ヒト遺伝子ノックアウトによるDNA鎖切断修復機構の解析とその応用研究

• 研究課題/領域番号: 21590066
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生物系薬学
• 研究機関: 横浜市立大学
• 研究代表者: 足立 典隆 横浜市立大学, 生命ナノシステム科学研究科, 教授 (30264675)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2011年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円); 2010年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2009年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: 遺伝子ノックアウト / DNA鎖切断 / エンドジョイニング / 組換え / NDA鎖切断

研究概要

ヒトNalm-6細胞を用いて、DNA鎖切断修復に関わる遺伝子をジーンターゲティング法により破壊し、さまざまなヒト遺伝子ノックアウト細胞を系統的に作製した。これらの細胞株について詳細な表現型解析(特に放射線感受性や抗癌剤感受性、組換え頻度の解析)を行い、遺伝子機能や修復機構に関する多くの興味深い知見を得ることができた。

研究成果

• [雑誌論文] EDGF/pisindependent HIV-l repli cation demonstrates a role for HRP-2 and remains sensitive to inhibition by LEDGINs (2012)
  • 著者名/発表者名: Schrijvers R, De Rijck J, Demeu lemeester J, Adachi N, Vets S, Ronen K, Christ F, Bushman FD, Debyser Z, Gt jsbers R.
  • 雑誌名: PLoS Pathog 巻: 8 ページ: 1002558-1002558
• [雑誌論文] Nucleofection-based gene targeting in human pie-B cells (2012)
  • 著者名/発表者名: Kurosawa A, Saito S, Mort M, Adachi N.
  • 雑誌名: Gene 巻: 492 ページ: 305-308
• [雑誌論文] Impaired cell adhesion, apoptosis, and signaling in WASP genedisrupted Nalm-6 pie-B cells and recovery of cell adhesion using a transducible form of WASp (2012)
  • 著者名/発表者名: Sate R, Iiizumi S, Kim ES, Honda F, Lee SK, Adachi N, Koyama H, Mizutani S, Morie T.
  • 雑誌名: Int J Hematol 巻: 95 ページ: 299-310
• [雑誌論文] The helicase domain and C-terminus of human RecQL4 facilitate replication elongation on DNA templates damaged by ionizing radiation (2012)
  • 著者名/発表者名: Adachi N., et al
  • 雑誌名: Carcinogenesis 巻: (印刷中)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nucleofection-based gene targeting in human pre-B cells (2012)
  • 著者名/発表者名: Kurosawa A, Adachi N
  • 雑誌名: Gene 巻: 492 ページ: 305-308
  • 査読あり
• [雑誌論文] LEDGF/p75-independent HIV-1 replication demonstrates a role for HRP-2 and remains sensitive to inhibition by LEDGINs (2012)
  • 著者名/発表者名: Adachi N., et al
  • 雑誌名: PLoS Pathogens 巻: 8
  • 査読あり
• [雑誌論文] Highefficiency gene tar geting in a human pie-B cell line : towards the human gene knockout project (2010)
  • 著者名/発表者名: Adachi N.
  • 雑誌名: Genome Biol 巻: 11 ページ: 1-1
• [雑誌論文] Functions and regulation of Artemis : A goddess in the maintenance of genome integrity (2010)
  • 著者名/発表者名: Kurosawa A, Adachi N.
  • 雑誌名: J Radiat Res 巻: 51 ページ: 503-509
  • NAID: 10026644156
• [雑誌論文] OGFODl, a member of the 2oxoglutarate and iron dependent dioxygenase family, functions in ischemic signaling (2010)
  • 著者名/発表者名: Saito K, Adachi N, Koyama H, Matsushita M.
  • 雑誌名: FEBS Left 巻: 584 ページ: 3340-3347
• [雑誌論文] Chromosomal manipulation by sitespecific recombinases and fluore scent protein-based vectors (2010)
  • 著者名/発表者名: Uemura M, Niwa Y, Kakazu N, Adachi N, Kinoshita K.
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 5 ページ: 9846-9846
• [雑誌論文] FENl functions in long patch base excision repair under conditions of oxidative stress in vertebrate cells (2010)
  • 著者名/発表者名: Asagoshi K, Tana K, Chastain PD II, Adachi N, Sonoda E, Kikuchi K, Koyama H, NagataK, Kaufman DG, Takeda S, Wilson SH, Watanabe M, Swenberg JA, Nakamura J.
  • 雑誌名: Mol Cancer Res 巻: 8 ページ: 204-215
• [雑誌論文] Functions and regulation of Artemis : A goddess in the maintenance of genome integrity. (2010)
  • 著者名/発表者名: Kurosawa A, Adachi N.
  • 雑誌名: J.Radiat.Res. 巻: 51 ページ: 503-509
  • NAID: 10026644156
  • 査読あり
• [雑誌論文] OGFOD1, a member of the 2-oxoglutarate and iron dependent dioxygenase family, functions in ischemic signaling. (2010)
  • 著者名/発表者名: Saito K., et al.
  • 雑誌名: FEBS Lett. 巻: 584 ページ: 3340-3347
  • 査読あり
• [雑誌論文] Chromosomal manipulation by site-specific recombinases and fluorescent protein-based vectors (2010)
  • 著者名/発表者名: Adachi, N., et al.
  • 雑誌名: PLoS ONE 5
  • 査読あり
• [雑誌論文] FEN1 functions in long patch base excision repair under conditions of oxidative stress in vertebrate cells (2010)
  • 著者名/発表者名: Adachi, N., et al.
  • 雑誌名: Mol.Cancer Res. 8 ページ: 204-215
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functions and regulation of Artemis : A goddess in the maintenance of genome integrity (2010)
  • 著者名/発表者名: Kurosawa, A., Adachi, N.
  • 雑誌名: J.Radiat.Res. 51(印刷中)
  • NAID: 10026644156
  • 査読あり
• [雑誌論文] The iron chelator Dp44mT causes DNA damage and selective inhibition of topoisomer ase-Ilalpha in breast cancer cells (2009)
  • 著者名/発表者名: Rae VA, Klein SR, Agama KK, Toyoda E, Adachi N, Pommier YG, Shacter EB.
  • 雑誌名: Cancer Res 巻: 69 ページ: 948-957
• [雑誌論文] Loss of Bloom syndrome protein destabilizes human gene cluster architecture (2009)
  • 著者名/発表者名: Killen MW, Stults DM, Adachi N, Hanakahi L, Pierce AJ.
  • 雑誌名: Hum Mol Genet 巻: 18 ページ: 3417-3428
• [雑誌論文] Genetic evidence that the nonhomologous endjoining repair pathway is involved in LINE retro transposition (2009)
  • 著者名/発表者名: Suzuki J, Yamaguchi K, Kajikawa M, Ichiyanagi K, Adachi N, Koyama H, Takeda S, Okada N.
  • 雑誌名: PLoS Genetics 巻: 5 ページ: 1000461-1000461
• [雑誌論文] Topoisomerase Ilalpha inhib ition following DNA transfection greatly enhances random integration in a human pie-B lymphocyte cell line (2009)
  • 著者名/発表者名: Toyoda E, Kurosawa A, Kamekawa H, Adachi N.
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun 巻: 382 ページ: 492-496
• [雑誌論文] Heterozygous disruption of the DNA topoisomerase I gene confers cellular resistance to camptothecin in human cells (2009)
  • 著者名/発表者名: Toyoda E, Kurosawa A, Fu j i i M, Adachi N.
  • 雑誌名: Biol Pharm Bull 巻: 32 ページ: 724-727
  • NAID: 110007160669
• [雑誌論文] Molecular mechanism of protein assembly on DNA double strand breaks in the nonhomologous endjoining pathway (2009)
  • 著者名/発表者名: Yano K, Morotomi-Yano K, Adachi N, Akiyama H.
  • 雑誌名: J Radiat Res 巻: 50 ページ: 97-108
  • NAID: 10025911271
• [雑誌論文] Model for MLL translocations in therapyrelated leukemia involving topoisomerase Ilbeta mediated DNA strand breaks and gene proximity
  • 著者名/発表者名: DCowell IG, Sondka Z, Smith K, Lee KC, Manville CM, SidorczukLesthuruge M, Rance HA, Padget K, Jackson GH, Adachi N, Austin CA.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci USA 巻: (in press)
• [雑誌論文] The helicase domain and Cterminus of human RecQL4 facilitate replication elongation on DNA templates damaged by ionizing radiation
  • 著者名/発表者名: Kohzaki M, Chiourea M, Versini G, Adachi N, Takeda S, Gages S, Halazonetis TD.
  • 雑誌名: Carcinogenesis 巻: (in press)
• [雑誌論文] Artemis Cterminal region facilitates efficient V(D) J recombination through its interaction with both DNA Ligase IV and DNA-PKcs
  • 著者名/発表者名: Malu S, De loannes P, Kozlov M, Greene M, Francis, D, Hanna M, Pena, J, Escalante CR, Kurosawa A, ErdjumentBromage H, Tempst P, Adachi N, Vezzoni P, Villa A, Aggarwal AK, Certes P.
  • 雑誌名: J Exp Med 巻: (in press)
• [備考]
  • URL: http://dnar.sci.yokohama-cu.ac.jp/