PEX16による植物ペルオキシソームの形成機構

• 研究課題/領域番号: 21570053
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 植物分子生物・生理学
• 研究機関: 基礎生物学研究所
• 研究代表者: 林 誠 基礎生物学研究所, 高次細胞機構研究部門, 准教授 (50212155)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円); 2011年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2010年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2009年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: ペルオキシソーム / グリオキシソーム / 脂質分解 / 光呼吸 / オルガネラ / 緑葉ペルオキシソーム / 脂肪酸β酸化 / タンパク質輸送

研究概要

植物のペルオキシソームは脂質分解や光呼吸などの代謝を担う重要なオルガネラである。申請者は、これまでに植物ペルオキシソームの形成を担うPEXタンパク質群を同定してきた。本申請では、これらPEXタンパク質群と協調的に働くタンパク質の同定を行った。その結果、PEX7と結合するタンパク質としてPEX12, PEX13およびRabE1cを見いだした。PEX16に結合するタンパク質も複数同定することに成功しており、現在その機能を解析中である。さらにGFP-PEX16過剰発現株よりサプレッサー変異体を単離する方法を確立した。

研究成果

• [雑誌論文] Proteomic analysis reveals that the Rab GTPase RabE1c is involved in the degradation of the peroxisomal protein receptor PEROXIN 7 (2013)
  • 著者名/発表者名: Cui, S., Fukao, Y., Mano, S., Yamada, K., Hayashi, M. and Nishimura, M
  • 雑誌名: J. Biol 巻: 288 ページ: 6014-6023
  • 査読あり
• [雑誌論文] Proteomic analysis reveals the Rab GTPase RabE1c is involved in the degradation of the peroxisomal protein receptor PEX7 (Peroxin 7) (2013)
  • 著者名/発表者名: Soungkui Cui, Yoichiro Fukao, Shoji Mano, Kenji Yamada, Makoto Hayashi and Mikio Nishimura
  • 雑誌名: Journal of Biological Chemistry 巻: 288 号: 8 ページ: 6014-6023
  • DOI: 10.1074/jbc.m112.438143
  • 査読あり
• [雑誌論文] Loss of XRN4 Function Can Trigger Cosuppression in a Sequence-dependent Manner. Plant Cell Physiol (2012)
  • 著者名/発表者名: Hayashi, M., Nanba, C., Saito M., Kondo, M., Takeda, A.,Watanabe Y. and Nishimura, M.
  • 雑誌名: Plant Cell Physiol 巻: 53 ページ: 1310-1321
  • 査読あり
• [雑誌論文] A peroxisomal ABC transporter promotes seed germination by inducing pectin degradation under the control of ABI5 (2010)
  • 著者名/発表者名: Kanai, M., Nishimura, M. and Hayashi, M
  • 雑誌名: Plant J 巻: 62 ページ: 936-947
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular components required for the targeting of PEX7 to peroxisomes in Arabidopsis thaliana (2009)
  • 著者名/発表者名: Singh, T., Hayashi, M., Mano, S., Arai, Y. and Nishimura, M
  • 雑誌名: Plant J 巻: 60 ページ: 488-498
  • 査読あり
• [雑誌論文] Peroxisomes are required for in vivo nitric oxide (NO) accumulation in the cytosol following salinity stress of Arabidopsis plants (2009)
  • 著者名/発表者名: Corpas, F.J., Hayashi, M., Mano, S., Nishimura, M. and Barroso, J.B
  • 雑誌名: Plant Physiol 巻: 151 ページ: 2083-2094
  • 査読あり
• [雑誌論文] Suppression of peroxsiome biogenesis factor 10 reduces cuticular wax accumulation by disrupting the ER network in Arabidopsis thaliana (2009)
  • 著者名/発表者名: Kamigaki, A., Kondo, M., Mano, S., Hayashi, M. and Nishimura, M
  • 雑誌名: Plant Cell Physiol 巻: 50 ページ: 2034-2046
  • 査読あり
• [雑誌論文] 植物ペルオキシソームの機能多様性とその制御 (2009)
  • 著者名/発表者名: 林 誠、西村幹夫
  • 雑誌名: Plant Morphology 巻: 21 ページ: 41-46
  • NAID: 130002152914
• [雑誌論文] SQUAMOSA promoter binding protein-like7 is a central regulator for copper homeostasis in Arabidopsis. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamasaki, H., ら
  • 雑誌名: Plant Cell 巻: 21 ページ: 347-361
  • 査読あり
• [雑誌論文] High-sensitivity real-time imaging of dual protein-protein interactions in living subjects using multicolor luciferases. (2009)
  • 著者名/発表者名: Hida, N., ら
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 4
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular components required for the targeting of PEX7 to peroxisomes in Arabidopsis thaliana. (2009)
  • 著者名/発表者名: Singh, T., ら
  • 雑誌名: Plant J. 巻: 60 ページ: 488-498
  • 査読あり
• [雑誌論文] Peroxisomes are required for in vivo nitric oxide (NO) accumulation in the cytosol following salinity stress of Arabidopsis plants. (2009)
  • 著者名/発表者名: Corpas, F.J., ら
  • 雑誌名: Plant physiol. 巻: 151 ページ: 2083-2094
  • 査読あり
• [雑誌論文] Suppression of peroxsiome biogenesis factor 10 reduces cuticular wax accumulation by disrupting the ER network in Arabidopsis thaliana. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kamigaki, A., ら
  • 雑誌名: Plant Cell Physiol. 巻: 50 ページ: 2034-2046
  • 査読あり
• [雑誌論文] Frontiers of research on organelle differentiation. (2009)
  • 著者名/発表者名: Hayashi, M., Nishimura, M.
  • 雑誌名: Plant Cell Physiol. 巻: 50 ページ: 1995-1999
  • NAID: 10027344578
• [学会発表] ペルオキシソーム局在型benzoyltransferaseはベンゼノイド産生を触媒する (2013)
  • 著者名/発表者名: 中井篤、林 誠、深尾陽一郎、吉瀬(新井)祐子、西村幹夫
  • 学会等名: 第54回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 岡山
• [学会発表] Identification and functional characterization of novel factors regulating peroxisomal protein receptor PEX7 (2013)
  • 著者名/発表者名: Soungkui Cui, Yoichiro Fukao, Shoji Mano, Kenji Yamada, Makoto Hayashi and Mikio Nishimura
  • 学会等名: 第54回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 岡山
• [学会発表] ペルオキシソーム局在異常変異体peup4の解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 及川和聡、柴田美智太郎、近藤真紀、真野昌二、林 誠、吉本光希、大隅良典、西村幹夫
  • 学会等名: 第54回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 岡山
• [学会発表] 種子特異的な乾燥耐性を担う遺伝子DPS1の同定とその機能解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 金井雅武、林 誠、西村幹夫
  • 学会等名: 第５４回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 岡山大学（岡山）
• [学会発表] ペルオキシソーム局在型benzoyltransferaseはベンゼノイド生産を触媒する (2013)
  • 著者名/発表者名: 中井篤、林 誠、深尾陽一郎、古瀬（新井）祐子、西村幹夫
  • 学会等名: 第５４回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 岡山大学（岡山）
• [学会発表] Identification and functional characterization of novel factors regulating peroxisomal protein receptor PEX7 (2013)
  • 著者名/発表者名: Soungkui Cui, Yoichiro Fukao, Shoji Mano, Kenji Yamada, Makoto Hayashi and Mikio Nishimura
  • 学会等名: 第５４回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 岡山大学（岡山）
• [学会発表] ペルオキシソーム局在異常変異体peup4の解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 及川和聡、柴田美智太郎、近藤真紀、真野昌二、 林 誠、吉本光希、大隅良典、西村幹夫
  • 学会等名: 第５４回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 岡山大学（岡山）
• [学会発表] 定量プロテオミクスを用いたダイズ子葉のペルオキシソーム機能転換の解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 中井篤、林 誠、深尾陽一郎、吉瀬(新井)祐子、西村幹夫
  • 学会等名: 第53回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] Identification of novel peroxisomal biogenesis factors binding to PEX7 (2012)
  • 著者名/発表者名: Soungkui Cui, Yoichiro Fukao, Makoto Hayashi and Mikio Nishimura
  • 学会等名: 第53回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] HS3は葉緑体ゲノムの転写制御により種子の貯蔵脂質合成に関与する (2011)
  • 著者名/発表者名: 金井雅武, ら
  • 学会等名: 日本植物生理学会
  • 発表場所: 東北大学(宮城)
  • 年月日: 2011-03-20
• [学会発表] ペルオキシソーム局在異常変異体peup2とpeup4の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 及川和聡, ら
  • 学会等名: 日本植物生理学会
  • 発表場所: 東北大学(宮城)
  • 年月日: 2011-03-20
• [学会発表] 定量プロテオミクスを用いたダイズ子葉のペルオキシソームタンパク質の網羅的解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 中井篤, ら
  • 学会等名: 日本植物生理学会
  • 発表場所: 東北大学(宮城)
  • 年月日: 2011-03-20
• [学会発表] HS3は葉緑体ゲノムの転写制御により種子の貯蔵脂質合成に関与する (2011)
  • 著者名/発表者名: 金井雅武,林 誠,西村幹夫
  • 学会等名: 第52回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 仙台
• [学会発表] 定量プロテオミクスを用いたダイズ子葉のペルオキシソームタンパク質の網羅的解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 中井 篤、林 誠、深尾陽一郎、吉瀬(新井)祐子、西村幹夫
  • 学会等名: 第52回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 仙台
• [学会発表] ペルオキシソーム局在異常変異体peup2とpeup4の解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 及川和聡、柴田美智太郎、近藤真紀、吉本光希、真野昌二、林 誠、大隅良典、西村幹夫
  • 学会等名: 第52回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 仙台
• [学会発表] Proteome as a tool for studying plant peroxisomes (2010)
  • 著者名/発表者名: Hayashi, M., ら
  • 学会等名: 2nd international symposium on "Frontier in Agriculture Proteome Research"
  • 発表場所: 作物研究所(茨城)
  • 年月日: 2010-11-18
• [学会発表] ペルオキシソーム膜タンパク質の網羅的解析による新規輸送タンパク質の同定 (2010)
  • 著者名/発表者名: 吉瀬(新井)祐子, ら
  • 学会等名: 第51回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 熊本大学(熊本)
  • 年月日: 2010-03-18
• [学会発表] Proteomic identification of novel peroxisome biogenesis factors (2010)
  • 著者名/発表者名: Songkui C., ら
  • 学会等名: 第51回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 熊本大学(熊本)
  • 年月日: 2010-03-18
• [学会発表] 光に依存したペルオキシソームとミトコンドリア・葉緑体との接着機構は光合成により制御される (2010)
  • 著者名/発表者名: 及川和聡, ら
  • 学会等名: 第51回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 熊本大学(熊本)
  • 年月日: 2010-03-18
• [学会発表] ダイズ子葉のペルオキシソーム機能変換におけるペルオキシソームタンパク質の網羅的解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中井篤, ら
  • 学会等名: 第51回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 熊本大学(熊本)
  • 年月日: 2010-03-18
• [学会発表] PED3はABI5を介して種子発芽を制御する (2010)
  • 著者名/発表者名: 金井雅武, ら
  • 学会等名: 第51回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 熊本大学(熊本)
  • 年月日: 2010-03-18
• [学会発表] Proteomic identification of novel peroxisome biogenesis factors (2010)
  • 著者名/発表者名: Songkui C., Fukao, Y., Hayashi, M. and Nishimura, M
  • 学会等名: 第51回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 熊本
• [学会発表] 光に依存したペルオキシソームとミトコンドリア、葉緑体との接着機構は光合成により制御される (2010)
  • 著者名/発表者名: 及川和聡、松永茂、真野昌二、林 誠、近藤真紀、香川貴俊、坂本亘、東正一、渡辺正勝、西村幹夫
  • 学会等名: 第51回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 熊本
• [学会発表] ダイズ子葉のペルオキシソーム機能変換におけるペルオキシソームタンパク質の網羅的解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 中井篤、林 誠、深尾陽一郎、吉瀬(新井)祐子、西村幹夫
  • 学会等名: 第51回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 熊本
• [学会発表] PED3はABI5を介して種子発芽を制御する (2010)
  • 著者名/発表者名: 金井雅武,西村幹夫,林 誠
  • 学会等名: 第51回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 熊本
• [学会発表] Peroxisomal targeting of PEX7, a receptor for PTS2-containing proteins, to peroxisomes (2009)
  • 著者名/発表者名: Hayashi, M., ら
  • 学会等名: International conference on Arabidopsis research
  • 発表場所: Edinburgh International Conference Centre, Edingurgh (UK)
  • 年月日: 2009-06-30
• [学会発表] PED3 is required for process of breaking dormancy (2009)
  • 著者名/発表者名: Kanai, M., ら
  • 学会等名: International conference on Arabidopsis research
  • 発表場所: Edinburgh International Conference Centre, Edingurgh (UK)
  • 年月日: 2009-06-30
• [学会発表] Peroxisomal targeting of PEX7, a receptor for PTS2-containing proteins, to peroxisomes, International conference on Arabidopsis research (2009)
  • 著者名/発表者名: Hayashi, M., Singh, T., Mano, S., Arai, Y., Goto, S. and Nishimura, M
  • 学会等名: Edingurgh
  • 発表場所: UK
• [学会発表] PED3 is required for process of breaking dormancy, International conference on Arabidopsis research (2009)
  • 著者名/発表者名: Kanai, M., Nishimura, M. and Hayashi, M
  • 学会等名: Edingurgh
  • 発表場所: UK
• [備考]
  • URL: http://www.nibb.ac.jp/~celmech/jp