生物研究のための3次元可視化アルゴリズムの開発

• 研究課題/領域番号: 21500099
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: メディア情報学・データベース
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 和田 昌昭 大阪大学, 大学院・情報科学研究科, 教授 (80192821)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円); 2012年度: 520千円 (直接経費: 400千円、間接経費: 120千円); 2011年度: 520千円 (直接経費: 400千円、間接経費: 120千円); 2010年度: 520千円 (直接経費: 400千円、間接経費: 120千円); 2009年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
• キーワード: 可視化 / アルゴリズム / 画像処理

研究概要

共焦点レーザー顕微鏡,CT,MRIなどによって得られるラスター画像中の生物組織の面積や体積を計算するためのアルゴリズムを開発した.アルゴリズムは,ノイズ耐性,合同不変性,線形不変性,トリム不変性などの好ましい性質を備えている.共焦点レーザー顕微鏡で光電子倍増館感度を5%, 10%, 20%, 40%, 60%, 80%と変化させて撮影した蛍光ビーズ画像にアルゴリズムを適用したところ,得られた面積の標準偏差はたった0.26%であった.

研究成果

• [雑誌論文] Erratum to the article Twisted Alexander polynomials and surjectivity of a group homomorphism (2011)
  • 著者名/発表者名: T.Kitano, M.Suzuki, M.Wada
  • 雑誌名: Algebraic & Geometric Topology 巻: 11 号: 5 ページ: 2937-2939
  • DOI: 10.2140/agt.2011.11.2937
  • 査読あり
• [雑誌論文] Twisted Alexander polynomial revisited (2011)
  • 著者名/発表者名: M.Wada
  • 雑誌名: 数理解析研究所講究録 巻: 1747 ページ: 140-144
• [学会発表] 放物型Cantor集合のコーディングとHausdorff次元 (2012)
  • 著者名/発表者名: 和田昌昭
  • 学会等名: クライン群とコンピュータ・グラフィックス
  • 発表場所: 名古屋大学多元数理科学研究科
  • 年月日: 2012-03-05
• [学会発表] Visualizing once-punctured torus groups (2011)
  • 著者名/発表者名: M.Wada
  • 学会等名: Introduction of the graduateschool of Information Science and Technology
  • 発表場所: East China Normal University (China)
  • 年月日: 2011-12-09
• [学会発表] 細胞内物質の体積計測のための閾値自動決定アルゴリズム (2009)
  • 著者名/発表者名: 和田昌昭, 秋山寛子
  • 学会等名: 細胞内ロジスティクス班会議
  • 発表場所: ANAインターコンチネンタル万座ビーチリゾート (沖縄県)
  • 年月日: 2009-11-10
• [学会発表] 三次元立体構成プログラム(Delta Viewer)の実際 (2009)
  • 著者名/発表者名: 和田昌昭
  • 学会等名: 神経科学セミナー
  • 発表場所: 東京都神経科学総合研究所
  • 年月日: 2009-09-07
• [学会発表] 3次元構築アプリケーションにおける3D表示 (2) (2009)
  • 著者名/発表者名: 鬼束未希, 和田昌昭
  • 学会等名: 第18回日本バイオイメージング学会学術集会
  • 発表場所: 就実大学 (岡山県)
  • 年月日: 2009-09-03
• [学会発表] Windows 用3次元立体構築アプリケーションにおけるobjファイル変換機能 (2009)
  • 著者名/発表者名: 牛尾奈々子, 和田畠昭
  • 学会等名: 第18回日本バイオイメージング学会学術集会
  • 発表場所: 就実大学 (岡山県)
  • 年月日: 2009-09-03
• [学会発表] ラスター画像から面積を求めるための閾値自動決定アルゴリズム (2009)
  • 著者名/発表者名: 秋山寛子, 和田昌昭
  • 学会等名: 第18回日本バイオイメージング学会学術集会
  • 発表場所: 就実大学 (岡山県)
  • 年月日: 2009-09-03
• [学会発表] 3次元構築アプリケーションにおける3D表示(2) (2009)
  • 著者名/発表者名: 鬼束未希,和田昌昭
  • 学会等名: 第18回日本バイオイメージング学会学術集会
  • 発表場所: 就実大学
• [学会発表] Windows用3次元立体構築アプリケーションにおけるobjファイル変換機能 (2009)
  • 著者名/発表者名: 牛尾奈々子,和田昌昭
  • 学会等名: 第18回日本バイオイメージング学会学術集会
  • 発表場所: 就実大学
• [学会発表] ラスター画像から面積を求めるための閾値自動決定アルゴリズム (2009)
  • 著者名/発表者名: 秋山寛子,和田昌昭
  • 学会等名: 第18回日本バイオイメージング学会学術集会
  • 発表場所: 就実大学
• [学会発表] 細胞内物質の体積計測のための閾値自動決定アルゴリズム (2009)
  • 著者名/発表者名: 和田昌昭,秋山寛子
  • 学会等名: 細胞内ロジスティクス班会議
  • 発表場所: 沖縄ANAインターコンチネンタル万座ビーチリゾート会議場
• [備考] DeltaViewer Project
  • URL: http://delta.math.sci.osaka-u.ac.jp/DeltaViewer/index-j.html
• [備考] DeltaViewer Project
  • URL: http://delta.math.sci.osaka-u.ac.jp/DeltaViewer/index-j.html
• [備考]
  • URL: http://delta.math.sci.osaka-u.ac.jp/DeltaViewer/index-j.html
• [備考]
  • URL: http://delta.math.sci.osaka-u.ac.jp/DeltaViewer/index-j.html
• [備考]
  • URL: http://delta.math.sci.osaka-u.ac.jp/DeltaViewer/index-j.html