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インフルエンザウイルスRNAポリメラーゼPB1-PB2複合体の構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 21370046
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関横浜市立大学

研究代表者

朴 三用  横浜市立大学, 生命ナノシステム科学研究科, 教授 (20291932)

研究分担者 福西 快文  産業技術総合研究所, バイオメディシナル情報研究センター, 主任研究員 (60357895)
研究期間 (年度) 2009 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
19,110千円 (直接経費: 14,700千円、間接経費: 4,410千円)
2011年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
2010年度: 7,280千円 (直接経費: 5,600千円、間接経費: 1,680千円)
2009年度: 9,100千円 (直接経費: 7,000千円、間接経費: 2,100千円)
キーワードインフルエンザ / RNAポリメラーゼ / 構造解析 / 創薬 / 複合体 / 構造我解析
研究概要

インフルエンザウイルスのRNAポリメラーゼは、ウイルスの複製(増殖)に中心的な役割を担っている事や、他のタンパク質と比べ変異を引き起こす事は少ないため、新規薬剤ターゲットとして注目されて来た。インフルエンザウイルスのRNAポリメラーゼが持つ3つのサブユニットのうち、どれか1つのサブユニットでも欠けるとウイルスの増殖機構が失われる事に注目し、PB1/PB2のサブユニットの複合体での構造解明を行う事を目的と創薬の基盤構築である。本研究者は、RNAポリメラーゼPB1/PB2複合体のタンパク質を発現・精製し成功して、分解能1.7Aで解析に成功した。PB1/PB2の構造は、それぞれ3本の.-へリックスからなり、非常に強い疎水結合により、複合体を形成している。そのアミノ酸残期は、PB2ではIle4, Leu7, Leu10と、PB1では、Val715, Ile750が関与しており、こられの残期の変異体を作製し、mRNA活性を測定した結果、極めて低下する事が確認でき、in-silicoによる基盤構造を確立する事が出来た。

報告書

(4件)
  • 2011 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (48件)

すべて 2011 2010 2009 その他

すべて 雑誌論文 (20件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (24件) 図書 (2件) 備考 (1件) 産業財産権 (1件) (うち外国 1件)

  • [雑誌論文] Oxygen binding and redox properties of the heme in soluble guanylate cyclase : Implications for the mechanism of ligand discrimination2011

    • 著者名/発表者名
      Makino R, Park SY, Obayashi E, Iizuka T, Hori H, Shiro Y.
    • 雑誌名

      J Biol Chem

      巻: 286(18) ページ: 15678-87

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書 2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Crystal structure of the human centromeric nucleosome containing CENP-A2011

    • 著者名/発表者名
      Tachiwana H, Kagawa W, Shiga T, Osakabe A, Miya Y, Saito K, Hayashi-Takanaka Y, Oda T, Sato M, Park SY, Kimura H, Kurumizaka H.
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 476(7359) ページ: 232-5

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書 2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Structures and oxygen affinities of crystalline human hemoglobin C({beta} 6 Glu-> Lys) in the R and R2 quaternary structures2011

    • 著者名/発表者名
      Shibayama N, Sugiyama K, Park SY
    • 雑誌名

      J Biol Chem

      巻: 286(38) ページ: 33661-8

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Crystal Structures of Penicillin-Binding Proteins 4 and 5 from Haemophilus influenzae2010

    • 著者名/発表者名
      Kawai F, Clarke TB, Roper DI, Han GJ, Hwang KY, Unzai S, Obayashi E, Park SY, Tame JR
    • 雑誌名

      J Mol Biol

      巻: 396(3) ページ: 634-45

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Direct determination of protonation states of histidine residues in a 2 A neutron structure of deoxy-human normal adult hemoglobin and implications for the Bohr effect2010

    • 著者名/発表者名
      Kovalevsky AY, Chatake T, Shibayama N, Park SY, Ishikawa T, Mustyakimov M, Fisher Z, Langan P, Morimoto Y.
    • 雑誌名

      J Mol Biol

      巻: 398(2) ページ: 276-91

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Autotransporter passenger proteins : virulence factors with common structural themes2010

    • 著者名/発表者名
      Nishimura K, Tajima N, Yoon YH, Park SY, Tame JR
    • 雑誌名

      J Mol Med

      巻: 88(5) ページ: 451-8

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] A novel intein-like autoproteolytic mechanism in autotransporter proteins2010

    • 著者名/発表者名
      Tajima N, Kawai F, Park SY, Tame JR
    • 雑誌名

      J Mol Biol

      巻: 402(4) ページ: 645-56

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Role of domains within the autotransporter Hbp/Tsh2010

    • 著者名/発表者名
      Nishimura K, Yoon YH, Kurihara A, Unzai S, Luirink J, Park SY, Tame JR
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr D Biol Crystallogr

      巻: 66(12) ページ: 1295-300

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] 新規抗インフルエンザウイルス薬の開発基盤となるRNAポリメラーゼの構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      朴三用
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: Vol.50, No.2 ページ: 74-79

    • NAID

      10025976244

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書 2010 実績報告書
  • [雑誌論文] タンパク質発現プロトコール2010

    • 著者名/発表者名
      浅賀正充、朴三用
    • 雑誌名

      実験医学別冊(羊土社)

      ページ: 94-111

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] インフルエザウスRNAポリメラーゼの構造解析と創薬研究2010

    • 著者名/発表者名
      杉山佳奈子、尾林栄治、吉田尚史、朴三用
    • 雑誌名

      日本結晶学会

      巻: 52 ページ: 271-278

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] インフルエンザウイルスRNAポリメラーゼの構造解析と創薬研究2010

    • 著者名/発表者名
      杉山佳奈子、尾林栄治、吉田尚史、朴三用
    • 雑誌名

      日本結晶学会

      巻: 52 ページ: 271-278

    • NAID

      10027673105

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural insight into the essential PB1-PB2 subunit contact of the influenza virus RNA polymerase2009

    • 著者名/発表者名
      Sugiyama K, Obayashi E, Kawaguchi A, Suzuki Y, Tame JR, Nagata K, Park SY.
    • 雑誌名

      EMBO J

      巻: 28(12) ページ: 1803-11

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Structural Studies of a Bacterial Condensin Complex Reveal ATP-Dependent Disruption of Intersubunit Interactions2009

    • 著者名/発表者名
      Woo JS, Lim JH, Shin HC, Suh MK, Ku B, Lee KH, Joo K, Robinson H, Lee J, Park SY, Ha NC, Oh BH.
    • 雑誌名

      Cell

      巻: 136(1) ページ: 85-96

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] The nature of the TRAP-Anti-TRAP complex2009

    • 著者名/発表者名
      Watanabe M, Heddle JG, Kikuchi K, Unzai S, Akashi S, Park SY, Tame JR
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci U S A

      巻: 106(7) ページ: 2176-81

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Visualizing breathing motion of internal cavities in concert with ligand migration in myoglobin2009

    • 著者名/発表者名
      Tomita A, Sato T, Ichiyanagi K, Nozawa S, Ichikawa H, Chollet M, Kawai F, Park SY, Tsuduki T, Yamato T, Koshihara SY, Adachi SI
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci U S A

      巻: 106(8) ページ: 2612-6

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Mutational Analysis of the Substrate Specificity of Escherichia coli Penicillin Binding Protein 4(PBP4)2009

    • 著者名/発表者名
      Clarke T, Kawai F, Park SY, Tame J, Dowson C, Roper D.
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 48(12) ページ: 2675-83

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] RNA and Protein Complexes of trp RNA-Binding Attenuation Protein Characterized by Mass Spectrometry2009

    • 著者名/発表者名
      Akashi S, Watanabe M, Heddle JG, Unzai S, Park SY, Tame JR
    • 雑誌名

      Anal Chem

      巻: 81(6) ページ: 2218-26

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] 抗インフルエンザ薬の開発研究2009

    • 著者名/発表者名
      朴三用
    • 雑誌名

      Bipphiliaビオフィリア(アドスリ社)

      巻: 5(4) ページ: 25-29

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Structural insight into the essential PB1-PB2 subunit contact of the influenza virus RNA polymerase2009

    • 著者名/発表者名
      Sugiyama K, Obayashi E, Kawaguchi A, Suzuki Y, Tame JR, Nagata K, Park SY
    • 雑誌名

      EMBO J. 28(12)

      ページ: 286-92

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Structure of PB1-PB2 subunit interface of inflenza A virus RNA polymerase2011

    • 著者名/発表者名
      Sugiyama K, Obayashi E, Kawaguchi A, Suzuki Y, Tame JR, Nagata K, Park SY
    • 学会等名
      IUCr
    • 発表場所
      Palacio Municipal de Congresos. Madrid, Spain
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] The structural basis for the essential PA-PB1 subunit interaction in influenza RNA polymerase2011

    • 著者名/発表者名
      Yoshida H, Obayashi E, Kawai F, Shibayama N, Kawaguchi A, Nagata K, Tame JR, Park SY
    • 学会等名
      IUCr
    • 発表場所
      Palacio Municipal de Congresos. Madrid, Spain
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Structural Studies of the Influenza RNA-polymerase for Novel Drug Design2011

    • 著者名/発表者名
      Sam-Yong Park
    • 学会等名
      The 9^<th> International Symposium for Future Drug Design and Medical Care
    • 発表場所
      Hokkaido University
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Structural Studies of the Influenza RNA-polymerase for Novel Drug Design2011

    • 著者名/発表者名
      Park SY
    • 学会等名
      The 9^<th> International Symposium for Future Drug Design and Medical Care
    • 発表場所
      Hokkaido University(招待講演)
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 新規抗ウイルス薬の開発基盤となるRNAポリメラーゼの構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      朴三用
    • 学会等名
      平成22年度KASTフォーラム1ドイツバイオ交流フォーラム
    • 発表場所
      川崎
    • 年月日
      2010-07-02
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] 新規抗インフルエンサウイルス薬の開発基盤となるRNAポリメラーゼの構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      朴三用
    • 学会等名
      第27回PFシンポジウム
    • 発表場所
      筑波
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] インフルエンザRNAポリメラーゼの構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      朴三用
    • 学会等名
      第47回日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] インフルエンザウイルスのRNAポリメラーゼサブユニットPB1-PB2サブユニト間相互作用の解明2010

    • 著者名/発表者名
      杉山佳奈子、尾林栄治、川口敦史、鈴木由佳理、テイムジェレミー、永田恭介、朴三用
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] インフルエンザウイルスのRNAポリメラーゼサブユニットPA-PB1サブユニト間相互作用の解明2010

    • 著者名/発表者名
      吉田尚史、尾林栄治、河合文啓、川口敦史、永田恭介、テイムジェレミー、朴三用
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] 新規抗インフルエンザウイルス薬の開発基盤となるRNAポリメラーゼの構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      朴三用
    • 学会等名
      第34回阿蘇シンポジウム
    • 発表場所
      阿蘇
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Structural Insight into the Subunit Contact of the Influenza Virus RNA Polymerase2010

    • 著者名/発表者名
      Sam-Yong Park
    • 学会等名
      2^<nd> International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR
    • 発表場所
      Yokohama City University
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] 新規抗ウイルス薬の開発基盤となるRNAポリメラーゼの構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      朴三用
    • 学会等名
      大阪大学蛋白質研究所セミナー
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] インフルエンザRNAポリメラーゼの構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      朴三用
    • 学会等名
      第47回日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      北海道大学(招待講演)
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] インフルエンザウイルスのRNAポリメラーゼサブユニットPB1-PB2サブユニット間相互作用の解明2010

    • 著者名/発表者名
      杉山佳奈子、尾林栄治、川口敦史、鈴木由佳理、テイム ジェレミー、永田恭介、朴三用
    • 学会等名
      第47回日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] インフルエンザウイルスのRNAポリメラーゼサブユニットPA-PB1サブユニット間相互作用の解明2010

    • 著者名/発表者名
      吉田尚史、尾林栄治、河合文啓、川口敦史、永田恭介、テイム ジェレミー、朴三用
    • 学会等名
      第47回日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 新規抗インフルエンザウイルス薬の開発基盤となるRNAポリメラーゼの構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      朴三用
    • 学会等名
      第34回 阿蘇シンポジウム
    • 発表場所
      阿蘇(招待講演)
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Structural Insight into the Subunit Contact of the Influenza Virus RNA Polymerase2010

    • 著者名/発表者名
      朴三用
    • 学会等名
      2^<nd> International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR
    • 発表場所
      Yokohama(招待講演)
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Structural Insight in to the Essential PA-PB1 Subunit Contact of the Influenza Virus RNA Polymerase2009

    • 著者名/発表者名
      Sam-Yong Park
    • 学会等名
      VII European Symposium of the Protein Society
    • 発表場所
      Zurich, Switzerland
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Structural Insight in to the Subunit Contact of the Influenza Virus RNA Polymerase2009

    • 著者名/発表者名
      Sam-Yong Park
    • 学会等名
      America Crystallographic Association
    • 発表場所
      Toronto Canada
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Structural Insight into the Subunit Contact of the Influenza Virus RNA Polymerase2009

    • 著者名/発表者名
      Sam-Yong Park
    • 学会等名
      9th KIAS-SUN Structure and Function
    • 発表場所
      Seoul National University, Seoul, Korea
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Structural Insight into the Essential Subunit Contact of the Influenza Virus RNA Polymerase2009

    • 著者名/発表者名
      E. Obayashi, K. Sugiyama, H. Yoshida, F. Kawai, A. Kawaguchi, Y. Suzuki, J. Tame, K. Nagata, SY Park
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会
    • 発表場所
      徳島文理大学
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Structure and function of Root effect fish hemoglobin2009

    • 著者名/発表者名
      S. Unzai, K. Imai, T. Yokoyama, SY Park, K. Nagai, J. Tame
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会
    • 発表場所
      徳島文理大学
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Structural Insight into the Subunit Contact of the Influenza Virus RNA Polymerase2009

    • 著者名/発表者名
      Sam-Yong Park
    • 学会等名
      The 9th R. O. C-Japan Joint Seminar on Crystallography
    • 発表場所
      Osaka University
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Structural Insight into the Subunit Contact of the Influenza Virus RNA Polymerase2009

    • 著者名/発表者名
      Sam-Yong Park
    • 学会等名
      America Crystallographic Association
    • 発表場所
      Toronto Canada
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [図書] トピックス:万能インフルエンザ治療薬に道筋2009

    • 著者名/発表者名
      朴三用
    • 総ページ数
      117
    • 出版者
      メディカル
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [図書] メディカル・トピックス:万能インフルエンザ治療薬に道筋2009

    • 著者名/発表者名
      朴三用
    • 総ページ数
      1
    • 出版者
      Newton 8月号
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/pdl/index.html

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [産業財産権] インフルエンザウイルス由来のNAポリメラーゼ発現系構築と結晶化及び、抗インフルエンザ薬のスクリーニング方法2009

    • 発明者名
      朴三用、尾林栄治、永田恭介、川口敦史
    • 権利者名
      公立大学法人横浜市立大学、国立大学法人筑波大学
    • 出願年月日
      2009-07-02
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 外国

URL: 

公開日: 2009-04-01   更新日: 2016-04-21  

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