白血病ゲノム異常の統合的解明

• 研究課題/領域番号: 21591217
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 血液内科学
• 研究機関: 自治医科大学
• 研究代表者: 山下 義博 自治医科大学, 医学部, 准教授 (10326861)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2011年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2010年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2009年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
• キーワード: 急性骨髄性白血病 / Blast Bank / ゲノムリシークエンス / 染色体構造異常 / miRNA / 体細胞変異 / アレイCGH

研究概要

我々は効率の良いゲノミクス解析を行うことを目的として、急性骨髄性白血病(AML)症例を含む様々な白血病類縁疾患の患者骨髄より造血幹細胞のみを純化保存する大規模検体収集事業「Blast Bank」を設立した。本研究において我々はBlast BankのAML検体の中から、核型や治療反応性などの臨床情報が整備された99例からなる「標準検体セット」を選び出し、これらに対して網羅的なゲノミクス解析を行い、新たながん遺伝子の同定を目指すと共に、真に治療反応性にリンクする遺伝子の同定を行った。

研究成果

• [雑誌論文] High-throughput resequencing of target-captured cDNA in cancer cells (2012)
  • 著者名/発表者名: Ueno, T., Yamashita, Y., et al.(全9名、第2著者)
  • 雑誌名: Cancer science 巻: 103 号: 1 ページ: 131-135
  • DOI: 10.1111/j.1349-7006.2011.02105.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Oncogenic MAP2K1 mutations in human epithelial tumors (2012)
  • 著者名/発表者名: Choi, Y. L., Soda, M., et al.(全11名、第10著者)
  • 雑誌名: Carcinogenesis 巻: 33 号: 5 ページ: 956-961
  • DOI: 10.1093/carcin/bgs099
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ex vivo expansion of human CD8+T cells using autologous CD4+T cell help (2012)
  • 著者名/発表者名: Butler, M. O., Imataki, O., et al.(全13名、第3著者)
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 7 号: 1 ページ: e30229-e30229
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0030229
  • 査読あり
• [雑誌論文] Array-based genomic resequencing of human leukemia (2010)
  • 著者名/発表者名: Yamashita Y, Yuan J, Suetake I, Suzuki H, Ishikawa Y, Choi Y L, Ueno T, Soda M, Hamada T, Haruta H, Takada S, Miyazaki Y, Kiyoi H, Ito E, Naoe T, Tomonaga M, Toyota M, Tajima S, Iwama A, and Mano H
  • 雑誌名: Oncogene 巻: 29 号: 25 ページ: 3723-3731
  • DOI: 10.1038/onc.2010.117
  • 査読あり
• [雑誌論文] EML4-ALK mutations in lung cancer that confer resistance to ALK inhibitors (2010)
  • 著者名/発表者名: Choi, Y. L., Soda, M., et al.(全15名、第3著者)
  • 雑誌名: N Engl J Med 巻: 363 号: 18 ページ: 1734-1739
  • DOI: 10.1056/nejmoa1007478
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of transforming activity of free fatty acid receptor 2 by retroviral expression screening (2010)
  • 著者名/発表者名: Hatanaka, H., Tsukui, M., et al.(全17名、第7著者)
  • 雑誌名: Cancer science 巻: 101 号: 1 ページ: 54-59
  • DOI: 10.1111/j.1349-7006.2009.01348.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of the transforming activity of Indian hedgehog by retroviral expression screening (2010)
  • 著者名/発表者名: Hatanaka, H., Takada, S., et al.(全16名、第7著者)
  • 雑誌名: Cancer science 巻: 101 号: 1 ページ: 60-64
  • DOI: 10.1111/j.1349-7006.2009.01355.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Array-based genomic resequencing of human leukemia. (2010)
  • 著者名/発表者名: Yamashita, Y., et al.
  • 雑誌名: Oncogene 巻: 29 ページ: 3723-3731
  • 査読あり
• [雑誌論文] EML4-ALK mutations in lung cancer that confer resistance to ALK inhibitors. (2010)
  • 著者名/発表者名: Choi, YL., et al.
  • 雑誌名: N Engl J Med. 巻: 363 ページ: 1734-1739
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of the transforming activity of Indian hedgehog by retroviral expression screening. (2010)
  • 著者名/発表者名: Hatanaka, H., et al
  • 雑誌名: Cancer Sci. 巻: 101 ページ: 60-64
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of transforming activity of free fatty acid receptor 2 by retroviral expression screening (2010)
  • 著者名/発表者名: Hatanaka, H., et al.
  • 雑誌名: Cancer Sci. 101 ページ: 54-59
  • 査読あり
• [雑誌論文] Screening for genetic abnormalities involved in ovarian carcinogenesis using retroviral expression libraries (2009)
  • 著者名/発表者名: Wada, T., Yamashita, Y., et al.(全16名、第2著者)
  • 雑誌名: Int J Oncol 巻: 35 号: 05 ページ: 973-976
  • DOI: 10.3892/ijo_00000410
  • 査読あり
• [雑誌論文] KIF5B-ALK, a novel fusion oncokinase identified by an immunohistochemistry-based diagnostic system for ALK-positive lung cancer (2009)
  • 著者名/発表者名: Takeuchi, K., Choi, Y. L., et al.
  • 雑誌名: Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research 巻: 15 号: 9 ページ: 3143-3149
  • DOI: 10.1158/1078-0432.ccr-08-3248
  • 査読あり
• [雑誌論文] Potential role of miR-29b in modulation of Dnmt3a and Dnmt3b expression in primordial germ cells of female mouse embryos (2009)
  • 著者名/発表者名: Takada, S., Berezikov, E., et al.(全5名、第4著者)
  • 雑誌名: Rna 巻: 15 号: 8 ページ: 1507-1514
  • DOI: 10.1261/rna.1418309
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide histone methylation profile for heart failure (2009)
  • 著者名/発表者名: Kaneda, R., Takada, S., et al.(全10名、第3著者)
  • 雑誌名: Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms 巻: 14 号: 1 ページ: 69-77
  • DOI: 10.1111/j.1365-2443.2008.01252.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Potential role of miR-29b in modulation of Dnmt3a and Dnmt3b expression in primordial germ cells of female mouse embryos (2009)
  • 著者名/発表者名: Takada, S., et al.
  • 雑誌名: RNA 15 ページ: 1507-1514
  • 査読あり
• [雑誌論文] Array-based genomic resequencing of human leukemia
  • 著者名/発表者名: Yamashita, Y., et al.
  • 雑誌名: Oncogene (in press)
  • 査読あり
• [学会発表] Array-based genomic resequencing of acute myeloid leukemia (2011)
  • 著者名/発表者名: Yamashita, Y., et al
  • 学会等名: Cold Spring Harbor Asia conference 2011, Translational Approaches to Cancer meeting
  • 発表場所: 中国江蘇省蘇州市
  • 年月日: 2011-05-25
• [学会発表] Array-based genomic resequencing of acute myeloid leukemia (2011)
  • 著者名/発表者名: Yamashita, Y., Ueno, T., Soda, M., Mano, H.
  • 学会等名: Cold Spring Harbor Asia Conference, Translational Approaches to Cancer
  • 発表場所: Victoria, Suzhou, Jiangsu Province, China
• [学会発表] 大型リシークエンスアレイによる白血病の遺伝子変異スクリーニング (2010)
  • 著者名/発表者名: 山下義博
  • 学会等名: 第69回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 大阪国際会議場(大阪府)
  • 年月日: 2010-09-23
• [学会発表] Array-based genomic resequencing of acute myeloid leukemia. (2010)
  • 著者名/発表者名: 山下義博
  • 学会等名: 第16回日本遺伝子治療学会学術総会
  • 発表場所: 栃木県総合文化センター(栃木県)
  • 年月日: 2010-07-01
• [学会発表] Array-based genomic resequencing of acute myeloid leukemia (2010)
  • 著者名/発表者名: Yamashita, Y., et al.
  • 学会等名: Keystone Symposia 2009-2010, Z1 Cancer Meeting
  • 発表場所: カナダブリティッシュコロンビア州ビクトリア
  • 年月日: 2010-03-25
• [学会発表] Array-based genomic resequencing of acute myeloid leukemia (2010)
  • 著者名/発表者名: 山下義博, 間野博行
  • 学会等名: 第16回日本遺伝子治療学会学術総会
  • 発表場所: 栃木
• [学会発表] 大型リシークエンスアレイによる白血病の遺伝子変異スクリーニング (2010)
  • 著者名/発表者名: 山下義博, 曽田学, 上野敏秀, 崔永林, 間野博行
  • 学会等名: 第69回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 大阪
• [学会発表] Array-based genomic resequencing of acute myeloid leukemia (2010)
  • 著者名/発表者名: Yamashita, Y., Soda, M., Ueno, T., Mano, H.
  • 学会等名: Keystone Symposia, New Paradigms in Cancer Therapeutics, Victoria, British Columbia
  • 発表場所: Canada
• [学会発表] A large-scale resequencing project of -5600 human genes in the genome of acute myeloid leukemia (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamashita, Y., et al.
  • 学会等名: 米国癌学会学術総会(AACR)
  • 発表場所: 米国コロラド州デンバー
  • 年月日: 2009-04-19
• [学会発表] A large-scale resequencing project of～5600 human genes in the genome of acute myeloid leukemia (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamashita, Y., Soda, M., Mano, H.
  • 学会等名: AACR 100th Annual Meeting 2009
  • 発表場所: Denver, Colorado, U. S. A.