メタゲノミクスを用いた病院環境の微生物分布の解析と院内感染対策への応用

• 研究課題/領域番号: 21591291
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 感染症内科学
• 研究機関: 群馬大学
• 研究代表者: 徳江 豊 群馬大学, 医学部, 准教授 (80292275)
• 研究期間 (年度): 2009 – 2011
• 研究課題ステータス: 完了 (2011年度)
• 配分額: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2011年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2010年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2009年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
• キーワード: メタゲノミクス / 16S rRNA / 病院環境 / 感染対策 / 院内感染対策 / 環境検査 / メタゲノム / 16SrRNA

研究概要

薬剤耐性菌が分離された病院内の環境調査を行う際に、通常の一般細菌培養と同時に分子生物学的微生物同定法で比較検討した。16SrRNA遺伝子を標的としPCRで増幅し、クローニング後、シークエンス決定しデータベースにて相同性を比較し菌種同定を行った。目的とする耐性菌の分離率は分子生物学的検討法で高く感度の高い検査であることが推測された。さらに乾燥した検体からも種々の菌を同定することが可能であり、環境汚染の指標として利用できる可能性が示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] Antibacterial activity of carbapenems against clinical isolates of respiratory bacterial pathogens in the northeastern region of Japan in 2007 (2011)
  • 著者名/発表者名: Gomi K, Fujimura S, Fuse K, Takane H, Nakano Y, Kariya Y, Kikuchi T, Kurokawa I, Tokue Y, Watanabe A
  • 雑誌名: J Infect Chemother 巻: 17 ページ: 200-206
  • NAID: 10028171398
  • 査読あり
• [雑誌論文] Criteria for safety evaluation of antimicrobial agents (2011)
  • 著者名/発表者名: Watanabe A, Tokue Y, Aoki N, Matsumoto T, Yanagihara K, Higa F, Tsuge H, Nagashima M, Matsuoka H, Sasagawa Y, Matsumoto M, Fujimaki K, Taguchi K, Ariyasu M, Yamamoto N, Kunii O, Shiba K
  • 雑誌名: J Infect Chemother 巻: 17 ページ: 47-139
  • NAID: 10027817022
  • 査読あり
• [雑誌論文] Criteria for safety evaluation of antimicrobial agents (2011)
  • 著者名/発表者名: Watanab A, Tokue Y, et al
  • 雑誌名: J Infect Chemother 巻: 17 ページ: 139-147
  • NAID: 10027817022
  • 査読あり
• [雑誌論文] Antibacterial activity of carbapenems against clinical isolates of respiratory bacterial pathogens in the northeasten region of Japan in 2007 (2011)
  • 著者名/発表者名: Gomi K, Tokue Y, et al
  • 雑誌名: J Infect Chemother 巻: 17 ページ: 200-206
  • 査読あり
• [雑誌論文] Antibacterial activity of carbapenems against clinical isolates of respiratory bacterial pathogens in the northeastern region of Japan in 2007 (2010)
  • 著者名/発表者名: Gomi K, Tokue Y, et al
  • 雑誌名: J Infect Chemother 巻: publish on line
  • NAID: 10028171398
  • 査読あり
• [雑誌論文] Association between Mycobacterial genotypes and disease progression in Mycobacterium avium pulmonary infection (2009)
  • 著者名/発表者名: Kikuchi T, Watanabe A, Gomi K, Sakakibara T, Nishimori K, Daito H, Fujimura S, Tazawa R, Inoue A, Ebina M, Tokue Y, Kaku M, Nukiwa T
  • 雑誌名: Thorax 巻: 64 ページ: 901-907
  • 査読あり
• [雑誌論文] Association between Mycobacterial genotypes and disease progression in Mycobacterium avium pulmonary infection. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kikuchi T, Tokue Y, et al
  • 雑誌名: Thorax 64 ページ: 901-907
  • 査読あり
• [学会発表] 呼吸器感染症の治療～レスピラトリーキノロンを中心に～ (2012)
  • 著者名/発表者名: 徳江豊
  • 学会等名: 日本薬学会第132年会
  • 発表場所: 北海道大学(札幌)
  • 年月日: 2012-03-29
• [学会発表] 教育講演2「ニューキノロン系抗菌薬の使い分け」 (2011)
  • 著者名/発表者名: 徳江豊
  • 学会等名: 第60回日本感染症学会東日本地方会、第58回日本化学療法学会東日本支部総会合同学会
  • 発表場所: 山形
  • 年月日: 2011-10-27
• [学会発表] ニューキノロン系抗菌薬の使い分け (2011)
  • 著者名/発表者名: 徳江豊
  • 学会等名: 日本化学療法学会・感染症学会東日本合同学会
  • 発表場所: 山形
  • 年月日: 2011-10-27
• [学会発表] 教育講演「病院感染対策の実際アウトブレイクへの対応 (2011)
  • 著者名/発表者名: 徳江豊
  • 学会等名: 日本呼吸器学会東北地方会
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2011-03-05
• [学会発表] 教育講演「病院感染対策の実際-アウトブレイクへの対応-」 (2011)
  • 著者名/発表者名: 徳江豊
  • 学会等名: 第92回日本呼吸器学会東北地方会
  • 発表場所: フォレスト仙台(宮城県)
  • 年月日: 2011-03-05
• [学会発表] シンポジウム5抗菌薬を使用しても改善しない!抗菌薬とホスト因子感染症におけるホスト因子の役割 (2010)
  • 著者名/発表者名: 徳江豊
  • 学会等名: 第58回日本化学療法学会
  • 発表場所: 長崎
  • 年月日: 2010-06-03
• [学会発表] シンポジウム「抗菌薬を使用しても改善しない!抗菌薬とホスト因子」感染症におけるホスト因子の役割 (2010)
  • 著者名/発表者名: 徳江豊
  • 学会等名: 第58回日本化学療法学会総会
  • 発表場所: 長崎ブリックホール(長崎県)
  • 年月日: 2010-06-03
• [学会発表] シンポジウム4 NICU病院感染予防のためのガイドライン ガイドラインの検証-感染管理担当者(基礎)の立場から (2010)
  • 著者名/発表者名: 徳江豊
  • 学会等名: 第25回日本環境感染学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-02-05
• [学会発表] 教育セミナー10抗菌薬の適正使用を含めた病院感染対策 (2010)
  • 著者名/発表者名: 徳江豊
  • 学会等名: 第25回日本環境感染学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-02-05
• [学会発表] NICU病院感染興望のためのガイドラインガイドラインの検証-感染管理担当者(基礎)の立場から (2010)
  • 著者名/発表者名: 徳江豊
  • 学会等名: 環境感染学会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-02-05
• [学会発表] ICD講習会院内感染における耐性菌の現状とその対策細菌感染症の動向とその対策 (2009)
  • 著者名/発表者名: 徳江豊
  • 学会等名: 第18回日本口腔感染症学会
  • 発表場所: 足利
  • 年月日: 2009-11-14