ウシPNLIP DNA多型の検出および和牛脂肪交雑との相関解析

• 研究課題/領域番号: 21580347
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 応用動物科学
• 研究機関: 新潟大学
• 研究代表者: 山田 宜永 新潟大学, 自然科学系, 教授 (40253207)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円); 2011年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2010年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円); 2009年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
• キーワード: 家畜ゲノム / 脂肪交雑 / 原因遺伝子 / PNLIP / DNA多型 / SNP / 相関解析 / 候補遺伝子 / 黒毛和種 / 侯補遺伝子 / EDG1 / RPL27A / プロモーター / レポーターアッセイ

研究概要

ダイレクトシーケンスによるPNLIP遺伝子多型の検出およびPCR-RFLPによる多型タイピング法の確立を行うことで、rs41648172、rs41648176およびrs41648178 SNPが和牛集団の高脂肪交雑能力牛群と低能力牛群間でアリル頻度が異なることを示した。さらに、相関解析、品種間アリル頻度比較解析および既知脂肪交雑マーカーを同時に取り込んだ相関解析により、rs41648172 SNPが脂肪交雑向上を目指したDNA育種技術に有用なマーカーとなることを明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] Distribution of allele frequencies at TTN g. 231054C> T, RPL27A g. 3109537C> T and AKIRIN2 c. 188G> A between Japanese Black and four other cattle breeds with differing historical selection for marbling (2011)
  • 著者名/発表者名: N. Watanabe, Y. Satoh, T. Fujita, T. Ohta, H. Kose, Y. Muramatsu, T. Yamamoto, T. Yamada
  • 雑誌名: BMC Res. Notes 巻: 4 ページ: 10-10
  • NAID: 120006748892
  • 査読あり
• [雑誌論文] Quantitative trait gene responsible for intramuscular fat content in the rat (2011)
  • 著者名/発表者名: H. Tanomura, T. Yamamoto, Y. Muramatsu, T. Ohta, T. Yamada
  • 雑誌名: J. Anim. Vet. Adv. 巻: 10 ページ: 841-846
  • NAID: 120006748899
  • 査読あり
• [雑誌論文] Difference in PNLIP allele frequency distribution between high-marbled and low-marbled cattle (2011)
  • 著者名/発表者名: H. Tanomura, Y. Muramatsu, T. Yamamoto, T. Ohta, H. Kose, T. Yamada
  • 雑誌名: J. Anim. Vet. Adv. 巻: 10 ページ: 1714-1718
  • NAID: 120006748898
  • 査読あり
• [雑誌論文] The pancreatic lipase gene is associated with marbling in Japanese Black beef cattle (2011)
  • 著者名/発表者名: H. Tanomura, T. Yamamoto, Y. Muramatsu, T. Ohta, H. Kose, T. Yamada
  • 雑誌名: J. Anim. Vet. Adv. 巻: 10 ページ: 1719-1723
  • NAID: 120006748897
  • 査読あり
• [雑誌論文] Possible association of single nucleotide polymorphism in titin gene with growth-related trait in Japanese Black beef cattle (2011)
  • 著者名/発表者名: T. Yamada, S. Sasaki, S. Sukegawa, Y. Takahagi, M. Morita, H. Murakami, F. Morimatsu, T. Fujita
  • 雑誌名: J. Anim. Vet. Adv. 巻: 10 ページ: 2603-2606
  • NAID: 120006748896
  • 査読あり
• [雑誌論文] Distribution of allele frequencies at TTN g.231054C>T, RPL27A g.3109537C>T and AKIRJN2 c.*188G>A between Japanese Black and four other cattle breeds with differing historical selection for marbling (2011)
  • 著者名/発表者名: Watanabe N, Satoh Y, Fujita T, Ohta T, Kose H, Muramatsu Y, Yamamoto T, Yamada T
  • 雑誌名: BMC Research Notes 巻: 4 号: 1 ページ: 10-10
  • DOI: 10.1186/1756-0500-4-10
  • 査読あり
• [雑誌論文] Quantitative trait gene responsible for intramuscular fat content in the rat (2011)
  • 著者名/発表者名: Tanomura H, Yamamoto T, Muramatsu Y, Ohta T, Yamada T
  • 雑誌名: Journal of Animal and Veterinary Advances 巻: 10 号: 7 ページ: 841-846
  • DOI: 10.3923/javaa.2011.841.846
  • NAID: 120006748899
  • 査読あり
• [雑誌論文] Difference in PNLIP allele frequency distribution between high-marbled and low-marbled cattle (2011)
  • 著者名/発表者名: Tanomura H, Muramatsu Y, Yamamoto T Ohta T, Kose H, Yamada T
  • 雑誌名: Journal of Animal and Veterinary Advances 巻: 10 号: 13 ページ: 1714-1718
  • DOI: 10.3923/javaa.2011.1714.1718
  • NAID: 120006748898
  • 査読あり
• [雑誌論文] The pancreatic lipase gene is associated with marbling in Japanese Blackbeef cattle (2011)
  • 著者名/発表者名: Tanomura H, Yamamoto T, Muramatsu Y, Ohta T, Kose H, Yamada T
  • 雑誌名: Journal of Animal and Veterinary Advances 巻: 10 号: 13 ページ: 1719-1723
  • DOI: 10.3923/javaa.2011.1719.1723
  • NAID: 120006748897
  • 査読あり
• [雑誌論文] Possible association of single nucleotide polymorphism in titin gene with growth-related trait in Japanese Black beef cattle (2011)
  • 著者名/発表者名: Yamada T, Sasaki S, Sukegawa S, Takahagi Y, Morita M, Murakami H, Morimatsu F, Fujita T
  • 雑誌名: Journal of Animal and Veterinary Advances 巻: 10 号: 19 ページ: 2603-2606
  • DOI: 10.3923/javaa.2011.2603.2606
  • NAID: 120006748896
  • 査読あり
• [雑誌論文] Replicated association of the single nucleotide polymorphism in EDG1 with marbling in three general populations of Japanese Black beef cattle (2010)
  • 著者名/発表者名: S. Sukegawa, T. Miyake, Y. Takahagi, H. Murakami, F. Morimatsu, T. Yamada, Y. Sasaki
  • 雑誌名: BMC Res. Notes 巻: 3 ページ: 66-66
  • NAID: 120006748891
  • 査読あり
• [雑誌論文] The T allele at the g. 1471620G> T in the EDG1 gene associated with high marbling in Japanese Black cattle is at a low frequency in breeds not selected for marbling (2010)
  • 著者名/発表者名: N. Watanabe, T. Yamada, S. Yoshioka, M. Itoh, Y. Satoh, M. Furuta, S. Komatsu, Y. Sumio, T. Fujita, Y. Sasaki
  • 雑誌名: Anim. Sci. J. 巻: 81 ページ: 142-144
  • NAID: 10027888890
  • 査読あり
• [雑誌論文] Association study on marbling trait in Japanese Black beef cattle, based on extrapolation from rat study (2010)
  • 著者名/発表者名: Y. Muramatsu, T. Yamada
  • 雑誌名: Res. Adv. Anim. Sci. 巻: 1 ページ: 1-8
• [雑誌論文] 佐賀県黒毛和種牛におけるAkirin2遺伝子の1塩基置換と枝肉形質との関連性 (2010)
  • 著者名/発表者名: 林田瑠美子, 前田友香, 片渕直人, 大坪利豪, 山田宜永, 佐々木義之, 和田康彦
  • 雑誌名: 日暖畜報 巻: 53 ページ: 51-56
  • NAID: 130004555622
  • 査読あり
• [雑誌論文] The T allele at the g.1471620G>T in the EDGI gene associated with high marbling in Japanese Black cattle is at a low frequency in breeds not selected for marbling. (2010)
  • 著者名/発表者名: Watanabe, et al.
  • 雑誌名: Anim.Sci.J. 巻: 81 ページ: 142-144
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characteristics of proliferation and differentiation-dependent C/EBP. PPARy and leptm gene expression patterns intrinsic to bovine mtramuscular, penrenal and subcutaneous preadipocytes. (2010)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, et al.
  • 雑誌名: J.Anim.Vet.Adv. 巻: 9 ページ: 1639-1645
  • 査読あり
• [雑誌論文] Replicated association of the single nucleotide polymorphism in EDG1 with marbling in three general populations of Japanese Black beef cattle. (2010)
  • 著者名/発表者名: Sukegawa, et al.
  • 雑誌名: BMC Res.Notes 巻: 3 ページ: 66-66
  • 査読あり
• [雑誌論文] Association of a single nucleotide polymorphism in ribosomal protein L27a gene with marbling in Japanese Black beef cattle (2009)
  • 著者名/発表者名: T. Yamada, S. Sasaki, S. Sukegawa, T. Miyake, T. Fujita, H. Kose, M. Morita, Y. Takahagi, H. Murakami, F. Morimatsu, Y. Sasaki
  • 雑誌名: Anim. Sci. J. 巻: 80 ページ: 631-635
  • NAID: 10027887826
  • 査読あり
• [雑誌論文] Association of a single nucleotide polymorphism in akirin2 gene with marbling in Japanese Black beef cattle (2009)
  • 著者名/発表者名: S. Sasaki, T. Yamada, S. Sukegawa, T. Miyake, T. Fujita, M. Morita, T. Ohta, Y. Takahagi, H. Murakami, F. Morimatsu, Y. Sasaki
  • 雑誌名: BMC Res. Notes 巻: 2 ページ: 131-131
  • NAID: 120006748890
  • 査読あり
• [雑誌論文] Association of a single nucleotide polymorphism in titin gene with marbling in Japanese Black beef cattle (2009)
  • 著者名/発表者名: T. Yamada, S. Sasaki, S. Sukegawa, S. Yoshioka, Y. Takahagi, M. Morita, H. Murakami, F. Morimatsu, T. Fujita, T. Miyake, Y. Sasaki
  • 雑誌名: BMC Res. Notes 巻: 2 ページ: 78-78
  • NAID: 120006748889
  • 査読あり
• [雑誌論文] Association of single nucleotide polymorphisms in the endothelial differentiation sphingolipid G-protein-coupled receptor 1 gene with marbling in Japanese Black beef cattle (2009)
  • 著者名/発表者名: T. Yamada, M. Itoh, S. Nishimura, Y. Taniguchi, T. Miyake, S. Sasaki, S. Yoshioka, T. Fujita, K. Shiga, M. Morita, Y. Sasaki
  • 雑誌名: Anim. Genet. 巻: 40 ページ: 209-216
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel SNP in 5' flanking region of EDG1 associated with marbling in Japanese Black beef cattle (2009)
  • 著者名/発表者名: T. Yamada, S. Sasaki, S. Sukegawa, T. Miyake, T. Fujita, H. Kose, M. Morita, Y. Takahagi, H. Murakami, F. Morimatsu, Y. Sasaki
  • 雑誌名: Anim. Sci. J. 巻: 80 ページ: 486-489
  • NAID: 10027887239
  • 査読あり
• [雑誌論文] The G allele at the c.-312A> G in the EDG1 gene associated with high marbling in Japanese Black cattle is at a low frequency in breeds not selected for marbling (2009)
  • 著者名/発表者名: N. Watanabe, S. Yoshioka, M. Itoh, Y. Satoh, M. Furuta, S. Komatsu, Y. Sumio, T. Fujita, T. Yamada, Y. Sasaki
  • 雑誌名: Anim. Genet. 巻: 40 ページ: 579-579
  • 査読あり
• [雑誌論文] 佐賀県黒毛和種牛におけるEDG1遺伝子の1塩基置換と枝肉形質との関連性 (2009)
  • 著者名/発表者名: 和田康彦, 林田瑠美子, 礒兼妙子, 片渕直人, 大坪利豪, 山田宜永, 佐々木義之
  • 雑誌名: 日暖畜報 巻: 52 ページ: 37-41
  • 査読あり
• [雑誌論文] Association of single nucleotide polymorphisms in the endothelial differentiation sphingolipid G-protein-coupled receptor 1 gene with marbling in Japanese Black beef cattle. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamada, et al.
  • 雑誌名: Animal Genetics 40 ページ: 209-216
  • 査読あり
• [雑誌論文] Association of a single nucleotide polymorphism in titin gene with marbling in Japanese Black beef cattle. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamada, et al.
  • 雑誌名: BMC Research Notes 2 ページ: 78-78
  • NAID: 120006748889
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel SNP in 5' flanking region of EDG1 associated with marbling in Japanese Black beef cattle. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamada, et al.
  • 雑誌名: Animal Science Journal 80 ページ: 486-489
  • NAID: 10027887239
  • 査読あり
• [雑誌論文] Association of single nucleotide polymorphism in pancreatic lipase gene with growth-related traits in Japanese Black beef cattle
  • 著者名/発表者名: H. Tanomura, Y. Muramatsu, T. Yamamoto, T. Ohta, H. Kose, T. Yamada
  • 雑誌名: J. Anim. Vet. Adv. 巻: (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Distribution of allele frequency at PNLIP rs41648172 between Japanese Black and four other cattle breeds with differing historical selection for marbling
  • 著者名/発表者名: H. Tanomura, Y. Muramatsu, T. Yamamoto, T. Ohta, H. Kose, T. Yamada
  • 雑誌名: J. Anim. Vet. Adv. 巻: (in press)
  • 査読あり
• [学会発表] 新潟県黒毛和種集団における脂肪交雑関連EDG1多型のアリル頻度分布 (2012)
  • 著者名/発表者名: 福家成美,日水唯衣,山田宜永,波田野雅人,小林英和,加藤博幸
  • 学会等名: 第50回北信越畜産学会新潟県分会
  • 発表場所: 新潟市
  • 年月日: 2012-03-16
• [学会発表] OLETFラットを用いた筋肉内脂肪蓄積に関わる遺伝子の探索:ポジショナルキャンディデートの探索 (2011)
  • 著者名/発表者名: 田之村秀樹,山本卓司,村松陽治,山田宜永
  • 学会等名: 第60回北信越畜産学会大会
  • 発表場所: 長野市
  • 年月日: 2011-11-11
• [学会発表] OLETFを用いた筋肉内脂肪蓄積に関わる遺伝子の探索:ポジショナルキャン.ギイデートの探索 (2011)
  • 著者名/発表者名: 田之村, ら
  • 学会等名: 第50回北信越畜産学会新潟県分会
  • 発表場所: 新潟大学
  • 年月日: 2011-03-17
• [学会発表] Association of single nucleotide polymorphisms in Pnlip with marbling in Japanese Black beef cattle. (2009)
  • 著者名/発表者名: Muramatsu, Yamada, et al.
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2009-12-11