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DNA系列が持つ制約の特徴量の計算とその符号構成への応用

研究課題

研究課題/領域番号 21560394
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 通信・ネットワーク工学
研究機関岐阜大学

研究代表者

鎌部 浩  岐阜大学, 工学部, 教授 (80169614)

研究期間 (年度) 2009 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
2011年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2010年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2009年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
キーワード情報理論 / 通信路容量 / 計算論的言語理論 / DNAコンピュータ / DNA計算 / 符号理論 / 入力制約のある通信路 / 記号力学系 / 制約符号 / 入力制約 / コンマフリー符号 / whiplashモデル / 文脈自由文法
研究概要

本研究では、DNA計算のために必要な系列の制約の容量の計算と、符号化について研究した。まず、文脈自由文法の形式で記述されるDNA系列の制約の容量を求めた。次に、分子プログラムが字句解析可能であるための制約の容量を、情報理論および記号力学系的な手法で求めた。これによって、符号の構成のための指針を得た。

報告書

(4件)
  • 2011 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2011 2010

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (7件)

  • [雑誌論文] Outfix-free and intercode con-straints for DNA squences2011

    • 著者名/発表者名
      H. Kamabe
    • 雑誌名

      Proceeding of 2011 IEEE International Symposium on Information Theory

      ページ: 1574-1578

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Outfix-free and intercode constraints for DNA sequences2011

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kamabe
    • 雑誌名

      Proceeding of 2011, IEEE International Symposium on Information Theory

      ページ: 622-627

    • DOI

      10.1109/isit.2011.6033809

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Outfix-free and Intercode Constraints for DNA Sequences2011

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kamabe
    • 雑誌名

      Proceedings of the International Symposium on Information Thoery 2011

      巻: (採録決定,未発刊)

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Constraints for DNA sequences by formal languages and its capacity2010

    • 著者名/発表者名
      H. Kamabe
    • 雑誌名

      Proceeding of Nature and Biologically Inspired Computing 2010

      ページ: 622-627

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Constraints for DNA Sequences by Formal Language and its Capacity2010

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kamabe
    • 雑誌名

      Proceedings of the World Congress on Nature and Biologically Inspired Computing 2010

      ページ: 629-634

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] On constraints for DNA sequences2011

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kamabe
    • 学会等名
      2011 Information Theory and its Applications Workshop
    • 発表場所
      カリフォルニア大学サンディエゴ校
    • 年月日
      2011-02-11
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Outfix-free and intercode con-straints for DNA squences2011

    • 著者名/発表者名
      H. Kamabe
    • 学会等名
      2011 IEEE Interna-tional Symposium on Information Theory
    • 発表場所
      Saint Petersberg
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Constraints for DNA Sequences by Formal Language and its Capacity2010

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kamabe
    • 学会等名
      The 32rd Symposium on Information Theory and its Application (SITA2010)
    • 発表場所
      信州松代ロイヤルホテル
    • 年月日
      2010-12-01
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] DNA系列の制約について2010

    • 著者名/発表者名
      鎌部浩
    • 学会等名
      電子情報通信学会情報理論研究会技術研究報告
    • 発表場所
      東北学院大学
    • 年月日
      2010-09-22
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] DNA系列の制約について2010

    • 著者名/発表者名
      鎌部浩
    • 学会等名
      電子情報通信学会 情報理論研究会
    • 発表場所
      東北学院大学
    • 年月日
      2010-09-22
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Constraints for DNA sequences by formal languages and its capacity2010

    • 著者名/発表者名
      H. Kamabe
    • 学会等名
      Nature and Biologically Inspired Computing 2010
    • 発表場所
      Ki-takyushu
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Constraints for DNA sequences by formal languages and its capacity2010

    • 著者名/発表者名
      H. Kamabe
    • 学会等名
      情報理論とその応用シンポジウム
    • 発表場所
      信州
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2016-04-21  

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