TGS誘導におけるAGO-siRNA複合体の標的DNA結合性の生化学的解析

• 研究課題/領域番号: 21570178
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 分子生物学
• 研究機関: 東京大学 (2010-2011); 早稲田大学 (2009)
• 研究代表者: 石田 尚臣 東京大学, 医科学研究所, 特任准教授 (80293447)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円); 2011年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2010年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2009年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: 転写 / TGS / Gene Silencing / Argonaute / epigenetics / siRNA / アルゴノート / 転写調節 / gene silencing / HIV

研究概要

研究代表者らの研究グループはこれまでにHIVプロモーター領域に設定したsiRNAがウイルスの複製を抑制する事を明らかにし、またその抑制活性は転写抑制(TGS)にある事を証明してきた。siRNAによる転写抑制はAGO1-siRNA複合体形成にある事を証明し、その複合体は直接標的DNAに結合しうる事を証明した。この配列結合性は、来はめて特異性が高い事を明らかにし、またその結合は、siRNA,HIV-1(標的配列)の共存在下で認められる事を証明した。

研究成果

• [雑誌論文] Viral interference with host mRNA surveillance, the nonsense-mediated mRNA decay (NMD) pathway, through a new function of HTLV-1 Rex: implicationsfor retroviral replication. (2013)
  • 著者名/発表者名: Nakano K, Ando T, Yamagishi M, Yokoyama K, Ishida T, Ohsugi T, Tanaka Y, Brighty DW, Watanabe T.
  • 雑誌名: Microbes Infect.
• [雑誌論文] HIV-1-encoded antisense RNA suppresses viral replication for a prolonged period. (2012)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi-Ishihara M, Yamagishi M, Hara T, Matsuda Y, Takahashi R, Miyake A, Nakano K, Yamochi T, Ishida T, Watanabe T.
  • 雑誌名: Retrovirology. 巻: 9 ページ: 38-38
• [雑誌論文] Direct evidence of nuclear Argonaute distribution during transcriptional silencing links the actin cytoskeleton to nuclear RNAi machinery in human cells. (2012)
  • 著者名/発表者名: Ahlenstiel CL, Lim HG, Cooper DA, Ishida T, Kelleher AD, Suzuki K.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 40(4) ページ: 1579-95
• [雑誌論文] Transcriptional gene silencing of HIV-1 through promoter targeted RNA is highly specific. (2011)
  • 著者名/発表者名: Suzuki K, Ishida T, Yamagishi M, Ahlenstiel C, Swaminathan S, Marks K, Murray D, McCartney EM, Beard MR, Alexander M, Purcell DF, Cooper DA, Watanabe T, Kelleher AD.
  • 雑誌名: RNA Biol. 巻: 8(6) ページ: 1035-46
• [雑誌論文] SMYD3 interacts with HTLV-1 Tax and regulates subcellular localization of Tax. (2011)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto K, Ishida T, Nakano K, Yamagishi M, Yamochi T, Tanaka Y, Furukawa Y, Nakamura Y, Watanabe T.
  • 雑誌名: Cancer Sci. 巻: 102(1) ページ: 260-6
  • NAID: 10029289377
• [雑誌論文] Epigenetic alteration of the NF-κB-inducing kinase (NIK) gene is involved in enhanced NIK expression in basal-like breast cancer. (2010)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto M, Ito T, Shimizu T, Ishida T, Semba K, Watanabe S, Yamaguchi N, Inoue J.
  • 雑誌名: Cancer Sci. 巻: 101 ページ: 2391-7
  • NAID: 10027833532
• [雑誌論文] Inhibition of active HIV-1 replication by NF-kappaB inhibitor DHMEQ. (2010)
  • 著者名/発表者名: Miyake A, Ishida T, Yamagishi M, Hara T, Umezawa K, Watanabe T, Horie R.
  • 雑誌名: Microbes Infect. 巻: 12(5) ページ: 400-8
• [雑誌論文] Retroviral delivery of promoter-targeted shRNA induces long-term silencing ofHIV-1 transcription. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamagishi M, Ishida T, Miyake A, Cooper DA, Kelleher AD, Suzuki K, Watanabe T.
  • 雑誌名: Microbes Infect. 巻: 11(4) ページ: 500-8
• [学会発表] Promoter targeting small RNA suppresses HIV-1 infection in vivo. (2013)
  • 著者名/発表者名: Kazuo Suzuki, S Hattori, K Marks, C Ahlenstiel, M Millington, M Boyd, G Symonds, Takaomi Ishida, D Cooper, Seiji Okada, A Kelleher.
  • 学会等名: 20^<th> Conference on retroviruses and opportunistic infections 2013.
  • 発表場所: Atlanta, USA.
• [学会発表] Promoter targeting small RNA suppresses HIV-1 infection in vivo. (2013)
  • 著者名/発表者名: Kazuo Suzuki, S Hattori, K Marks, C Ahlenstiel, M Millington, M Boyd, G Symonds, Takaomi Ishida, D Cooper, Seiji Okada, A Kelleher.
  • 学会等名: 20th Conference on retroviruses and opportunistic infections 2013.
  • 発表場所: Atlanta, USA
• [学会発表] Kelleher and Toshiki Watanabe.The epigenetic regulation of HIV-1 virus gene expression (2012)
  • 著者名/発表者名: Takaomi Ishida, Kazuo Suzuki, Makoto Yamagishi, Ariko Miyake, David A Cooper, Anthony D.
  • 学会等名: Cold Sprimg Harbor retrovirus meeting.
  • 発表場所: New York, USA.
• [学会発表] Kelleher and Toshiki Watanabe The Epigenetic Regulation of HIV-1 Virus Gene Expression. (2012)
  • 著者名/発表者名: Takaomi Ishida, Kazuo Suzuki, Makoto Yamagishi, Ariko Miyake, David A Cooper, Anthony D.
  • 学会等名: Keystone Symposia, Frontiers HIV Pathogenesis, Therapy and Eradication
• [学会発表] プロモーター領域を標的とした siRNA はHIV-1 の増殖抑制を誘導する(in vovo の実験系による評価) (2012)
  • 著者名/発表者名: 鈴木一雄、服部真一郎、前田洋助、石田尚臣、David Cooper、岡田誠治、Anthony Kelleher.
  • 学会等名: 日本エイズ学会学術集会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] HIV-1 潜伏化の成立と維持における Polycomb group の機能解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 松田有加、山岸誠、小林美栄、原拓馬、石田尚臣、渡邉 俊樹
  • 学会等名: 日本ウイルス学会学術集会
  • 発表場所: 大阪
• [学会発表] HIV-1 由来 antisense RNA によるウイルス複製抑制メカニス〓 ムの解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小林(石原)美栄、 山岸誠、 松田有加、 中野和民、 矢持忠徳、 石田尚臣 、渡邉俊樹
  • 学会等名: 日本ウイルス学会学術集会
  • 発表場所: 大阪
• [学会発表] The epigenetic regulation of HIV-1 virus gene expression (2012)
  • 著者名/発表者名: Takaomi Ishida, Kazuo Suzuki, Makoto Yamagishi, Ariko Miyake, David A Cooper, Anthony D. Kelleher and Toshiki Watanabe.
  • 学会等名: Cold Spring Harbor retrovirus meeting.
  • 発表場所: New York, USA
• [学会発表] プロモーター領域を標的としたsiRNAはHIV-1の増殖抑制を誘導する（in vovoの実験系による評価） (2012)
  • 著者名/発表者名: 鈴木一雄、 服部真一郎、 前田洋助、石田尚臣、David Cooper、 岡田誠治、 Anthony Kelleher.
  • 学会等名: 日本エイズ学会学術集会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] HIV-1 由来新規 anisense RNA, ALe はウイルス増殖を抑制する (2011)
  • 著者名/発表者名: 小林美栄、山岸誠、原拓馬、松田有加、三宅在子、中野和民、石田尚臣、渡邉俊樹
  • 学会等名: 日本エイズ学会学術集会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] HIV-1由来新規anisense RNA, ALeはウイルス増殖を抑制する (2010)
  • 著者名/発表者名: 小林美栄、山岸誠、原拓馬、松田有加、三宅在子、中野和民、石田尚臣、渡邉俊樹
  • 学会等名: 日本エイズ学会
  • 発表場所: グランドプリンスホテル高輪ザ・プリンスさくらタワー東京(東京都)
  • 年月日: 2010-11-24
• [学会発表] The Epgenetic Regulation of HIV-1 virus Gene Expression. (2010)
  • 著者名/発表者名: Takaomi Ishida, Kazuo Suzuki, Makoto Yamagishi, David A Cooper, Anthony D. Lelleher, Kentaro Semba, Tadashi Yamamoto,Aikichi Iwamoto and Toshiki Watanabe.
  • 学会等名: The 7th Japan-China joint laboratory workshop pathogenesis, gene regulation, and signal transduction.
  • 発表場所: Beijing, China.
  • 年月日: 2010-10-25
• [学会発表] HIV-1 由来新規 antisense RNA, ALe の同定と機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 小林美栄、山岸誠、原拓馬、松田有加、三宅在子、中野和民、石田尚臣、渡邉俊樹
  • 学会等名: 日本ウイルス学会学術集会
  • 発表場所: 徳島
• [学会発表] ヒトPBMCを用いたHIV-1潜伏感染モデルの構築と解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 原拓馬, 松田有加, 山岸誠, 三宅在子, 石田尚臣, 渡邊俊樹
  • 学会等名: 日本エイズ学会学術集会
  • 発表場所: 名古屋(名古屋国際会議場)
  • 年月日: 2009-11-30
• [学会発表] HIV-1ゲノムアンチセンス鎖にコードするRNAの探索と機能解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 小林美栄, 原拓馬, 山岸誠, 三宅在子, 石田尚臣, 渡邊俊樹
  • 学会等名: 日本エイズ学会学術集会
  • 発表場所: 名古屋(名古屋国際会議場)
  • 年月日: 2009-11-30
• [学会発表] プロモーター領域をターゲットとしたshRNAにより特展的HIV-1 gene silence (2009)
  • 著者名/発表者名: 鈴木一雄, 石田尚臣, 山岸誠, Cooper David, Kelleher Anthony, 渡邊俊樹
  • 学会等名: 日本エイズ学会学術集会
  • 発表場所: 名古屋(名古屋国際会議場)
  • 年月日: 2009-11-28
• [学会発表] HIV-1潜伏化における Polycomb group の機能解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 山岸誠, 松田有加, 原拓馬, 三宅在子, 鈴木一雄, 石田尚臣, 渡邉俊樹
  • 学会等名: 日本ウイルス学会学術集会
  • 発表場所: 東京(都市センターホテル)
  • 年月日: 2009-10-25
• [学会発表] HIV-1にコードする antisonse RNAの新規探索と機能解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 小林美栄, 原拓馬, 山岸誠, 三宅在子, 石田尚臣, 渡邉俊樹
  • 学会等名: 日本ウイルス学会学術集会
  • 発表場所: 東京(都市センターホテル)
  • 年月日: 2009-10-25
• [学会発表] ヒトPBMCを用いたHIV-1潜伏感染モデルの構築と解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 原拓馬, 松田有加, 山岸誠, 三宅在子, 石田尚臣, 渡邉俊樹
  • 学会等名: 日本ウイルス学会学術集会
  • 発表場所: 東京(都市センターホテル)
  • 年月日: 2009-10-25
• [図書] 山梨裕司編集シグナル伝達キーワード (2012)
  • 著者名/発表者名: 山本雅、仙波憲太郎
  • 出版者: 羊土社