少数サンプルを対象とした統計的パターン認識とその肝癌診断への応用

• 研究課題/領域番号: 21500173
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 知覚情報処理・知能ロボティクス
• 研究機関: 山口大学
• 研究代表者: 浜本 義彦 山口大学, 大学院・医学系研究科, 教授 (90198820)
• 研究分担者: 飯塚 徳男 山口大学, 医学部付属病院, 准教授 (80332807) ; 藤田 悠介 山口大学, 大学院・医学系研究科, 助教 (40509527)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2011年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円); 2010年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2009年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
• キーワード: 癌 / パターン認識 / 診断

研究概要

本研究ではC型肝炎ウィルスに起因する肝癌を対象とした癌診断システムの開発を目的とする。このため、超高次元で少数サンプルの状況下においても実行可能な特徴選択法を確立し、それに基づいて肝癌の診断に役立つ標的因子群としてメチル化遺伝子SPINT2, SRD5A2を発見した。さらにこれら2つの新規マーカーとAFP, PIVKA-IIを用いて肝癌の診断システムを開発し、4施設から提供されたテストサンプル258症例に対して、血液検査で感度73. 2%,特異度87. 7%という高精度で肝癌を診断できたことから、臨床応用の見通しを得た。

研究成果

• [雑誌論文] Efficient detection of hepatocellular carcinoma by a hybrido blood test of epigenetic and classical protein markers (2011)
  • 著者名/発表者名: N. Iizuka, M. Oka, I. Sakaida, T. Moribe, T. Miura, N. Kimura, S. Tamatsukuri, H. Ishitsuka, K. Uchida, S. Terai, S. Yamashita, K. Okita, K. Sakata, Y. Karino, J. Toyota, E. Ando, T. Ide, M. Sata, R. Tsunedomi, M. Tsutsui, M. Iida, Y. Tokuhisa, K. Sakamoto, T. Tamesa, Y. Fujita, Y. Hamamoto
  • 雑誌名: Clinica Chimica Acta 巻: 412 ページ: 152-158
  • 査読あり
• [雑誌論文] Efficient detection of hepatocellular carcinoma by a hybrid blood test of epigenetic and classical protein markers (2011)
  • 著者名/発表者名: N.Iizuka, et al.
  • 雑誌名: Clinica Chimica Acta 巻: 412 ページ: 152-158
  • 査読あり
• [雑誌論文] Methylated cyclin D2 gene circulating in the blood as a prognosis predictor of hepatocellular carcinoma (2010)
  • 著者名/発表者名: M. Tsutsui, N. Iizuka, T. Moribe, T. Miura, N. Kimura, S. Tamatsukuri, H. Ishitsuka, Y. Fujita, Y. Hamamoto, R. Tsunedomi, M. Iida, Y. Tokuhisa, K. Sakamoto, T. Tamesa, I. Sakaida and M. Oka
  • 雑誌名: Clinica Chimica Acta 巻: 411 ページ: 516-520
  • 査読あり
• [雑誌論文] Methylated cyclin D2 gene circulating in the blood as a prognosis predictor of hepatocellular carcinoma (2010)
  • 著者名/発表者名: M.Tsutsui, et al.
  • 雑誌名: Clinical Chimica Acta 411 ページ: 516-520
  • 査読あり
• [雑誌論文] Rapid and quantitative detection of CpG-methylationstatus using TaqMan PCR combined with methyl-binding-domain polypeptide (2009)
  • 著者名/発表者名: N. Kimura, T. Moribe, N. Iizuka, T. Miura, S. Tamatsukuri, H. Ishitsuka, Y. Hamamoto and M. Oka
  • 雑誌名: Clinical Biochemistry 巻: 42 ページ: 1113-1122
  • 査読あり
• [雑誌論文] Methylation of multiple genes as molecular markers for diagnosis of a small well-differentiated hepatocellular carcinoma (2009)
  • 著者名/発表者名: T. Moribe, N. Iizuka, T. Miura, N. Kimura, S. Tamatsukuri, H. Ishitsuka, Y. Hamamoto, K. Sakamoto, T. Tamesa and M. Oka
  • 雑誌名: Int. J. Cancer 巻: 125 ページ: 388-397
  • 査読あり
• [雑誌論文] Methylation of multiple genes as molecular markers for diagnosis of a small well-differentiated hepatocellular carcinoma (2009)
  • 著者名/発表者名: T.Moribe, et al.
  • 雑誌名: Int.J.Cancer 125 ページ: 388-397
  • 査読あり
• [雑誌論文] Rapid and quantitative detection of CpG-methylationstatus using TaqMan PCR combined with methyl-binding-domain polypeptide (2009)
  • 著者名/発表者名: N.Kimura, et al
  • 雑誌名: Clinical Biochemistry 42 ページ: 1113-1122
  • 査読あり
• [学会発表] 血清CIMPと肝細胞癌の予後 (2011)
  • 著者名/発表者名: 飯塚徳男、岡正朗、恒富亮一、藤田悠介、浜本義彦、森部豊輝
  • 学会等名: 第70回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場、名古屋
  • 年月日: 2011-10-03
• [学会発表] 血清CIMPと肝細胞癌の予後 (2011)
  • 著者名/発表者名: 飯塚, 他
  • 学会等名: 第70回日本癌学会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場
  • 年月日: 2011-10-03
• [学会発表] An optimized Fisher linear classifier for detection of hepatocellular carcinoma, 8^<th> AACR-JCA Joint Conference Cancer Genomics (2010)
  • 著者名/発表者名: Y. Fujita, Y. Hamamoto, N. Iizuka, M. Oka, T. Moribe
  • 学会等名: Epigenomics and the Development of Novel Therapeutics
  • 発表場所: Hilton Waikoloa Village, Hawaii(米国)
  • 年月日: 2010-02-06
• [学会発表] An optimized Fisher liner classifier for detection of hepatocellular car cinoma (HCC) (2010)
  • 著者名/発表者名: Y.Fujita
  • 学会等名: 8th AACR-JCA Joint Conference : Cancer Genomics, Epigenomies.and the Development of Novel Therapeutics
  • 発表場所: Hilton Waikoloa Village, Hawaii (米国)
  • 年月日: 2010-02-06
• [図書] 統計的パターン認識入門 (2009)
  • 著者名/発表者名: 浜本義彦
  • 総ページ数: 122
  • 出版者: 森北出版
• [備考]
  • URL: http://www.ir.csse.yamaguchi-u.ac.jp/
• [備考] URL
  • URL: http://www.ir.csse.yamaguchi-u.ac.jp
• [備考]
  • URL: http://www.ir.csse.yamaguchi-u.ac.jp
• [産業財産権] AFPおよびPIVKA-IIの測定値を特徴値とした識別関数を利用する、肝臓癌および慢性肝疾患の病態進行度の検出方法 (2009)
  • 発明者名: 木村直紀、森部豊輝、玉造滋、飯塚徳男、岡正朗、浜本義彦
  • 権利者名: エフホフマンーラロシュアーゲー
  • 産業財産権番号: 2009-094252
  • 出願年月日: 2009-04-08
• [産業財産権] 特許 (2005)
  • 発明者名: 浜本義彦, 他
  • 権利者名: 山口大学
  • 出願年月日: 2005-12-02
  • 取得年月日: 2011-04-08