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大量SNPデータの血縁関係判定への応用

研究課題

研究課題/領域番号 21590746
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 法医学
研究機関東海大学

研究代表者

大澤 資樹  東海大学, 医学部, 教授 (90213686)

研究分担者 木村 亮介  琉球大学, 亜熱帯島嶼科学超域研究推進機構, 特命准教授 (00453712)
連携研究者 稲岡 斉彦  東海大学, 医学部, 助教 (50564689)
研究期間 (年度) 2009 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2011年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2010年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2009年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワード親子鑑定 / DNA多型 / SNP / マイクロアレイ / 遺伝子
研究概要

血縁関係判定の目的に、STR多型15座位を解析する系が採用されてきたが、同胞関係でも有意の結果を得ることは容易でない。そこで、マイクロアレイ技術を用いた大量SNPデータから血縁関係を証明することを試みた。SNPにおいては、全解析座位におけるIBDの割合を基にした判定指数が適当で、連鎖不平衡値と稀アリル頻度の条件を設定した。非血縁者と分離するために必要な最小座位数は、同胞間で500、第二度近親で数千程度と推定した。

報告書

(4件)
  • 2011 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (30件)

すべて 2011 2010 2009 その他

すべて 雑誌論文 (13件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (17件)

  • [雑誌論文] IBS値に基づく血縁関係解析法の実用性2011

    • 著者名/発表者名
      田村友紀, 木村亮介, 稲岡斉彦, 田中佐知, 佐藤文子, 佐藤至, 大澤資樹
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 19 ページ: 179-184

    • NAID

      10029668842

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] DNAチップを用いたSNP解析による二者間の血縁関係判定2011

    • 著者名/発表者名
      稲岡斉彦, 田嶋敦, 田村友紀, 田中佐知, 佐藤文子, 筒井健太, 佐藤至, 大澤資樹
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 19 ページ: 164-168

    • NAID

      10029668815

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Kinship analysis based on SNP data from microarray assay2011

    • 著者名/発表者名
      Inaoka Y, Tajima A, Tamura T, Satoh F, Osawa M
    • 雑誌名

      Forensic Sci Int. Genetics

      巻: 3(1)

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Re-evaluation of the identical-by-state method in pairwise kinship inference2011

    • 著者名/発表者名
      Tamura T, Osawa M, Inaoka Y, Tanaka S, Satoh F, Nakamura T
    • 雑誌名

      Forensic Sci Int. Genetics

      巻: 3(1)

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Postmortem molecular analysis to SIDS victims2011

    • 著者名/発表者名
      Osawa M, Inaoka Y, Hasegawa I, Satoh F
    • 雑誌名

      Forensic Sci Int. Genetics

      巻: 3(1)

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Postmortem molecular analysis to SIDS victims2011

    • 著者名/発表者名
      Osawa M, Inaoka Y, Hasegawa I, Satoh F
    • 雑誌名

      Forensic Science International : Genetics

      巻: 3(1) 号: 1 ページ: e263-e264

    • DOI

      10.1016/j.fsigss.2011.08.128

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Kinship analysis based on SNP data from microarray assay2011

    • 著者名/発表者名
      Inaoka Y, Tajima A, Tamura T, Satoh F, Osawa M
    • 雑誌名

      Forensic Science International : Genetics

      巻: 3(1) 号: 1 ページ: e275-e276

    • DOI

      10.1016/j.fsigss.2011.08.134

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Re-evaluation of the identical-by-state method in pairwise kinship inference2011

    • 著者名/発表者名
      Tamura T, Osawa M, Inaoka Y, Tanaka S, Satoh F, Nakamura T
    • 雑誌名

      Forensic Science International : Genetics

      巻: 3(1) 号: 1 ページ: e244-e245

    • DOI

      10.1016/j.fsigss.2011.08.121

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] IdentifilerシステムでのIBS法による血縁関係解析2010

    • 著者名/発表者名
      大澤資樹, 田村友紀, 木村亮介, 稲岡斉彦, 早田慈, 長谷川巖, 佐藤文子, 佐藤至
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 18 ページ: 152-156

    • NAID

      10029668214

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] A common variation in EDAR is a genetic determinant of shovel-shaped incisors2009

    • 著者名/発表者名
      Kimura R, Yamaguchi T, Takeda M, Kondo O, Toma T, Haneji K, Hanihara T, Matsukusa H, Kawamura S, Maki K, Osawa M, Ishida H, Oota H
    • 雑誌名

      Am J Hum Genet

      巻: 85(4) ページ: 528-535

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 集団頻度情報を用いないゲノムワイドなSNPタイピングによる親縁係数の推定2009

    • 著者名/発表者名
      木村亮介, 大澤資樹
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 17 ページ: 14-17

    • NAID

      10025754017

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Evaluation of the allele-sharing approach, known as the IBS method, in kinship analysis the allele-sharing approach, known as the IBS method

    • 著者名/発表者名
      Tamura T, Osawa M, Kimura R, Inaoka Y, Tanaka S, Satoh F, Sato I
    • 雑誌名

      Forensic Leg Med

      巻: (in press)

    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evaluation of the allele-sharing approach, known as the IBS method, in kinship analysis

    • 著者名/発表者名
      Tamura T., Osawa M., Inaoka S, Kimura R., et al.
    • 雑誌名

      Journal of Forensic and Legal Medicine

      巻: (in press)

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 同胞関係推定におけるIBS値の応用2011

    • 著者名/発表者名
      田村友紀、大澤資樹、稲岡斉彦、田中佐知、佐藤文子
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第20回学術集会
    • 発表場所
      横浜、はまぎんホール
    • 年月日
      2011-12-02
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ABO式血液型におけるDNA検査による遺伝子型判定法の比較2011

    • 著者名/発表者名
      稲岡斉彦, 筒井健太, 中西亜由美, 坪井秋男, 瀬戸良久, 長谷川巖, 佐藤文子, 大澤資樹
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第20回学術集会
    • 発表場所
      はまぎんホール(横浜市)
    • 年月日
      2011-12-01
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Kinship analysis based on SNP data from microarray assay2011

    • 著者名/発表者名
      Inaoka Y, Tajima A, Tamura T, Satoh F, Osawa M
    • 学会等名
      24^<th> World Congress of the International Society for Forensic Genetics
    • 発表場所
      University of Vienna, Vienna, Austria(招待講演)
    • 年月日
      2011-09-01
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Postmortem molecular analysis to SIDS victims2011

    • 著者名/発表者名
      Osawa M, Inaoka Y, Hasegawa I, Satoh F
    • 学会等名
      24^<th> World Congress of the International Society for Forensic Genetics
    • 発表場所
      Vienna, Austria
    • 年月日
      2011-08-31
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Postmortem molecular analysis to SIDS victims2011

    • 著者名/発表者名
      Osawa M, Inaoka Y, Hasegawa I, Satoh F
    • 学会等名
      24^<th> World Congress of the International Society for Forensic Genetics
    • 発表場所
      University of Vienna, Vienna, Austria
    • 年月日
      2011-08-31
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Kinship analysis based on SNP data from microarray assay2011

    • 著者名/発表者名
      Inaoka Y, Tajima A, Tamura T, Satoh F, Osawa M
    • 学会等名
      24^<th> World Congress of the International Society for Forensic Genetics
    • 発表場所
      Vienna, Austria
    • 年月日
      2011-08-30
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Re-evaluation of the identical-by-state method in pairwise kinship inference2011

    • 著者名/発表者名
      Tamura T, Osawa M, Inaoka Y, Tanaka S, Satoh F, Nakamura T
    • 学会等名
      24^<th> World Congress of the International Society for Forensic Genetics
    • 発表場所
      Vienna, Austria
    • 年月日
      2011-08-30
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] 原因不明の突然死に対する死後遺伝子解析2010

    • 著者名/発表者名
      大澤資樹
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第19回学術集会・シンポジウム
    • 発表場所
      三島市民文化会館(静岡県)
    • 年月日
      2010-11-19
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] IBS値に基づく血縁関係解析法の実用性2010

    • 著者名/発表者名
      田村友紀, 木村亮介, 稲岡斉彦, 田中佐知, 佐藤文子, 佐藤至, 大澤資樹
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第19回学術集会
    • 発表場所
      三島市民文化会館(三島市)
    • 年月日
      2010-11-18
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] STR多型解析からの二者間血縁関係判定におけるIBS評価法2010

    • 著者名/発表者名
      大澤資樹、田村友紀、木村亮介、稲岡斉彦、田中佐知、早田慈、長谷川巌、佐藤文子、佐藤至
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第55回大会日本人類遺伝学会第55回大会
    • 発表場所
      大宮ソニックシティ(さいたま市)
    • 年月日
      2010-10-28
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] STR多型解析からの二者間血縁関係判定におけるIBS評価法2010

    • 著者名/発表者名
      大澤資樹
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第55回大会
    • 発表場所
      大宮ソニックシティ(埼玉県)
    • 年月日
      2010-10-28
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Postmortem molecular analysis of sudden deaths from unknown causes2010

    • 著者名/発表者名
      Osawa M
    • 学会等名
      BIT's 1st Annual World Congress of Forensics
    • 発表場所
      Dalian Bayshore Hotel, Dalian, China
    • 年月日
      2010-10-23
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] IdentifilerシステムでのIBS法による血縁関係解析2009

    • 著者名/発表者名
      大澤資樹
    • 学会等名
      日本DNA多型学会
    • 発表場所
      久留米大学医学部(福岡県)
    • 年月日
      2009-11-20
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 個人識別におけるAmpFlSTR Identifiler Kitを用いたSTR解析の有用性2009

    • 著者名/発表者名
      田村友紀, 大澤資樹, 田村佐和, 木村亮介, 稲岡斉彦, 早田慈, 山本佳世, 石割敦也, 鈴木隆徳, 佐藤至
    • 学会等名
      日本法科学技術学会第15回学術集会
    • 発表場所
      ホテルフロラシオン青山(東京都)
    • 年月日
      2009-11-12
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] IdentifilerシステムでのIBS法による血縁関係解析2009

    • 著者名/発表者名
      大澤資樹, 田村友紀, 木村亮介, 稲岡斉彦, 早田慈, 長谷川巖, 佐藤文子, 佐藤至
    • 学会等名
      日本DNA多型学会第18回学術集会
    • 発表場所
      久留米大学医学部筑水会館(久留米市)
    • 年月日
      2009-10-28
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] Evaluation of the IBS method in relationship analysis from short tandem repeat data2009

    • 著者名/発表者名
      Osawa M, Kimura R, Tamura T, Soda M, Satoh F, Hasegawa I, Sato I
    • 学会等名
      The American Society of Human Genetics 59th annual meeting
    • 発表場所
      Hawaii Convention Center, Honolulu, USA
    • 年月日
      2009-10-22
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書
  • [学会発表] A nonsynonymous SNP in EDAR is associated with tooth shoveling2009

    • 著者名/発表者名
      Kimura R, Yamaguchi Y, Maki K, Takeda M, Kondo O, Hanihara T, Osawa M, Ihida H, Kawamura S, Oota H
    • 学会等名
      The American Society of Human Genetics 59th Annual Meeting
    • 発表場所
      Hawaii Convention Center, Honolulu, USA
    • 年月日
      2009-10-22
    • 関連する報告書
      2011 研究成果報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2016-04-21  

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