脂質二分子膜でのドラッグの分配と会合のMDとNMRによる研究

• 研究課題/領域番号: 21300111
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生体生命情報学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 松林 伸幸 京都大学, 化学研究所, 准教授 (20281107)
• 研究分担者: 若井 千尋 京都大学, 化学研究所, 助教 (40293948)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 18,070千円 (直接経費: 13,900千円、間接経費: 4,170千円); 2012年度: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円); 2011年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円); 2010年度: 3,510千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 810千円); 2009年度: 5,850千円 (直接経費: 4,500千円、間接経費: 1,350千円)
• キーワード: コンピュータシミュレーション / 脂質二重膜 / 溶液理論 / 自由エネルギー / NOE / ペプチド / NMR / バイセル / 分子動力学シミュレーション / 曲率 / 分布関数 / ナフタレン誘導体 / 脂質 / 二重膜 / ミセル / エネルギー表示 / NOESY / 分配係数

研究概要

脂質二分子膜へのドラッグ・機能性分子の結合様式は、薬理作用や麻酔作用を理解するための必須の情報である。本研究では、理論的手法(大規模分子動力学シミュレーションとエネルギー表示溶液理論)を主とし、実験的手法(NMR-NOE法)を相補的に用いることで、官能基を系統的に変えた小分子から麻酔剤や20残基程度の膜貫通タンパク質までの、結合量・結合配置・大域的運動様式を、全原子レベルで解析した。

研究成果

• [雑誌論文] Anion-Dependence of Fast Relaxation Component in Na-, K-Halide 2 Solutions at Low Concentrations Measured by High-Resolution 3 Microwave Dielectric Spectroscopy (2013)
  • 著者名/発表者名: George Mogami, Takashi Miyazaki, Tetsuichi Wazawa, Nobuyuki Matubayasi, and Makoto Suzuki
  • 雑誌名: J. Phys. Chem A 巻: 117 号: 23 ページ: 4851-4862
  • DOI: 10.1021/jp4012119
  • 査読あり
• [雑誌論文] Effect of heavy hydrogen isotopes on the vibrational line shape for supercritical water through rotational couplings (2013)
  • 著者名/発表者名: K. Yoshida, N. Matubayasi, Y. Uosaki, and M. Nakahara
  • 雑誌名: J. Chem. Phys 巻: 138 号: 13 ページ: 134508-134508
  • DOI: 10.1063/1.4798933
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular Dynamics Simulations of Yeast F1-ATPase Before and After 16-degree Rotation of the Gamma Subunit (2013)
  • 著者名/発表者名: Yuko Ito, Takashi Yoshidome, Nobuyuki Matubayashi, Masahiro Kinoshita, Mitsunori Ikeguchi
  • 雑誌名: The journal of Physical Chemistry B 巻: 117 号: 12 ページ: 3298-3307
  • DOI: 10.1021/jp312499u
  • 査読あり
• [雑誌論文] Solvent Effect on Pathways and Mechanisms for D-Fructose Conversion to 5-Hydroxymethyl-2-furaldehyde: In Situ^<13>C NMR Study (2013)
  • 著者名/発表者名: H. Kimura, M. Nakahara, and N. Matubayasi
  • 雑誌名: J. Phys. Chem. A 巻: 117 号: 10 ページ: 2102-2113
  • DOI: 10.1021/jp312002h
  • 査読あり
• [雑誌論文] Interaction-component analysis of the urea effect on amino acid analogs (2013)
  • 著者名/発表者名: Y. Karino and N. Matubayasi
  • 雑誌名: Phys. Chem. Chem. Phys 巻: 15 号: 12 ページ: 4377-4391
  • DOI: 10.1039/c3cp43346c
  • NAID: 120005466636
  • 査読あり
• [雑誌論文] A theoretical study of the two binding modes between lysozyme and tri-NAG with an explicit solvent model based on the fragment molecular orbital method (2013)
  • 著者名/発表者名: T. Ishikawa, R. R. Burri, Y. O. Kamatari, S. Sakuraba, N. Matubayasi, A. Kitao, and K. Kuwata
  • 雑誌名: Phys. Chem. Chem. Phys 巻: 15 号: 10 ページ: 3646-3654
  • DOI: 10.1039/c3cp42761g
  • 査読あり
• [雑誌論文] Free-energy analysis of lysozyme-triNAG binding modes with all-atom molecular dynamics simulation combined with the solution theory in the energy representation (2013)
  • 著者名/発表者名: K. Takemura, R. R. Burri, T. Ishikawa, T. Ishikura, S. Sakuraba, N. Matubayasi, K. Kuwata, and A. Kitao
  • 雑誌名: Chem. Phys. Lett 巻: 559 ページ: 94-98
  • DOI: 10.1016/j.cplett.2012.12.063
  • 査読あり
• [雑誌論文] High-Energy X-ray Diffraction Study on the Intramolecular Structure of 2-Aminoethanol in the Liquid State (2013)
  • 著者名/発表者名: Y. Kameda, H. Deguchi, Y. Kubota, H. Furukawa, Y. Yagi, Y. Imai, M. Tatsumi, N. Yamazaki, N. Watari, T. Hirata, N. Matubayasi
  • 雑誌名: Bull. Chem. Soc. Japan 巻: 86 号: 1 ページ: 99-103
  • DOI: 10.1246/bcsj.20120222
  • NAID: 130004153140
  • 査読あり
• [雑誌論文] Free-energy analysis of water affinity in polymer studied by atomistic molecular simulation combined with the theory of solutions in the energy representation (2012)
  • 著者名/発表者名: T. Kawakami, I. Shigemoto, and N. Matubayasi
  • 雑誌名: J. Chem. Phys 巻: 137 号: 23
  • DOI: 10.1063/1.4770334
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular dynamics study of fast dielectric relaxation of water around a molecular-sized ion (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Kubota, A. Yoshimori, N. Matubayasi, M. Suzuki, and R. Akiyama
  • 雑誌名: J. Chem. Phys 巻: 137 号: 22
  • DOI: 10.1063/1.4769972
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evaluation of protein-protein docking model structures using all-atom molecular dynamics simulations combined with the solution theory in the energy representation (2012)
  • 著者名/発表者名: K. Takemura, H. Guo, S. Sakuraba, N. Matubayasi, and A. Kitao
  • 雑誌名: J. Chem. Phys 巻: 137 号: 21
  • DOI: 10.1063/1.4768901
  • 査読あり
• [雑誌論文] Density effect on infrared spectrum for supercritical water in the low- and medium-density region studied by molecular dynamics simulation (2012)
  • 著者名/発表者名: K. Yoshida, N. Matubayasi, Y. Uosaki, and M. Nakahara
  • 雑誌名: J. Chem. Phys 巻: 137 号: 19
  • DOI: 10.1063/1.4767352
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nuclear magnetic resonance study on rotational dynamics of water and benzene in a series of ionic liquids: Anion and cation effects (2012)
  • 著者名/発表者名: H. Kimura, Y. Yasaka, M. Nakahara, and N. Matubayasi
  • 雑誌名: J. Chem. Phys 巻: 137 号: 19
  • DOI: 10.1063/1.4766258
  • NAID: 120005054548
  • 査読あり
• [雑誌論文] Non-catalytic Hydrothermal Elimination of Terminal D-Glucose Unit from Malto- and Cello-oligosaccharides through Transformation to D-Fructose (2012)
  • 著者名/発表者名: H. Kimura, M. Nakahara, and N. Matubayasi
  • 雑誌名: J. Phys. Chem. A 巻: 116 号: 41 ページ: 10039-10049
  • DOI: 10.1021/jp3034165
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural Characteristics of Yeast F_1-ATPase Before and After 16-degree Rotation of the γ Subunit : Theoretical Analysis Focused on the Water-Enrtopy Effect (2012)
  • 著者名/発表者名: Takashi Yoshidome, Yuko Ito, Nobuyuki Matubayashi, Mitunori Ikeguchi, Masahiro Kinoshita
  • 雑誌名: Journal of Chemical Physics 巻: 137 号: 3 ページ: 8-8
  • DOI: 10.1063/1.4734298
  • 査読あり
• [雑誌論文] Interaction of naphthalene derivatives with lipid in membrane studied by 1H-nuclear Overhauser effect and molecular dynamics simulation (2012)
  • 著者名/発表者名: M. Shintani, Y. Matsuo, S. Sakuraba, and N. Matubayasi
  • 雑誌名: Phys. Chem. Chem. Phys 巻: 14 号: 40 ページ: 14049-14060
  • DOI: 10.1039/c2cp41984j
  • NAID: 120005312058
  • 査読あり
• [雑誌論文] A possible molecular mechanism for the pressure reversal of general anaesthetics: aggregation of halothane in POPC bilayers at high pressure (2012)
  • 著者名/発表者名: K. M. Tu, N. Matubayasi, K. K. Liang, I. T. Todorov, S. L. Chan, and P.-L. Chau
  • 雑誌名: Chem. Phys. Lett 巻: 542 ページ: 148-154
  • DOI: 10.1016/j.cplett.2012.06.044
  • 査読あり
• [雑誌論文] Simple and exact approach to the electronic polarization effect on the solvation free energy: Formulation for QM/MM system and its applications to aqueous solutions (2012)
  • 著者名/発表者名: H. Takahashi, A. Omi, A. Morita, and N. Matubayasi
  • 雑誌名: J. Chem. Phys 巻: 136 号: 21 ページ: 214503-214503
  • DOI: 10.1063/1.4722347
  • 査読あり
• [雑誌論文] Free-Energy and Structural Analysis of Ion Solvation and Contact Ion-Pair Formation of Li^+ with BF_4^- and PF_6^- in Water and Carbonate Solvents (2012)
  • 著者名/発表者名: M. Takeuchi, N. Matubayasi, Y. Kameda, B. Minofar, S. Ishiguro, and Y. Umebayashi
  • 雑誌名: J. Phys. Chem. B 巻: 116 号: 22 ページ: 6476-6487
  • DOI: 10.1021/jp3011487
  • 査読あり
• [雑誌論文] The effect of pressure on halothane binding to hydrated DMPC bilayers (2012)
  • 著者名/発表者名: P.-L. Chau, K. M. Tu, K. K. Liang, I. T. Todorov, S. J. Roser, R. Barker, and N. Matubayasi
  • 雑誌名: Mol. Phys 巻: 110 号: 13 ページ: 1461-1467
  • DOI: 10.1080/00268976.2012.659682
  • 査読あり
• [雑誌論文] Rotational dynamics of benzene and water in an ionic liquid explored via molecular dynamics simulations and NMR T1 measurements (2012)
  • 著者名/発表者名: Y.Yasaka, M.L.Klein, M.Nakahara, N.Matubayasi
  • 雑誌名: Journal of Chemical Physics 巻: 136 号: 7
  • DOI: 10.1063/1.3685100
  • 査読あり
• [雑誌論文] Free-energy analysis of the electron-density fluctuation in the quantum-mechanical/molecular-mechanical simulation combined with the theory of energy representation (2012)
  • 著者名/発表者名: N.Matubayasi, H.Takahashi
  • 雑誌名: Journal of Chemical Physics 巻: 136 号: 4
  • DOI: 10.1063/1.3677184
  • 査読あり
• [雑誌論文] Pathways and Kinetics of Anisole Pyrolysis Studied by NMR and Selective ^<13>C Labeling. Heterolytic Carbon Monoxide Generation (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Tsujino, Y. Yasaka, N. Matubayasi, and M. Nakahara
  • 雑誌名: Bull. Chem. Soc. Japan 巻: 85 号: 1 ページ: 124-132
  • DOI: 10.1246/bcsj.20110334
  • NAID: 130004152976
  • 査読あり
• [雑誌論文] In Situ Kinetic Study on Hydrothermal Transformation of D-Glucose into 5-Hydroxymethylfurfural through D-Fructose with ^<13>C NMR (2011)
  • 著者名/発表者名: H.Kimura, M.Nakahara, N.Matubayasi
  • 雑誌名: Journal of Physical Chemistry A 巻: 115 号: 48 ページ: 14013-14021
  • DOI: 10.1021/jp206355e
  • 査読あり
• [雑誌論文] Frequency-Domain Investigation of the Ionic Mobility of Triflate Salts in Tetrahy drofuran (2011)
  • 著者名/発表者名: T.Yamaguchi, Y.Yamada, T.Matsuoka, S.Koda, Y.Yasaka, N.Matubayasi
  • 雑誌名: Journal of Physical Chemistry B 巻: 115 号: 43 ページ: 12558-12565
  • DOI: 10.1021/jp208317f
  • 査読あり
• [雑誌論文] Hydration structure around CO_2 captured in aqueous amine solutions observed by high energy X-ray scattering (2011)
  • 著者名/発表者名: H.Deguchi, Y.Kubota, H.Furukawa, Y.Yagi, Y.Imai, M.Tatsumi, N.Yamazaki, N.Watari, T.Hirata, N.Matubayasi, Y.Kameda
  • 雑誌名: Int.J.Greenhouse Gas Control 巻: 5 号: 6 ページ: 1533-1539
  • DOI: 10.1016/j.ijggc.2011.08.010
  • 査読あり
• [雑誌論文] Distribution-function approach to free energy computation (2011)
  • 著者名/発表者名: S.Sakuraba, N.Matubayasi
  • 雑誌名: Journal of Chemical Physics 巻: 134 号: 11
  • DOI: 10.1063/1.3637036
  • NAID: 120003437103
  • 査読あり
• [雑誌論文] NMR-NOE and MD Simulation Study on Phospholipid Membranes : Dependence on Membrane Diameter and Multiple Time Scale Dynamics (2011)
  • 著者名/発表者名: M.Shintani, K.Yoshida, S.Sakuraba, M.Nakahara, N.Matubayasi
  • 雑誌名: Journal of Physical Chemistry B 巻: 115 号: 29 ページ: 9106-9115
  • DOI: 10.1021/jp204051f
  • 査読あり
• [雑誌論文] Energetic Origin of Proton Affinity to the Air/Water Interface (2011)
  • 著者名/発表者名: H.Takahashi, K.Maruyama, Y.Karino, A.Morita, M.Nakano, P.Jungwirth, N.Matubayasi
  • 雑誌名: Journal of Physical Chemistry B 巻: 115 号: 16 ページ: 4745-4751
  • DOI: 10.1021/jp2015676
  • 査読あり
• [雑誌論文] Exploring the reorientation of benzene in an ionic liquid via molecular dynamics : Effect of temperature and solvent effective charge on the slow dynamics (2011)
  • 著者名/発表者名: Y.Yasaka, M.L.Klein, M.Nakahara, N.Matubayasi
  • 雑誌名: Journal of Chemical Physics 巻: 134 号: 19
  • DOI: 10.1063/1.3592530
  • 査読あり
• [雑誌論文] Free-energy analysis of hydration effect on protein with explicit solvent: Equilibrium fluctuation of cytochrome c (2011)
  • 著者名/発表者名: Y. Karino and N. Matubayasi
  • 雑誌名: J. Chem. Phys 巻: 134 号: 4
  • DOI: 10.1063/1.3535560
  • 査読あり
• [雑誌論文] Free-energy analysis of hydration effect on protein with explicit solvent : Equilibrium fluctuation of cytochrome c (2011)
  • 著者名/発表者名: Y.Karino, N.Matubayasi
  • 雑誌名: J.Chem.Phys. 巻: 134(Communication)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Energetic Origin of Proton Affinity to the Air/Water Interface (2011)
  • 著者名/発表者名: H.Takahashi, K.Maruyama, Y.Karino, A.Morita, M.Nakano, P.Jungwirth, N.Matubayasi
  • 雑誌名: J.Phys.Chem.B 巻: 115(印刷中)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Hydration property of globular proteins: An analysis of solvation free energy by energy representation method (2010)
  • 著者名/発表者名: H. Saito, N. Matubayasi, K. Nishikawa, and H. Nagao
  • 雑誌名: Chem. Phys. Lett 巻: 497 号: 4-6 ページ: 218-222
  • DOI: 10.1016/j.cplett.2010.08.008
  • 査読あり
• [雑誌論文] End-point calculation of solvation free energy of amino-acid analogs by molecular theories of solution (2010)
  • 著者名/発表者名: Y. Karino, M. V. Fedorov, and N. Matubayasi
  • 雑誌名: Chem. Phys. Lett 巻: 496 号: 4-6 ページ: 351-355
  • DOI: 10.1016/j.cplett.2010.07.054
  • NAID: 120002561295
  • 査読あり
• [雑誌論文] Scaled Polynomial Expression for Self-Diffusion Coefficients for Water, Benzene, and Cyclohexane over a Wide Range of emperatures and Densities (2010)
  • 著者名/発表者名: K. Yoshida, N. Matubayasi, Y. Uosaki, and M. Nakahara
  • 雑誌名: J. Chem. Eng. Data 巻: 55 号: 8 ページ: 2815-2823
  • DOI: 10.1021/je100206s
  • 査読あり
• [雑誌論文] Insights into the Origins of Configurational Stability of Axially Chiral Biaryl Amines with an Intramolecular N-H-N Hydrogen Bond (2010)
  • 著者名/発表者名: K. Hayashi, N. Matubayasi, C. Jiang, T. Yoshimura, S. Majumdar, T. Sasamori, N. Tokitoh, and T. Kawabata
  • 雑誌名: J. Org. Chem 巻: 75 号: 15 ページ: 5031-5036
  • DOI: 10.1021/jo100586b
  • 査読あり
• [雑誌論文] Controlling the Equilibrium of Formic Acid with Hydrogen and Carbon Dioxide Using Ionic Liquid (2010)
  • 著者名/発表者名: Y. Yasaka, C. Wakai, N. Matubayasi, and M. Nakahara
  • 雑誌名: J. Phys. Chem. A 巻: 114 号: 10 ページ: 3510-3515
  • DOI: 10.1021/jp908174s
  • 査読あり
• [雑誌論文] Newly Designed Neutron Diffraction Cell for Fluids at High Temperatures and High Pressures (2010)
  • 著者名/発表者名: H. Iwase, N. Matubayasi, Y. Kameda, K. Itoh, T. Otomo, and M. Nakahara
  • 雑誌名: Japanese Journal of Applied Physics 巻: 49 号: 1 ページ: 016602-016602
  • DOI: 10.1143/jjap.49.016602
  • NAID: 40016941288
  • 査読あり
• [雑誌論文] Controlling the Equilibrium of Formic Acid with Hydrogen and Carbon Dioxide Using Ionic Liquid (2010)
  • 著者名/発表者名: Y.Yasaka, C.Wakai, N.Matubayasi, M.Nakahara
  • 雑誌名: J.Phys.Chem.A 巻: 114 ページ: 3510-3515
  • 査読あり
• [雑誌論文] Insights into the Origins of Configurational Stability of Axially Chiral Biaryl Amines with an Intramolecular N-H-N Hydrogen Bond (2010)
  • 著者名/発表者名: K.Hayashi, N.Matubayasi, C.Jiang, T.Yoshimura, S.Majumdar, T.Sasamori, N.Tokitoh, T.Kawabata
  • 雑誌名: J.Org.Chem. 巻: 75 ページ: 5031-5036
  • 査読あり
• [雑誌論文] Scaled Polynomial Expression for Self-Diffusion Coefficients for Water, Benzene, and Cyclohexane over a Wide Range of Temperatures and Densities (2010)
  • 著者名/発表者名: K.Yoshida, N.Matubayasi, Y.Uosaki, M.Nakahara
  • 雑誌名: J.Chem.Eng.Data 巻: 55 ページ: 2815-2823
  • 査読あり
• [雑誌論文] End-point calculation of solvation free energy of amino-acid analogs by molecular theories of solution (2010)
  • 著者名/発表者名: Y.Karino, M.V.Fedorov, N.Matubayasi
  • 雑誌名: Chem.Phys.Lett. 巻: 496 ページ: 351-355
  • NAID: 120002561295
  • 査読あり
• [雑誌論文] Hydration property of globular proteins : An analysis of solvation free energy by energy representation method (2010)
  • 著者名/発表者名: H.Saito, N.Matubayasi, K.Nishikawa, H.Nagao
  • 雑誌名: Chem.Phys.Lett. 巻: 497 ページ: 218-222
  • 査読あり
• [雑誌論文] 高温高圧水における有機反応研究の進歩 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中原勝、辻野康夫、八坂能郎、吉田健、魚崎泰弘、若井千尋、松林伸幸
  • 雑誌名: 高圧力の科学と技術 巻: 20 ページ: 40-49
  • NAID: 10026122135
  • 査読あり
• [雑誌論文] Development of a Quantum Chemical Method Combined with a Theory of Solutions--Free-Energy Calculation for Chemical Reactions by Condensed Phase Simulations (2010)
  • 著者名/発表者名: H.Takahashi, N.Matubayasi, M.Nakano
  • 雑誌名: Advances in Quantum Chemistry 巻: 59 ページ: 283-351
  • 査読あり
• [雑誌論文] イオン液体の不純物戦記-水という「pH指示薬」を用いた不純物の検出法 (2010)
  • 著者名/発表者名: 八坂能郎、中原勝、松林伸幸
  • 雑誌名: 化学 巻: 65(7) ページ: 46-51
• [雑誌論文] Newly Designed Neutron Diffraction Cell for Fluids at High Temperatures and High Pressures (2010)
  • 著者名/発表者名: H.Iwase, N.Matubayasi, Y.Kameda, K.Itoh, T.Otomo, M.Nakahara
  • 雑誌名: Japanese Journal of Applied Physics 49
  • NAID: 40016941288
  • 査読あり
• [雑誌論文] Self-diffusion coefficients for water and organic solvents in extremely low-density supercritical states (2009)
  • 著者名/発表者名: K. Yoshida, N. Matubayasi, and M. Nakahara
  • 雑誌名: J. Mol. Liq 巻: 147 号: 1-2 ページ: 96-101
  • DOI: 10.1016/j.molliq.2008.10.006
  • 査読あり
• [雑誌論文] Water as an In-situ NMR Indicator for Impurity Acids in Ionic Liquids (2009)
  • 著者名/発表者名: Y. Yasaka, C. Wakai, N. Matubayasi, and M. Nakahara
  • 雑誌名: Anal. Chem 巻: 81 号: 1 ページ: 400-407
  • DOI: 10.1021/ac801767u
  • 査読あり
• [雑誌論文] Water as an In-situ NMR Indicator for Impurity Acids in Ionic Liquids (2009)
  • 著者名/発表者名: Y.Yasaka, C.Wakai, N.Matubayasi, M.Nakahara
  • 雑誌名: Analytical Chemistry 81 ページ: 400-407
  • 査読あり
• [雑誌論文] Self-diffusion coefficients for water and organic solvents in extremely low-density supercritical states (2009)
  • 著者名/発表者名: K.Yoshida, N.Matubayasi, M.Nakahara
  • 雑誌名: J.Mol.Liq. 147 ページ: 96-101
  • 査読あり
• [雑誌論文] Free-Energy Analysis of Solvation with the Method of Energy Representation (2009)
  • 著者名/発表者名: 松林伸幸
  • 雑誌名: Frontiers in Bioscience 14 ページ: 3536-3549
  • NAID: 10025613007
  • 査読あり
• [雑誌論文] エネルギー表示法による溶媒和の自由エネルギー解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 松林伸幸
  • 雑誌名: 熱測定 36 ページ: 165-172
  • NAID: 10025613007
  • 査読あり
• [学会発表] Interaction-component analysis of hydration and cosolvent effects on protein structure (2013)
  • 著者名/発表者名: Nobuyuki Matubayasi
  • 学会等名: International Mini-Workshop on the Coupled Effects of Water, ATP, and Osmolyte on Bio-Related Systems
  • 発表場所: 仙台市青葉区 ホテルモントレー
  • 招待講演
• [学会発表] Free-energy analysis of water and cosolvent effects on functional molecules in solution (2012)
  • 著者名/発表者名: N. Matubayasi
  • 学会等名: RCAS Thursday Seminar
  • 発表場所: Taipei, Taiwan
  • 年月日: 2012-12-13
• [学会発表] Effects of water and cosolvents on functional molecules in solution (2012)
  • 著者名/発表者名: N. Matubayasi
  • 学会等名: EMLG/JMLG Annual Meeting 2012 "Molecular association in fluid phases and at fluid interfaces"
  • 発表場所: Eger, Hungary
• [学会発表] Extended Concept of Solvation toward Unified Understandings of Molecular Binding in Weakly Ordered Systems (2012)
  • 著者名/発表者名: N. Matubayasi
  • 学会等名: JST International Symposium on Multi-scale Simulation of Condensed-phase Reacting Systems
  • 発表場所: 名古屋
• [学会発表] Extended Concept of Solvation toward Unified Treatment of Molecular Binding in Weakly Ordered Systems (2012)
  • 著者名/発表者名: N. Matubayasi
  • 学会等名: The 2nd AICS (Advanced Institute for Computational Science) International Symposium
  • 発表場所: 神戸
• [学会発表] Extended Concept of Solvation toward Unified Understandings of Molecular Binding in Weakly Ordered Systems (2012)
  • 著者名/発表者名: Nobuyuki Matubayasi
  • 学会等名: JST International Symposium on Multi-scale Simulation of Condensed-phase Reacting Systems
  • 発表場所: 名古屋大学 東山キャンパス ESホール
  • 招待講演
• [学会発表] 拡張型の溶媒和概念に基づく均一・不均一溶液系の自由エネルギー解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 松林 伸幸
  • 学会等名: 第72回分析化学討論会
  • 発表場所: 鹿児島大学工学部 郡元キャンパス
  • 招待講演
• [学会発表] 拡張型の溶媒和概念に基づくソフト分子集団の自由エネルギー解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 松林 伸幸
  • 学会等名: 第2回CSJ化学フェスタ2012
  • 発表場所: 東京工業大学 大岡山キャンパス
  • 招待講演
• [学会発表] Free-energy analysis of water and cosolvent effects on biomolecules in the energetic perspective (2012)
  • 著者名/発表者名: Nobuyuki Matubayasi
  • 学会等名: Mini-Symposium on Modeling, Simulation and Function of Biomolecular Assemblies
  • 発表場所: 東京大学 伊藤国際学術研究センター
  • 招待講演
• [学会発表] Free-energy analysis of water and cosolvent effects on functional molecules in solution (2012)
  • 著者名/発表者名: Nobuyuki Matubayasi
  • 学会等名: RCAS Thursday Seminar
  • 発表場所: 台北、台湾
  • 招待講演
• [学会発表] Extended Concept of Solvation toward Unified Treatment of Molecular Binding in Weakly Ordered Systems (2012)
  • 著者名/発表者名: Nobuyuki Matubayasi
  • 学会等名: The 2nd AICS (Advanced Institute for Computational Science) International Symposium
  • 発表場所: RIKEN Advanced Institute for Computational Science (神戸)
  • 招待講演
• [学会発表] 拡張型の溶媒和概念に基づく膜・不均一系の機能解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 松林伸幸
  • 学会等名: 生物物理若手の会京都支部セミナー「様々な角度からの膜の研究」
  • 発表場所: 京都大学理学部セミナーハウス(京都市左京区)(招待講演)
  • 年月日: 2011-03-12
• [学会発表] Extended Concept of Solvation toward Unified Analysis of Molecular Binding in Weakly Ordered Systems (2011)
  • 著者名/発表者名: N. Matubayasi
  • 学会等名: The Seventh Congress of the International Society for Theoretical Chemical Physics (ISTCP-VII)
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] Free-energy Analysis of urea effect on amino-acid analogs and proteins (2011)
  • 著者名/発表者名: N. Matubayasi
  • 学会等名: Telluride Science Research Center workshop "The Physics, Chemistry, and Biology of Ions and Osmolytes in Solution"
  • 発表場所: Telluride, CO, USA
• [学会発表] Free-energy Analysis of urea effect on amino-acid analogs and proteins (2011)
  • 著者名/発表者名: Nobuyuki Matubayasi
  • 学会等名: Telluride Science Research Center workshop "The Physics, Chemistry, and Biology of Ions and Osmolytes in Solution"
  • 発表場所: Telluride, USA
  • 招待講演
• [学会発表] Extended Concept of Solvation toward Unified Analysis of Molecular Binding in Weakly Ordered Systems (2011)
  • 著者名/発表者名: Nobuyuki Matubayasi
  • 学会等名: The Seventh Congress of the International Society for Theoretical Chemical Physics (ISTCP-VII)
  • 発表場所: 早稲田大学新宿キャンパス
  • 招待講演
• [学会発表] 自由エネルギー計算で見るタンパク質に対する共溶媒効果 (2011)
  • 著者名/発表者名: 狩野 康人、松林 伸幸
  • 学会等名: 第63回コロイドおよび界面化学討論会
  • 発表場所: 京都大学吉田キャンパス
  • 招待講演
• [学会発表] 拡張型の溶媒和概念に基づくソフト分子集団の自由エネルギー解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 松林 伸幸
  • 学会等名: 東北大学グローバルCOEプログラム「分子系高次構造体化学国際教育研究拠点」 グローバルCOEプログラムシンポジウム２０１１
  • 発表場所: 東北大学片平さくらホール
  • 招待講演
• [学会発表] ポリモルフから生起する分子集団機能 (2011)
  • 著者名/発表者名: 松林伸幸、櫻庭俊
  • 学会等名: 物性研・CMSI・次世代ナノ情報合同研究会「計算物質科学の課題と展望」
  • 発表場所: 東京大学物性研究所(千葉県柏市)(招待講演)
• [学会発表] 分子動力学計算による高分子電解質ゲルの物質透過性の研究 (2011)
  • 著者名/発表者名: 川上智教、茂本勇、松林伸幸
  • 学会等名: 物性研・CMSI・次世代ナノ情報合同研究会「計算物質科学の課題と展望」
  • 発表場所: 東京大学物性研究所(千葉県柏市)
• [学会発表] Energetics of ATP Hydrolysis in cell, solution and vacuum and on protein (2011)
  • 著者名/発表者名: 児玉孝雄、松林伸幸、木森義孝
  • 学会等名: 2011年生体運動研究合同班会議
  • 発表場所: 大阪市立大学杉本キャンパス(大阪市住吉区杉本3-3-138)
• [学会発表] 分子シミュレーションと溶液理論の融合によるソフト分子集団の自由エネルギー解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 松林伸幸
  • 学会等名: 計算分子科学研究拠点第1回研究会
  • 発表場所: 自然科学研究機構 岡崎コンファレンスセンター(招待講演)
• [学会発表] ermodの開発状況と環境調和型化学過程への適用事例 (2011)
  • 著者名/発表者名: 松林伸幸
  • 学会等名: 文部科学省「最先端・高性能スーパーコンピュータの開発利用」プロジェクト 次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発 第5回公開シンポジウム
  • 発表場所: 甲南大学ポートアイランドキャンパス7階 セミナーホール (神戸市中央区)(招待講演)
• [学会発表] Free-Energy Analysis of Protein-Membrane Interaction : Preferred Configuration of Transmembrane Protein and Roles of Lipid and Water (2011)
  • 著者名/発表者名: Acep PURQON, 松林伸幸
  • 学会等名: 文部科学省「最先端・高性能スーパーコンピュータの開発利用」プロジェクト 次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発 第5回公開シンポジウム
  • 発表場所: 甲南大学ポートアイランドキャンパス7階 セミナーホール (神戸市中央区)
• [学会発表] cytochrome cの構造変化に対するエネルギー解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 狩野康人、松林伸幸
  • 学会等名: 文部科学省「最先端・高性能スーパーコンピュータの開発利用」プロジェクト 次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発第5回公開シンポジウム
  • 発表場所: 甲南大学ポートアイランドキャンパス7階 セミナーホール (神戸市中央区)
• [学会発表] 独立部分空間分析を用いたタンパク質運動の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 桜庭俊、松林伸幸、城地保昌、北尾彰朗
  • 学会等名: 文部科学省「最先端・高性能スーパーコンピュータの開発利用」プロジェクト 次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発 第5回公開シンポジウム
  • 発表場所: 甲南大学ポートアイランドキャンパス7階 セミナーホール (神戸市中央区)
• [学会発表] 2-アミノエタノール(MEA)水溶液の分子動力学的解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 窪田善之、古川博敏、狩野康人、桜庭俊、松林伸幸
  • 学会等名: 文部科学省「最先端・高性能スーパーコンピュータの開発利用」プロジェクト 次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発 第5回公開シンポジウム
  • 発表場所: 甲南大学ポートアイランドキャンパス7階 セミナーホール (神戸市中央区)
• [学会発表] 自由エネルギー計算を活用した高分子電解質の物質透過性の研究 (2011)
  • 著者名/発表者名: 川上智教、茂本勇、松林伸幸
  • 学会等名: 文部科学省「最先端・高性能スーパーコンピュータの開発利用」プロジェクト 次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発 第5回公開シンポジウム
  • 発表場所: 甲南大学ポートアイランドキャンパス7階 セミナーホール (神戸市中央区)
• [学会発表] 脂質膜の曲率がダイナミクスに及ぼす効果:溶液NMR-NOE測定と大規模MDによる研究 (2011)
  • 著者名/発表者名: 新谷恵、吉田健、櫻庭俊、中原勝、松林伸幸
  • 学会等名: 日本化学会第91春季年会
  • 発表場所: 神奈川大学 横浜キャンパス
• [学会発表] グルコースの水熱反応の機構と速度論解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 木村浩、中原勝、松林伸幸
  • 学会等名: 日本化学会第91春季年会
  • 発表場所: 神奈川大学 横浜キャンパス
• [学会発表] 溶液NMRによる脂質二分子膜中のドラッグ分子の相互作用位置およびダイナミクスの検討 (2011)
  • 著者名/発表者名: 松尾勇志、新谷恵、松林伸幸
  • 学会等名: 日本化学会第91春季年会
  • 発表場所: 神奈川大学横浜キャンパス
• [学会発表] 不斉軸に直結した中心金属を持つビナフチル化合物の合成と物性 (2011)
  • 著者名/発表者名: 林一広, 中島裕美子, 小澤文幸, 松林伸幸, 笹森貴裕, 時任宣博, 川端猛夫
  • 学会等名: 日本薬学会第131年会
  • 発表場所: ツインメッセ静岡 (静岡市)
• [学会発表] NMRと計算化学の融合によるナノ不均一溶液系の動的構造の解明 (2010)
  • 著者名/発表者名: 松林伸幸
  • 学会等名: 第33回JEOL NMRユーザーズミーティング
  • 発表場所: メルパルク京都(招待講演)
  • 年月日: 2010-12-02
• [学会発表] Recent Progress in JST/SSF Exchange Program (2010)
  • 著者名/発表者名: Nobuyuki Matubayasi
  • 学会等名: Meeting of JST-SSF/Vinnova Cooperative Programme on "Multidisciplinary BIO"
  • 発表場所: 京都大学化学研究所
  • 年月日: 2010-11-02
• [学会発表] バイオ分子間相互作用形態研究における情報的粗視化モデリング (2010)
  • 著者名/発表者名: 松林伸幸
  • 学会等名: CREST「バイオ分子間相互作用形態の階層的モデリング」チームミーティング
  • 発表場所: 京都大学 東京オフィス
  • 年月日: 2010-10-07
• [学会発表] 溶液内のナノ不均一構造の自由エネルギー解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 松林伸幸
  • 学会等名: 新化学発展協会先端化学技術部会コンピュータケミストリ分科会講演会
  • 発表場所: ハーモニーホール(東京都千代田区内神田)(招待講演)
  • 年月日: 2010-09-01
• [学会発表] Free-energy analysis of functional, self-organizing systems in solution (2010)
  • 著者名/発表者名: Nobuyuki Matubayasi
  • 学会等名: 理研セミナー
  • 発表場所: 理化学研究所 基幹研究所(埼玉県和光市)(招待講演)
  • 年月日: 2010-07-28
• [学会発表] Free-energy analysis of the hydration effect on cytochrome c (2010)
  • 著者名/発表者名: Yasuhito Karino, Nobuyuki Matubayasi
  • 学会等名: 4th Mini-Symposium on Liquids
  • 発表場所: 九州大学21世紀交流プラザ
  • 年月日: 2010-06-26
• [学会発表] エネルギー表示法によるナノ不均一溶液系の自由エネルギー解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 松林伸幸
  • 学会等名: 九州大学 理学研究院第1回物理教室談話会
  • 発表場所: 九州大学 理学研究院(招待講演)
  • 年月日: 2010-05-25
• [学会発表] エネルギー表示法による溶液系の自由エネルギー解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 松林伸幸
  • 学会等名: (社)近畿化学協会コンピュータ化学部会第78回例会
  • 発表場所: 大阪科学技術センター(招待講演)
  • 年月日: 2010-05-21
• [学会発表] Free-Energy Analysis of Biomolecular Solvation in the Energetic Perspective (2010)
  • 著者名/発表者名: N. Matubayasi
  • 学会等名: Gordon Research Conference on Water & Aqueous Solutions
  • 発表場所: Holderness, NH, USA
• [学会発表] Free-Energy Analysis of Nano-Organized Systems in Solution (2010)
  • 著者名/発表者名: N. Matubayasi
  • 学会等名: 21st IUPAC International Conference on Chemical Thermodynamics
  • 発表場所: つくば
• [学会発表] Free-Energy Analysis of Solvation in the Energetic Perspective (2010)
  • 著者名/発表者名: N. Matubayasi
  • 学会等名: Trilateral Scientific Seminar "Solvation in Complex Liquids: Bridging Length Scales by Theory and Experiment"
  • 発表場所: Leipzig, Germany
• [学会発表] Free-energy analysis of functional, self-organizing systems in solution (2010)
  • 著者名/発表者名: N. Matubayasi
  • 学会等名: Workshop "Solvation of bioactive compounds: bridging theory, computation and experiment"
  • 発表場所: Leipzig, Germany
• [学会発表] Free-Energy Analysis of Solvation in the Energetic Perspective (2010)
  • 著者名/発表者名: Nobuyuki Matubayasi
  • 学会等名: Trilateral Scientific Seminar "Solvation in Complex Liquids : Bridging Length Scales by Theory and Experiment"
  • 発表場所: Leipzig, Germany(招待講演)
• [学会発表] Free-Energy Analysis of Nano-Organized Systems in Solution (2010)
  • 著者名/発表者名: Nobuyuki Matubayasi
  • 学会等名: 21st IUPAC International Conference on Chemical Thermodynamics
  • 発表場所: Tsukuba International Congress Center(つくば)(招待講演)
• [学会発表] Free-Energy Analysis of the Hydration Effect on Cytochrome c (2010)
  • 著者名/発表者名: Yasuhito Karino, Nobuyuki Matubayasi
  • 学会等名: 21st IUPAC International Conference on Chemical Thermodynamics
  • 発表場所: Tsukuba International Congress Center(つくば)
• [学会発表] Free-Energy Analysis of Biomolecular Solvation in the Energetic Perspective (2010)
  • 著者名/発表者名: Nobuyuki Matubayasi
  • 学会等名: Gordon Research Conference on Water & Aqueous Solutions
  • 発表場所: Holderness School, Holderness, NH, USA(招待講演)
• [学会発表] エネルギー表示法による溶媒和効果の自由エネルギー解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 松林伸幸
  • 学会等名: 水和ナノ構造研究会第1回研究会
  • 発表場所: KKR稲取(静岡県賀茂郡)(招待講演)
• [学会発表] Structure and Energetics of Hydration for Functional Molecules in Solution (2010)
  • 著者名/発表者名: Nobuyuki Matubayasi
  • 学会等名: 第48回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 東北大学 川内キャンパス(招待講演)
• [学会発表] Free-energy analysis of hydration effect on structural stability of cytochrome c (2010)
  • 著者名/発表者名: Yasuhito Karino, Nobuyuki Matubayasi
  • 学会等名: 第48回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 東北大学 川内キャンパス
• [学会発表] 異常な軸性不斉安定性を持つ水素結合性ビナフチル型分子のラセミ化挙動 (2010)
  • 著者名/発表者名: 林一広、松林伸幸、Jiang Changsheng、吉村智之、椿一典、川端猛夫
  • 学会等名: 第40回複素環化学討論会
  • 発表場所: 仙台市民会館
• [学会発表] 分子動力学法による超臨界水中の並進拡散に対する相互作用の異方性の影響の解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 吉田健、中原勝、松林伸幸、魚崎泰弘
  • 学会等名: 第51回高圧討論会
  • 発表場所: 仙台市戦災復興記念館
• [学会発表] 二酸化炭素を吸収したアミン水溶液のX線解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 出口博史、窪田善之、古川博敏、八木靖幸、三谷育子、今井義博、辰巳雅彦、山崎紀子、亘紀子、平田琢也、松林伸幸、亀田恭男
  • 学会等名: 第2回SPring-8合同コンファレンス
  • 発表場所: 東京ステーションコンファレンス
• [学会発表] 超臨界水中の自己拡散に対する水素結合の異方性の影響の動的溶媒和殻モデルによる解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 吉田健、中原勝、松林伸幸、魚崎泰弘
  • 学会等名: 第33回溶液化学シンポジウム
  • 発表場所: 京都大学百周年時計台記念館
• [学会発表] cytochrome cに対する水和効果の自由エネルギー解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 狩野康人、松林伸幸
  • 学会等名: 第33回溶液化学シンポジウム
  • 発表場所: 京都大学百周年時計台記念館
• [学会発表] 溶液NMRと大規模MDによる異なる曲率の脂質膜の分子間相互作用とダイナミクスの研究 (2010)
  • 著者名/発表者名: 新谷恵、吉田健、櫻庭俊、中原勝、松林伸幸
  • 学会等名: 第33回溶液化学シンポジウム
  • 発表場所: 京都大学百周年時計台記念館
• [学会発表] グルコースの水熱反応の機構と速度論解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 木村浩、中原勝、松林伸幸
  • 学会等名: 第33回溶液化学シンポジウム
  • 発表場所: 京都大学百周年時計台記念館
• [学会発表] 分子動力学計算による2-アミノエタノール(MEA)水溶液の微視的解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 窪田善之、狩野康、桜庭俊、古川博敏、松林伸幸
  • 学会等名: 第33回溶液化学シンポジウム
  • 発表場所: 京都大学百周年時計台記念館
• [学会発表] アニソールの超臨界水反応および熱分解反応に関するNMRによる研究 (2010)
  • 著者名/発表者名: 辻野康夫、松林伸幸、中原勝
  • 学会等名: 第33回溶液化学シンポジウム
  • 発表場所: 京都大学百周年時計台記念館
• [学会発表] 1-ブチルー3-メチルイミダゾリウム ビス(トリフルオロスルホニル)アミドイオン液体へのCO2の溶解-溶媒和自由エネルギー計算と溶媒和構造- (2010)
  • 著者名/発表者名: 梅林泰宏、吉井未生、金久保光央、亀田恭男、藤井健太、竹内宗孝、狩野康人、松林伸幸
  • 学会等名: 第33回溶液化学シンポジウム
  • 発表場所: 京都大学百周年時計台記念館
• [学会発表] 曲率の異なる脂質膜の分子間相互作用とダイナミクス:NMR-NOE測定と大規模MDによる研究 (2010)
  • 著者名/発表者名: 新谷恵、吉田健、櫻庭俊、中原勝、松林伸幸
  • 学会等名: 膜シンポジウム2010
  • 発表場所: 京都大学薬学部 記念講堂
• [学会発表] cytochrome cの構造変化に対する水和効果の自由エネルギー解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 狩野康人、松林伸幸
  • 学会等名: 第24回分子シミュレーション討論会
  • 発表場所: 福井県県民ホール
• [学会発表] 独立部分空間分析によるBiotin Carboxylaseの解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 櫻庭俊、松林伸幸
  • 学会等名: 第24回分子シミュレーション討論会
  • 発表場所: 福井県県民ホール
• [学会発表] 2-アミノエタノール(MEA)水溶液の分子動力学的解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 窪田善之、狩野康人、桜庭俊、古川博敏、松林伸幸
  • 学会等名: 第24回分子シミュレーション討論会
  • 発表場所: 福井県県民ホール
• [学会発表] 分子動力学計算による高分子電解質ゲルの物質透過性の研究 (2010)
  • 著者名/発表者名: 川上智教、茂本勇、松林伸幸
  • 学会等名: 第24回分子シミュレーション討論会
  • 発表場所: 福井県県民ホール
• [学会発表] Free-energy analysis of nano-organized systems in aqueous solution (2010)
  • 著者名/発表者名: Nobuyuki Matubayasi
  • 学会等名: Pacifichem 2010
  • 発表場所: Honolulu, Hawaii, USA
• [学会発表] Free-energy analysis of functional, self-organizing systems in solution (2010)
  • 著者名/発表者名: 松林伸幸
  • 学会等名: Workshop "Solvation of bioactive compounds : bridging theory, computation and experiment"
  • 発表場所: Leipzig, Germany
• [学会発表] Solvation free energy of globular protein : a molecular dynamics study (2010)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Saito, Taku Mizukami, Nobuyuki Matubayasi, Hidemi Nagao
  • 学会等名: International Symposium on "Molecular Theory for Real Systems"
  • 発表場所: 京都大学
• [学会発表] 大規模分子シミュレーションと溶液理論の融合によるナノ不均一溶液系の自由エネルギー解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 松林伸幸
  • 学会等名: 文部科学省「最先端・高性能スーパーコンピュータの開発利用」プロジェクト 次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発 第4回公開シンポジウム
  • 発表場所: 岡崎
• [学会発表] 水中における cytochrome cの構造安定性に対するエネルギー解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 狩野康人, 松林伸幸
  • 学会等名: 文部科学省「最先端・高性能スーパーコンピュータの開発利用」プロジェクト 次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発 第4回公開シンポジウム
  • 発表場所: 岡崎
• [学会発表] Free-Energy Analysis of the Preferred Configuration of Transmembrane Protein in Model Membrane : Roles of Lipid and Water (2010)
  • 著者名/発表者名: Acep PURQON, 松林伸幸
  • 学会等名: 文部科学省「最先端・高性能スーパーコンピュータの開発利用」プロジェクト 次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発 第4回公開シンポジウム
  • 発表場所: 岡崎
• [学会発表] イオン液体中の溶質回転運動の長時間ダイナミクス (2010)
  • 著者名/発表者名: 八坂能郎, 若井千尋, 中原勝, 松林伸幸
  • 学会等名: 文部科学省「最先端・高性能スーパーコンピュータの開発利用」プロジェクト 次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発 第4回公開シンポジウム
  • 発表場所: 岡崎
• [学会発表] エネルギー表示法による高分子材料の親溶媒性の研究 (2010)
  • 著者名/発表者名: 川上智教, 茂本勇, 松林伸幸
  • 学会等名: 文部科学省「最先端・高性能スーパーコンピュータの開発利用」プロジェクト 次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発 第4回公開シンポジウム
  • 発表場所: 岡崎
• [学会発表] Free-energy analysis of the structural stability of cytochrome c (2010)
  • 著者名/発表者名: 狩野康人, 松林伸幸
  • 学会等名: International Symposium on Hydration and ATP Energy
  • 発表場所: 仙台
• [学会発表] Free-Energy Analysis of the Roles of Lipid and Water in Transmembrane Protein Configuration in Model Membrane (2010)
  • 著者名/発表者名: Acep Purqon, Nobuyuki Matubayasi
  • 学会等名: International Symposium on Hydration and ATP Energy
  • 発表場所: 仙台
• [学会発表] [CnmIm] [TFSA] イオン液体中のCO2のMDシミュレーションおよび 溶媒和自由エネルギー計算 (2010)
  • 著者名/発表者名: 吉井未生, 松林伸幸, 竹内宗孝, 梅林泰宏, 石黒慎一
  • 学会等名: 電気化学会第77回大会
  • 発表場所: 富山
• [学会発表] 溶液理論と大規模分子シミュレーションの融合による機能性分子集合系の自由エネルギー解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 松林伸幸
  • 学会等名: JST戦略的国際科学技術協力推進事業 : 日瑞研究交流「核酸医薬品伝達のための新規方法論の開発」
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2009-08-10
• [学会発表] Extended Concept of Solvation toward Free-Energy Analysis of Nano-Inhomogeneous Systems (2009)
  • 著者名/発表者名: 松林伸幸
  • 学会等名: International Mini-workshop on "Hydration and ATP Energy"
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2009-07-11
• [学会発表] 溶液理論と大規模分子シミュレーションの融合による機能性分子集合系の自由エネルギー解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 松林伸幸
  • 学会等名: 第16回ファーマサイエンスフォーラム「明日の創薬と生物物理化学」
  • 発表場所: 北海道大学
  • 年月日: 2009-06-11
• [学会発表] Free-Energy Analysis of Solvation in the Energetic Perspective (2009)
  • 著者名/発表者名: N. Matubayasi
  • 学会等名: Mini-symposium on computation of interactions in biological systems
  • 発表場所: Nove Hrady, Czech
• [学会発表] Free energy of solvation in the energetic perspective (2009)
  • 著者名/発表者名: 松林伸幸
  • 学会等名: International Symposium on Multi-Scale Dynamics of Protein Complex Formation and Function
  • 発表場所: 東京大学
• [学会発表] Self-Diffusion for Water and Organic Solvents in Sub-and Supercritical Conditions Studied by High-Temperature NMR method (2009)
  • 著者名/発表者名: Ken Yoshida, Nobuyuki Matubayasi, Yasuhiro Uosaki, Masaru Nakahara
  • 学会等名: Joint AIRAPT-22 & HPCJ-50
  • 発表場所: Tokyo International Exchange Center
• [学会発表] Hydrothermal Chemistry of Formic Acid and a New Scheme of Hydrogen Technology (2009)
  • 著者名/発表者名: Masaru Nakahara, Ken Yoshida, Yoshiro Yasaka, Yasuo Tsujino, Chihiro Wakai, Nobuyuki Matubayasi
  • 学会等名: Joint AIRAPT-22 & HPCJ-50
  • 発表場所: Tokyo International Exchange Center
• [学会発表] ATP加水分解の自由エネルギー解析 : エネルギー表示法による水・タンパク質複合系の自由エネルギー計算 (2009)
  • 著者名/発表者名: 松林伸幸
  • 学会等名: 新学術領域研究「水を主役としたATPエネルギー変換」第1回全体会議
  • 発表場所: 大阪ガーデンパレス
• [学会発表] 分子動力学法による球状タンパク質の水和特性評価 (2009)
  • 著者名/発表者名: 齋藤大明, 松本圭介, 中村力, 水上卓, 松林伸幸, 西川清, 長尾秀実
  • 学会等名: 第3回分子科学討論会
  • 発表場所: 名古屋大学
• [学会発表] Free-Energy Analysis of Functional, Self-Organizing Systems in Solution (2009)
  • 著者名/発表者名: 松林伸幸
  • 学会等名: NSYSU-KU Bilateral Symposium on Materials Chemistry
  • 発表場所: 国立中山大学 (高雄、台湾)
• [学会発表] Hybrid quantum mechanical/molecular mechanical approach to the computation of the free energy change for chemical reactions in condensed systems (2009)
  • 著者名/発表者名: H.Takahashi, R.Kishi, M.Nakano, N.Matubayasi
  • 学会等名: The 12th Asian Workshop on First-Principles Electronic Structure Calculations
  • 発表場所: 北京 (中国)
• [学会発表] Solvation Free Energy of Globular Proteins : A Molecular Dynamics Study (2009)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Saito, Taku Mizukami, Nobuyuki Matubayasi, Kiyoshi Nishikawa, Hidemi Nagao
  • 学会等名: International Conference on Computational Science 2009
  • 発表場所: Bali, Indonesia
• [学会発表] 水和自由エネルギー計算を用いた cytochrome cの水中での構造安定性に関する研究 (2009)
  • 著者名/発表者名: 狩野康人, 松林伸幸
  • 学会等名: 第32回溶液化学シンポジウム
  • 発表場所: 新潟
• [学会発表] Free-Energy Analysis of the Configuration of Transmembrane Protein in Model Membrane : Roles of Lipid and Water (2009)
  • 著者名/発表者名: Acep PURQON, 松林伸幸
  • 学会等名: 第32回溶液化学シンポジウム
  • 発表場所: 新潟
• [学会発表] MDシミュレーションによるイオン液体中の回転運動の長時間ダイナミクス解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 八坂能郎, 若井千尋, 中原勝, 松林伸幸
  • 学会等名: 第32回溶液化学シンポジウム
  • 発表場所: 新潟
• [学会発表] テトラヒドロピランの高温反応の機構と速度論研究 (2009)
  • 著者名/発表者名: 木村浩, 中原勝, 松林伸幸
  • 学会等名: 第32回溶液化学シンポジウム
  • 発表場所: 新潟
• [学会発表] 生体モデル膜への分子結合様式はどのように曲率に依存するか? (2009)
  • 著者名/発表者名: 新谷恵, 中原勝, 松林伸幸
  • 学会等名: 第32回溶液化学シンポジウム
  • 発表場所: 新潟
• [学会発表] イオン液体中でのアルデヒド不均化反応 (2009)
  • 著者名/発表者名: 伊能博臣, 八坂能郎, 若井千尋, 中原勝, 松林伸幸
  • 学会等名: 第32回溶液化学シンポジウム
  • 発表場所: 新潟
• [学会発表] 超臨界水中の並進および溶媒和殻のダイナミクスに対して水素結合相互作用の異方性の与える影響 (2009)
  • 著者名/発表者名: 吉田健, 中原勝, 松林伸幸, 魚崎泰弘
  • 学会等名: 第32回溶液化学シンポジウム
  • 発表場所: 新潟
• [学会発表] 全原子型シミュレーションによる球状タンパク質の水和特性評価 (2009)
  • 著者名/発表者名: 齋藤大明, 松本圭介, 中村力, 水上卓, 松林伸幸, 西川清, 長尾秀実
  • 学会等名: 第23回分子シミュレーション討論会
  • 発表場所: 名古屋
• [学会発表] 水中における cytochrome cの構造安定性 : エネルギー表示法を用いた水和自由エネルギー計算による研究 (2009)
  • 著者名/発表者名: 狩野康人, 松林伸幸
  • 学会等名: 第23回分子シミュレーション討論会
  • 発表場所: 名古屋
• [学会発表] Free-Energy Analysis of the Preferred Configuration of Transmembrane Protein in Model Membrane : Roles of Lipid and Water (2009)
  • 著者名/発表者名: Acep PURQON, 松林伸幸
  • 学会等名: 第23回分子シミュレーション討論会
  • 発表場所: 名古屋
• [学会発表] Free-Energy Analysis of Functional, Self-Organizing Systems in Solution (2009)
  • 著者名/発表者名: 松林伸幸
  • 学会等名: Meeting of JST-SSF/Vinnova Cooperative Programme on "Multidisciplinary BIO"
  • 発表場所: Stockholm University (Sweden)
• [学会発表] Free-Energy Analysis of Solvation in the Energetic Perspective (2009)
  • 著者名/発表者名: 松林伸幸
  • 学会等名: Mini-symposium on computation of interactions in biological systems
  • 発表場所: Nove Hrady (Czech)
• [学会発表] エネルギー表示溶液理論と分子シミュレーションの融合による溶液系の自由エネルギー解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 松林伸幸
  • 学会等名: 第3回分子シミュレーションスクール -基礎から応用まで-
  • 発表場所: 岡崎
• [図書] 超臨界水と脂質膜, 巨大分子系の計算化学 超大型計算機時代の理論化学の新展開11章,CSJカレントレビュー (2012)
  • 著者名/発表者名: 松林 伸幸
  • 出版者: 化学同人
• [図書] Development of a Quantum Chemical Method Combined with a Theory of Solutions -- Free-Energy Calculation for Chemical Reactions by Condensed Phase Simulations,Advances in Quantum Chemistry, vol 59 (2010)
  • 著者名/発表者名: H. Takahashi, N. Matubayasi, and M. Nakano
• [図書] Advances in Quantum Chemistry (2010)
  • 著者名/発表者名: H.Takahashi, N.Matubayasi, M.Nakano
  • 総ページ数: 68
  • 出版者: Development of a Quantum Chemical Method Combined with a Theory of Solutions--Free-Energy Calculation for Chemical Reactions by Condensed Phase Simulations
• [備考] 本研究で用いた自由エネルギー計算ソフトErmodを公開
  • URL: http://sourceforge.net/projects/ermod/
• [産業財産権] 細胞・微生物のNMR測定方法およびNMR用プローブ並びにNMR制御装置 (2012)
  • 発明者名: 池田 武義、中原 勝、松林 伸幸、若井 千尋
  • 権利者名: 池田 武義、中原 勝、松林 伸幸、若井 千尋
  • 出願年月日: 2012-07-27
• [産業財産権] 水熱反応を利用した水素の製造方法 (2010)
  • 発明者名: 中原 勝、松林 伸幸、若井 千尋、吉田 健
  • 権利者名: 中原 勝、松林 伸幸、若井 千尋、吉田 健
  • 出願年月日: 2010-03-26
• [産業財産権] 水素の製造方法 (2009)
  • 発明者名: 中原 勝、松林 伸幸、八坂 能郎
  • 権利者名: 中原 勝、松林 伸幸、八坂 能郎
  • 出願年月日: 2009-07-28
  • 外国
• [産業財産権] 高温測定用NMRプローブ (2009)
  • 発明者名: 中原 勝、松林 伸幸、若井 千尋、池田 武義
  • 権利者名: 中原 勝、松林 伸幸、若井 千尋、池田 武義
  • 出願年月日: 2009-06-26