NMD抑制に基づく新しい遺伝子破壊法をTリンパ球の研究に応用する

• 研究課題/領域番号: 21310128
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 応用ゲノム科学
• 研究機関: 奈良先端科学技術大学院大学
• 研究代表者: 石田 靖雅 奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 准教授 (10221756)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 16,510千円 (直接経費: 12,700千円、間接経費: 3,810千円); 2011年度: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円); 2010年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円); 2009年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
• キーワード: 遺伝子トラップ / マウス / ES細胞 / nonsense-mediated mRNA decay / リンパ球 / マウスES細胞 / ノックアウトマウス / Tリンパ球 / UPATrap / 遺伝子発現

研究概要

ランダムな遺伝子破壊の技術革新を目指し、NMD抑制を利用したポリAトラップ法「UPATrap」の基盤を、当初のレトロウイルスからDNAトランスポゾンTol2に変更した。その結果、マウスES細胞中で発現しない遺伝子群(免疫系遺伝子などを含む)のトラップ効率が大きく改善し、コンディショナルな遺伝子破壊が可能となった。さらに、差別化タグで標識された15種類のトランスポゾンを混合して実験に供する新しい手法を開発し、トランスポゾン・ベクターの致命的な欠点を克服した。これらの研究成果は、Tリンパの機能解析に大きく貢献する。

研究成果

• [雑誌論文] CtBP-interacting BTB zinc finger protein(CIBZ) promotes proliferation and G1/S transition in embryonic stem cells via Nanog. (2012)
  • 著者名/発表者名: Nishii, T., Oikawa, Y., Ishida, Y., Kawaichi, M., and Matsuda, E.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem 巻: Vol.287 ページ: 12417-12424
  • NAID: 120005818445
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mixture of differentially tagged Tol2 transposons accelerates conditional disruption of a broad spectrum of genes in mouse embryonic stem cells (2012)
  • 著者名/発表者名: N.I.Mayasari, et al
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 40(In Press) 号: 13 ページ: e97-e97
  • DOI: 10.1093/nar/gks262
  • 査読あり
• [雑誌論文] The methyl-CpG-binding protein CIBZ suppresses myogenic differentiation by directly inhibiting myogenin expression (2011)
  • 著者名/発表者名: Oikawa, Y., Omori, R., Nishii, T., Ishida, Y., Kawaichi, M., and Matsuda, E.
  • 雑誌名: Cell Res 巻: Vol.21 ページ: 1578-1590
  • NAID: 120005818451
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evidence that the Upf1-related molecular motor scans the 3'-UTR to ensure mRNA integrity.
  • 著者名/発表者名: Shigeoka, T., Kato, S., Kawaichi, M., and Ishida, Y.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mixture of differentially tagged Tol2 transposons accelerates conditional disruption of a broad spectrum of genes in mouse embryonic stem cells.
  • 著者名/発表者名: Mayasari, N. I., Mukougawa, K., Shigeoka, T., Kawakami, K., Kawaichi, M, and Ishida, Y.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: (in press)
  • 査読あり
• [学会発表] Mixture of differentially tagged Tol2 transposons accelerates conditional disruption of a broad spectrum of genes in mouse embryonic stem cells. (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasumasa Ishida(石田靖雅)
  • 学会等名: The Company of Biologists Workshop "New Technologies and Applications for Genome Engineering"
  • 発表場所: Steiyning, UK(英国)
  • 年月日: 2012-03-25
• [学会発表] Mixture of differentially tagged Tol2 transposons accelerates conditional disruption of a broad spectrum of genes in mouse embryonic stem cells (2012)
  • 著者名/発表者名: 石田靖雅
  • 学会等名: The Company of Biologists Workshop "New Technologies and Applications for Genome Engineering"
  • 発表場所: Wiston House, Steyning, UK
  • 年月日: 2012-03-25
• [学会発表] 条件的遺伝子改変ES細胞株の量産とデータベース化 (2011)
  • 著者名/発表者名: N. I. Mayasari、田畑海渡、石田靖雅
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
• [学会発表] 条件的遺伝子改変ES細胞株の量産とデータベース化 (2011)
  • 著者名/発表者名: N.I.Mayasari
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(複数日ポスター発表)
• [備考] The NAISTrap project
  • URL: http://bsw3.naist.jp/kawaichi/naistrap.html
• [備考] The NAISTrap project
  • URL: http://bsw3.naist.jp/kawaichi/naistrap.html