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ミトコンドリアに存在する未知のアセチル化酵素の同定

研究課題

研究課題/領域番号 21651086
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 応用ゲノム科学
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

伊藤 昭博  独立行政法人理化学研究所, 吉田化学遺伝学研究室, 專任研究員 (40391859)

研究期間 (年度) 2009 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
3,200千円 (直接経費: 3,200千円)
2010年度: 1,400千円 (直接経費: 1,400千円)
2009年度: 1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
キーワードアセチル化酵素 / ミトコンドリア / タンパク質アセチル化 / ピルビン酸脱水素酵素複合体
研究概要

タンパク質のアセチル化は、核において遺伝子発現を制御する主要な翻訳後修飾である。最近、ミトコンドリアには多数のアセチル化タンパク質の存在が示唆され、アセチル化は核と同様にミトコンドリアにおいても主要な翻訳後修飾である可能性は高いが、ミトコンドリアに局在するアセチル化酵素の存在は不明である。そこでゲノムワイドなsiRNAライブラリーを用いて、ミトコンドリアに存在する未知のアセチル化酵素の同定することを目的とした。具体的には、研究代表者が同定したアセチル化ミトコンドリアタンパク質であるHMG-CoAlyase(HMGCL)のアセチル化レベルを減少させるようなsiRNAオリゴをスクリーニングすることにより、アセチル化酵素を探索した。約21,000のヒト遺伝子を標的としたダーマコン社のゲノムワイドなsiRNAライブラリーから、ミトコンドリアのプロテオーム等のデータベースでミトコンドリアに局在すると予測された1,373遺伝子についてHMGCLを恒常的に発現させたHeLa細胞を用いてスクリーニングした。その結果、ピルビン酸脱水素酵素複合体の構成因子であるpyruvate dehydrogenase α1 (PDHA1)および、dihydrolipoamide S-acetyltransferase (DLAT)のノックダウンによりHMGCLのアセチル化が顕著に低下することを見出した。興味深いことに、PDHA1あるいはDLATのノックダウンは、ヒストンのアセチル化レベルにはほとんど影響をおよぼさなかった。
本研究において、ピルビン酸脱水素酵素複合体による新規ミトコンドアタンパク質のアセチル化調節機構を示唆する結果を得た。

報告書

(2件)
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2011 2010 2009

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (5件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Histone deacetylase inhibitors block NF-κB-dependent transcription by interfering with RNA polymerase II recruitment.2011

    • 著者名/発表者名
      Furumai R
    • 雑誌名

      Cancer Sci.

      巻: (In press)

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The role of class I histone deacetylase (HDAC) on gluconeogenesis in liver.2010

    • 著者名/発表者名
      Oiso H
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun.

      巻: 404 ページ: 166-172

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Total synthesis of (+)-chaetocin and its analogues : their histone methyltransferase G9a inhibitory activity.2010

    • 著者名/発表者名
      Iwasa E
    • 雑誌名

      J Am Chem Soc.

      巻: 132 ページ: 4078-4079

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Bicyclic peptides as potent inhibitors of histone deacetylases : optimization of alkyl loop length2010

    • 著者名/発表者名
      Islam NM
    • 雑誌名

      Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters 20

      ページ: 997-999

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Isolation of azaspiracid-2 from a marine sponge Echinoclathria sp.as a potent cytotoxin2009

    • 著者名/発表者名
      Ueoka R
    • 雑誌名

      Toxicon. 53

      ページ: 680-684

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Kerriamycin B inhibits protein SUMOylation2009

    • 著者名/発表者名
      Fukuda I
    • 雑誌名

      Journal of Antibiotics 62

      ページ: 221-224

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ミトコンドリアにおける脱アセチル化酵素SIRT3による新規エネルギー代謝制御2010

    • 著者名/発表者名
      伊藤昭博
    • 学会等名
      日本農芸化学会2010大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-03-30
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Regulation of energy metabolism by SIRT32010

    • 著者名/発表者名
      伊藤昭博
    • 学会等名
      The 5th Japan-Korea Chemical Biology Symposium
    • 発表場所
      釜山
    • 年月日
      2010-01-27
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 脱アセチル化酵素SIRT3によるケトン体生成制御2009

    • 著者名/発表者名
      伊藤昭博
    • 学会等名
      第82回日本生化学会大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2009-10-24
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] エネルギー代謝を制御する脱アセチル化酵素SIRT32009

    • 著者名/発表者名
      伊藤昭博
    • 学会等名
      第20回新薬創製談話会
    • 発表場所
      熱海
    • 年月日
      2009-09-18
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] SIRT3 regulates ketogenesis2009

    • 著者名/発表者名
      伊藤昭博
    • 学会等名
      FASEB Summer Research Conference
    • 発表場所
      Lucca
    • 年月日
      2009-08-10
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [図書] ケミカルエピジェネティクス-化合物によるエピジェネティクス情報の制御2010

    • 著者名/発表者名
      伊藤環
    • 出版者
      羊土社 実験医学
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2016-04-21  

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