核酸の高度な高次構造制御を基盤としたオリゴヌクレオチド型人工転写因子の創製

• 研究課題/領域番号: 21350094
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生体関連化学
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 小比賀 聡 大阪大学, 大学院・薬学研究科, 教授 (80243252)
• 研究分担者: 兒玉 哲也 大阪大学, 大学院・薬学研究科, 助教 (00432443)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 19,500千円 (直接経費: 15,000千円、間接経費: 4,500千円); 2011年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円); 2010年度: 5,070千円 (直接経費: 3,900千円、間接経費: 1,170千円); 2009年度: 11,180千円 (直接経費: 8,600千円、間接経費: 2,580千円)
• キーワード: 核酸 / 人工核酸 / 三重鎖 / 4重鎖 / 分子認識 / 転写制御 / 遺伝子 / 発現制御 / 有機化学

研究概要

構造変化のスイッチ機能を持つ人工核酸、核酸複合体化に有用な人工核酸、そして二種の架橋型人工核酸グアニン類縁体を創出した。また、中性付近でシトシン四重鎖を形成し得るオリゴ人工核酸を合成した。さらに、蛍光観察による非侵襲的遺伝子発現制御評価系を構築し、本来発現する遺伝子とは異なる遺伝子の発現を人工核酸で誘起できることを示した。これら成果は、我々が日々創製を重ねている人工核酸が、現在の遺伝子発現抑制法から脱却した真の制御法に有用であることを示唆する大きな前進である。

研究成果

• [雑誌論文] Synthesis and evaluation of novel caged DNA alkylating agents bearing 3, 4-epoxypiperidine structure (2012)
  • 著者名/発表者名: Yuji Kawada, Tetsuya Kodama, Kazuyuki Miyashita, Takeshi Imanishi, Satoshi Obika
  • 雑誌名: Organic & Biomolecular Chemistry 巻: (in press) 号: 26 ページ: 5102-5102
  • DOI: 10.1039/c2ob25366f
  • 査読あり
• [雑誌論文] Hybridizing ability and nuclease resistance profile of backbone modified cationic phosphorothioate oligonucleotides (2012)
  • 著者名/発表者名: S. M. Abdur Rahman, Takeshi Baba, Tetsuya Kodama, Md. Ariful Islam, Satoshi Obika
  • 雑誌名: Bioorganic & Medicinal Chemistry 巻: (in press) 号: 13 ページ: 4098-4102
  • DOI: 10.1016/j.bmc.2012.05.009
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cleavage of oligonucleotides containing a P3'→N5' phosphoramidite linkage mediated by single-stranded oligonucleotide templates (2011)
  • 著者名/発表者名: Kosuke R. Ito, Tetsuya Kodama, Futaba Makimura, Noritsugu Hosoki, Tomohisa Osaki, Ayao Orita, Takeshi Imanishi, Satoshi Obika
  • 雑誌名: Molecules 巻: 16 ページ: 10695-10708
  • 査読あり
• [雑誌論文] Design, synthesis and properties of boat-shaped glucopyranosyl nucleic acid (2011)
  • 著者名/発表者名: Kazuto Mori, Tetsuya Kodama, Satoshi Obika
  • 雑誌名: Organic Letters 巻: 13 ページ: 6050-6053
  • 査読あり
• [雑誌論文] Benzylidene acetal-type bridged nucleic acids : changes in properties upon cleavage of the bridge triggered by external stimuli (2011)
  • 著者名/発表者名: K. Morihiro, T. Kodama, S. Obika
  • 雑誌名: Chemistry-A European Journal 巻: 17 ページ: 7918-7926
• [雑誌論文] Bridged nucleic acid conjugates at 6'-thiol : synthesis, hybridization properties and nuclease resistances (2011)
  • 著者名/発表者名: Kazuto Mori, Tetsuya Kodama, Takeshi Baba, Satoshi Obika
  • 雑誌名: Organic & Biomolecular Chemistry 巻: 9 ページ: 5272-5279
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis and triplex-forming ability of oligonucleotides bearing 1-substituted 1H-1, 2, 3-triazole nucleobases (2011)
  • 著者名/発表者名: Yoshiyuki Hari, Motoi Nakahara, Juanjuan Pang, Masaaki Akabane, Takeshi Kuboyama, Satoshi Obika
  • 雑誌名: Bioorbganic & Medicinal Chemistry 巻: 19 ページ: 1162-1166
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis and Triplex-Forming Ability of Oligonucleotides Bearing 1-Substituted 1H-1,2,3-Triazole Nucleobases (2011)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Obika, 他5名
  • 雑誌名: Bioorg.Med.Chem. 巻: 19 ページ: 1162-1166
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel bridged nucleoside bearing a conformationally switchable sugar moiety in response to redox changes (2010)
  • 著者名/発表者名: Takeshi Baba, Tetsuya Kodama Kazuto Mori, Takeshi Imanishi, Satoshi Obika
  • 雑誌名: Chemical Communications 巻: 46 ページ: 8058-8060
  • 査読あり
• [学会発表] 光刺激により糖部架橋構築が誘起される人工核酸の開発 (2012)
  • 著者名/発表者名: 肯特夫, 森廣邦彦, 兒玉哲也, 小比賀聡
  • 学会等名: 第132回日本薬学会年会
  • 発表場所: 北海道大学(札幌)
  • 年月日: 2012-03-31
• [学会発表] 光刺激により認識塩基が変化するシン配向型非天然核酸塩基の開発 (2012)
  • 著者名/発表者名: 森廣邦彦, 兒玉哲也, 小比賀聡
  • 学会等名: 日本化学会第92春季年会
  • 発表場所: 慶応大学(横浜)
  • 年月日: 2012-03-25
• [学会発表] Synthesis and Evaluation of External Stimuli-responsive Bridged Nucleic Acids (2011)
  • 著者名/発表者名: Kunihiko Morihiro, Tetsuya Kodama, Satoshi Obika
  • 学会等名: The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry(2011ISNAC)
  • 発表場所: 北海道大学(札幌)
• [学会発表] Cleavage of Oligonucleotides Containing a P3'→N5' Phosphoramidate Linkage Triggered by Duplex Formation (2011)
  • 著者名/発表者名: Kosuke. R. Ito, Tetsuya Kodama, Futaba Makimura, Noritsugu Hosoki, Tomohisa Osaki, Ayako Orita, Takeshi Imanishi, Satoshi Obika
  • 学会等名: The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry(2011ISNAC)
  • 発表場所: 北海道大学(札幌)
• [学会発表] A new entry of thiol-containing nucleic acid monomer for conjugation chemistry (2011)
  • 著者名/発表者名: Tetsuya Kodama, Kazuto Mori, Takeshi Baba, Satoshi Obika
  • 学会等名: 6th Cambridge Symposium on Nucleic Acids Chemistry and Biology
  • 発表場所: Queens' College Cambridge, UK
• [学会発表] Synthesis and Evaluation of External Stimuli-responsive Bridged Nucleic Acids (2011)
  • 著者名/発表者名: K.Morihiro, T.Kodama, S.Obika
  • 学会等名: The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry (2011ISNAC)
  • 発表場所: 北海道大学(札幌)
• [学会発表] Cleavage of Oligonucleotides Containing a P3'→N5' Phosphoramidate Linkage Triggered by Duplex Formation (2011)
  • 著者名/発表者名: K.R.Ito, T.Kodama, F.Makimura, N.Hosoki, T.Osaki, A.Orita, T.Imanishi, S.Obika.
  • 学会等名: The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry (2011ISNAC)
  • 発表場所: 北海道大学(札幌)
• [学会発表] 機能性人工核酸の開発-新たな核酸医薬・診断薬創出に向けて- (2010)
  • 著者名/発表者名: 小比賀聡
  • 学会等名: 日本化学会第90春季年会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2010-03-27
• [学会発表] Synthesis and properties of 2', 4'-BNA with 8-aza-7-deazaguanine (2010)
  • 著者名/発表者名: Yumi Takegaki, Kunihiko Morihiro, Tetsuya Kodama, Moeka Nakatani and Satoshi Obika
  • 学会等名: The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies(PACIFICHEM 2010)
  • 発表場所: Honolulu, Hawaii(USA)
• [学会発表] Synthesis and properties of 2',4'-BNA with 8-aza-7-deazaguanine. (2010)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Obika, 他4名
  • 学会等名: The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICHEM 2010)
  • 発表場所: Honolulu, Hawaii (USA)
• [学会発表] 機能性アンチセンス分子による核酸医薬の開発 (2009)
  • 著者名/発表者名: 小比賀聡
  • 学会等名: 第3回創薬とイメージングに関するワークショップ
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2009-12-04
• [図書] Therapeutic Oligonucleotides : Methods and Protocols (2011)
  • 著者名/発表者名: Y.Hari, T.Kodama, T.Imanishi, S.Obika
  • 出版者: Humana Press