腰椎椎間板ヘルニアの疾患感受性遺伝子の同定と分子病態の解明

• 研究課題/領域番号: 21249080
• 研究種目: 基盤研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 整形外科学
• 研究機関: 独立行政法人理化学研究所
• 研究代表者: 池川 志郎 独立行政法人理化学研究所, 骨関節疾患研究チーム, チームリーダー (30272496)
• 研究分担者: 古市 達哉 独立行政法人理化学研究所, 骨関節疾患研究チーム, 上級研究員 (30392103) ; 稲葉 郁代 独立行政法人理化学研究所, 骨関節疾患研究チーム, 特別研究員 (60415081)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 47,710千円 (直接経費: 36,700千円、間接経費: 11,010千円); 2011年度: 12,740千円 (直接経費: 9,800千円、間接経費: 2,940千円); 2010年度: 12,740千円 (直接経費: 9,800千円、間接経費: 2,940千円); 2009年度: 22,230千円 (直接経費: 17,100千円、間接経費: 5,130千円)
• キーワード: 脊椎脊髄病学 / 腰椎椎間板ヘルニア / 相関解析 / 遺伝子 / 分子病態 / SNP / 椎間板ヘルニア

研究概要

国内の主要な脊椎外科の専門医と協力し、椎間板ヘルニア患者の検体、約1, 600を収集した。それらの患者の臨床的、X線学的表現型を詳細に分析し、椎間板ヘルニア疾患関連因子に関する臨床データをデータベース化した。検体からゲノムDNAを抽出し、椎間板遺伝子発現プロファイル、コンピュータ解析による知識発見システムなどに基づき決定された候補遺伝子に対する症例-対照相関解析、約55万のSNPマーカーによる全ゲノムスクリーニング等のゲノム解析を行った。その結果、いくつかの非常に高い相関を示すSNPマーカーを発見した。それらの中には、椎間板の発生やプロテオグリカンの代謝に関係するものが見られた。

研究成果

• [雑誌論文] 一塩基多型を用いた大規模症例・対照相関解析による腰椎椎間板ヘルニアの原因遺伝子解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 池川志郎
  • 雑誌名: Journal of Spine Research 巻: 2(9)
• [雑誌論文] TGF-βファミリーと骨・関節疾患 (2010)
  • 著者名/発表者名: 池川志郎
  • 雑誌名: 実験医学 巻: 29 ページ: 883-887
• [雑誌論文] Association of the tag SNPs in the human SKT Gene(KIAA1217) with lumbar disc herniation (2009)
  • 著者名/発表者名: Karasugi T. Semba K, Hirose Y, Kelempisioti A, Nakajima M, Miyake A, Furuichi T, Kawaguchi Y, Mikami Y, Chiba K, Kamata M, Ozaki K, Takahashi A, Makela P, Karppinen J, Kimura T, Kubo T, Toyama Y, Yamamura K, Mannikko M, Mizuta H, Ikegawa S
  • 雑誌名: J Bone Miner Res 巻: 24(9) ページ: 1537-1543
• [雑誌論文] Association of the tag SNPs in the human SKT Gene(KIAA1217)with lumbar disc herniation (2009)
  • 著者名/発表者名: Karasugi T
  • 雑誌名: J Bone Miner Res 24(9) ページ: 1537-1543
  • 査読あり
• [学会発表] Next steps for genetic study of skeletal diseases-problems and solutions from 10 years' experience (2012)
  • 著者名/発表者名: Ikegawa S
  • 学会等名: Symposium on Developmental Genomics and Genetics Disorders
  • 発表場所: Hong Kong, China
  • 年月日: 2012-01-17
• [学会発表] Next steps for genetic study of skeletal diseases-problems and solutions from 10 years' experience (2012)
  • 著者名/発表者名: Ikegawa Shiro
  • 学会等名: Symposium on Developmental Genomics and Genetics Disorders
  • 発表場所: Hong Kong, China(招待講演)
  • 年月日: 2012-01-17
• [学会発表] ゲノム科学による疾患研究 (2012)
  • 著者名/発表者名: 池川志郎
  • 学会等名: 早稲田大学講義先端生命医科学特論イノベーティブディスカバリー
  • 発表場所: 早稲田大学生命医科学センター(東京都)
  • 年月日: 2012-01-13
• [学会発表] ゲノム科学による疾患研究 (2012)
  • 著者名/発表者名: 池川志郎
  • 学会等名: 早稲田大学講義先端生命医科学特論イノベーティブディスカバリー
  • 発表場所: 早稲田大学生命医科学センター(東京都)(招待講演)
  • 年月日: 2012-01-13
• [学会発表] 疾患遺伝子研究の現状と未来:骨・関節疾患を例に (2011)
  • 著者名/発表者名: 池川志郎
  • 学会等名: 徳島大学「次世代シーケンサーを用いた最先端研究」講演会
  • 発表場所: 徳島大学医学部(徳島県)
  • 年月日: 2011-08-26
• [学会発表] 疾患遺伝子研究の現状と未来:骨・関節疾患を例に (2011)
  • 著者名/発表者名: 池川志郎
  • 学会等名: 徳島大学「次世代シーケンサーを用いた最先端研究」講演会
  • 発表場所: 徳島大学医学部(徳島県)(招待講演)
  • 年月日: 2011-08-26
• [学会発表] ゲノムから医療へ、創薬ヘ:相関解析により同定された骨・関節の生活習慣病の原因遺伝子(疾患感受性遺伝子)に関する知見・知財の臨床応用に向けての課題の克服 (2011)
  • 著者名/発表者名: 池川志郎
  • 学会等名: 次世代医療システム産業化フォーラム招待講演
  • 発表場所: シティプラザ大阪(大阪府)
  • 年月日: 2011-07-08
• [学会発表] ゲノムから医療へ、創薬へ:相関解析により同定された骨・関節の生活習慣病の原因遺伝子(疾患感受性遺伝子)に関する知見・知財の臨床応用に向けての課題の克服 (2011)
  • 著者名/発表者名: 池川志郎
  • 学会等名: 次世代医療システム産業化フォーラム
  • 発表場所: シティプラザ大阪(大阪府)(招待講演)
  • 年月日: 2011-07-08
• [学会発表] Genomic analysis of osteoarthritis-From patient to gene, from genome to molecular pathogenesis (2011)
  • 著者名/発表者名: Ikegawa S
  • 学会等名: 1st Symposium of the Asia Pacific League of Associations for Rheumatology
  • 発表場所: Taipei, Taiwan
  • 年月日: 2011-04-16
• [学会発表] Genomic analysis of osteoarthritis-From patient to gene, from genome to molecular pathogenesis (2011)
  • 著者名/発表者名: Ikegawa Shiro
  • 学会等名: 1st Symposium of the Asia Pacific League of Associations for Rheumatology
  • 発表場所: Taipei, Taiwan(招待講演)
  • 年月日: 2011-04-16
• [学会発表] Genomic study of Bone and Joint Diseases using human and mouse genetics (2010)
  • 著者名/発表者名: Ikegawa S
  • 学会等名: 10th Annual meeting of the EAUHG(East Asian Union of Human Genetics Societies)
  • 発表場所: Jinan, China
  • 年月日: 2010-10-08
• [学会発表] Genomic study of Bone and Joint Diseases using human and mouse genetics (2010)
  • 著者名/発表者名: Ikegawa S
  • 学会等名: 10th Annual meeting of the EAUHG (East Asian Union of Human Genetics Societies)
  • 発表場所: Jinan, China
  • 年月日: 2010-10-08
• [学会発表] From genome to skeletal diseases-recent advances in the association study of osteoarthritis and lumbar disc herniation (2010)
  • 著者名/発表者名: Ikegawa S
  • 学会等名: 1st OARSI China Forum
  • 発表場所: Nanjing, China
  • 年月日: 2010-10-05
• [学会発表] From genome to skeletal diseases- recent advances in the association study of osteoarthritis and lumbar disc herniation (2010)
  • 著者名/発表者名: Ikegawa S
  • 学会等名: 1st OARSI China Forum
  • 発表場所: Nanjing, China
  • 年月日: 2010-10-05
• [学会発表] ヒト遺伝学を出発点とする運動器疾患研究 (2010)
  • 著者名/発表者名: 池川志郎
  • 学会等名: 第11回運動器科学研究会
  • 発表場所: 長野県・軽井沢
  • 年月日: 2010-09-10
• [学会発表] ゲノムから疾患へ-ヒト遺伝学(Human Genetics)を出発点とする疾患遺伝子と分子病態の解明 (2010)
  • 著者名/発表者名: 池川志郎
  • 学会等名: 京都大学再生医科学研究所第1回生命医科学セミナー
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2010-09-07
• [学会発表] ゲノムから疾患へ-ヒト遺伝学(Human Genetics)を出発点とする疾患遺伝子と分子病態の解明 (2010)
  • 著者名/発表者名: 池川志郎
  • 学会等名: 京都大学再生医科学研究所 第1回生命医科学セミナー
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2010-09-07
• [学会発表] ヒト遺伝学を出発点とする運動器疾患研究 (2010)
  • 著者名/発表者名: 池川志郎
  • 学会等名: 第11回運動器科学研究会
  • 発表場所: 軽井沢,長野
  • 年月日: 2010-09-01
• [学会発表] From genome to skeletal diseases-recent advances in the association study of osteoarthritis and lumbar disc herniation and its association with ECM biology (2010)
  • 著者名/発表者名: Ikegawa S
  • 学会等名: Gordon Conference(Proteoglican)
  • 発表場所: New Hampshire, USA
  • 年月日: 2010-07-14
• [学会発表] From genome to skeletal diseases- recent advances in the association study of osteoarthritis and lumbar disc herniation and its association with ECM biology (2010)
  • 著者名/発表者名: Ikegawa S
  • 学会等名: Gordon Conference (Proteoglican)
  • 発表場所: New Hampshire, USA
  • 年月日: 2010-07-14
• [学会発表] 遺伝学を用いた骨・関節疾患へのアプローチ (2010)
  • 著者名/発表者名: 池川志郎
  • 学会等名: 第5回Skeletal Research Meeting
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2010-06-12
• [学会発表] Genomic Analysis of Bone and Joint Diseases-Integrated Approach of Human & Mouse Genetics Toward Disease Genes & Molecular Pathogenesis of the Diseases (2010)
  • 著者名/発表者名: Ikegawa S
  • 学会等名: The Fourth Margaret River Region Forum
  • 発表場所: Duns borough, Australia
  • 年月日: 2010-04-29
• [学会発表] Genetic study of lumbar disc diseases (2010)
  • 著者名/発表者名: Ikegawa S
  • 学会等名: The 3rd Jishuitan Orthopedics Forum
  • 発表場所: Beijing, China
  • 年月日: 2010-04-24
• [学会発表] 骨・関節疾患のゲノム解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 池川志郎
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第54回大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2009-09-24
• [学会発表] 骨・関節疾患のゲノム解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 池川志郎
  • 学会等名: 日本人類遺伝学会第54回大会
  • 発表場所: 東京、グランドプリンスホテル高輪
  • 年月日: 2009-09-24
• [学会発表] Common polymorphisms and risk for degenerative joiny diseases in human populations (2009)
  • 著者名/発表者名: Ikegawa S
  • 学会等名: 9th Biennial Meeting of International Skeletal Dysplasia Society
  • 発表場所: Boston, USA
  • 年月日: 2009-07-19
• [学会発表] From Mouse to Human, from Monogenic to Polygenic Disease (2009)
  • 著者名/発表者名: Ikegawa S
  • 学会等名: Gordon Research Conference Catrilage Biology & Pathology
  • 発表場所: Les Diablerets, Switzerland
  • 年月日: 2009-06-08
• [学会発表] From Mouse to Human, from Monogenic to Polygenic Disease (2009)
  • 著者名/発表者名: 池川志郎
  • 学会等名: Gordon Research Conference Catrilage Biology & Pathology 2009
  • 発表場所: Les Diablerets, Switzerland
  • 年月日: 2009-06-08
• [学会発表] Integrated Approach toward Bone and Joint Diseases using Human and Mouse Genetics (2009)
  • 著者名/発表者名: Ikegawa S
  • 学会等名: Yokosuka Science Festa 2009 (Joint Conference of 8th Pan-Pacific Connective Tissue Societies Symposium (PPCTSS), 41st Annual Meeting of the Japanese Society of Connective Tissue Research (JSCTR), and 56th Annual Meeting of the Japan Matrix Club (JMC) Concurrent Meeting: Yokosuka International Conference on Cancer Microenvironment (YICCM)).
  • 発表場所: Yokosuka, Japan
  • 年月日: 2009-06-04
• [学会発表] Integrated Approach toward Bone & Joint Diseases using Human and Mouse Genetics (2009)
  • 著者名/発表者名: 池川志郎
  • 学会等名: Yokosuka Science Festa 2009(Joint Conference of 8th Pan-Pacific Connective Tissue Societies Symposium(PPCTSS), 41st Annual Meeting of the Japanese Society of Connective Tissue Research(JSCTR), and 56th Annual Meeting of the Japan Matrix Club(JMC)Concurrent Meeting : Yokosuka International Conference on Cancer Microenvironments(YICCM))
  • 発表場所: Yokosuka(神奈川県)
  • 年月日: 2009-06-04
• [学会発表] 骨関節疾患のゲノム解析-融合遺伝学アプローチによる疾患遺伝子の解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 池川志郎
  • 学会等名: 第14回Bone Research Joint Meeting
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2009-05-26
• [学会発表] 骨関節疾患のゲノム解析-融合遺伝学アプローチによる疾患遺伝子の解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 池川志郎
  • 学会等名: 第14回 Bone Research Joint Meeting
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2009-05-26
• [備考]
  • URL: http://www.riken.jp/lab-www/OA-team/
• [備考]
  • URL: http://www.riken.go.jp/
• [備考]
  • URL: http://www.riken.jp/lab-www/OA-team/
• [備考]
  • URL: http://www.riken.go.jp/
• [備考]
  • URL: http://www.riken.jp/lab-www/OA-team/
• [備考]
  • URL: http://www.riken.go.jp/
• [備考]
  • URL: http://www.riken.jp/lab-www/OA-team/