ミトコンドリアゲノムの構造多様性と分子系統解析に基づく尾索動物の進化の研究

• 研究課題/領域番号: 21570101
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 東京薬科大学
• 研究代表者: 横堀 伸一 東京薬科大学, 生命科学部, 講師 (40291702)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2011年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2010年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2009年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: ミトコンドリアゲノム / 分子系統解析 / 尾索動物 / 尾策動物 / タリア綱 / ヒカリボヤ

研究概要

尾索動物の複数ミトコンドリアゲノムの全塩基配列の決定を行い、一次配列とそれ以外の高次情報に基づいて分子系統解析を行い、尾索動物の進化経路を明らかにすることを試みた。特に、ヒカリボヤPyrosom atlanticumのミトコンドリアゲノム配列の情報を加え、尾索動物の分子系統解析を行うと、タリア綱は腸性目の群内郡となり、腸性目ホヤ(管鰓亜目と無管亜目)が側系統群である可能性が示唆された。特に、ユウレイボヤ科ユウレイボヤ亜科が無管亜目の姉妹群に、またユウレイボヤ科ムネボヤ亜科が無管亜目の内群である可能性が示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] Male death resulting from hybridisation between subspecies of the gypsy moth, Lymantria dispar. (2011)
  • 著者名/発表者名: Higashiura, Y., H. Yamaguchi, M. Ishihara, N. Ono, H. Tsukagoshi, S. Yokobori, S. Tokishita, H. Yamagata, & T. Fukatsu
  • 雑誌名: Heredity 巻: 106 ページ: 603-613
• [雑誌論文] Taurine-containing uridine modifications in tRNA anticodons are required to decipher non-universal genetic codes in ascidian mitochondria (2011)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, T., K. Miyauchi, T. Suzuki, S. Yokobori, N. Shigi, A. Kondow, N. Takeuchi, A. Yamagishi, & K. Watanabe
  • 雑誌名: J. Biol. Chem 巻: 286 ページ: 35494-35498
• [雑誌論文] tRNA modification and genetic code variations in animal mitochondria (2011)
  • 著者名/発表者名: Watanabe, K. & S. Yokobori
  • 雑誌名: J. Nucleic Acids. Article 巻: 2011 ページ: 1-12
  • DOI: 10.4061/2011/623095
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genetic code : introduction(Version 2) (2011)
  • 著者名/発表者名: Watanabe, K. & S. Yokobori
  • 雑誌名: Encyclopedia of Life Science
  • DOI: 10.1002/9780470015902.a0000809.pub2
  • 査読あり
• [雑誌論文] Male death resulting from hybridisation between subspecies of the gypsy moth, Lymantria dispar (2011)
  • 著者名/発表者名: Higashiura, Y., H.Yamaguchi, M.Ishihara, N.Ono, H.Tsukagoshi, S.Yokobori, S.Tokishita, H.Yamagata, T.Fukatsu
  • 雑誌名: Heredity 巻: 106 号: 4 ページ: 603-613
  • DOI: 10.1038/hdy.2010.92
  • 査読あり
• [雑誌論文] Taurine-containing uridine modifications in tRNA anticodons are required to decipher non-universal genetic codes in ascidian mitochondria (2011)
  • 著者名/発表者名: Suzuki T (第1著者), 他8名
  • 雑誌名: J. Biol. Chem 巻: 286 号: 41 ページ: 35494
  • DOI: 10.1074/jbc.m111.279810
  • 査読あり
• [雑誌論文] Repetitive sequences in the lamprey mitochondrial DNA control region and speciation of Lethenteron (2010)
  • 著者名/発表者名: Okada, K., Y. Yamazaki, S. Yokobori, & H. Wada
  • 雑誌名: Gene 巻: 465 ページ: 45-52
  • NAID: 120007137933
• [雑誌論文] The complete mitochondrial genome of Caprella scaura(Caprellidea) with a note on a unique gene order pattern and duplicated control region (2010)
  • 著者名/発表者名: Ito, A., M. Aoki, S. Yokobori, & H. Wada
  • 雑誌名: Mitochondrial DNA 巻: 21 ページ: 183-190
• [雑誌論文] Evolution of genetic code (2010)
  • 著者名/発表者名: Yokobori, S., T. Ueda, & K. Watanabe
  • 雑誌名: Encyclopedia of Life Science 2010
  • DOI: 10.1002/9780470015902.a0000548.pub2
  • URL: http://www.els.net/
  • 査読あり
• [雑誌論文] Repetitive sequences in the lamprey mitochondrial DNA control region and speciation of Lethenteron. (2010)
  • 著者名/発表者名: Okada, K., Y.Yamazaki, S.Yokobori, H.Wada
  • 雑誌名: Gene 巻: 465 ページ: 45-52
  • NAID: 120007137933
  • 査読あり
• [雑誌論文] The complete mitochondrial genome of Caprella scaura (Caprellidea) with a note on a unique gene order pattern and duplicated control region. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ito, A., M.Aoki, S.Yokobori, H.Wada?
  • 雑誌名: Mitochondrial DNA 巻: 21 ページ: 183-190
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evolution of genetic code (Version2) (2010)
  • 著者名/発表者名: Yokobori, S., T.Ueda, K.Watanabe
  • 雑誌名: Encyclopedia of Life Science (In press)
  • 査読あり
• [学会発表] ミトコンドリアtRNAの解析から見た遺伝暗号の進化 (2012)
  • 著者名/発表者名: 横堀伸一、山岸明彦、渡辺公綱
  • 学会等名: 第37回生命の起原と進化学会学術講演会
  • 発表場所: 高槻(2012/03)
  • 年月日: 2012-03-08
• [学会発表] シロウリガイ類のミトコンドリアゲノム解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小澤元希、島村繁、高木善弘、横堀伸一、前田太郎、丸山正、吉田尊雄
  • 学会等名: ブルーアース2012
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] ミトコンドリアtRNAの解析から見た遺伝暗号の進化 (2012)
  • 著者名/発表者名: 横堀伸一、山岸明彦、渡辺公綱
  • 学会等名: 第37回生命の起原と進化学会学術講演会
  • 発表場所: 高槻
• [学会発表] Molecular phylogeny of urochordates and evolution of mitochondrial genetic code in urochordate mitochondria (2011)
  • 著者名/発表者名: Yokobori, S., K.Watanabe, A.Yamagishi
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜(2011/12)
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] 深海性二枚貝シロウリガイ類のミトコンドリアゲノム解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 小澤元希、島村繁、高木善弘、横堀伸一、丸山正、吉田尊雄
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜(2011/12)
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] tRNAから見た遺伝暗号の進化 (2011)
  • 著者名/発表者名: 横堀伸一
  • 学会等名: 第4回アストロバイオロジーネットワークワークショップ
  • 発表場所: 神戸(2011/11)
  • 年月日: 2011-11-27
• [学会発表] ミトコンドリアゲノムに基づく尾索動物の分子系統解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 大曽根祐、廣瀬裕一、和田洋、西川淳、倉林敦、山岸明彦、横堀伸一
  • 学会等名: 日本動物学会第82回年次大会
  • 発表場所: 旭川、北海道
  • 年月日: 2011-09-21
• [学会発表] Unique characteristics of ascidian mitochondrial tRNAs : Existence of 5-taurinometylyuridine-containing tRNAs involved in deciphering the non-universal genetic codes and an initiator tRNA corresponding to AUG codon (2011)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, T., K. Miyauchi, N. Shigi, A. Kondoh, N. Takeuchi, T. Suzuki, A. Yamagishi, S. Yokobori, & K. Watanabe.
  • 学会等名: RNA2011
  • 発表場所: Kyoto
• [学会発表] An approach to the origin of the genetic code table by inferring from variations in the extant genetic codes of animal mitochondria. (2011)
  • 著者名/発表者名: Watanabe, K., S. Yokobori, & T. Suzuki
  • 学会等名: Symposium on behalf of prof. Tom Raj Bhandary
  • 発表場所: Bangalore, India
• [学会発表] 尾索動物ミトコンドリア遺伝暗号の進化 (2011)
  • 著者名/発表者名: 横堀伸一、山岸明彦、渡辺公綱
  • 学会等名: 日本進化学会第13回年会
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] ミトコンドリアゲノムに基づく尾索動物の分子系統解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 大曽根祐、廣瀬裕一、和田洋、西川淳、倉林敦、山岸明彦、横堀伸一
  • 学会等名: 動物学会
  • 発表場所: 旭川、北海道
• [学会発表] tRNAから見た遺伝暗号の進化 (2011)
  • 著者名/発表者名: 横堀伸一
  • 学会等名: 第4回アストロバイオロジーネットワークワークショップ
  • 発表場所: 神戸
• [学会発表] 深海性二枚貝シロウリガイ類のミトコンドリアゲノム解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 小澤元希、島村繁、高木善弘、横堀伸一、丸山正、吉田尊雄
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] 尾索動物ミトコンドリア構造多様性の進化 (2010)
  • 著者名/発表者名: 大曽根佑、倉持祐吾、和田洋、倉林敦、広瀬裕一、西川淳、山岸明彦、横堀伸一
  • 学会等名: 第81回動物学会年会
  • 発表場所: 駒場
• [学会発表] 遺伝暗号の進化:ミトコンドリア遺伝情報系をモデルとして (2010)
  • 著者名/発表者名: 横堀伸一
  • 学会等名: 第3回アストロバイオロジーネットワーク・ワークショップ
  • 発表場所: 多摩
• [学会発表] ミトコンドリアゲノムに基づく尾索動物の分子系統解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 横堀伸一、大曽根祐、倉林敦、西川淳、広瀬裕一、山岸明彦
  • 学会等名: 日本動物学会年会
  • 発表場所: 静岡
  • 年月日: 2009-09-19
• [学会発表] Molecular phylogeny of Urochordata (Tunicata) based on complete mitochondrial genome sequences and 18S rRNA gene sequences (2009)
  • 著者名/発表者名: Yokobori, S., A.Kurabayashi, J.Nishikawa, Y.Ohsone, A.Yamagishi, E.Hirose
  • 学会等名: The 5th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Okinawa
  • 年月日: 2009-06-21
• [学会発表] Complete nucleotide sequences of mitochondrial genomes of two salps Ritteriella amboinensis and R.picteti. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ohsone, Y., H.Wada, J.Nishikawa, A.Kurabayashi, E.Hirose, A.Yamagishi, S.Yokobori
  • 学会等名: The 5th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Okinawa
  • 年月日: 2009-06-21
• [学会発表] Molecular phylogeny of Urochordata(Tunicata) based on complete mitochondrial genome sequences and 18S rRNA gene sequences (2009)
  • 著者名/発表者名: Yokobori, S., A. Kurabayashi, J. Nishikawa, Y. Ohsone, A. Yamagishi, & E. Hirose.
  • 学会等名: The 5th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Okinawa
• [学会発表] Complete nucleotide sequences of mitochondrial genomes of two salps Ritteriella amboinensis and R. picteti (2009)
  • 著者名/発表者名: Ohsone, Y., H. Wada, J. Nishikawa, A. Kurabayashi, E. Hirose, A. Yamagishi, & S. Yokobori
  • 学会等名: The 5th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Okinawa
• [学会発表] ミトコンドリアゲノムに基づく尾索動物の分子系統解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 横堀伸一、大曽根祐、倉林敦、西川淳、広瀬裕一、山岸明彦
  • 学会等名: 第80回日本動物学会年会
  • 発表場所: 静岡