明.山本兼由
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜
  • 年月日: 2011-12-13
• [学会発表] 大腸菌のモリブデン応答転写因子ModEレギュロンの解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 木口悠也、倉田竜明、小笠原寛、石浜明、山本兼由
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜
  • 年月日: 2011-12-13
• [学会発表] 原子間力顕微鏡を用いた一分子解析による転写制御機構の解明 (2011)
  • 著者名/発表者名: 中野雅博、島田友裕、寺本潤、山本兼由、石浜明
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜
  • 年月日: 2011-12-13
• [学会発表] Prokaryotic genome regulation : Multi-factor promoters, multi-target regulators and hierarchic networks (2011)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 学会等名: 5^<th> IECA Conference 2011 on Gene Regulatory Networks in the Enterobacteiaceae
  • 発表場所: Xcaret, Mexico(招待講演)
  • 年月日: 2011-12-07
• [学会発表] 大腸菌転写因子LeuOのゲノム転写制御における新規役割:Universal Silencer H-NSに対する拮抗作用 (2011)
  • 著者名/発表者名: 島田友裕、Arnaud Brider, Romain Briander, 石浜明
  • 学会等名: 第15回微生物研究会
  • 発表場所: 千葉大学農学部,松戸
  • 年月日: 2011-11-12
• [学会発表] Single molecule analysis of transcription factor-DNA complexes using atomic force microscopy (2011)
  • 著者名/発表者名: Nakano, M., Teramoto, J., Shimada, T., Ishihama, A.
  • 学会等名: MHS2011&Micro-Nano Global COE
  • 発表場所: Nagoya Univ., Nagoya
  • 年月日: 2011-11-08
• [学会発表] 大腸菌転写因子LeuOのゲノム転写制御における新規役割 (2011)
  • 著者名/発表者名: 島田友裕、石浜明
  • 学会等名: 日本ゲノム微生物学会若手の会
  • 発表場所: 労金研修所富士センター
  • 年月日: 2011-09-29
• [学会発表] 大腸菌環境応答におけるゲノム転写の包括制御 (2011)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 第84回日本生化学会大会、シンポジウム
  • 発表場所: 京都国際会議場、京都(招待講演)
  • 年月日: 2011-09-21
• [学会発表] 大腸菌の酸耐性能を制御するYdeOレギュロンの解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 山中幸、大島拓、石浜明、山本兼由
  • 学会等名: 第84回日本生化学会大会
  • 発表場所: 京都国際会議場、京都
  • 年月日: 2011-09-21
• [学会発表] ポリアミンによるppGppの合成促進及びRpoZ-ppGpp複合体を介したRNA合成調節による大腸菌生の生存率上昇 (2011)
  • 著者名/発表者名: 坂本明彦、照井祐介、秋山真律子、富取秀行、山本兼由、石浜明、五十嵐一衛、柏木敬子
  • 学会等名: 第84回日本生化学会大会
  • 発表場所: 京都国際会議場、京都
  • 年月日: 2011-09-21
• [学会発表] 大腸菌酸耐性システムにおけるYdeO機能の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 山中幸、大島拓、石浜明、山本兼由
  • 学会等名: 日本ゲノム微生物学会ワークショップ
  • 発表場所: 東北大学、仙台
  • 年月日: 2011-08-20
• [学会発表] 大腸菌酸耐性能を制御するYdeOレギュロンの解明 (2011)
  • 著者名/発表者名: 山中幸、大島拓、石浜明、山本兼由
  • 学会等名: 第5回日本細菌細菌学学会・若手コロッセウム
  • 発表場所: 高知大学、高知
  • 年月日: 2011-08-08
• [学会発表] Anaerobiosis-induced nucleoid associated protein Dan polymerizes along ds DNA to form rigid helical-like co-filament that is able to concatemarize (2011)
  • 著者名/発表者名: Lim, C.J., Lee, S.Y., Ishihama, A., Yan, J.
  • 学会等名: Biophys.Soc.Meet."Dynamic DNA Packaging Across Kingdoms : Chromatin & Beyond"
  • 発表場所: Asilomar, Californica, USA
  • 年月日: 2011-07-05
• [学会発表] Regulation of synthesis of Eschericia coli RNA polymerase sigma subunit in sepsis model infection in Drosophila (2011)
  • 著者名/発表者名: Afwa Firdausi, Akiko Shiratsuchi, Ayako Kori, Akira Ishihama, Yoshinobu Nakanishi
  • 学会等名: 日本分子生物学会第11回春季シンポジウム
  • 発表場所: 金沢県立音楽堂,金沢
  • 年月日: 2011-05-25
• [学会発表] バイオフィルム統括転写調節因子CsgDの機能解明 (2011)
  • 著者名/発表者名: 小笠原寛、山本兼由、石浜明
  • 学会等名: 第8回大腸菌研究会
  • 発表場所: ホテル木曽路,南木曽、長野
  • 年月日: 2011-05-18
• [学会発表] 細菌細胞の個性:細菌ゲノムの転写包括制御機構 (2011)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 信州大学ヒト環境科学研究支援センター
  • 発表場所: 信州大学,上田、長野(招待講演)
  • 年月日: 2011-05-09
• [学会発表] 細菌細胞の個性:その分子基盤 (2011)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 九州大学G-COE「未来分子システム科学」公開セミナー
  • 発表場所: 九州大学先導物質化学研究所・福岡
  • 年月日: 2011-02-09
• [学会発表] Anaerobiosis-induced nucleoid associated protein Dan polymerizes along dsDNA to form rigid helical-like co-filament that is able to concatemarize (2011)
  • 著者名/発表者名: Lim, C. J., Lee, S. Y., Ishihama, A. and Yan, J.
  • 学会等名: Biophys. Soc. Meet."Dynamic DNA Packaging Across Kingdoms"
  • 発表場所: Asilomar, Californica, USA
• [学会発表] 大腸菌環境応答におけるゲノム転写の包括制御 (2011)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 第84回日本生化学会大会
  • 発表場所: 京都・国際会議場
• [学会発表] ふたつの転写因子CRPとCraによる大腸菌炭素源代謝遺伝子群の転写制御の全体像 (2011)
  • 著者名/発表者名: 島田友裕
  • 学会等名: 日本農芸化学会2011年度大会
  • 発表場所: 京都女子大学
• [学会発表] バイオフィルム統括転写調節因子CsgDの機能解明 (2011)
  • 著者名/発表者名: 小笠原寛
  • 学会等名: 日本農芸化学会2011年度大会
  • 発表場所: 京都女子大学
• [学会発表] 細菌ゲノム制御全体像解明のための戦略戦術 (2010)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 日本大学学術研究高度化推進公開シンポジウム
  • 発表場所: 日大オープンリサーチセンター
  • 年月日: 2010-06-30
• [学会発表] 大腸菌ゲノム転写制御の新展開 (2010)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 第9回微生物研究会
  • 発表場所: 法政大学小金井キャンパス
  • 年月日: 2010-06-26
• [学会発表] バイオフィルム形成統括制御遺伝子csgDの多因子による転写制御機構 (2010)
  • 著者名/発表者名: 小笠原寛
  • 学会等名: 第7回21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: グリーンピア南阿蘇
  • 年月日: 2010-06-26
• [学会発表] 単一細胞計測システムによる大腸菌プロモーター強度と制御の解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 寺本潤
  • 学会等名: 第9回微生物研究会
  • 発表場所: 法政大学小金井キャンパス
  • 年月日: 2010-06-26
• [学会発表] 桿菌の形態形成に関わる細胞骨格蛋白RodZのRMA結合活性を介した赤痢菌病原因子発現への関与 (2010)
  • 著者名/発表者名: 三戸部治郎
  • 学会等名: 第9回微生物研究会
  • 発表場所: 法政大学小金井キャンパス
  • 年月日: 2010-06-26
• [学会発表] Genome-wide Genomic-SELEX Search of Regulation Targets by Transcription Factors (2010)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T., Fujita, N., Yamamoto, K. and Ishihama, A.
  • 学会等名: Jacques Monod Commemorative Minisymposium : Gene Expression and Signalling in Bacteria
  • 発表場所: Institut Pasteur, Paris, France
  • 年月日: 2010-05-31
• [学会発表] Genome-wide Genomic-SELEX Search of Regulation Targets by Transcription Factors. (2010)
  • 著者名/発表者名: Tomohiro SHIMADA
  • 学会等名: Jacques Monod Commemorative Minisymposium
  • 発表場所: Institut Pasteur, Paris
  • 年月日: 2010-05-31
• [学会発表] Prokaryotic Genome Regulation : Multi-factor promoters, multi-target regulators and multi-factor networks. (2010)
  • 著者名/発表者名: Akira ISHIHAMA
  • 学会等名: Japan-India Collaborative Science Program Seminar
  • 発表場所: Centre for Cellular and Molecular Biology (CCMB), India
  • 年月日: 2010-04-17
• [学会発表] Prokaryotic Genome Regulation : Multi-factor promoters, multi-target regulators and multi-factor networks. (2010)
  • 著者名/発表者名: Akira ISHIHAMA
  • 学会等名: Japan-India Collaborative Science Program Seminar
  • 発表場所: Centre for DNA Fingerprinting and Diagnosis (CDFD), India
  • 年月日: 2010-04-16
• [学会発表] Prokaryotic Genome Regulation. Japan-India Collaborative Science Program Seminar (2010)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 学会等名: Centre for Cellular and Molecular Biology(CCMB)
  • 発表場所: Hyderabad, India
  • 年月日: 2010-03-17
• [学会発表] Prokaryotic Genome Regulation : Multi-factor promoters, multi-target regulators and multi-factor networks. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 学会等名: Japan-India Collaborative Science Program Seminar
  • 発表場所: CCMB, Hyderabad (India)
  • 年月日: 2010-03-17
• [学会発表] Prokaryotic Genome Regulation : Multi-factor promoters, multi-target regulators and multi-factor networks. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 学会等名: Japan-India Collaborative Science Program Seminar
  • 発表場所: CDFD, Hyderabad (India)
  • 年月日: 2010-03-16
• [学会発表] 大腸菌新規核様体タンパクDanの発見と構造機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 寺本潤・吉村成弘・山田佳代子・郡彩子・竹安邦夫・石浜明
  • 学会等名: 特定領域研究「バイオ操作」第8回公開シンポジウム
  • 発表場所: 九州大学(福岡)
  • 年月日: 2010-03-11
• [学会発表] 細菌単一細胞での転写制御の解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 寺本潤・山西陽子・大山晃太郎・中島正博・新井史人・福田敏男・石浜明
  • 学会等名: 特定領域研究「バイオ操作」第8回公開シンポジウム
  • 発表場所: 九州大学(福岡)
  • 年月日: 2010-03-11
• [学会発表] 細菌ゲノム制御全体像解明のための戦略戦術 (2010)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 日本大学学術研究高度化推進事業公開シンポジウム
  • 発表場所: 日大・オープンリサーチセンター
  • 年月日: 2010-02-26
• [学会発表] 細菌ゲノム制御全体像解明のための戦略戦術 (2010)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 日本大学学術研究高度化推進事業公開シンポジウム「病原体抑制遺伝子の解明と感染症の制御」
  • 発表場所: 日本大学(東京)
  • 年月日: 2010-02-26
• [学会発表] 細菌細胞の個性:その分子基盤 (2010)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 九州大学G-COE「未来分子システム科学」公開セミナー
  • 発表場所: 九州大学(福岡)
  • 年月日: 2010-02-09
• [学会発表] Prokaryotic Genome Regulation : Multi-factor Promoters and Multi-target Regulators (2010)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 学会等名: 11^<th> Asian Conference on Transcription(ACT)
  • 発表場所: Nakijin Hall, Okinawa, Japan
• [学会発表] Prokaryotic Genome Regulation : Multi-factor Promoters and Multi-target Regulators (2010)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 学会等名: 2^<nd> Florence Conference on Phenotype Microarray
  • 発表場所: Internatl. Conf. Hall, Pisa, Italy
• [学会発表] Multi-scale molecular genetics of prokaryotic genome regulation (2010)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A., Ogasawara, H., Shimada, T. Teramoto, T., Kori, A., Yamada, K., Kobayashi, K., Katayama, T. and Yamamoto, K.
  • 学会等名: 21st Internatl. Symp. Micro-NanoMechatronics Human Sci.
  • 発表場所: Nagoya Univ., Nagoya, Japan
• [学会発表] Prokaryotic Genome Regulation : Multi-factor Promoters and Multi-target Regulators. (2010)
  • 著者名/発表者名: Akira ISHIHAMA
  • 学会等名: 11^<th> Asian Conference on Transcription (ACT)
  • 発表場所: Okinawa, Japan
• [学会発表] Multi-scale molecular genetics of prokaryotic genome regulation. (2010)
  • 著者名/発表者名: Akira ISHIHAMA
  • 学会等名: 21st Internatl.Symp."Systems Cell Engineering by Multi-scale Manipulation"
  • 発表場所: Nagoya, Japan
• [学会発表] Prokaryotic Genome Regulation : Multi-factor Promoters and Multi-target Regulators. (2010)
  • 著者名/発表者名: Akira ISHIHAMA
  • 学会等名: 2^<nd> Flurence Conference on Phenotype Microarray
  • 発表場所: Pisa, Italy
• [学会発表] Novel nucleoid protein Dan of Escherichia coli induced under anaerobiotic growth conditions. (2010)
  • 著者名/発表者名: Jun TERAMOTO
  • 学会等名: 21st Internatl.Symp."Systems Cell Engineering by Multi-scale Manipulation"
  • 発表場所: Nagoya, Japan
• [学会発表] 核様体タンパク質FisとDpsによるDNA折り畳み様式の差異 (2010)
  • 著者名/発表者名: 佐藤祐子
  • 学会等名: 第48回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 東北大川内キャンパス
• [学会発表] Genomic SELEX法を用いた機能未知転写因子YbjKの機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 片山泰徳
  • 学会等名: 第4回日本ゲノム微生物学会若手の会
  • 発表場所: 神戸セミナーハウス
• [学会発表] Genomic SELEXによる転写因子標的の網羅的探索 (2010)
  • 著者名/発表者名: 島田友裕
  • 学会等名: 第4回日本ゲノム微生物学会若手の会
  • 発表場所: 神戸セミナーハウス
• [学会発表] 細菌-細胞観測システムの構築と転写制御解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 寺本潤
  • 学会等名: 第4回日本ゲノム微生物学会若手の会
  • 発表場所: 神戸セミナーハウス
• [学会発表] 大腸菌炭素源代謝制御のふたつの転写因子CRPとCraによるゲノム転写制御の全体像:Genomic SELEX法を用いた解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 島田友裕
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会・第83回日本生化学会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] 大腸菌機能未知転写因子YcjZの制御機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 山崎薫
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会第83回日本生化学会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] バイオフィルム形成統括制御遺伝子csgDの多種類転写因子による転写制御機構 (2010)
  • 著者名/発表者名: 小笠原寛
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会・第83回日本生化学会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] Fe(III)に応答する大腸菌転写因子BasRの転写制御ネットワークの解明 (2010)
  • 著者名/発表者名: 篠原翔太
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会・第83回日本生化学会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] 大腸菌機能未知転写因子YbjKの制御的遺伝子群の同定と制御機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 片山泰徳
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会・第83回日本生化学会合同大会
  • 発表場所: 袖戸ポートアイランド
• [学会発表] 大腸菌機能未知転写因子YeaMの標的遺伝子の同定と制御機能の解明 (2010)
  • 著者名/発表者名: 大江星菜
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会・第83回日本生化学会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] 細胞隔壁制御因子SdiAの新規標的遺伝子群の探索とQSシグナル感知機構の解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 島田佳織
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会・第83回日本生化学会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] 大腸菌外来性機能未知遺伝子YagIの制御標的遺伝子群の探索 (2010)
  • 著者名/発表者名: 籾山絵里
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会・第83回日本生化学会合同大会
  • 発表場所: 紳戸ポートアイランド
• [学会発表] Identification of novel regulation targets of the antioxidant OxyR transcription factor in Escherichia coll. (2010)
  • 著者名/発表者名: Jun TERAMOTO
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会・第83回日本生化学会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] 紫外線によって誘導される大腸菌YdeOの機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 山中幸
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会・第83回日本生化学会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] 大腸菌機能未知転写因子YkgDの制御標的遺伝子群の同定と機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 大貫章吾
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会・第83回日本生化学会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] 大腸菌モデル環境における、増殖期と定常期のDNA高次構造変化-ヌクレオイドプロテインFisとDpsによるDNAの折り畳み、その顕著な差異 (2010)
  • 著者名/発表者名: 佐藤祐子
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会・第83回日本生化学会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] 多様な環境要因に応答するcsgDプロモーターの転写制御に関わる分子機構の解明 (2010)
  • 著者名/発表者名: 小笠原寛・郡彩子・山田佳代子・山本兼由・石浜明
  • 学会等名: 日本農芸化学会2010大会
  • 発表場所: 東京大学(東京)
• [学会発表] 大腸菌転写因子CRPのゲノム上結合部位の全体像:Genomic SELEX法を用いた解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 島田友裕, 藤田信之, 山本兼由, 石浜明
  • 学会等名: 第4回ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 九州大学(福岡)
• [学会発表] モリブデンを感知する転写因子ModEに制御される新規非翻訳RNA (2009)
  • 著者名/発表者名: 平松優和・小笠原寛・石浜明・山本兼由
  • 学会等名: 第8回 微生物研究会
  • 発表場所: 日本大学湘南キャンパス(神奈川)
  • 年月日: 2009-05-30
• [学会発表] Genomic SELEX search for regulation targets by 100 species of uncharacterized transcription factors from E. coli (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 学会等名: 12^<th> Transcription Assembly
  • 発表場所: Chandigarh, India
• [学会発表] Growth phase-dependent regulation of csgD, the master regulator of biofilm formation (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A., Ogasawara, H., Shimada, T., Teramoto, J., Kori, A., Yamada, K., and Yamamoto, K.
  • 学会等名: 3^<rd> Internatl. Conf. Environmental, Industrial and Applied Microbiology, BioMicroWorld
  • 発表場所: Lisbon, Portugal
• [学会発表] Regulatory roles of nucleoid-associated proteins in Escherichia coli (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A., Teramoto, J., Ogasawara, H., Shimada, T. and Yamamoto, K.
  • 学会等名: 32nd Ann. Meet. Mol. Biol. Soc. Jpn
  • 発表場所: Pacifico Yokohama, Japan
• [学会発表] 大腸菌ゲノム転写の包括制御 (2009)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 2008年度「べん毛研究交流会」
  • 発表場所: 秋保グランドホテル、宮城
• [学会発表] 細菌の環境金属応答のゲノム制御 (2009)
  • 著者名/発表者名: 石浜明, 小笠原寛、島田友祐、寺本潤
  • 学会等名: メタロチオネインおよびメタルバイオサイエンス研究会2009
  • 発表場所: 東京大学・山上会館
• [学会発表] 大腸菌における環境金属応答のゲノム転写制御 (2009)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: メタルバイオサイエンス研究会2009
  • 発表場所: 東京大学、東京
• [学会発表] 細菌の生存戦略としてのバイオフィルム形成:遺伝子制御ネットワークと転写因子群 (2009)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 日本生化学会第82回大会シンポジウム"細菌の生存戦略をめぐる新たな展開"
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド、神戸
• [学会発表] Genomic SELEX search for regulation targets by 100 species of uncharacterized transcription factors from E.coli. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 学会等名: 12^<th> Transcription Assembly
  • 発表場所: Chandigarh (India)
• [学会発表] Growth phase-dependent regulation of csgD, the master regulator of biofilm formation : Interplay between multiple transcription factors. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A., Ogasawara, H., Shimada, T., Teramoto, J., Kori, A., Yamada, K., Yamamoto, K.
  • 学会等名: 3^<rd> Internatl.Conf.Environ.Indust.Appl. Microbiol. (BioMicroWorld2009)
  • 発表場所: Lisbon (Portugal)
• [学会発表] Regulatory roles of nucleoid-associated proteins in Escherichia coli. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A., Teramoto, J., Ogasawara, H., Shimada, T., Yamamoto, K.
  • 学会等名: 32^<nd> Ann.Meet.Mol.Biol.Soc. Japan
  • 発表場所: Pacifico Yokohama (Japan)
• [学会発表] Control of biofilm formation by Escherichia coli : Interplay between multiple transcription factors. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, H., Kon, A., Yamada, K., Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 学会等名: 20^<th> Internatl.Symp. Micro-NanoMechatronics Human Sci., Symp. "Systems Cell Engineering by Multi-scale Manipulation"
  • 発表場所: Nagoya, Univ. (Japan)
• [学会発表] Novel technologies for the genome-wide search of regulation targets by transcription factors : Genomic SELEX and SELEX-chip. (2009)
  • 著者名/発表者名: Shimada, T., Fujita, N., Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 学会等名: 20th Internatl. Symp. Micro-NanoMechatronics Human Sci., Symp. "Systems Cell Engineering by Multi-scale Manipulation"
  • 発表場所: Nagoya Unv. (Japan)
• [学会発表] Single live-bacterial cell assay of promoter activity and regulation : Escherichia coli gcl promoter. (2009)
  • 著者名/発表者名: Teramoto, J., Yamanishi, Y., Magdy, E-S.H., Hasegawa, A., Nakajima, M., Arai, F., Fukuda, T., Ishihama, A.
  • 学会等名: 3^<rd> Internatl.Conf.Environ.Indust.Appl.Microbiol. (BioMicroWorld2009)
  • 発表場所: Lisbon (Portugal)
• [学会発表] Anaeoboriosis-induced novel nucleoid protein Dan in Escherichia coli. (2009)
  • 著者名/発表者名: Teramoto, J., Yoshimura, S.H., Takeyasu, K., Ishihama, A.
  • 学会等名: 20^<th> Internatl.Symp. Micro-NanoMechatronics Human Sci., Symp. "Systems Cell Engineering by Multi-scale Manipulation"
  • 発表場所: Nagoya Univ. (Japan)
• [学会発表] Single live-cell cell assay of promoter activity and regulation. (2009)
  • 著者名/発表者名: Teramoto, J., Yamanishi, Y., Magdy, E-S.H., Hasegawa, A., Shohata, E., Kori, A., Nakajima, M., Arai, F., Fukuda, T., Ishihama, A.
  • 学会等名: 20^<th> Internatl.Symp.Micro-NanoMechatronics Human Sci., Symp. "Systems Cell Engineering by Multi-scale Manipulation"
  • 発表場所: Nagoya Univ. (Japan)
• [学会発表] A single cell immobilization and culture system under suspenced polymeric microbridge with compartments. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamanishi, Y., Teramoto, J., Magariyama, Y., Ishihama, A., Fukuda, T., Arai, F.
  • 学会等名: 20^<th> Internatl.Symp.Micro-NanoMechatronics Human Sci., Symp. "Systems Cell Engineering by Multi-scale Manipulation"
  • 発表場所: Nagoya Univ. (Japan)
• [学会発表] On-chip temperature control under suspended microbridge for cell immobilization and culture system.A (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamanishi, Y., Teramoto, J., Magariyama, Y., Ishihama, A., Fukuda, T., Arai, F.
  • 学会等名: 3^<th> Internatl.Conf. Miniaturized Systems for Chemist.Life Sci. (mTAS)
  • 発表場所: Jeju (Korea)
• [学会発表] 細菌の生存戦略としてのバイオフィルム形成:遺伝子制御ネットワークと転写因子群 (2009)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 学会等名: 2008年度「べん毛研究会」
  • 発表場所: 秋保グランドホテル(宮城)
• [学会発表] 細菌の環境金属応答のゲノム制御 (2009)
  • 著者名/発表者名: 石浜明・小笠原寛・島田友祐・寺本潤・小林尚貴・郡彩子・山田佳代子・山本兼由
  • 学会等名: メタロチオネインおよびメタルバイオサイエンス研究会2009
  • 発表場所: 東京大学(東京)
• [学会発表] 細菌の生存戦略としてのバイオフィルム形成:遺伝子制御ネットワークと転写因子群 (2009)
  • 著者名/発表者名: 石浜明・小笠原寛・島田友祐・寺本潤・小林尚貴・郡彩子・山田佳代子・山本兼由
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会シンポジウム「細菌の生存戦略をめぐる新たな展開」
  • 発表場所: 神戸ポートピア(神戸)
• [学会発表] 大腸菌転写因子YpdB支配下制御遺伝子群の同定と制御機構の解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 稲葉達也・山田佳代子・郡彩子・石浜明
  • 学会等名: 日本ゲノム微生物学会第3回年会
  • 発表場所: 中央大学(東京)
• [学会発表] 大腸菌機能未知転写因子YkgDの制御標的遺伝子群の同定と機能解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 大貫章吾・寺本潤・郡彩子・石浜明
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] 細胞分裂調節因子SdiAに影響するHomoserine Lactone類似体の同定と新規支配下遺伝子群の探索 (2009)
  • 著者名/発表者名: 島田佳織・鍛代悠一・松井誠・島田友裕・五十嵐潤・菅裕明・石浜明
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] ウラシル/チミンを感知する転写因子RutRによるピリミジン合成/分解経路に関与する遺伝子群の制御機構の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 島田友祐・山本兼由・石浜明
  • 学会等名: 日本農芸化学会2009年度大会
  • 発表場所: 福岡メッセ(福岡)
• [学会発表] Genomic SELEXを用いた大腸菌LeuOの転写制御機構解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 島田友祐・山本兼由・石浜明
  • 学会等名: 第6回 21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: KKR熱海(神奈川)
• [学会発表] Genomic SELEXを用いた大腸菌LeuOの転写制御機構解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 島田友裕・山本兼由・石浜明
  • 学会等名: 日本ゲノム微生物学会第3回年会
  • 発表場所: 中央大学(東京)
• [学会発表] Involvement of the leucine response transcription factor LeuO in regulation of the genes for sulfa drug efflux. (2009)
  • 著者名/発表者名: 島田友裕・山本兼由・石浜明
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] ビフィズス菌の共存時に発現する大腸菌プロモーター (2009)
  • 著者名/発表者名: 田村正典・村田侑子・森田英利・石浜明・山本兼由
  • 学会等名: 第6回 21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: KKR熱海(神奈川)
• [学会発表] Identification of promoters induced in Escherichia coli growing with Bifidobacterium. (2009)
  • 著者名/発表者名: 田村正典・村田侑子・石浜明・山本兼由
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] 多因子が関与する大腸菌Curli線毛発現制御機構の解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 小笠原寛・郡彩子・山田佳代子・山本兼由・石浜明
  • 学会等名: 日本農芸化学会2009年度大会
  • 発表場所: 福岡メッセ(福岡)
• [学会発表] Control of biofilm formation by Escherichia coli : Interplay between multiple transcription factors. (2009)
  • 著者名/発表者名: 小笠原寛・郡彩子・山田佳代子・山本兼由・石浜明
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] 大腸菌機能未知転写因子YidZの制御楳的遺伝子群の同定と制御機能解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 片山泰徳・小笠原寛・郡彩子・山田佳代子・石浜明
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] 大腸菌機能未知転写因子YbjKによる転写制御機構の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 河北寿一・島田友裕・山田佳代子・石浜明
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] 大腸菌機能未知転写因子YneJによる転写制御機構の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 國友雄介・寺本潤・山田佳代子・長谷川明子・石浜明
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会.
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] Quorum Sensing転写因子QseAの調節機能の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 小林尚貴・寺本潤・石浜明
  • 学会等名: 日本ゲノム微生物学会第3回年会
  • 発表場所: 中央大学(東京)
• [学会発表] Quorum-sensing transcription factor QseA of Escherichia coli : Search for regulation targets and analysis of reaulatorv modes. (2009)
  • 著者名/発表者名: 小林尚貴・稲葉達也・山田佳代子・寺本潤・石浜明
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] 嫌気条件で誘導される大腸菌新規核様体タンパク質 (2009)
  • 著者名/発表者名: 寺本潤・吉村成弘・竹安邦夫・石浜明
  • 学会等名: 第6回 21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: KKR熱海(神奈川)
• [学会発表] Single live-bacterial cell assay of promoter activity and regulation in Escherichia coli. (2009)
  • 著者名/発表者名: 寺本潤・山西陽子・Magdy, E-S.H.・長谷川明子・正畑絵理・新井史人・福田敏男・石浜明
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] 大腸菌転写因子DeoRの新規標的遺伝子群の同定と制御機能解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中川史之・島田友裕・石田雄士・石浜明
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] 大腸菌全tRNA遺伝子発現プロファイルの解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 長谷川喬彬・梅林章・石浜明・前田理久
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] Novel non-coding RNA regulated by ModE in Escherichia coli. (2009)
  • 著者名/発表者名: 平松優和・小笠原寛・石浜明・山本兼由
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [学会発表] モリブデンを感知する転写因子ModEに制御される新規非翻訳RNA (2009)
  • 著者名/発表者名: 平松優和・小笠原寛・石浜明・山本兼由
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸ポートピア(神戸)
• [学会発表] Autoregulation of the murR repressor that regulate the enzymes for the degradation of N-acetylymuramic acid in Escherichia coli. (2009)
  • 著者名/発表者名: 山本兼由・石浜明
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
• [図書] Detection of bacterial bahits : Single planktonic cells and assembled Detection of bacterial bahits : Single planktonic cells and assembled biofilm. In : Nanomedicine in Diagnostics (2012)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 出版者: Science Publishes
• [図書] Transcription factors and transcriptional apparatus in bacteria. In : Encyclopedia of Systems Biology (2012)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 出版者: Springer
• [図書] Encyclopedia of Systems Biology (2012)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 出版者: Springer, London, UK(In press)
• [図書] Nanomedicine in Diagnostics (2012)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 出版者: CRC Press, Boca Raton, FL, USA(In press)
• [図書] Prokaryotic genome regulation : Multi-factor promoters, multi-target regulators and hierarchic networks (2010)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
• [図書] Chapter 2.6, The Nucleoid : an Overview. In : EcoSal. Escherichia coli and Salmonella : cellular and molecular biology (2010)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 出版者: インターネット出版
  • URL: http://www.ecosal.org.
• [図書] 原核生物RNAポリメラーゼ.「生化学事典」 (2010)
  • 著者名/発表者名: 石浜明
  • 総ページ数: 788
  • 出版者: 朝倉書店
• [図書] EcoSal-Escherichia coil and Salmonella : Cellular and Molecular Biology (Chapter 2:6: The Nucleoid : an Overview) (2010)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 総ページ数: 2000
  • 出版者: ASM (American Society for Microbiology) Press
• [図書] EcoSal-Escherichia coli and Salmonella : cellular and molecular biology. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ishihama, A.
  • 出版者: ASM (American Society for Microbiology) Press