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ピロリジル転移リボ核酸合成酵素を利用した非天然型アミノ酸の蛋白質への導入

研究課題

研究課題/領域番号 21550167
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生体関連化学
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

柳沢 達男  独立行政法人理化学研究所, システム研究チーム, 研究員 (10450420)

研究期間 (年度) 2009 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2011年度: 130千円 (直接経費: 100千円、間接経費: 30千円)
2010年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2009年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
キーワードバイオテクノロジー / 非天然型アミノ酸 / タンパク質 / クロスリンカー / ケミカルバイオロジー / 翻訳 / ピロリジン / アミノアシルtRNA合成酵素 / tRNA / 翻訳後修飾 / アミノアシル-tRNA合成酵素 / 有用性官能基 / ピロリジル-tRNA合成酵素
研究概要

研究代表者はピロリジルtRNA合成酵素(PylRS)/tRNA^<Pyl>システムを用いて新規のクロスリンカー含有リジン誘導体、TmdZLysをタンパク質に部位特異的に導入することに成功した。従来のクロスリンカー含有アミノ酸に比べて、TmdZLysを導入したタンパク質は細胞内ターゲットであるタンパク質と広い範囲でUVクロスリンクが可能であった。TmdZLys導入系を用いてタンパク質間相互作用ネットワークを解明することが期待される。

報告書

(4件)
  • 2011 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (23件)

すべて 2012 2011 2010 2009 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (9件) 図書 (6件) 産業財産権 (2件)

  • [雑誌論文]2012

    • 著者名/発表者名
      Yanagisawa, T., Hino, N., Iraha, F., Mukai, T., Sakamoto, K., Yokoyama, S.
    • 雑誌名

      Mol. BioSyst

      巻: 8 ページ: 1131-1135

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Wade-range protein photo-crosslinking achieved by a genetically encoded N^ε-(benzyloxycarbonyl) lysine derivative with a diazirinyl moiety2012

    • 著者名/発表者名
      T. Yanagisawa, N. Hino, F. Iraha, T. Mukai, K. Sakamoto, S. Yokoyama
    • 雑誌名

      Mol. Bio Syst.

      巻: 8 号: 4 ページ: 1131-1135

    • DOI

      10.1039/c2mb05321g

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文]2011

    • 著者名/発表者名
      Mukai, T., Yanagisawa, T., Ohtake, K., Wakamori, M., Adachi, J., Hino, N., Sato, A., Kobayashi, T., Hayashi, A., Shirouzu, M., Umehara, T., Yokoyama, S., Sakamoto, K.
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun

      巻: 411 ページ: 757-761

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genetic-code evolution for protein synthesis with non-natural amino acids2011

    • 著者名/発表者名
      T. Mukai, T. Yanagisawa, K. Ohtake, M. Wakamori, J. Adachi, N. Hino, A. Sato, T. Kobayashi, A. Hayashi, M. Shirouzu, T. Umehara, S. Yokoyama, K. Sakamoto
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Comm.

      巻: 411 ページ: 757-761

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A paralog of lysyl-tRNA synthetase aminoacylates a conserved lysine residue in translation elongation factor P2010

    • 著者名/発表者名
      T. Yanagisawa. T. Sumida, R. Ishii, C. Takemoto, S. Yokoyama
    • 雑誌名

      Nat. Struct. Mol. Biol.

      巻: 17 ページ: 1136-1143

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallizaton and preliminary X-ray crystallographic study of GenX, a lysyl-tRNA synthetase paralogue from Escherichia coli, in complex with translation elongation factor P2010

    • 著者名/発表者名
      T. Sumida, T. Yanagisawa, R. Ishii, S. Yokoyama
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr. Sect. F Struct. Biol. Cryst. Commn.

      巻: 66 ページ: 1115-1119

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 終止コドンUAGがセンス・コドンに再定義された大腸菌株を用いた非天然型アミノ酸のタンパク質への導入2011

    • 著者名/発表者名
      坂本健作、安達仁朗、若森昌聡、白水美香子、梅原崇史、柳沢達男、向井崇人、横山茂之
    • 学会等名
      第6回無細胞生命科学研究会
    • 発表場所
      兵庫
    • 年月日
      2011-11-16
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] 転移RNAを擬態する大腸菌翻訳因子EF-Pのアミノアシル化修飾2011

    • 著者名/発表者名
      柳沢達男、澄田智美、石井亮平、竹本千重、横山茂之
    • 学会等名
      第5回細菌学若手コロッセウム
    • 発表場所
      高知県高知市
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 終止コドンUAGがセンス・コドンに再定義された大腸菌株を用いた非天然型アミノ酸のタンパク質への導入2011

    • 著者名/発表者名
      坂本健作、安達仁朗、若森昌聡、白水美香子、梅原崇史、柳沢達男、向井崇人、横山茂之
    • 学会等名
      第6回無細胞生命科学研究会
    • 発表場所
      兵庫県姫路市
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌、昆虫細胞、動物細胞を用いた非天然型アミノ酸のタンパク質への部位特異的導入法の開発2010

    • 著者名/発表者名
      坂本健作、向井崇人、大竹和正、伊良波史枝、林明子、佐藤文、樋野展正、柳沢達男、脇山素明、横山茂之
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2010-06-17
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Escherichia coli translation elongation factor P (EF-P) is lysylated by GenX/PoxA/YjeA, a paralog of lysyl-tRNA synthetase, and YjeK2010

    • 著者名/発表者名
      Tatsuo Yanagisawa. Tomomi Sumida, Ryohei Ishii, Chie Takemoto, Shigeyuki Yokoyama
    • 学会等名
      Ribosomes2010
    • 発表場所
      イタリア/オルビエート
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] リジル-tRNA合成酵素パラログGenX/PoxA/YjeA、およびYjeKによる翻訳因子EF-Pの翻訳後修飾2010

    • 著者名/発表者名
      柳沢達男、澄田智美、石井亮平、竹本千重、横山茂之
    • 学会等名
      日本RNA学会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌、昆虫細胞、動物細胞を用いた非天然型アミノ酸のタンパク質への部位特異的導入法の開発2010

    • 著者名/発表者名
      坂本健作、向井崇人、大竹和正、伊良波史枝、林明子、佐藤文、樋野展正、柳沢達男、脇山素明、横山茂之
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      札幌
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Structural bases of specific generation of amino-acid ligated tRNAs and proteins2010

    • 著者名/発表者名
      Shun-ichi Sekine、Takuhiro Ito、Tatsuo Yanagisawa、Shigeyuki Yokoyama
    • 学会等名
      国際核酸化学シンポジウム (ISNAC-2010)
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 翻訳後修飾アミノ酸のタンパク質への部位特異的導入2009

    • 著者名/発表者名
      坂本健作、小林隆嗣、柳沢達男、横山茂之
    • 学会等名
      第4回無細胞生命科学研究会
    • 発表場所
      岐阜
    • 年月日
      2009-11-16
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [図書] 化学と生物2011

    • 著者名/発表者名
      柳沢達男、澄田智美、横山茂之
    • 総ページ数
      4
    • 出版者
      転移RNAを擬態する大腸菌翻訳因子EF-Pのアミノアシル化修飾-抗菌薬ターゲットとしての可能性に期待-
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [図書] Photon Factory Activity Report Research Highlights 20102011

    • 著者名/発表者名
      T. Yanagisawa, T. Sumida, S. Yokoyama
    • 総ページ数
      1
    • 出版者
      The Crystal Structure of Translation Elongation Factor P (EF-P) Complexed with An Aminoacyl-tRNA Synthetase Paralog, GenX, Reveals that EF-P Functionally Mimics Transfer RNA
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [図書] SPring-8 Research Frontiers 20102011

    • 著者名/発表者名
      T. Yanagisawa, T. Sumida, S. Yokoyama
    • 総ページ数
      1
    • 出版者
      Structure and function of a protein mimicking transfer RNA revealed from the structure of translation elongation factor P complexed with an aminoacyl-tRNA synthetase paralog, GenX.
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [図書] SPring-8 Research Frontiers 2010 : Structure and Function of a Protein Mimicking transfer RNA Revealed from the Structure of Translation Elongation Factor P Complexed with an Aminoacyl-tRNA Synthetase Paralog, GenX2011

    • 著者名/発表者名
      柳沢達男、澄田智美、横山茂之
    • 総ページ数
      2
    • 出版者
      SPring-8
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [図書] ライフサイエンス新着論文レビュー:リジル-tRNA合成酵素パラログGenX-YjeKシステムによる翻訳因子EF-Pのリジル化修飾2010

    • 著者名/発表者名
      柳沢達男、横山茂之
    • 総ページ数
      3
    • 出版者
      ライフサイエンス統合データベースセンター
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [図書] RIKEN Research : Copycat protein finds a perfect match核酸と瓜二つのタンパク質2010

    • 著者名/発表者名
      柳沢達男、澄田智美、横山茂之
    • 総ページ数
      1
    • 出版者
      理化学研究所
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [産業財産権] 新規な非天然型アミノ酸、及びその利用(N^ε-(p-trifluoromethyldia zirinylbenzyloxycarbonyl)-lysine)2011

    • 発明者名
      横山茂之、坂本健作、柳沢達男、樋野展正、伊良波史枝
    • 権利者名
      横山茂之、坂本健作、柳沢達男、樋野展正、伊良波史枝
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2011-11-18
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [産業財産権] 新規非天然型アミノ酸とその応用に関する研究: N(epsilin)-(p-trifluoromethyldiazirinylbenzylo xycarbonyl) lysine

    • 発明者名
      Yokoyama, S., Sakamoto, K., Yanagisawa, T., Hino, N., F. Iraha
    • 権利者名
      Yokoyama, S., Sakamoto, K., Yanagisawa, T., Hino, N., F. Iraha
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2016-04-21  

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