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核およびオルガネラDNA情報に基づくスギの系統地理学的研究

研究課題

研究課題/領域番号 21380102
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 森林科学
研究機関独立行政法人森林総合研究所

研究代表者

近藤 禎二  独立行政法人森林総合研究所, 林木育種センター育種部, 部長 (20370827)

研究分担者 渡邊 敦史 (渡邉 敦史)  独立行政法人森林総合研究所, 林木育種センター育種部, 室長 (10360471)
宮本 尚子  独立行政法人森林総合研究所, 林木育種センター遺伝資源部, 主任研究員 (30370844)
平尾 知士  独立行政法人森林総合研究所, 森林バイオ研究センター, 研究員 (90457763)
津村 義彦  独立行政法人森林総合研究所, 森林遺伝研究領域, 領域長 (20353774)
伊原 徳子  独立行政法人森林総合研究所, 森林遺伝研究領域, 主任研究員
高田 克彦  秋田県立大学, 木材高度加工研究所, 教授 (50264099)
研究期間 (年度) 2009 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
17,420千円 (直接経費: 13,400千円、間接経費: 4,020千円)
2011年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2010年度: 6,110千円 (直接経費: 4,700千円、間接経費: 1,410千円)
2009年度: 7,410千円 (直接経費: 5,700千円、間接経費: 1,710千円)
キーワードスギ / 系統地理学 / 核DNA / オルガネラDNA / 葉緑体 / オモテスギ / ウラスギ / 環境適応遺伝子 / 葉緑体ゲノム / SNP / ハプロタイプネットワーク / 突然変異率 / 環境適応的遺伝子 / ミトコンドリアゲノム / 父性遺伝 / コアコレクション / GIS / DNAマーカー / 集団構造 / 環境区分
研究概要

核DNAマーカーに加えてオルガネラDNAマーカーを用いてスギの系統地理学的分化の解明に取り組んだ。核DNAマーカーでは、ウラスギとオモテスギとの分化に関連していることが示唆される2マーカーを検出した。オルガネラのうち、葉緑体DNAマーカーでは、多くのSNP(Single Nucleotide Polymorphism)が見出され、ハプロタイプネットワークを構築した結果、大きく二つのハプロタイプに区分され、過去に大きく二つの集団に分化したと考えられた。

報告書

(4件)
  • 2011 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2012 2011 2010

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (7件) 図書 (3件)

  • [雑誌論文] An efficient method for developing SNP markers based on EST data combined with high resolution melting(HRM) analysis2011

    • 著者名/発表者名
      Ujino-Ihara, T., Y. Taguchi, Y. Moriguchi and Y. Tsumura
    • 雑誌名

      BMC Research Notes

      巻: 3(51) ページ: 1-5

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An efficient method for developing SNP markers based on EST data combined with high resolution melting(HRM)analysis2010

    • 著者名/発表者名
      Ujino-Ihara, T., Y.Taguchi, Y.Moriguchi, Y.Tsumura
    • 雑誌名

      BMC Research Notes (In press)

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 「杉のきた道」のこれまで2012

    • 著者名/発表者名
      近藤禎二
    • 学会等名
      森林遺伝育種学会第1回シンポジウム
    • 発表場所
      宇都宮大学(宇都宮市)
    • 年月日
      2012-03-29
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書 2011 研究成果報告書
  • [学会発表] オルガネラゲノムを利用したスギの遺伝変異2012

    • 著者名/発表者名
      平尾知士, 他
    • 学会等名
      森林遺伝育種学会第1回シンポジウム
    • 発表場所
      宇都宮大学(宇都宮市)
    • 年月日
      2012-03-29
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書 2011 研究成果報告書
  • [学会発表] 核遺伝子から明らかになったスギの遺伝構造と地域環境適応2012

    • 著者名/発表者名
      津村義彦
    • 学会等名
      森林遺伝育種学会第1回シンポジウム
    • 発表場所
      宇都宮大学(宇都宮市)
    • 年月日
      2012-03-29
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書 2011 研究成果報告書
  • [学会発表] スギ天然林を利用した環境適応的遺伝子の検出2011

    • 著者名/発表者名
      津村義彦, 他
    • 学会等名
      第122回日本森林学会
    • 発表場所
      静岡大学(静岡市)
    • 年月日
      2011-03-27
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] スギ天然林を利用した環境適応的遺伝子の検出2011

    • 著者名/発表者名
      津村義彦・内山憲太郎・上野真義・伊原徳子
    • 学会等名
      日本森林学会(第122回大会)
    • 発表場所
      静岡大学(静岡市)
    • 年月日
      2011-03-27
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] スギ葉緑体ゲノムにおける進化速度の検証2010

    • 著者名/発表者名
      三嶋賢太郎・平尾知士・宮本尚子・渡辺敦史・近藤禎二・高田克彦
    • 学会等名
      日本森林学会
    • 発表場所
      筑波大学(発表予定)
    • 年月日
      2010-04-04
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] GISが開く森林資源の新たな評価法2010

    • 著者名/発表者名
      宮本尚子・高橋誠・渡辺敦史
    • 学会等名
      日本森林学会
    • 発表場所
      筑波大学(発表予定)
    • 年月日
      2010-04-04
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [図書] コンサイス木材百科2011

    • 著者名/発表者名
      平尾知士, 他
    • 出版者
      秋田文化出版株式会社
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [図書] コンサイス木材百科(秋田県立大学・木材高度加工研究所編)スギ天然林の遺伝変異2011

    • 著者名/発表者名
      三嶋賢太郎、高田克彦
    • 出版者
      秋田文化出版株式会社
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [図書] コンサイス木材百科(秋田県立大学・木材高度加工研究所編)スギ葉緑体ゲノムの構造2011

    • 著者名/発表者名
      平尾知士、高田克彦
    • 出版者
      秋田文化出版株式会社
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2016-04-21  

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