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オオムギ野生種におけるS遺伝子座領域のゲノム解析と認識決定因子の同定

研究課題

研究課題/領域番号 21580006
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 育種学
研究機関三重大学

研究代表者

掛田 克行  三重大学, 大学院・生物資源学研究科, 教授 (50221867)

連携研究者 小松田 隆夫  独立行政法人農業生物資源研究所, 基盤研究領域植物ゲノム研究ユニット, 上級研究員 (60370657)
研究期間 (年度) 2009 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2011年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2010年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2009年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワード自家不和合性 / イネ科 / S遺伝子 / ゲノム解析 / 自家不和合成
研究概要

オオムギ野生種(Hordeum bulbosum)は、独立二遺伝子座(SおよびZ)支配の自家不和合性を有している。本研究では、新たな花粉側S遺伝子候補を探索するため、雌ずい側S遺伝子の有力候補HPS10遺伝子周辺のゲノム塩基配列解析を行った。S1およびS3ハプロタイプから単離した当該ゲノム領域のクローンコンティグ(50kbおよび67kb)の全塩基配列を決定し、遺伝子の予測および発現解析を行った。その結果、HPS10遺伝子近傍にはハプロタイプ間で多型に富むゲノム領域が存在すること、また当該領域内に生殖器官で発現している遺伝子のあることが明らかとなった。さらに、上記のゲノムシーケンスデータを用いた花粉タンパク質のプロテオーム解析から、自家不和合性の認識因子として機能しうる推定タンパク質が新たに見出された。

報告書

(4件)
  • 2011 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2012 2011 2010 2009

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 7件) 学会発表 (15件)

  • [雑誌論文] Expression and functional analysis of the barley Nud gene using transgenic rice2011

    • 著者名/発表者名
      K. Kakeda, N. Ishihara, Y. Izumi, K. Sato, S. Taketa
    • 雑誌名

      Breeding Science

      巻: 61 ページ: 35-42

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書 2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Deletion mutations of the self-incompatibility(S) locus induced by gamma irradiation in a wild diploid species of sweet potato2010

    • 著者名/発表者名
      K. Kakeda, M. Tsutsumi, Y. Kowyama
    • 雑誌名

      Ipomoea trifida、JARQ

      巻: 44 ページ: 127-131

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Deletion mutations of the self-incompatibility (S) locus induced by gamma irradiation in a wild diploid species of sweet potato, Ipomoea trifida2010

    • 著者名/発表者名
      K.Kakeda
    • 雑誌名

      Jpn.Agr.Res.Qtr.(JARQ)

      巻: 44 ページ: 127-131

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular phylogeny of the genus Hordeum using thioredoxin-like gene sequences2009

    • 著者名/発表者名
      K. Kakeda, S. Taketa, T. Komatsuda
    • 雑誌名

      Breeding Science

      巻: 59 ページ: 595-601

    • NAID

      10025925016

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Slocus-linked F-box genes expressed in anthers of Hordeum bulbosum2009

    • 著者名/発表者名
      K. Kakeda
    • 雑誌名

      Plant Cell Reports

      巻: 28 ページ: 1453-1460

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] S locus-linked F-box genes expressed in anthers of Hordeum bulbosum2009

    • 著者名/発表者名
      K.Kakeda
    • 雑誌名

      Plant Cell Reports 28

      ページ: 1453-1460

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular phylogeny of the genus Hordeum using thioredoxin-like gene sequences2009

    • 著者名/発表者名
      K.Kakeda
    • 雑誌名

      Breeding Science 59

      ページ: 595-601

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] BSMV-VIGSによるオオムギNud遺伝子の発現抑制と皮裸性の変化2012

    • 著者名/発表者名
      掛田克行
    • 学会等名
      日本育種学会第121回講演会
    • 発表場所
      宇都宮市
    • 年月日
      2012-03-30
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] オオムギ野生種における雌蕊側S因子候補HPS10のin vitro花粉発芽阻害効果の検定2011

    • 著者名/発表者名
      橋本翔
    • 学会等名
      育種学会中部地区談話会第19回講演会
    • 発表場所
      津市
    • 年月日
      2011-12-10
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書 2011 研究成果報告書
  • [学会発表] BSMV-VIGSによるオオムギNud遺伝子の発現抑制と皮裸性の変化2011

    • 著者名/発表者名
      掛田克行
    • 学会等名
      日本育種学会第121回講演会
    • 発表場所
      福井市
    • 年月日
      2011-09-24
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] イネ科植物の受粉過程における二遺伝子座自家不和合性システム2010

    • 著者名/発表者名
      掛田克行
    • 学会等名
      日本分子生物学会第33回年会
    • 発表場所
      神戸市
    • 年月日
      2010-12-07
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書 2010 実績報告書
  • [学会発表] オオムギ属野生種におけるCly1ホモログの解析2010

    • 著者名/発表者名
      掛田克行
    • 学会等名
      日本育種学会第118回講演会
    • 発表場所
      秋田市
    • 年月日
      2010-09-25
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書 2010 実績報告書
  • [学会発表] Molecular and genomic analysis of the S locus region in wild barley, Hordeum bulbosum2010

    • 著者名/発表者名
      K. Kakeda
    • 学会等名
      11th International Congress on Sexual Plant Reproduction
    • 発表場所
      Bristol(UK)
    • 年月日
      2010-08-05
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Molecular and genomic analysis of the S locus region in wild barley, Hordeum bulbosum2010

    • 著者名/発表者名
      K.Kakeda
    • 学会等名
      11th International Congress on Sexual Plant Reproduction
    • 発表場所
      Bristol (U.K.)
    • 年月日
      2010-08-05
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Two-locus allorecognition system in the self-incompatibility of wild barley, Hordeum bulbosum2010

    • 著者名/発表者名
      K. Kakeda
    • 学会等名
      International Symposium Intercellular recognition and allogeneric authentication
    • 発表場所
      Nagoya
    • 年月日
      2010-01-14
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書 2009 実績報告書
  • [学会発表] オオムギ皮裸性遺伝子(Nud)を導入した形質転換イネの組織化学的解析2009

    • 著者名/発表者名
      石原倫光
    • 学会等名
      育種学会中部地区談話会第17回講演会
    • 発表場所
      静岡市
    • 年月日
      2009-12-05
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] オオムギ皮裸性遺伝子(Nud)のを導入した形質転換イネの組織化学的解析2009

    • 著者名/発表者名
      石原倫光
    • 学会等名
      育種学会中部地区談話会第17回講演会
    • 発表場所
      静岡
    • 年月日
      2009-12-05
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Comparative analysis of the S locus region in wild barley, Hordeum bulbosum2009

    • 著者名/発表者名
      K. Kakeda
    • 学会等名
      9th International Plant Molecular Biology Congress
    • 発表場所
      St. Louis(USA)
    • 年月日
      2009-10-28
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Comparative analysis of the S locus region in wild barley, Hordeum bulbosunz2009

    • 著者名/発表者名
      K.Kakeda
    • 学会等名
      9th International Plant Molecular Biology Congress
    • 発表場所
      St. Louis (USA)
    • 年月日
      2009-10-28
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] オオムギ属における穎花の開閉性に関する種間変異2009

    • 著者名/発表者名
      石原倫光
    • 学会等名
      日本育種学会第116回講演会
    • 発表場所
      札幌市
    • 年月日
      2009-09-25
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] オオムギ属における穎花の開閉性に関する種間変異2009

    • 著者名/発表者名
      石原倫光
    • 学会等名
      日本育種学会第116回講演会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2009-09-25
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Molecular phylogeny of the genus Hordeum using thioredoxin-like gene sequences2009

    • 著者名/発表者名
      K. Kakeda
    • 学会等名
      6th International Triticeae Symposium
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2009-06-01
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書 2009 実績報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2016-04-21  

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