バイオインフォマティクス手法による細胞発現糖鎖の網羅的解析と生物学的意義の検討

• 研究課題/領域番号: 21500293
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生体生命情報学
• 研究機関: 独立行政法人国立成育医療研究センター
• 研究代表者: 中島 英規 独立行政法人国立成育医療研究センター, 小児血液・腫瘍研究部, 研究員 (30450620)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2011年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2010年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2009年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
• キーワード: 糖鎖 / 情報工学 / マイクロアレイ / 生体分子 / 細胞 / 組織 / 細胞・組織

研究概要

質量分析装置(MS)と液体クロマトグラフィー(LC)を組み合わせたLC-MSのデータをバイオインフォマティクス手法により解析するソフトウェアの開発に協力し市販されるに至った。このソフトウェアを用いて様々な病態の小児白血病細胞を分析したところ、統計学的にそれぞれの病態で異なった発現糖鎖パターンを示すことを明らかにした。特に乳児性白血病ではこれまで報告のない糖脂質Ln3Cerが発現していることを見いだした。

研究成果

• [学会発表] LC-MS/MSによる代謝異常症の高感度検出 (2011)
  • 著者名/発表者名: 中島英規
  • 学会等名: 日本電気泳動学会シンポジウム・臨床プロテオーム研究会連合大会
  • 発表場所: 山口県山口大学
  • 年月日: 2011-05-10
• [学会発表] ヒト人工多能性幹(iPS)細胞における糖脂質の比較解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 尾島琢磨,中島英規,梅澤明広
  • 学会等名: 日本再生医療学会
  • 発表場所: 東京都京王プラザホテル
  • 年月日: 2011-03-01
• [学会発表] ヒト人工多能性幹(ips)細胞における糖脂質の比較解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 尾島琢磨, 中島英規, 梅澤明広
  • 学会等名: 日本再生医療学会
  • 発表場所: 東京都京王プラザホテル
  • 年月日: 2011-03-01
• [学会発表] タンテムマス質量分析器を用いたポンペ病の診断法の開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中島英規,藤本純一郎,奥山虎之
  • 学会等名: 日本先天代謝異常学会総会、アジア先天性代謝異常症シンポジウム
  • 発表場所: 大阪府大阪国際会議場
  • 年月日: 2010-10-21
• [学会発表] タンテムマス質量分析器を用いたポンペ病の診断法の開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中島英規, 藤本純一郎, 奥山虎之
  • 学会等名: 日本先天代謝異常学会総会、アジア先天性代謝異常症シンポジウム
  • 発表場所: 大阪府 大阪国際会議場
  • 年月日: 2010-10-21
• [学会発表] 濾紙血検体を用いたライソゾーム病の欠損酵素活性測定 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中島英規,藤本純一郎,奥山虎之
  • 学会等名: 日本マススクリーニング学会
  • 発表場所: 神奈川県ワークピア横浜
  • 年月日: 2010-08-28
• [学会発表] 濾紙血検体を用いたライソゾーム病の欠損酵素活性測定 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中島英規, 藤本純一郎, 奥山虎之
  • 学会等名: 日本マス・スクリーニング学会
  • 発表場所: 神奈川県ワークピア横浜
  • 年月日: 2010-08-28
• [備考]
  • URL: http://www.reifycs.com/japanese/SPMSoutline_jp.html